宋雛葉
由于對生物很感興趣,我平時就非常關(guān)注生物學(xué)科方面的信息和知識。2015年的諾貝爾獎揭曉后,我注意到2015年的諾貝爾化學(xué)獎授予給了瑞典、美國、土耳其的三位科學(xué)家,以表彰他們對“細(xì)胞修復(fù)自身DNA的機(jī)制”的研究。有“豪華版諾貝爾獎”之稱的“生命科學(xué)突破獎”2015年頒給了六位科學(xué)家,其中美國和瑞典的兩位科學(xué)家獲獎是因?yàn)閷Α盎蚪M編輯CRISPR技術(shù)”的研究。該技術(shù)基于DNA保護(hù)機(jī)制。DNA修復(fù)與保護(hù)技術(shù)為什么會受到科學(xué)界的重視呢?我?guī)е蓡柌殚喠撕芏噘Y料,請教了幾位老師,對它進(jìn)行了初步的探索和分析。
DNA分子獨(dú)特的雙螺旋,具有較穩(wěn)定的結(jié)構(gòu);DNA雙鏈提供精確模板,通過堿基互補(bǔ)配對能夠保證復(fù)制準(zhǔn)確進(jìn)行。怎么會出現(xiàn)差錯呢?DNA如何保存自身相對穩(wěn)定?DNA受到損傷又如何修復(fù)?下面結(jié)合DNA復(fù)制、變異、基因表達(dá)等相關(guān)知識進(jìn)行一些分析和探索。
一、DNA的快速復(fù)制
在細(xì)胞增殖的間期DNA復(fù)制,復(fù)制需要模板、原料、酶(解旋酶、DNA聚合酶、DNA連接酶)、ATP及適宜的溫度、pH等條件。遵循邊解旋邊復(fù)制,以解旋的兩條親代母鏈為模板,按照堿基互補(bǔ)配對原則合成兩條子鏈,新合成子鏈與母鏈重新相互盤繞形成兩個完全相同的雙鏈DNA分子,表現(xiàn)為半保留復(fù)制。
研究發(fā)現(xiàn),37℃時DNA聚合酶Ⅲ催化速率為750個核苷酸/秒,按此速率,含有245 522 847個堿基對的人1號染色體復(fù)制約需91h。而人體受精卵經(jīng)5次有絲分裂發(fā)育成含32個細(xì)胞的桑葚胚需3~4天,每個周期至少也得14 h。可見,若要短期內(nèi)完成DNA復(fù)制,除了提高DNA聚合酶活性外,關(guān)鍵是“DNA多起點(diǎn)雙向復(fù)制”。
(1)多起點(diǎn)雙向復(fù)制。這是真核生物DNA復(fù)制最主要的形式,從一個特定位點(diǎn)解旋得到兩條母鏈,以此作為復(fù)制模板,沿著兩個相反的方向各延伸出兩條鏈,形成1個復(fù)制泡、2個復(fù)制叉;2個起點(diǎn)則形成2個復(fù)制泡、4個復(fù)制叉……這樣可以大幅提高DNA復(fù)制速率。如圖1所示,DNA有兩個復(fù)制起點(diǎn)O1和O2,各形成兩個相反方向的復(fù)制叉,相當(dāng)于形成4個“工作面”,其復(fù)制速率就可達(dá)1個復(fù)制起點(diǎn)時的4倍。
(2)DNA聚合酶。DNA是由兩條反向平行的脫氧核苷酸單鏈相互盤繞而成的。DNA聚合酶只能將單個游離脫氧核苷酸通過形成3′,5′一磷酸二酯鍵連接到核苷酸鏈的3′端,換言之,DNA聚合酶只能沿5′→3′方向延伸(合成)子鏈。DNA聚合酶的這一特性使得DNA復(fù)制時出現(xiàn)兩個有趣現(xiàn)象:①DNA復(fù)制需要引物,引物為長度為15~30個堿基的單鏈DNA或RNA。在DNA人工合成(PCR)中需要加入人工合成的引物,如:一個DNA分子連續(xù)復(fù)制n次,需要兩種引物2n—2個,數(shù)量各半。②DNA半不連續(xù)復(fù)制。DNA是“邊解旋邊復(fù)制”的,故DNA復(fù)制時,以3′→5′鏈為模板合成的一條子鏈延伸方向?yàn)?′→3′,與復(fù)制叉移動方向一致;而另一條以5′→3′為模板鏈合成的子鏈。延伸方向與復(fù)制叉移動方向相反,其合成是不連續(xù)的,即先形成許多不連續(xù)的片斷(稱為岡崎片斷),再通過DNA連接酶連成一條完整的DNA鏈。見圖2。
DNA合成速率如此之快,復(fù)制差錯在所難免。此外,各種高能輻射、化學(xué)試劑、病毒等物理、化學(xué)、生物因素都可能對DNA造成損傷,導(dǎo)致基因突變或染色體結(jié)構(gòu)變異。
