趙曉剛
ATP,名稱腺苷三磷酸,由1個腺嘌呤、1個核糖和3個磷酸基團組成(圖1)。連接兩個磷酸基團之間的磷酸鍵不太穩(wěn)定,水解時釋放的能量比連接在糖分子上的磷酸鍵多,稱為高能磷酸鍵。ATP是細胞中各項生命活動所需能量的直接來源,是細胞中的“能量通貨”。
在教學和備考過程中,學生圍繞著ATP結(jié)構(gòu)、產(chǎn)生過程以及在RNA和DNA合成過程中起的作用,提出了許多值得教師思考的問題:
(1) 在有氧呼吸的3個階段中,產(chǎn)生ATP的原理一樣嗎?光合作用產(chǎn)生ATP的原理呢?
(2) 依據(jù)ATP的結(jié)構(gòu),UTP、CTP、GTP是不是直接能源物質(zhì),為何教材中只強調(diào)ATP是直接能源物質(zhì)?
(3) DNA復制需要能量,是ATP供能嗎?
學生能夠提出上述問題,反映出他們具有良好的科學思維品質(zhì)。教師幫助學生妥善地解決這些教學疑難問題,有益于培養(yǎng)學生獲取新知識和信息處理能力、探究學習和批判性思考能力等。因此,在教學中,教師切忌以內(nèi)容超越考綱而一言以蔽之。
1 ATP合成原理
高中教材對有氧呼吸的3個階段進行了簡化:第一階段糖酵解,1分子葡萄糖在細胞質(zhì)基質(zhì)中分解為2分子丙酮酸,產(chǎn)生了少量ATP和少量[H];第二階段三羧酸循環(huán),丙酮酸在線粒體基質(zhì)中脫去CO2,產(chǎn)生少量ATP和大量[H];第三階段電子傳遞和氧化磷酸化,前兩個階段產(chǎn)生的[H]和O2反應產(chǎn)生H2O,同時產(chǎn)生大量ATP。
學生在學習過程中指出,第三階段發(fā)生在線粒體內(nèi)膜上,內(nèi)膜上存在電子傳遞鏈,[H]中勢能高的電子沿電子傳遞鏈傳遞過程中能量降低導致ATP合成。而第一、二階段在基質(zhì)進行,無膜結(jié)構(gòu),ATP是如何合成的呢,它們的原理一致嗎?
實質(zhì)上有氧呼吸ATP的合成包括氧化磷酸化和底物磷酸化兩種方式。
有氧呼吸第三階段中ATP合成原理為氧化磷酸化。代謝物失去電子或脫氧,電子沿電子傳遞體傳遞過程中釋放能量使ADP磷酸化生成ATP過程,是ATP生成的主要方式。此ATP的合成機制最有說服力的是1961年由Peter.Mitchell提出的“化學滲透”原理,他提出電子傳遞釋放的自由能儲存在由質(zhì)子泵建立起的跨線粒體內(nèi)膜電化學H+梯度中,此梯度的電化學勢被用來合成ATP。此假說得到許多實驗結(jié)果的支持,但許多科學家也得到了與其相矛盾的實驗結(jié)果,化學滲透假說的能量轉(zhuǎn)換機理還有待進一步深入研究與探討。
ATP合成酶多分布于葉綠體類囊體膜、線粒體內(nèi)膜和某些細菌的細胞膜上,參與光合磷酸化和氧化磷酸化過程,在跨膜H+梯度的推動下合成ATP,其結(jié)構(gòu)由親水外周膜蛋白F1和嵌入膜內(nèi)的疏水蛋白F0組成(圖2)。
有氧呼吸第二、三階段中ATP的合成原理為底物水平磷酸化。營養(yǎng)物質(zhì)在代謝過程中經(jīng)過脫氫、脫羧、分子重排和烯醇化等反應,分子內(nèi)的能量重新分布,形成了高能磷酸基團或高能鍵,隨后直接將高能磷?;D(zhuǎn)移給ADP生成ATP;或?qū)⑺飧吣苕I釋放的自由能用于ADP與Pi反應生成ATP,以這樣的方式生成ATP的過程稱為底物水平磷酸化。此過程在胞漿和線粒體中進行,包括有:
(1) 1,3-二磷酸甘油酸+ADP 3-磷酸甘油酸+ATP。
