陳優(yōu)生
(廣東食品藥品職業(yè)學(xué)院 制藥工程學(xué)院,廣東 廣州 510520)
2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽的合成及晶體結(jié)構(gòu)
陳優(yōu)生
(廣東食品藥品職業(yè)學(xué)院 制藥工程學(xué)院,廣東 廣州 510520)
以4-硝基苯二胺為原料通過(guò)取代反應(yīng)、加成反應(yīng)和水解反應(yīng)三步單元反應(yīng)制備2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑,經(jīng)過(guò)制備單晶并用X-射線衍射表征其為2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽晶體結(jié)構(gòu),化合物屬單斜晶系,空間群為C2/C,分子式C7H7N4O2+·Cl-,Mr=214.62,晶胞參數(shù)a=13.969(3)?、b=7.806 4(19)?、c=16.490(4)?、β=91.303(3)o、V=1 797.7(7) ?3,晶胞密度(計(jì)算值)為1.586 Mg·m3、Z=8、R=0.035、ωR=0.096,化合物通過(guò)氫鍵形成空間三維結(jié)構(gòu)。
2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽;X-射線衍射;晶體結(jié)構(gòu)
苯并咪唑類化合物是一種含有兩個(gè)氮原子的苯并雜環(huán)化合物,苯并咪唑衍生物及其金屬配合物具有良好的生物活性,可作為藥物中間體,制備人、畜的驅(qū)蟲(chóng)藥物。含咪唑環(huán)的苯并咪唑及其衍生物在抗癌、抗真菌、鎮(zhèn)痛消炎、抗風(fēng)濕、驅(qū)蟲(chóng)等方面有很重要的藥用價(jià)值。由于其具有特殊的結(jié)構(gòu)、生理活性和反應(yīng)活性等,應(yīng)用十分廣泛。因此,幾十年來(lái)苯并咪唑及其衍生物的合成及應(yīng)用研究從未間斷,至今仍十分活躍。
以4-硝基苯二胺為原料制備2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽單晶,化合物的單晶結(jié)構(gòu)通過(guò)X-衍射后進(jìn)行得到確認(rèn)。本文中所述苯并咪唑衍生物的合成工藝簡(jiǎn)單易行,收率高達(dá)92%。
1.1試劑和儀器
2-硝基苯二胺、BrCN均為國(guó)產(chǎn)分析純,氨水為化學(xué)純。
Bruker Smart-APEXII CCD單晶X衍射儀;三頸反應(yīng)瓶等玻璃儀器,磁力攪拌器等。
1.22-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽的制備[1]
稱取4-硝基苯二胺1.4 g于三頸瓶中,加入溴化氰(BrCN)0.97 g,加入水30 mL,繼續(xù)攪拌熱回流7 h,然后冷卻,再加入氨水(25%)調(diào)節(jié)反應(yīng)液pH值至11,室溫條件下經(jīng)過(guò)1天,揮干母液后得到樣品,樣品溶于pH等于1的鹽酸溶液中放置2天,揮干母液得到衍射樣品。
1.3X-射線衍射測(cè)定單晶結(jié)構(gòu)
選一個(gè)大小為0.12 mm×0.12 mm×0.10 mm的單晶樣品,封入鋰毛細(xì)管中,在Enraf-Nonius CAD4四圓衍射儀上[2],T=291K,以Mo Kα射線(λ=0.710 73?),石墨單色器,ω /2θ 掃描方式收集衍射數(shù)據(jù),衍射指標(biāo)hkl值分別為-16~16、-9~9、-19~13,共收集5o≤2θ ≤50o范圍內(nèi)的獨(dú)立衍射點(diǎn)1580個(gè),其中I>2σ(I)的可觀測(cè)衍射點(diǎn)為1242個(gè),參數(shù)數(shù)目127個(gè),在微機(jī)用直接法(SHEL XS97)解析晶體結(jié)構(gòu)[3-4],從E圖上獲得全部14個(gè)非氫原子位置,用塊對(duì)角矩陣最小二乘法修正結(jié)構(gòu)參數(shù)并判別原子種類,用幾何計(jì)算法與差值Fourier法獲取全部氫原子位置,并用全矩陣最小二乘法修正結(jié)構(gòu)參數(shù),最終可靠因子為R[F2>2σ(F2)]=0.035,ωR(F2)=0.096,(?/σ)max<0.001,最終殘余的最低峰(?ρ)min=-0.19 e/?3,最高峰(?ρ)max=0.18 e/?3,S=1.02。
2.1衍射樣品的合成
2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑的化學(xué)反應(yīng)式如下圖1所示。
圖1 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑的合成路線
2.22-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽單晶X-射線衍射的表征
2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽單晶X-射線衍射樣品結(jié)構(gòu)如圖2所示。標(biāo)題化合物屬單斜晶系,空間群為C2/C,分子式C7H7N4O2+·Cl-,Mr=214.62,晶胞參數(shù)a=13.969(3)?、b=7.8064 (19)?、c=16.490(4)?、β=91.303(3)o、V=1797.7(7) ?3、Z=8,晶胞尺寸為0.12×0.12×0.10 ?3,F(xiàn)000=880,晶胞密度(計(jì)算值)為1.586 Mg·m3。
