王曉冰
2016年10月3日,瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎委員會宣布,2016年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎授予日本科學(xué)家大隅良典,因為他發(fā)現(xiàn)了細(xì)胞自噬的機理。大隅良典獨自獲得800萬瑞典克朗(約合人民幣625萬元)獎金。
細(xì)胞自噬是什么?
自噬是細(xì)胞內(nèi)的一種“自食”現(xiàn)象。細(xì)胞自噬已經(jīng)被研究人員研究了60多年,目前的定義是,細(xì)胞自噬是指生物膜(大部分表現(xiàn)為雙層膜,有時多層或單層)包裹部分細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞內(nèi)需要降解的細(xì)胞器、蛋白質(zhì)等形成自噬體,并與內(nèi)涵體形成自噬內(nèi)涵體,最后與溶酶體融合形成自噬溶酶體,降解其所包裹的內(nèi)容物,以實現(xiàn)細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和細(xì)胞器的更新。
通俗地講,細(xì)胞自噬就是細(xì)胞的自我吞噬,通常發(fā)生在細(xì)胞或者機體缺乏能量、或受到環(huán)境脅迫,如缺乏氨基酸、缺氧的情況下,細(xì)胞里會產(chǎn)生雙層膜結(jié)構(gòu),包裹自己的一部分細(xì)胞器,運送到溶酶體進行降解。
自噬的出現(xiàn)是因為細(xì)胞在新陳代謝過程中會不斷產(chǎn)生受損傷的細(xì)胞器,如受損的線粒體、蛋白質(zhì)聚合體等,這就需要細(xì)胞清理它們。通過自噬作用,組織和細(xì)胞對自身不斷地清理,以保持細(xì)胞的穩(wěn)態(tài)平衡。這個作用有點像人用吸塵器清潔衛(wèi)生,用以吸收室內(nèi)各種臟東西,從而保持室內(nèi)清潔和干凈。
自噬這個單詞源于希臘語,希臘語單詞前綴auto意為“自我”,另一個希臘語單詞phagein意為“吞食”,二者組合成一個詞就是自我吞噬。最早研究細(xì)胞自噬并提出這一概念的并非大隅良典,而是比利時科學(xué)家杜夫。他在20世紀(jì)50年代通過電鏡觀察細(xì)胞的內(nèi)部情況時,發(fā)現(xiàn)了溶酶體,是細(xì)胞內(nèi)的一種細(xì)胞器,其功能是處理細(xì)胞攝入的營養(yǎng)物質(zhì)并分解較大的顆粒。與此同時,他也發(fā)現(xiàn)了自噬現(xiàn)象,并且在1963年溶酶體國際會議上首先提出了“自噬”的概念。因此,他和他的同事、電子顯微鏡專家克洛德和帕拉迪分享了1974年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。
細(xì)胞中有三種類型的自噬:大自噬、小自噬和伴侶介導(dǎo)的自噬。大自噬始于杯狀雙層隔離膜的形成(也稱為自噬膜或隔離膜)。隔離膜合閉形成一個成熟的囊泡,如自噬體,最終與溶酶體融合,使自噬體的內(nèi)容物被溶酶體水解酶降解。通常溶酶體被認(rèn)為是作用于壽命較長的蛋白的降解。
小自噬則直接通過溶酶體膜的內(nèi)陷、突出和分離來吞噬細(xì)胞質(zhì)。伴侶介導(dǎo)的細(xì)胞自噬則是直接通過溶酶體伴侶——溶酶體膜受體HSC70和LAMP-2A運輸未折疊蛋白到溶酶體中進行降解。在這三種自噬中,大自噬是最普遍的,常被簡稱并指代自噬。
細(xì)胞自噬與細(xì)胞凋亡(即細(xì)胞自殺)有相似處,也相輔相成,二者共用相同的刺激因素和調(diào)節(jié)蛋白,但是誘發(fā)閾值和門檻不同,它們是如何轉(zhuǎn)換和協(xié)調(diào)的目前還不清楚。細(xì)胞凋亡機理的研究結(jié)果已經(jīng)獲得2002年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(英國的悉尼·布雷內(nèi)、美國的羅伯特·霍維茨和英國的約翰·蘇爾斯頓共同獲獎,因為他們發(fā)現(xiàn)了器官發(fā)育和程序性細(xì)胞死亡即細(xì)胞凋亡過程中的基因調(diào)節(jié)作用)。
