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環(huán)狀RNA:心力衰竭新的生物標(biāo)志物

2017-01-13 01:28:57施冰李俊峽
關(guān)鍵詞:內(nèi)含子環(huán)狀外顯子

施冰,李俊峽

環(huán)狀RNA:心力衰竭新的生物標(biāo)志物

施冰1,李俊峽2

環(huán)狀RNA(circRNAs)是1976年發(fā)現(xiàn)的一類特殊的非編碼RNA,呈共價(jià)閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)。環(huán)狀RNA不具有5′端多聚A尾和3′端帽子結(jié)構(gòu),也不被核糖核酸外切酶降解[1]。由于環(huán)狀RNA的特殊結(jié)構(gòu),核酸外切酶無(wú)法將其降解,因此它們比多數(shù)線性RNA更加穩(wěn)定。環(huán)狀RNA序列高度保守,具有組織特異性和發(fā)育階段特異性表達(dá)的特征[2]。隨著環(huán)狀RNA芯片和二代測(cè)序技術(shù)的廣泛應(yīng)用,有關(guān)環(huán)狀RNA在心血管疾病的研究已引起人們的廣泛重視。本文就環(huán)狀RNA的分類、功能及其在心力衰竭的研究進(jìn)展進(jìn)行簡(jiǎn)要綜述。

1 circRNAs的分類

根據(jù)circRNAs來(lái)源于基因組的不同位點(diǎn),將circRNAs分為以下5類:①外顯子環(huán)狀RNA,來(lái)源于線性轉(zhuǎn)錄體的同一條意義鏈中的一個(gè)或多個(gè)外顯子。最近,科學(xué)家們已構(gòu)建了一個(gè)包含超過(guò)32 000條人類外顯子circRNAs的數(shù)據(jù)庫(kù)circRNADb[3]。②內(nèi)含子環(huán)狀RNA,來(lái)源于線性轉(zhuǎn)錄體的同一個(gè)內(nèi)含子。③反義鏈環(huán)狀RNA,來(lái)源于線性轉(zhuǎn)錄體的反義鏈的一個(gè)或多個(gè)外顯子。④基因區(qū)內(nèi)環(huán)狀RNA,源于線性轉(zhuǎn)錄體上與內(nèi)含子或外顯子相隔1 kb內(nèi)的基因區(qū)域。⑤基因間區(qū)環(huán)狀RNA,來(lái)源于線性轉(zhuǎn)錄體上與內(nèi)含子或外顯子相隔1 kb以上的基因間隔區(qū)域。

2 circRNAs的生物學(xué)功能

研究發(fā)現(xiàn)circRNAs具有以下功能:microRNAs海綿[4,5];調(diào)節(jié)剪切或轉(zhuǎn)錄[6,7];與RNA結(jié)合蛋白(RBPs)相互作用調(diào)節(jié)基因表達(dá)[8,9]。微小RNA(miRNA)可與特定的mRNA的3′端非翻譯區(qū)堿基互補(bǔ)配對(duì),抑制其翻譯,甚至可引起靶mRNA的降解。circRNAs能夠與miRNA結(jié)合,解除miRNA對(duì)mRNA的抑制,從而調(diào)節(jié)多種細(xì)胞功能,因此circRNAs又稱為miRNA海綿。

在真核生物中,circRNAs作為microRNAs海綿發(fā)揮作用是一種普遍現(xiàn)象。如ciRS-7/CDR1AS具有70個(gè)miR-7的結(jié)合位點(diǎn),可吸附miR-7抑制其生物功能。circ-Sry具有16個(gè)miR-138的結(jié)合位點(diǎn),可吸附miR-138并發(fā)揮基因調(diào)節(jié)作用[4]。除了作為miRNA海綿發(fā)揮生物學(xué)功能,circRNAs還可以通過(guò)與RNA聚合酶Ⅱ相結(jié)合促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄,以及通過(guò)影響基因剪切過(guò)程而發(fā)揮生物學(xué)功能。文獻(xiàn)報(bào)道,circRNAs-EI可通過(guò)與U1snRNP和RNA聚合酶Ⅱ相互作用促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄[6]。circRNAs可與RBPs相互作用而發(fā)揮生物學(xué)功能。如circRNAs-Mbl有MBL蛋白結(jié)合位點(diǎn)。MBL與circRNAs-Mbl相互結(jié)合使circRNAs-Mbl與mbl mRNA的生成處于動(dòng)態(tài)平衡[7], circ-Foxo3與CDK2、p21形成復(fù)合體而阻止細(xì)胞周期進(jìn)程[8]。