(2) 磷酸烯醇式丙酮酸+ADP→烯醇式丙酮酸+ATP。
(3) 琥珀酰CoA+H3PO4+GDP 琥珀酸+CoASH+GTP。
底物水平磷酸化不需要經(jīng)過呼吸鏈的電子傳遞過程,不需要消耗氧,也不利用線粒體的ATP酶系統(tǒng)。因此生成ATP的速度比較快,但是生成量不多。在機體缺氧或無氧條件下,底物水平磷酸化無疑是一種生成ATP的快捷、便利的方式。
光合作用產(chǎn)生ATP過程與有氧呼吸第三階段類似,稱為光合磷酸化。依據(jù)“化學滲透假說”解釋,ATP合成酶位于類囊體膜上,膜兩側(cè)H+濃度差的構(gòu)建有2個來源:電子傳遞釋放的能量將H+由葉綠體基質(zhì)泵到類囊體腔;質(zhì)子動力勢的另一個來源是類囊體腔中水的光解。
2 ATP的結(jié)構(gòu)及思維延伸
在學習了RNA的結(jié)構(gòu)和合成后,學生提出ATP和UTP、CTP、GTP均為RNA合成的原料,四者的結(jié)構(gòu)只是堿基的差異。那么UTP、CTP、GTP理論上也可以為直接能源物質(zhì),為何高中教材中只提到ATP是細胞中直接能源物質(zhì)呢?
ATP是主要的直接能源物質(zhì),UTP、CTP、GTP也參與能量傳遞作用,可分別為糖原、磷脂、蛋白質(zhì)等合成提供能量,但它們一般不能從物質(zhì)氧化過程中直接生產(chǎn),只能在核苷二磷酸激酶的催化下,從ATP獲得高能磷酸鍵。
在教學過程中,有學生繼續(xù)追問:為什么ATP是主要的直接能源物質(zhì),為何物質(zhì)氧化不直接產(chǎn)生其他NTP呢?學生提出的此問題實際上是很難回答的,查閱資料主要有下面2種可能的解釋。
解釋一:腺嘌呤可自身合成而不依賴于其他NTP,而其他堿基的合成則需要ATP參與,由此推測在進化過程中A是較早產(chǎn)生的堿基,據(jù)此推斷為何細胞選擇ATP作為主要能量攜帶者。
解釋二:現(xiàn)在比較得到認可的假說是,在細胞中A-U含有氫鍵少相互作用低,而G-C含有氫鍵多彼此作用強,使得在胞內(nèi)游離態(tài)G-C含量比A、U數(shù)量少,而游離態(tài)的NTP是作為共同能量儲存者的必備條件之一。
3 ATP與DNA復制
在高中學習階段,下面的題目是每一屆學生都會遇到的一個題目,其答案為A,從而使大多數(shù)的學生都普遍認為DNA復制需要ATP。有學生提出了疑問:為何在做PCR實驗時不加入ATP呢?
生物體的DNA復制必需的一組條件是( )
① ATP;② DNA分子;③ 酶;④ 轉(zhuǎn)運RNA;⑤ 信使RNA;⑥ 脫氧核苷酸;⑦ 適宜的pH;⑧ 適宜的溫度
A. ①②③⑥⑦⑧ B. ①②③④⑤⑥
C. ①②③⑤⑥⑧ D. ②③④⑤⑥⑦
實質(zhì)上,無論體內(nèi)DNA的合成還是PCR體外擴增DNA,DNA合成的原料是dNTP(四種脫氧核苷三磷酸),dNTP均含有2個高能磷酸鍵,PPi的水解利于磷酸二酯鍵的合成(圖3),在此過程中并不需要ATP供能,可以說是原料自身提供能量,NTP合成RNA的原理也是如此。
但在哺乳動物或噬菌體中,DNA連接酶催化互補雙鏈DNA中單鏈缺口的連接需要ATP的參與(圖4)。
教學的真諦在于以知識為載體,喚起學生探究知識的激情,教會學生學習和思維,培養(yǎng)學生的創(chuàng)新精神和實踐能力。教師在教學過程中解答學生的疑難問題,同樣是達成預期目標的一種教學活動形式。
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