另一方面,20世紀(jì)七八十年代,研究人員也發(fā)現(xiàn)了另一種與細(xì)胞自噬相似的蛋白質(zhì)降解(死亡)的現(xiàn)象。一種被稱為泛素的多肽在需要能量的蛋白質(zhì)降解過程中扮演著重要角色。這種多肽由76個氨基酸組成,最初是從小牛的胰臟中分離出來的。它就像標(biāo)簽一樣,被貼上標(biāo)簽的蛋白質(zhì)會被運送到細(xì)胞內(nèi)的“垃圾處理廠”(溶酶體)中被降解。由于這一機理的發(fā)現(xiàn),以色列的阿龍·切哈諾沃、阿夫拉姆·赫什科、美國的歐文·羅斯三人共同獲得2004年的諾貝爾化學(xué)獎。
但是,蛋白質(zhì)降解的機理并不能解釋細(xì)胞是如何降解大的蛋白復(fù)合體和其他廢棄的細(xì)胞器的,細(xì)胞自噬機理的發(fā)現(xiàn)則能解釋這一切。因此,今天,繼蛋白質(zhì)降解后,細(xì)胞凋亡和細(xì)胞自噬成為細(xì)胞生物學(xué)研究最熱門的研究領(lǐng)域。
為何大隅良典獨自獲獎?
按照近年來諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎的慣例,是三人或二人獲獎,而且在細(xì)胞自噬研究中,至少還有另外幾人的研究也具有獨創(chuàng)性和重要意義,但此次卻是大隅良典獨自獲獎。這意味著,諾貝爾獎委員會認(rèn)為大隅良典的發(fā)現(xiàn)更重要和更有創(chuàng)新。
大隅良典最早是在1992年的《細(xì)胞生物學(xué)雜志》(119卷第2期)上發(fā)表了發(fā)現(xiàn)酵母細(xì)胞自噬現(xiàn)象的論文,此后,又在1997年克隆了第一個酵母自噬基因(ATG),命名為ATG1,以及在2000年參與克隆了目前廣泛使用的自噬標(biāo)志物L(fēng)C3。迄今研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)并克隆了40多個ATG基因。
1998年美國研究人員也在細(xì)胞自噬研究中獲得重大發(fā)現(xiàn),美國西南醫(yī)學(xué)中心的貝思·萊文研究小組克隆了第一個哺乳動物自噬基因,命名為Beclin 1,后者實際上是一個抑癌基因,是通過調(diào)節(jié)細(xì)胞自噬的過程來實現(xiàn)抑癌功能。
美國密歇根大學(xué)的丹尼爾·克利昂斯基也在酵母模型的自噬研究中獲得重大成果,1996年在研究蛋白從細(xì)胞質(zhì)到溶酶體的定位過程中,發(fā)現(xiàn)這一過程和細(xì)胞自噬采用了同樣的基因,因而促發(fā)了在后來發(fā)現(xiàn)一系列細(xì)胞自噬的調(diào)節(jié)基因。
如果說大隅良典的研究與其他研究人員有什么區(qū)別,以致諾貝爾獎委員會對其研究青睞有加,就在于他設(shè)計了不同的研究模式,直觀地觀察到細(xì)胞自噬現(xiàn)象和克隆自噬基因,并能合理和圓滿地解釋這一現(xiàn)象。
1988年,大隅良典任東京大學(xué)教養(yǎng)學(xué)部副教授,在博士畢業(yè)后15年擁有了自己的實驗室,并且選擇對酵母液泡降解機制進行深入研究,因為之前還沒有任何人開展這樣的研究。液泡是一種充滿細(xì)胞液的細(xì)胞器,是植物細(xì)胞的主要成分,約占植物細(xì)胞體積的90%,1980年代液泡被簡單地視為惰性細(xì)胞器和廢物存儲庫。
促使大隅良典選擇這一研究內(nèi)容的原因主要是要完成他此前未竟的探索。在美國洛克菲勒大學(xué)進行博士后研究期間(1974~1977),他曾試圖分離出酵母細(xì)胞核,但在離心管的頂層無意發(fā)現(xiàn)了一層明顯的細(xì)胞器,這就是酵母液泡,這些成分原本是要被拋棄的,但他認(rèn)為這種物質(zhì)既然是酵母的細(xì)胞器,相當(dāng)于人類細(xì)胞中的溶酶體,不會沒有功能和作用。