3 circRNAs與心力衰竭

在人類心臟中,基因titin和基因RYR2可表達(dá)大量的不同的circRNAs[10,11]。目前,在心血管系統(tǒng)疾病中,有9個(gè)環(huán)狀RNAs(HRCR、CDR1AS、Circ-foxo3、cZNF292、cTTN1、cTTN2、cTTN4、cTTN5、MICA)已被報(bào)道與心肌肥厚、心力衰竭、心肌梗死、左心室收縮功能不全、心肌缺氧、擴(kuò)張性心肌病等相關(guān)[7,12-15]。環(huán)狀RNAcZNF292存在于血管內(nèi)皮并被缺氧所介導(dǎo),在缺氧心肌可見(jiàn)cZNF292表達(dá)上調(diào)[15]。在心力衰竭患者心肌組織中,四種與RBM20相關(guān)的環(huán)狀RNAcTTN1、cTTN2、cTTN4、cTTN5表達(dá)顯著下調(diào),其表達(dá)變化與RBM20基因的可變剪接相關(guān)[10]。

心臟相關(guān)circRNA(HRCR)是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的與心血管疾病相關(guān)的環(huán)狀RNA。HRCR可在小鼠心肌組織中表達(dá),在小鼠心肌肥厚和心衰模型中,心肌組織中HRCR表達(dá)被抑制。miR-223轉(zhuǎn)基因小鼠可以出現(xiàn)心力衰竭,而miR-223基因敲除小鼠未發(fā)生心力衰竭,提示miR-223在心力衰竭的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中具有重要意義。Wang等[7]發(fā)現(xiàn)miR-223可通過(guò)調(diào)節(jié)包含CARD域的細(xì)胞凋亡抑制因子(ARC)從而導(dǎo)致心力衰竭的發(fā)生和發(fā)展。在心肌細(xì)胞中ARC呈高水平表達(dá),ARC是miR-223的下游靶標(biāo)。HRCR作為內(nèi)源性miR-223海綿,通過(guò)吸附miR-223而抑制miR-223的表達(dá),抑制miR-223活性,使下游ARC的表達(dá)增加,從而抑制心力衰竭。

研究發(fā)現(xiàn),在小鼠心肌梗死模型中,隨著心肌梗死面積擴(kuò)大,心肌組織中環(huán)狀RNA CDR1AS表達(dá)上調(diào)[13]。CDR1AS具有促凋亡作用,與miR-7的抗凋亡作用一致。小鼠心臟組織中過(guò)表達(dá)CDR1AS可導(dǎo)致心肌梗死后梗死面積擴(kuò)大。而這種作用可被miR-7的過(guò)表達(dá)所抑制。miR-7a可通過(guò)抑制促凋亡因子PARP及轉(zhuǎn)錄因子SP1的表達(dá)而抑制心肌細(xì)胞凋亡。CDR1AS通過(guò)吸附miR-7a,抑制了miR-7a的作用,導(dǎo)致心肌組織中PARP及SP1表達(dá)水平上調(diào),加重心肌梗死后心肌細(xì)胞凋亡,過(guò)表達(dá)miR-7a可逆轉(zhuǎn)上述作用[13]。

4 總結(jié)與展望

環(huán)狀RNA作為一類新型的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源性RNA(ceRNA),具有作為生物標(biāo)志物的潛質(zhì)。與其他類型的ceRNA相比,環(huán)狀RNA具有高度保守、結(jié)構(gòu)穩(wěn)定、表達(dá)量高、穩(wěn)定性強(qiáng)、與miRNA結(jié)合位點(diǎn)更多等優(yōu)點(diǎn)。環(huán)狀RNA與miRNA的結(jié)合和釋放也更加快速和穩(wěn)定。對(duì)miRNA的競(jìng)爭(zhēng)性抑制有明顯的優(yōu)越性。由于高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,在人類和小鼠的組織中已識(shí)別了近千個(gè)細(xì)胞特異的環(huán)狀RNA位點(diǎn)。環(huán)狀RNA存在于全血、血漿和細(xì)胞外囊泡中,檢測(cè)便捷。目前有關(guān)circRNAs在心血管疾病的研究才剛剛起步,僅發(fā)現(xiàn)幾種與心血管疾病相關(guān)的circRNAs。隨著研究的深入,相信會(huì)發(fā)現(xiàn)更多與心血管疾病相關(guān)的circRNAs及其作用機(jī)制,為心血管疾病診斷及治療提供新的思路和治療靶點(diǎn)。

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本文編輯:孫竹

R541.61

A

1674-4055(2017)08-1008-02

全軍后勤重點(diǎn)課題基金項(xiàng)目(14BJL001)

1100700 北京,陸軍總醫(yī)院干一科;2100700 北京,陸軍總醫(yī)院心血管內(nèi)科

李俊峽,E-mail:18600090805@163.com

10.3969/j.issn.1674-4055.2017.08.40

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