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沈撫灌渠底泥石油降解菌株“ODF—3”的篩選和鑒定

2017-04-12 00:00:00袁野張夢(mèng)琦吳喬峰張瑩顏佳興卜寧
南方農(nóng)業(yè)·上旬 2017年5期

摘 要 從沈撫污灌渠三寶屯附近采集長(zhǎng)期被石油嚴(yán)重污染的底泥樣品,以原油為唯一碳源,采用富集培養(yǎng)、平板涂布、平板劃線等方法,篩選得到9株石油降解菌,其中4株為細(xì)菌、5株為真菌;通過(guò)形態(tài)學(xué)觀察和18S rDNA序列比對(duì)分析,對(duì)其中1株真菌菌株(ODF-3)進(jìn)行鑒定,確定其為煙曲霉(Aspergillus sp.),與模式種Aspergillus fumigatus的相似度為99%。將菌株在偏酸環(huán)境中培養(yǎng)2 d后投放使用,其穩(wěn)定性與降解速率最好。

關(guān)鍵詞 污灌渠底泥;石油降解菌;篩選;鑒定;煙曲霉

中圖分類(lèi)號(hào):X53 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A DOI:10.19415/j.cnki.1673-890x.2017.13.018

知網(wǎng)出版網(wǎng)址:http://kns.cnki.net/kcms/detail/50.1186.s.20170508.2146.017.html 網(wǎng)絡(luò)出版時(shí)間:2017-5-8 21:46:00

沈撫灌區(qū)位于遼寧省沈陽(yáng)和撫順兩市的近郊區(qū),該污水灌渠作為國(guó)內(nèi)最早建設(shè)的污水灌渠至今已運(yùn)行幾十年,雖然灌渠曾經(jīng)為農(nóng)業(yè)灌溉發(fā)揮過(guò)作用,但所造成的地下水污染和農(nóng)作物的污染,給人居環(huán)境造成的影響和危害是極大的[1]。其上游和中游地區(qū)從 20 世紀(jì) 40 年代末就已經(jīng)開(kāi)始接受主要來(lái)自撫順石油二廠的污水灌溉。隨著工業(yè)的迅猛發(fā)展和人口的增加,大量超標(biāo)污水未經(jīng)處理長(zhǎng)年直接排入灌渠中,導(dǎo)致灌渠內(nèi)水質(zhì)日趨惡化,灌區(qū)土壤中芳烴、揮發(fā)酚、重金屬等污染物嚴(yán)重超標(biāo),土壤通透性下降,肥力減低,土壤(尤其是底泥)微生物種群發(fā)生了很大改變(有較多的嗜油菌),灌區(qū)土壤生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)與功能被嚴(yán)重破壞[2]。由于生物降解法具有獨(dú)特的優(yōu)越性,利用微生物降解烴類(lèi)物質(zhì)的能力來(lái)消除石油污染已經(jīng)越來(lái)越受到人們的重視[3]。探明沈撫灌區(qū)這樣一個(gè)特殊環(huán)境下微生物種群的組成結(jié)構(gòu),開(kāi)展與土壤生物修復(fù)有關(guān)的基礎(chǔ)性研究以及提出具有經(jīng)濟(jì)效益的污染防治措施,具有重要的理論和實(shí)踐研究?jī)r(jià)值[4]。

1材料與方法

1.1材料

1.1.1 污灌底泥

2014年10月底2015年3月初,于遼寧省撫順市沈撫灌渠三寶屯附近用采泥器取污灌渠底泥,規(guī)定距離處分東西南北4個(gè)方位分別用采樣工具采集0~20 cm的地面土,采集后混合均勻,將樣品立即帶回實(shí)驗(yàn)室,置于4℃保存?zhèn)溆肹4]。

1.1.2 原油

由撫順石油二廠提供。

1.1.3 儀器與試劑

1.1.3.1儀器

實(shí)驗(yàn)中所用的主要儀器列于表1。

1.1.3.2試劑

真菌基因組DNA快速抽提試劑盒:生工生物(上海)股份有限公司。

PCR擴(kuò)增試劑盒:生工生物(上海)股份有限公司。

18S rDNA序列擴(kuò)增引物:生工生物(上海)股份有限公司合成。

1.1.4 培養(yǎng)基

1.1.4.1富集培養(yǎng)基

將污灌底泥樣品1 g分別加入100 mL牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基、100 mL馬鈴薯培養(yǎng)基中制備成富集培養(yǎng)基。

1.1.4.2石油平板培養(yǎng)基

無(wú)機(jī)鹽培養(yǎng)基:MgSO4·7H2O 0.5 g、CaCl2 0.02 g、KH2PO4 1.0 g、NH4NO3 1.0 g、FeCl3 0.05 g、瓊脂20 g,原油適量,pH值調(diào)至7.0。

1.1.4.3馬鈴薯液體培養(yǎng)基(PDA培養(yǎng)基)