回到日本東京大學(xué)理學(xué)院之后,大隅良典心無旁鶩地認(rèn)真研究起酵母液泡來。經(jīng)過長期觀察,他發(fā)現(xiàn)酵母液泡具有主動運輸物質(zhì)的能力,運輸?shù)奈镔|(zhì)包括氨基酸等代謝物和離子,這種作用對維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)具有重要作用。
為什么酵母液泡主動運輸細(xì)胞內(nèi)的物質(zhì)會穩(wěn)定細(xì)胞?大隅良典一是通過顯微鏡觀察液泡的變化,二是通過設(shè)置一定條件來觀察,以尋求答案。當(dāng)把酵母放置于缺乏營養(yǎng)物質(zhì)的培養(yǎng)條件下,大隅良典發(fā)現(xiàn)酵母細(xì)胞內(nèi)出現(xiàn)了自噬現(xiàn)象。具體過程是,酵母在饑餓狀態(tài)下細(xì)胞內(nèi)會形成孢子樣結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)會使細(xì)胞內(nèi)的代謝產(chǎn)物獲得降解,由此讓酵母細(xì)胞平穩(wěn)地度過艱難的饑荒時期。
大隅良典的發(fā)現(xiàn)當(dāng)然也有機遇,但是機遇特別寵愛像大隅良典這樣有準(zhǔn)備的人。他發(fā)現(xiàn),酵母被饑餓處理幾個小時后,有大量小顆粒積累在液泡內(nèi),這些顆粒能快速晃動,即所謂的布朗運動。這一運動吸引了大隅良典,讓其一連觀察幾小時。布朗運動的產(chǎn)生是因為酵母含有的蛋白成分少,細(xì)胞液黏度小。這些活動的顆粒內(nèi)含部分胞質(zhì)成分,被酵母的單層膜結(jié)構(gòu)約束。
更驚人的發(fā)現(xiàn)是,當(dāng)正常酵母的液泡中存在降解酶時,液泡內(nèi)的胞質(zhì)成分會很快被降解。當(dāng)時的光學(xué)顯微鏡只能放大600倍(今天的光學(xué)顯微鏡放大倍數(shù)已經(jīng)高達2250倍),因此在大隅良典之前并沒有人能直觀地觀察到這種現(xiàn)象。能讓大隅良典直觀地觀察到這個現(xiàn)象的,是酵母細(xì)胞內(nèi)的那些做布朗運動的細(xì)胞顆粒,沒有這些顆粒的運動,也不會吸引大隅良典長時間關(guān)注和研究它們,從而發(fā)現(xiàn)細(xì)胞自噬。
但是,這還不是細(xì)胞自噬的全部內(nèi)容,也即還不能完全證實細(xì)胞自噬。用顯微鏡觀察并證明了自噬現(xiàn)象后,大隅良典要找到產(chǎn)生這種現(xiàn)象的原因,例如發(fā)現(xiàn)和確定引發(fā)自噬的自噬基因。因為如果自噬基因是滅活的,自噬也不會發(fā)生。于是,大隅良典把酵母細(xì)胞暴露在一種化學(xué)物質(zhì)下,并隨意引入多個基因突變,誘導(dǎo)細(xì)胞自噬。在發(fā)現(xiàn)酵母自噬現(xiàn)象后的一年內(nèi),大隅良典從數(shù)千個基因中篩選到自噬基因(ATG),即ATG1。
后來,大隅良典陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了10多個自噬基因,再到近幾年,這樣的基因已經(jīng)被其他研究人員發(fā)現(xiàn)了40多個。在后來的一系列研究中,由這些基因所編碼的蛋白質(zhì)也從功能層面上被識別。這些研究結(jié)果表明,細(xì)胞自噬是由一連串的蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)復(fù)合物所控制,每一個都掌管著自噬體的萌生和形成的不同階段。
這些發(fā)現(xiàn)讓大隅良典推論,細(xì)胞自噬不只是在酵母細(xì)胞中存在,而且在其他動植物的細(xì)胞中也存在。1996年,大隅良典到實驗條件更好的日本岡崎國家基礎(chǔ)生物學(xué)研究所進行研究,經(jīng)過幾年的艱苦工作,大隅良典證明,細(xì)胞自噬是許多動植物細(xì)胞的最基本的功能之一,其主要功能就在于能保持細(xì)胞的穩(wěn)定。
細(xì)胞自噬有什么用?
