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山杏種質(zhì)資源遺傳多樣性研究方法及現(xiàn)狀

2017-04-05 12:17:03王璐曹穎
防護林科技 2017年5期
關鍵詞:山杏種質(zhì)遺傳

王璐,曹穎

(遼寧省林業(yè)種苗管理總站,遼寧 沈陽 110036)

山杏種質(zhì)資源遺傳多樣性研究方法及現(xiàn)狀

王璐,曹穎

(遼寧省林業(yè)種苗管理總站,遼寧 沈陽 110036)

山杏是亞洲特有的經(jīng)濟樹種,在我國北方地區(qū)廣泛分布,開展山杏遺傳多樣性研究有著重要意義。本文主要從形態(tài)標記、細胞標記、蛋白質(zhì)標記和DNA標記等四方面介紹遺傳多樣性的研究方法,以及山杏種質(zhì)資源的研究現(xiàn)狀,為今后對山杏種質(zhì)資源遺傳多樣性的研究奠定基礎。

山杏;種質(zhì)資源;遺傳多樣性;研究方法

山杏(Armeniacasibirica),薔薇科(Rosaceous),杏屬(ArmeniacaMill.),一般為落葉喬木,作為亞洲特有的既具有生態(tài)性又具有經(jīng)濟性的樹種,它主要分布的地區(qū)為俄羅斯的西伯利亞地區(qū),蒙古的東部、東南部地區(qū)以及我國的內(nèi)蒙古、黑龍江、吉林、遼寧、山西等地區(qū),在新疆和西藏等部分地區(qū)也有一定分布[1]。山杏花可作為蜜源;山杏木材可制作家具;山杏肉含多種維生素和礦物質(zhì)等;山杏仁營養(yǎng)成分很高,也是重要的中藥材。山杏具有抗寒、抗旱、耐高溫、耐瘠薄等特性,能夠固沙保土、涵養(yǎng)水源、美化環(huán)境。但由于山杏長期處于無人問津的狀態(tài),使其有價值的、具有優(yōu)良性狀的種質(zhì)資源未被發(fā)現(xiàn)和認識[2-4]。

遺傳多樣性,廣義上是指地球上所有生物攜帶的遺傳信息的總和,即在個體形態(tài)、細胞和分子等水平上的種內(nèi)或種間的遺傳變異程度[5,6]。遺傳多樣性的變異主要體現(xiàn)在個體的表型、細胞學的特征、DNA序列和基因位點等方面。遺傳多樣性是物種發(fā)展的核心,與物種的進化速率呈正相關,即遺傳多樣性越豐富,該物種順應環(huán)境的生長能力就越強,更有利于其生長領域擴散[7]。對物種遺傳多樣性的研究不但能夠剖析其進化史、了解其進化潛力,還能夠揭示其遺傳變異的水平、時空分布和環(huán)境條件三者之間的關系[8]。因此分析遺傳多樣性是保護資源必不可少的工作之一[9]。

1 遺傳多樣性研究方法

1.1 形態(tài)標記

形態(tài)標記,是指通過肉眼觀察可以辨識的特征,即基因的外在表現(xiàn)形式,是基因和環(huán)境條件共同調(diào)控的。非人工干預條件下,極少出現(xiàn)單基因控制的性狀,稀有突變等耗時過長且多為有害突變,可以通過某性狀出現(xiàn)次數(shù)或頻率的數(shù)量化處理,以分布表或圖的形式來表現(xiàn)單基因性狀。多基因性狀可以通過計數(shù)、測定、稱量等方式進行衡量,并對獲得的數(shù)字材料進行數(shù)理統(tǒng)計和遺傳參數(shù)計算等,從而反映遺傳變異程度。

1.2 細胞標記

細胞標記,是指對細胞內(nèi)染色體的變異進行的標記,其中染色體的變異主要有染色體數(shù)量、組數(shù)、大小、隨體、著絲點等的變異。植物顯微鏡和組織切片技術的發(fā)展使得人們可以較為準確的通過細胞標記來研究物種的分類與演化,但細胞標記材料制備難度較大、易受觀察時機與制片技術的影響,且大多數(shù)種、變種或變型染色體數(shù)目、形態(tài)極為相似、難以區(qū)分,同時染色體標記數(shù)目的有限性限制了細胞標記的使用。