馬鈴薯 200 g,葡萄糖20 g,水1 000 mL,pH值自然。

1.1.4.4牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基

牛肉膏 3 g、蛋白胨10 g、NaCl 5 g、水1 000 mL,pH值7.0~8.0。

1.2方法

1.2.1 石油降解菌的富集、分離、純化

分別在含有污灌底泥的富集牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基、馬鈴薯液體培養(yǎng)基中,接入底泥懸浮液,于37℃、24℃,120 rpm搖床培養(yǎng)1周;然后,取一定量的上述富集培養(yǎng)液接入100 mL新鮮富集培養(yǎng)液中,再次于37℃、24℃,120 rpm搖床培養(yǎng)1周。采用稀釋平板法分離石油降解菌[5]。將富集培養(yǎng)液按10倍稀釋法稀釋?zhuān)?0-4~10-6倍培養(yǎng)液各0.1 mL涂布于含油固體培養(yǎng)基上,置于37℃、24℃恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),每個(gè)濃度設(shè)3個(gè)重復(fù)。恒溫培養(yǎng)24 h后,觀察菌株生長(zhǎng)情況。待平板上長(zhǎng)出菌落時(shí),選取具有優(yōu)勢(shì)、不同顏色及形態(tài)的單菌落,在油平板上多次劃線分離純化,以得到形態(tài)一致的單菌落。將純化菌株接種于試管斜面培養(yǎng)基后保存于4℃冰箱。

1.2.2 石油降解真菌ODF-3菌株的形態(tài)學(xué)觀察

菌落形態(tài)觀察:將石油降解真菌ODF-3接種于PDA平板上,25℃條件下,倒置培養(yǎng)數(shù)天,觀察記錄菌株的生長(zhǎng)速度,菌落形態(tài),有無(wú)同心螺紋,是否有色素產(chǎn)生等。用平皿插片法觀察菌株的顯微形態(tài)特征[6]。

菌絲形態(tài)觀察:將石油降解真菌ODF-3接種于PDA平板上,插片,置25℃恒溫箱中培養(yǎng)數(shù)天,取出用光學(xué)顯微鏡觀察菌絲大小、形狀、表面特征以及是否有隔,是否有孢子以及孢子大小、形狀、類(lèi)型、顏色等。參照戴芳滿(mǎn)的《中國(guó)真菌總匯》和魏景超的《真菌鑒定手冊(cè)》對(duì)石油降解真菌ODF-3進(jìn)行形態(tài)學(xué)的分類(lèi)鑒定[6]。

1.2.3 分子生物學(xué)鑒定

采用真菌基因組DNA提取試劑盒提取基因組DNA作為PCR模版[4]。以18S-ITS1:5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′和18S-ITS4:5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′為引物進(jìn)行擴(kuò)增[7]。PCR產(chǎn)物的純化和測(cè)定由生工生物(上海)股份有限公司完成。PCR反應(yīng)體系見(jiàn)表2,反應(yīng)條件見(jiàn)表3。將測(cè)得的18S rDNA序列在GenBank中進(jìn)行BLAST分析,根據(jù)序列同源性確定菌種[8-10],構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

1.2.4 石油降解真菌ODF-3的系統(tǒng)發(fā)育分析

用Mega 6.0對(duì)測(cè)得的序列和相關(guān)參考序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建,以及系統(tǒng)進(jìn)化分析[8-9]。

1.2.5 石油降解真菌ODF-3菌株的生物學(xué)物性研究

1.2.5.1菌株的活化

將保藏狀態(tài)的石油降解真菌ODF-3菌株放入適宜的培養(yǎng)基中培養(yǎng)。用移液管移取0.3~0.4 mL冷藏菌液滴入無(wú)菌水中輕輕震蕩,溶解成懸浮狀液體。再取出0.2 mL菌懸液轉(zhuǎn)接于PDA培養(yǎng)基斜面,將剩余的菌液注入PDB培養(yǎng)基中,在25℃、135 rpm的恒溫培養(yǎng)箱中震蕩3 d后,備用[10]。

1.2.5.2菌株的生長(zhǎng)曲線測(cè)定

將已經(jīng)活化的石油降解真菌ODF-3菌液接種到已滅菌的PDB培養(yǎng)基中,置25℃、135 rpm的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),在0, 6, 12, 18, 24, 30, 42, 54, 66, 78, 80, 92 h分別取3瓶菌液進(jìn)行過(guò)濾,105℃或100℃烘干至恒重,測(cè)定其干重并記錄數(shù)據(jù)[11]。

1.2.5.3菌株的初始pH值測(cè)定

配制pH值分別為3, 4, 5, 6, 7, 8, 9的7組PDB培養(yǎng)基,將已活化好的石油降解真菌ODF-3菌液分別接種其中,每組3瓶;于25℃、135 rpm的恒溫培養(yǎng)箱中震蕩60 h,取出后進(jìn)行過(guò)濾,105℃或100℃烘干至恒重,測(cè)定其干重并記錄數(shù)據(jù)[11-12]。