細(xì)胞自噬與許多疾病、衰老和生命現(xiàn)象相關(guān)。細(xì)胞自噬能夠控制細(xì)胞中重要的生理學(xué)功能,細(xì)胞中的組分需要被降解并且回收利用,細(xì)胞自噬能夠快速提供能量并且為細(xì)胞組分的回收利用提供基本的構(gòu)件,同時細(xì)胞自噬對于細(xì)胞對饑餓及其他壓力的反應(yīng)也至關(guān)重要。在機體感染后,細(xì)胞自噬能夠消滅外來入侵的細(xì)菌和病毒,而且細(xì)胞自噬對于胚胎發(fā)育和細(xì)胞分化也非常關(guān)鍵,細(xì)胞還能夠利用自噬來消除損傷的蛋白質(zhì)和細(xì)胞器,這種細(xì)胞內(nèi)部的質(zhì)量控制機制對于應(yīng)對老化帶來的副作用也發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。
現(xiàn)在,研究人員發(fā)現(xiàn),干擾自噬作用或許與帕金森病、Ⅱ型糖尿病及其他機體障礙直接相關(guān),自噬基因的突變往往也會引發(fā)遺傳性疾病的發(fā)生,干擾自體吞噬過程既可能治療癌癥,也可能誘發(fā)癌癥,因此,研究人員正在根據(jù)自噬的機理和過程進行更為深入的研究,以開發(fā)新型靶向作用的自噬療法,從而治療多種類型的疾病。
以癌癥治療為例,美國芝加哥大學(xué)的研究人員最近發(fā)現(xiàn)抑制細(xì)胞的自噬過程能夠有效阻斷動物腫瘤模型中的乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移,因為自噬在腫瘤轉(zhuǎn)移過程中發(fā)揮了非常重要的作用。研究人員對患癌小鼠進行研究,敲除了癌細(xì)胞中的自噬關(guān)鍵基因ATG5和ATG7,隨后在顯微鏡下觀察癌細(xì)胞的遷移運動情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)對照組癌細(xì)胞的遷移運動比較活躍,但敲除自噬關(guān)鍵基因的癌細(xì)胞不能移動,它們似乎被卡住了。這也意味著利用這一點可以阻止癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。因為,自噬是高度轉(zhuǎn)移性腫瘤細(xì)胞運動和侵襲所必須的一個生物學(xué)過程。抑制自噬或許是臨床上阻斷腫瘤轉(zhuǎn)移擴散的一個有效方法。
同時,結(jié)合自噬作用也可以讓藥物治癌(化療)產(chǎn)生更好的效果。美國科羅拉多大學(xué)癌癥中心的索伯恩等人最近的一項研究顯示,腫瘤受到抗癌藥物的攻擊時,一些較敏感的細(xì)胞死亡,但另一些有抵抗力的細(xì)胞存活下來。原因在于這些敏感細(xì)胞和抵抗細(xì)胞之間存在自噬凈化自己的能力不同。
例如,用一種稱為IC-50的藥物處理癌細(xì)胞,50%的癌細(xì)胞會死亡,但另外50%的細(xì)胞能夠存活。為什么有這種差異呢?研究發(fā)現(xiàn),這取決于細(xì)胞自噬水平的差異。因為,自噬可以在壓力條件下幫助細(xì)胞生存,例如分解掉非必需的組分來提供能量,或者降解掉有破壞性的蛋白避免細(xì)胞損傷。