圖2 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑鹽酸鹽單晶結(jié)構(gòu)
晶體結(jié)構(gòu)中,分子內(nèi)的C-H…Cl 和N-H…Cl及分子間的N-H…Cl作用力使分子形成比較穩(wěn)定的二面體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)如圖4。通過(guò)π-π共軛苯并咪唑環(huán)有很強(qiáng)的穩(wěn)定性。
化合物部分原子坐標(biāo)及熱參數(shù)見(jiàn)表1,化合物參數(shù)(鍵角和鍵長(zhǎng))見(jiàn)表2,化合物氫鍵(鍵長(zhǎng)和鍵角)見(jiàn)表3。化合物分子結(jié)構(gòu)如圖3所示,晶胞堆積如圖4所示。
表1 化合物非氫原子坐標(biāo)及熱參數(shù)(?)
續(xù)表1
表2 化合物鍵角(o)和鍵長(zhǎng)(?)
表3 化合物氫鍵(鍵長(zhǎng)?和鍵角o)
圖3 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑分子結(jié)構(gòu)圖
圖4 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑晶胞堆積圖
以4-硝基苯二胺為原料通過(guò)取代反應(yīng),加成反應(yīng),水解反應(yīng)三步單元反應(yīng)制備2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑,產(chǎn)率高,操作簡(jiǎn)單易行,通過(guò)X-衍射確定產(chǎn)物屬單斜晶系,空間群為C2/C,晶胞參數(shù)a=13.969(3)?、b=7.806 4(19)?、c=16.490(4)?、β=91.303(3)°、V=1 797.7(7) ?3、Z=8,晶胞密度(計(jì)算值)為1.586 Mg·m3。晶體結(jié)構(gòu)中,分子內(nèi)的C-H…Cl 和N-H…Cl及分子間的N-H…Cl作用力使分子形成比較穩(wěn)定的二面體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。
[1] Allen F H, Kennard O, Watson D G, et al. Table of bond lengths determined by X-ray and neutron diffraction[J]. J Chem Soc Perkin Trans, 1987, 2(12): 1-19.
[2] 陳小明, 蔡繼文. 單晶結(jié)構(gòu)分析原理與實(shí)踐[M]. 北京: 科學(xué)出版社, 2003, 41-45.
[3] Sheldrick G M SHELXS 97. Program for Crystal Structure Solution[M]. University of G?ttingen, Germany: 1997.
[4] Sheldrick G M SHELXL 97. Program for Crystal Structure Refinement[M]. University of G?ttingen, Germany: 1997.
Absrtact: The compound 2-amino-6-nitro-1H-benzoimidazol-3-ium chloride was prepared with 4-nitro -phenylenediamine、BrCN and NH4OH by substitution reaction、additive reaction、hydrolysis reaction. Its structure had been determined by X-ray diffraction method. The crystal crystallize in monmclinic system, space group C2/C with C7H7N4O2+·Cl-, Mr=214.62, cell parameters: a=13.969(3)?,b=7.806 4(19)?,c=16.490(4)?,β=91.303 (3)o,V=1 797.7(7) ?3,Dc=1.586 Mg·m3,Z=8,R=0.035,ωR=0.096。The molecules were formed to be a 3-D network through hydrogen bong.
Synthesis and Crystal Structure of 2-Amino-6-Nitro-1H-Benzoimidazol-3-Ium Chloride
Chen You-sheng
(School of Pharmaceutical Engineering, Guangdong Food and Drug Vocational College, Guangzhou 510520, China)
2-amino-6-nitro-1H-benzoimidazol-3-ium chloride; X-ray diffraction; crystal structure
R972
A
1009-220X(2016)03-0049-04
10.16560/j.cnki.gzhx.20160309
2016-03-02
廣東省自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目資助(9151052005000006)。
陳優(yōu)生(1972~),男,江西吉安人,副教授,博士;主要從事藥物合成的研究。yous11@163.com