2結(jié)果與分析

2.1石油降解菌的篩選結(jié)果

經(jīng)過(guò)富集、純化,共篩選到4株細(xì)菌,5株真菌,分別命名為ODB-1、ODB-2、ODB-3、ODB-4和ODF-1、ODF-2、OD-F3、ODF-4、ODF-5。

2.2石油降解真菌ODF-3菌株的形態(tài)學(xué)觀察

石油降解真菌ODF-3菌株的顯微形態(tài)見(jiàn)圖1。ODF-3菌株菌落初呈白色,后菌落正面產(chǎn)生孢子后呈褐色。在光學(xué)顯微鏡下菌絲無(wú)色,分枝,有橫隔。

2.3石油降解真菌ODF-3菌株的分子鑒定結(jié)果

2.4石油降解真菌ODF-3菌株的生物學(xué)特性

2.4.1 石油降解真菌ODF-3菌株生長(zhǎng)曲線

石油降解真菌ODF-3菌株的生長(zhǎng)曲線見(jiàn)圖3。由圖3可見(jiàn),0~24 h為菌株生長(zhǎng)的適應(yīng)期(又稱(chēng)停滯期、調(diào)整期),在這個(gè)時(shí)間內(nèi)菌絲細(xì)胞干重(生物量)基本不增加或增加非常緩慢;24~84 h為為菌株生長(zhǎng)的指數(shù)增長(zhǎng)期,在該時(shí)期菌株的生長(zhǎng)繁殖速度很快,活菌的數(shù)目呈對(duì)數(shù)增長(zhǎng),當(dāng)培養(yǎng)時(shí)間達(dá)84 h左右時(shí),菌絲細(xì)胞干重(生物量)達(dá)最大值;84~154 h為菌株生長(zhǎng)的穩(wěn)定期(又稱(chēng)恒定期或最高生長(zhǎng)期),即菌絲細(xì)胞干重(生物量)不再繼續(xù)增加,保持平衡,這是由于此階段營(yíng)養(yǎng)物尤其是生長(zhǎng)限制因子耗盡、營(yíng)養(yǎng)物的比例失調(diào),酸、醇、毒素或H2O2等有害代謝產(chǎn)物累積,pH值、氧化還原等物化條件越來(lái)越不適宜,使得在此階段的細(xì)胞分裂間隔時(shí)間延長(zhǎng),曲線上升開(kāi)始緩慢,隨后部分細(xì)胞停止分裂,少數(shù)細(xì)胞開(kāi)始死亡,致使新生細(xì)胞與死亡細(xì)胞處于動(dòng)態(tài)平衡狀態(tài);154 h后,菌株生長(zhǎng)進(jìn)入衰亡期,在此時(shí)期菌絲細(xì)胞干重(生物量)減少,呈現(xiàn)出負(fù)生長(zhǎng)趨勢(shì),這主要是由于外界環(huán)境對(duì)繼續(xù)生長(zhǎng)越來(lái)越不利,從而引起細(xì)胞內(nèi)的分解代謝大大超過(guò)合成代謝,繼而導(dǎo)致菌體死亡。

2.4.2 初始 pH值對(duì)石油降解真菌ODF-3菌株生長(zhǎng)的影響

培養(yǎng)基的初始pH值對(duì)石油降解真菌ODF-3菌株生長(zhǎng)的影響見(jiàn)圖4。由圖4可見(jiàn),ODF-3菌株生長(zhǎng)的初始最佳pH值為6左右,中性偏酸比偏堿的生長(zhǎng)環(huán)境更適合石油降解真菌ODF-3菌株的生長(zhǎng)。

3結(jié)論與討論

本試驗(yàn)選用石油烴為培養(yǎng)基的唯一碳源,采用連續(xù)富集篩選的方法,共得到9株可降解石油的菌株,經(jīng)過(guò)形態(tài)學(xué)觀察和18S rDNA序列分析,鑒定其中石油降解真菌ODF-3菌株為煙曲霉,可考慮選擇該菌株作為油廢水生物處理的石油降解菌。

通過(guò)對(duì)ODF-3菌株生長(zhǎng)曲線的測(cè)定得知,ODF-3菌株在培養(yǎng)24 h后進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,在84 h后進(jìn)入穩(wěn)定生長(zhǎng)期,在154 h后進(jìn)入生長(zhǎng)衰亡期;ODF-3菌株的初始最佳pH值為6左右,且偏酸的生長(zhǎng)環(huán)境比偏堿的生長(zhǎng)環(huán)境更適合菌株生長(zhǎng)。由此顯示,將菌株在偏酸環(huán)境中培養(yǎng)2 d后投放使用,其穩(wěn)定性與降解速率最好。

通過(guò)本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),被石油污染的污灌渠底泥中潛藏著較為豐富的“土著”石油降解菌,分離篩選這些微生物并對(duì)其進(jìn)行深入研究,可為進(jìn)一步開(kāi)發(fā)石油降解菌資源和開(kāi)展石油污染的生物修復(fù)工作提供一定的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

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(責(zé)任編輯:丁志祥)

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