李忠杰,吳虎,吳海軍,周如華
(1.張家港市公安局刑事科學(xué)技術(shù)室,江蘇張家港 215600;2.蘇州市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所,江蘇蘇州 215131)
·研究簡報·
蘇州地區(qū)漢族和哈尼族人群17個STR基因座的遺傳多態(tài)性
李忠杰1,吳虎1,吳海軍1,周如華2
(1.張家港市公安局刑事科學(xué)技術(shù)室,江蘇張家港 215600;2.蘇州市公安局刑事科學(xué)技術(shù)研究所,江蘇蘇州 215131)
法醫(yī)遺傳學(xué);多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;STR;蘇州;哈尼族
本研究采用AGCU 17+1 STR熒光檢測試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司),對蘇州地區(qū)哈尼族人群進行17個STR基因座的遺傳多態(tài)性調(diào)查,獲取了相關(guān)的群體遺傳學(xué)參數(shù),并與本地區(qū)漢族人群進行比較,旨在為該地區(qū)哈尼族人群的法醫(yī)學(xué)個人識別和親子鑒定以及群體遺傳學(xué)研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
圖4為不同氧氣分壓制備樣品XRD譜圖及二硫化鉬、三氧化鉬XRD標準譜圖。圖4中曲線0.5 MPa、0.8 MPa、1.2 MPa與二硫化鉬、三氧化鉬標準曲線對比知,0.5 MPa曲線與二硫化鉬標準曲線完全相同,證明0.5 MPa樣品金屬鉬賦存狀態(tài)為二硫化鉬;0.8 MPa曲線、1.2 MPa曲線與三氧化鉬標準曲線基本完全相同,證明氧氣分壓為0.8 MPa、1.2 MPa條件下制備樣品中金屬鉬賦存狀態(tài)三氧化鉬。
蘇州地區(qū)2 000名漢族無關(guān)個體口腔拭子樣本(男性1640例,女性360例),215名哈尼族無關(guān)個體口腔拭子樣本(男性186例,女性29例),均來自實驗室日常建庫工作積累。PCR擴增采用AGCU 17+1 STR熒光檢測試劑盒,總反應(yīng)體系10μL,在9700型擴增儀(美國AB公司)上對17個基因座進行復(fù)合擴增,取1μL擴增產(chǎn)物與0.5μL內(nèi)標SIZ500和9.5μL去離子甲酰胺混合,置3500XL遺傳分析儀(美國AB公司)上進行全自動毛細管電泳,用GeneMapper? ID-X軟件進行等位基因分型。應(yīng)用Modified-Powerstates軟件[1]對數(shù)據(jù)進行處理,得到17個STR基因座的等位基因頻率、觀察雜合度(Ho)、多態(tài)信息含量(PIC)、個人識別率(DP)、非父排除率(PE)、典型親權(quán)指數(shù)(TPI)以及Hardy-Weinberg平衡檢驗的結(jié)果。按文獻[2]的方法計算期望雜合度(He)、累積個人識別率(CDP)、累積非父排除率(CPE)。不同民族人群間等位基因頻率分布差異用SPSS 13.0統(tǒng)計軟件進行χ2檢驗,檢驗水準α=0.05。
黨的十八大以來,以習(xí)近平同志為核心的黨中央高度重視黨的紀律建設(shè),把紀律建設(shè)提升到了全面從嚴治的高度,并不斷貫徹落實習(xí)近平關(guān)于黨的紀律建設(shè)講話的精神實質(zhì),黨的紀律建設(shè)全面加強。黨的十九大更是在總結(jié)歷史創(chuàng)新經(jīng)驗基礎(chǔ)上,首次將紀律建設(shè)納入黨的建設(shè)總體布局并寫入黨章,彰顯了以習(xí)近平同志為核心的黨中央堅持用紀律管黨治黨的決心和意志。
蘇州地區(qū)2000名漢族無關(guān)個體在17個STR基因座中共觀察到227種等位基因和995種基因型,215名哈尼族無關(guān)個體在17個STR基因座中共觀察到172種等位基因和584種基因型,等位基因及其頻率分布見表1,經(jīng)用Modified-Powerstates軟件檢驗,調(diào)查的各基因座符合Hardy-Weinberg平衡(P〉0.05),表明該群體調(diào)查資料具有可靠性和科學(xué)性。各基因座的常用群體遺傳學(xué)參數(shù)見表2。
表1 蘇州地區(qū)漢族和哈尼族人群17個STR基因座等位基因頻率分布[n(漢族)=2000,n(哈尼族)=215]
續(xù)表1
續(xù)表1
表2 蘇州地區(qū)漢族和哈尼族人群17個STR基因座群體遺傳學(xué)參數(shù)[n(漢族)=2000,n(哈尼族)=215]
將蘇州地區(qū)哈尼族人群與漢族人群進行等位基因分布頻率的比對,發(fā)現(xiàn)所比較的17個基因座中,除在D7S820、TPOX、D19S433基因座的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P〉0.05)外,在CSF1PO等其余14個基因座的差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P〈0.05)。由此表明,即使在同一地區(qū),不同民族的等位基因頻率分布差異往往也很明顯,故不同民族人群之間的基因頻率分布資料不宜混用,調(diào)查統(tǒng)計不同地區(qū)、民族人群的群體遺傳學(xué)資料十分必要。
上述17個STR基因座中,Ho為0.5514~0.8791,DP為0.772 3~0.970 3,PIC為0.527 9~0.867 4,PE為0.2366~0.7529,TPI為1.1146~4.1346。17個STR基因座的CDP為0.9999999999999999999731154,CPE 為0.999999919705071。按Gill等[3]提出的DP≥0.9、H≥0.7、PIC≥0.7的STR基因座屬高度多態(tài)性基因座的標準來衡量,D13S317、D7S820、D16S539、Penta E、D2S1338、D19S433、vWA、D5S818、FGA、D6S1043、 D8S1179、D21S11、D18S51共13個基因座屬高鑒別能力的基因座,其中FGA基因座的各項指標最優(yōu)。調(diào)查表明,17個STR基因座在蘇州地區(qū)漢族和哈尼族人群中具有高度多態(tài)性,可用于該地區(qū)法醫(yī)學(xué)個人識別和親子鑒定。
[1]趙方,伍新堯,蔡貴慶,等.Modified-Powerstates軟件在法醫(yī)生物統(tǒng)計中應(yīng)用[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2003,18(5):297-298,312.
[2]侯一平.法醫(yī)物證學(xué)[M].第3版.北京:人民衛(wèi)生出版社,2009:21-22,283.
[3]Gill P,Urquhart A,Millican E,et al.A new method of STR interpretation using inferential logic--development of a criminal intelligence database[J].Int J Legal Med,1996,109(1):14-22.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2015.02.020
1004-5619(2015)02-0152-04
2014-07-14)
(本文編輯:柳燕)
李忠杰(1981—),男,內(nèi)蒙古烏海人,碩士,主檢法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學(xué)科研與鑒定;E-mail:cmu86k11blzj@163.com