1.3 蛋白標記

蛋白標記,是指對植物新陳代謝產(chǎn)生的獨特生化產(chǎn)物的標記,主要有同工酶、等位酶和種子貯藏蛋白等標記。

1.4 DNA標記

DNA標記是基于物種DNA的遺傳多樣性的標記方法[12]。DNA標記可以檢測不同研究材料間遺傳物質(zhì)的相似性、親緣性及進化地位[13],個體遺傳變異性和穩(wěn)定性較高,其優(yōu)點包括:不受環(huán)境條件、發(fā)育期和顯隱性基因型等限制;標記點位多,且大多點位多態(tài)性水平高;大多標記表現(xiàn)為共顯性,能夠辨別雜合和純合基因型,并完整的表達基因型等[14]。按技術原理可將DNA標記分為以下三類:

(1)以分子雜交為基礎的標記技術(Southern雜交)。如限制性片段長度多態(tài)性標記(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP)等。RFLP是第一個被用于遺傳學研究的DNA標記技術[11,15]。

(2)以聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction, PCR)為基礎。如簡單序列重復標記(simple sequence repeats, SSR)、簡單重復序列間擴增(inter-simple sequence repeats, ISSR)、擴展片段長度多態(tài)性標記(aillphfied fragment length polymorphism, AFLP)等。

(3)以基因組測序結(jié)果為基礎的分子標記。如表達序列標簽(expressed sequences tags, EST-SSR)、單核普酸多態(tài)性(single nucleotides polymorphism, SNP)等。

2 山杏遺傳多樣性研究現(xiàn)狀

近些年來,國外在山杏種質(zhì)資源研究領域取得了很大進展,篩選出來一批優(yōu)良的種質(zhì)資源[10]。應用分子生物技術研究山杏種質(zhì)資源取得一定進展。從開展形態(tài)標記研究、細胞標記研究、蛋白質(zhì)標記研究到如今的DNA標記研究,山杏種質(zhì)資源的遺傳結(jié)構、遺傳變異和演化歷史越發(fā)清晰。與國外發(fā)達國家相比,我們對山杏種質(zhì)資源研究領域研究較少,與我國所擁有的山杏資源現(xiàn)狀極不協(xié)調(diào),而對山杏的調(diào)查研究幾乎為零。

2.1 形態(tài)標記分析

趙桂玲[2]對遼寧西部地區(qū)開展山杏種質(zhì)資源及遺傳多樣性的調(diào)查研究工作,采用訪問調(diào)查、路線普查與樣點調(diào)查相結(jié)合的方法對山杏種質(zhì)資源進行實地調(diào)查。通過對數(shù)量性狀變異研究和正態(tài)性的檢驗結(jié)果可以得出,在山杏群體內(nèi)部花、葉、果實、核、仁等的數(shù)量性狀呈現(xiàn)正態(tài)分布的結(jié)論,由此可知,這些性狀是由多基因控制的[21]。通過形態(tài)標記,發(fā)現(xiàn)山杏變異在形態(tài)方面,主要表現(xiàn)在花、葉、果實、核、仁、樹、抗逆性等7個方面,分析后得出冠幅是與山杏產(chǎn)量最相關的樹體因子的結(jié)論,而樹高、干徑、綠層高等樹體因子與產(chǎn)量也有一定關系[2]。

李明、趙忠等[22]運用SPSS和DPS分析方法,得出如下結(jié)論:山杏種質(zhì)資源變異類型較多,種質(zhì)資源豐富,主要由自交不親和、不同地域間引種和受環(huán)境條件影響等原因造成;數(shù)量性狀變異較大,其中葉面積、果重、核重、出核率變異較為突出,由此可見山杏品種改良潛力巨大;核、仁的數(shù)量性狀及其葉柄長度、葉形指數(shù)、果實指數(shù)等與核重、仁重等豐產(chǎn)經(jīng)濟性狀呈顯著相關。這一結(jié)論為選育高產(chǎn)品種提供主要選擇指標。[22]