因此,自噬水平低的癌細(xì)胞在接受藥物處理時死亡率會更高。但實際上研究人員發(fā)現(xiàn),癌細(xì)胞死亡率的高低不僅依賴于細(xì)胞的自噬水平,還取決于抗癌藥物的作用機制。根據(jù)自噬水平的高低將細(xì)胞分組,然后用兩種激活細(xì)胞死亡受體的藥物處理細(xì)胞。用第一種藥物處理時,自噬水平高的細(xì)胞死亡率最高;用第二種藥物處理時,自噬水平低的細(xì)胞死亡率最高??梢?,使用的藥物不同,自噬的影響相反。
而且,用一些生物分子激活細(xì)胞自噬也能幫助治療癌癥。一項研究發(fā)現(xiàn),腫瘤壞死因子受體(TNFR)的跨膜蛋白通過激活細(xì)胞的死亡受體和細(xì)胞自噬,使細(xì)胞進入程序性死亡(凋亡)。例如,F(xiàn)as(Apo-1/CD95)和TRAIL就是腫瘤壞死因子受體(TNFR)家族的跨膜蛋白,它們介導(dǎo)細(xì)胞凋亡。這一過程是通過激活細(xì)胞自噬來完成的,激活細(xì)胞自噬后使得細(xì)胞的致死率或者上升或者下降,因此Fas和TRAIL介導(dǎo)具體細(xì)胞(癌細(xì)胞)的凋亡效果是不同的。自噬水平高的細(xì)胞對Fas更為敏感,而自噬水平低的細(xì)胞對TRAIL更為敏感,從而促使細(xì)胞凋亡。最重要的是,研究人員在不同類型的癌細(xì)胞中也觀察到了類似的差異。
原因在于,一些癌細(xì)胞含有FAP-1蛋白,這種蛋白能夠降低Fas殺死細(xì)胞的能力。但自噬會將這種蛋白降解,從而使細(xì)胞對Fas更為敏感。顯然,自噬的這種作用只對含有FAP-1蛋白的細(xì)胞有效。
這提示,在治療癌癥時可以根據(jù)不同癌細(xì)胞自噬的機理和過程配以不同的藥物,以取得更好的療效。
最近的研究還發(fā)現(xiàn),自噬與人的肥胖也有關(guān)。人體內(nèi)存在棕色和白色兩種脂肪,前者引起肥胖,因為白色脂肪堆積在皮下,負(fù)責(zé)儲存多余熱量;但棕色脂肪阻止肥胖,因為棕色脂肪負(fù)責(zé)分解引發(fā)肥胖的白色脂肪,將后者轉(zhuǎn)化成二氧化碳、水和熱量,本身不儲存熱量。所以,棕色脂肪具有減肥功效。
美國加州大學(xué)舊金山分校的研究人員最近 在《細(xì)胞代謝》上發(fā)表的論文指出,自噬介導(dǎo)的線粒體清除是導(dǎo)致棕色脂肪細(xì)胞向白色脂肪細(xì)胞轉(zhuǎn)變的一個關(guān)鍵調(diào)控過程,抑制該過程可以維持棕色脂肪細(xì)胞的形態(tài)和功能,從而可以讓白色脂肪細(xì)胞棕色化,找到治療肥胖或減肥的新方法。
其中的機理是,在撤除外部刺激之后,棕色脂肪細(xì)胞會逐步失去形態(tài)學(xué)和分子特征,直接獲得白色脂肪細(xì)胞樣特征。與此同時,棕色脂肪細(xì)胞向白色脂肪細(xì)胞轉(zhuǎn)變與線粒體數(shù)目下降、自噬增加以及MiT/TFE轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)的溶酶體生成激活有密切關(guān)聯(lián)。自噬途徑對于這個轉(zhuǎn)變過程中線粒體的清除至關(guān)重要,在脂肪細(xì)胞中特異性敲除ATG5或ATG12基因,可以抑制自噬,從而能夠阻止外部刺激撤除之后棕色脂肪細(xì)胞喪失,由此可以讓棕色脂肪細(xì)胞維持高產(chǎn)熱能力,抵抗人們因飲食誘導(dǎo)的肥胖和胰島素抵抗。
因此,自噬不僅與疾病治療有關(guān),也與生命代謝、衰老有關(guān)。在自噬的原理充分揭示后,將會引發(fā)更多的醫(yī)療和藥物變革,造福于公眾。