二、DNA修復(fù)與保護(hù)
DNA在生物體內(nèi)保持穩(wěn)定,證明存在特殊的DNA修復(fù)與保護(hù)機(jī)制。
(1)重組修復(fù)。依據(jù)DNA損壞程度可分為單鏈損傷和DNA雙鏈斷裂,前者可利用雙鏈DNA中一段完整的互補(bǔ)鏈按照堿基互補(bǔ)配對原則修復(fù)。雙鏈斷裂的DNA則能以其同源染色體DNA為模板,通過同源重組的方式修復(fù)。
DNA雙鏈斷裂的修復(fù)較其他類型的DNA損傷更加困難,修復(fù)不當(dāng)則可能導(dǎo)致染色體缺失、重排、易位和倒位等,從而易于形成腫瘤等疾病。真核細(xì)胞具有成對同源染色體,其DNA相應(yīng)部位具有相同遺傳信息(等位基因或相同基因)。如果一條染色體DNA部分缺失。就可以以另一條同源染色體上的DNA進(jìn)行復(fù)制和修復(fù),當(dāng)然這種修復(fù)不可能是100%,因?yàn)橥慈旧w的兩個DNA分子的堿基序列并不完全相同,但修復(fù)之后一般可保證細(xì)胞遺傳和代謝的正常進(jìn)行,畢竟相同位點(diǎn)具有控制相對性狀的基因。
(2)端粒的保護(hù)。端粒是真核細(xì)胞染色體末端的可保護(hù)染色體的特殊結(jié)構(gòu)。正常細(xì)胞隨細(xì)胞不斷增殖,端粒逐漸縮短,當(dāng)細(xì)胞端??s至一定程度,細(xì)胞停止分裂。端粒酶能復(fù)制和延長端粒DNA來穩(wěn)定染色體端粒DNA的長度。端粒酶是由RNA和蛋白質(zhì)組成的復(fù)合物,如人類端粒由6個堿基重復(fù)序列TFAGGG和結(jié)合蛋白組成,其蛋白質(zhì)具有催化活性,能以RNA為模板,以端粒3末端為引物,合成端粒重復(fù)序列,故端粒酶屬于逆轉(zhuǎn)錄酶。
(3)限制酶的保護(hù)。限制酶能識別特定的核苷酸序列,并在每條鏈中特定部位的兩個核苷酸之間的磷酸二酯鍵進(jìn)行切割。限制酶是由細(xì)菌產(chǎn)生的,一般不切割自身的DNA分子,只切割外源DNA,其生理意義是提高自身的防御能力。
(4)CRISPR??茖W(xué)家在對微生物基因組研究時發(fā)現(xiàn),病毒能把自身的基因整合到細(xì)菌,利用細(xì)菌的細(xì)胞工具為自身的基因復(fù)制服務(wù),而細(xì)菌力圖將來自病毒的入侵基因清除,兩者共同進(jìn)化,細(xì)菌最終發(fā)展出一種CRISPR的系統(tǒng),利用該系統(tǒng),細(xì)菌可以不動聲色地把病毒基因從自身DNA上切除,這是細(xì)菌特有的免疫系統(tǒng)。如今,CRISPR基因編輯系統(tǒng)被迅速運(yùn)用到基因敲除動物模型的構(gòu)建之中,成為生命科學(xué)最熱門的技術(shù)。該技術(shù)實(shí)質(zhì)是“RNA干擾”,原理如圖3:病毒基因、人工轉(zhuǎn)入基因等外源性基因隨機(jī)整合到宿主細(xì)胞基因組內(nèi),并利用宿主細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄時,常產(chǎn)生一些雙鏈RNA(dsRNA)。宿主細(xì)胞利用核酸內(nèi)切酶迅速將這些dsR-NA切割成多個約21~23個堿基對的小片段RNA(即siRNA)。siRNA在解旋酶的作用下解旋為兩條單鏈RNA,并與外源性基因表達(dá)的mRNA的同源區(qū)進(jìn)行特異性結(jié)合,最終誘發(fā)宿主細(xì)胞針對這些mRNA的降解反應(yīng)。由于dsRNA抑制基因表達(dá)具有高效性,任何導(dǎo)致正常機(jī)體dsRNA形成的情況都會引起不需要的基因不能表達(dá)(稱基因沉寂)。當(dāng)然,機(jī)體內(nèi)正?;蛴行П磉_(dá)時,有一套嚴(yán)密防止dsRNA形成的機(jī)制。
DNA修復(fù)與保護(hù)對人類非常重要,以上只是一些基本原理和常識,它還有很多奧妙等待我們?nèi)パ芯?、去探索?/p>
作者單位:河南鄭州一中龍湖校區(qū)高三(1)班
(責(zé)任編輯 趙平)