趙海娟,劉威生等[23]運用SPSS數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析方法分析品質(zhì)性狀與植物學性狀的關系,得出單果品質(zhì)性狀與其葉片長度、寬度和葉柄長度呈正相關性。

2.2 蛋白質(zhì)標記分析

趙桂玲運用蛋白質(zhì)標記(山杏葉片POD同工酶和種子可溶性蛋白PAGE技術),證實晚花、豐產(chǎn)的可遺傳性[2]。

劉明國,趙桂玲等運用PAGE技術分析方法對山杏POD同工酶及種子可溶性蛋白質(zhì)進行分析,研究晚花、豐產(chǎn)、抗凍等優(yōu)良遺傳特性及分類,山杏葉片POD同工酶和種子可溶性蛋白質(zhì)多態(tài)、有活力且穩(wěn)定,并具有準確性高和所含信息量大等特點,可以作為遺傳變異標記。山杏種子可溶性蛋白SDS-PAGE電泳分析發(fā)現(xiàn),山杏種子可溶性蛋白質(zhì)含量豐富(約200g/kg)、蛋白質(zhì)譜帶清晰、穩(wěn)定,是進行山杏遺傳分類研究的重要依據(jù)。[24]

李明、趙忠等在形態(tài)標記基礎上,選取具有典型形態(tài)的山杏,運用考馬斯亮藍G-250染色法和SDS-PAGE電泳法對種子可溶性蛋白質(zhì)含量等進行檢測分析,結(jié)果表明山杏遺傳范圍廣,有較大潛力改良其育種。[25]

2.3 DNA標記分析

劉華波、王哲等運用SSR分子標記技術的分析方法,對山杏進行遺傳多樣性分析。根據(jù)有效等位基因數(shù)(Ne)、期望雜合度(He)和Shannon信息指數(shù)(I)等3個遺傳多樣性參數(shù)分析,發(fā)現(xiàn)山杏具有較高的遺傳多樣性,由此可以為山杏種質(zhì)資源收集保護奠定基礎。[26]

馬麗娟,郭太君等[27,28]以及白玉娥、烏日恒等[4]運用ISSR分子標記技術研究山杏種質(zhì)資源遺傳多樣性,根據(jù)多態(tài)性條帶百分比(PPL)Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)、Shannon信息指數(shù)(I)、等位基因數(shù)(Na)、效等位基因數(shù)(Ne)等遺傳多樣性參數(shù),得出如下結(jié)論:山杏的遺傳變異平均分布于種群內(nèi)部;山杏種間也有基因交流;晚花群體遺傳多樣性高于早花群體;早花群體與晚花群體之間存在遺傳分化。

萬冬梅、吳月亮等[29]運用SRAP分子標記,對25個山杏無性系的遺傳多樣性進行分析研究,并運用NTSYS計算,發(fā)現(xiàn)山杏多態(tài)性高,同時也明確了各種質(zhì)之間的親緣關系,研究結(jié)果為山杏雜交育種親本選擇提供依據(jù)。

3 分析與展望

山杏作為亞洲特有的經(jīng)濟樹種,能夠為我們帶來不可估量的生態(tài)、經(jīng)濟價值,研究其遺傳多樣性可以了解起源馴化,并為良種選育和資源保護提供重要理論依據(jù)及技術基礎。遺傳多樣性的研究方法多種多樣,其中DNA標記方法最受青睞,它可以彌補形態(tài)標記、蛋白質(zhì)標記等方法中的缺陷,但是DNA標記也不是適用于任何情況的理想標記方法,所以形態(tài)標記、蛋白質(zhì)標記與多種DNA分子標記的結(jié)合運用將會成為未來遺傳性狀的主要研究方法。在擴大山杏調(diào)查范圍的同時,運用更加科學合理的技術手段,將會更好地研究山杏種質(zhì)資源遺傳多樣性,為山杏種質(zhì)資源的保存提供依據(jù),為山杏良種選育奠定更好的基礎。

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1005-5215(2017)05-0080-03

2017-03-12

王璐(1990-),女,遼寧沈陽人,大學,工程師,現(xiàn)從事林木良種培育研究.

S602.4

A

10.13601/j.issn.1005-5215.2017.05.029

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