梁鉅超 +屈穎 +于苗苗 +徐玲玲 +劉亞潔+孫占學(xué) 陳煥文
摘要 本研究以721礦和745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌為研究對(duì)象,采用常壓化學(xué)電離質(zhì)譜直接分析其代謝產(chǎn)物,分別考察了頂空采樣(Headspacesampling)、界面采樣(Interfacesampling)和中性解吸采樣(Neutraldesorptionsampling)3種進(jìn)樣方式對(duì)電離效果的影響。在優(yōu)化條件下,常壓化學(xué)電離質(zhì)譜對(duì)微生物純菌種和混合菌種的代謝產(chǎn)物均具有良好的分析能力,可根據(jù)獲得的代謝產(chǎn)物指紋譜圖結(jié)合主成分分析(PCA)方法和聚類分析(CA)方法區(qū)分2個(gè)放射性強(qiáng)弱不同區(qū)域共4類嗜酸性微生物樣品,并對(duì)主要胺類、酯類等代謝成分進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜鑒定,為耐輻射微生物的相關(guān)研究提供了一種可借鑒的分析方法。
關(guān)鍵詞嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌;常壓化學(xué)電離;代謝產(chǎn)物;質(zhì)譜分析
1引言
嗜酸性微生物是指可在極端酸性環(huán)境(pH<3.5)中生長(zhǎng)良好的微生物,多分布在酸性礦水、酸性熱泉、火山湖、地?zé)崛葮O端酸性環(huán)境中,含硫化物礦物環(huán)境中亦有較多分布[1~3\]。大部分已知的嗜酸性微生物分離自上述酸性環(huán)境,并被用于生物濕法冶金,如氧化亞鐵硫桿菌(Acidithiobacillusferrooxidans,At.f)、氧化硫硫桿菌(Acidithiobacillusthioxidans,At.t)等,既是典型的嗜酸菌,也是典型的化能自養(yǎng)型微生物。這類微生物能氧化某種特定的無機(jī)物,并利用所產(chǎn)生的化學(xué)能還原二氧化碳和生成有機(jī)碳化合物[4~6\],At.f能將Fe2+氧化為Fe3+,獲得能量而生長(zhǎng),而Fe3+又是冶金工藝中良好的氧化劑,At.t可以低價(jià)硫或單質(zhì)硫?yàn)槟茉床⑸闪蛩幔\(yùn)用于冶金工藝中可以降低酸耗,大大節(jié)約生產(chǎn)成本[7~9\]。同時(shí),由于貧礦、尾礦、品外礦的增加,微生物浸礦工藝已成為許多地區(qū)首選的浸礦技術(shù)。因此,通過微生物代謝產(chǎn)物研究生物冶金中目標(biāo)礦體環(huán)境中嗜酸性微生物特異性,對(duì)目標(biāo)菌種的篩選及構(gòu)建生物浸出體系中優(yōu)勢(shì)冶金菌群具有很重要的指導(dǎo)作用[10\]。
基于代謝產(chǎn)物對(duì)微生物種類進(jìn)行識(shí)別鑒定具有快速無損的優(yōu)勢(shì),開發(fā)微生物代謝產(chǎn)物快速檢測(cè)的方法,已成為了熱門的研究課題。目前,微生物代謝產(chǎn)物的分析方法很多,傳統(tǒng)方法的包括化學(xué)傳感、光譜學(xué)、“電子鼻”、離子遷移譜等[11\]。由于質(zhì)譜技術(shù)具有較高的化學(xué)特異性,得到越來越廣泛的應(yīng)用,但傳統(tǒng)的質(zhì)譜方法常與氣相色譜或液相色譜聯(lián)用,樣品預(yù)處理較復(fù)雜,耗時(shí)較長(zhǎng)。直接質(zhì)譜分析技術(shù)能夠在無需樣品預(yù)處理的情況下對(duì)復(fù)雜基體樣品中痕量待測(cè)物進(jìn)行快速分析,因此得到了極大的關(guān)注和廣泛的應(yīng)用[12\]。Liang等[13\]利用常壓化學(xué)電離,無需任何預(yù)處理,對(duì)臨床上5種常見的致病菌進(jìn)行指紋譜圖分析,并得到其揮發(fā)性代謝產(chǎn)物生物標(biāo)志物作為快速識(shí)別的信號(hào)。Yang等[14\]利用表面解吸常壓化學(xué)電離(SDAPCI)質(zhì)譜法,在無需樣品預(yù)處理的情況下,直接測(cè)定了奶粉中三聚氰胺,實(shí)現(xiàn)了奶粉中三聚氰胺的半定量和批量檢測(cè)。常壓化學(xué)電離質(zhì)譜法作為一種常用的直接質(zhì)譜分析技術(shù),通過高電壓的針尖電暈放電,使空氣中某些中性分子電離,產(chǎn)生H3O+,N2+,O2+和O+等離子,這些離子與待測(cè)物分子發(fā)生離子分子反應(yīng),使待測(cè)物分子離子化,反應(yīng)過程包括由質(zhì)子轉(zhuǎn)移和電荷交換產(chǎn)生正離子,質(zhì)子脫離和電子捕獲產(chǎn)生負(fù)離子等[15\]。該方法對(duì)易揮發(fā)半極性的小分子化合物具有較高的靈敏度,特別適宜在環(huán)境監(jiān)測(cè)和生物表征中發(fā)揮作用。本實(shí)驗(yàn)以721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌及745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌為研究對(duì)象,比較了頂空、界面、中性解吸3種進(jìn)樣方式的特點(diǎn),分析了嗜酸性微生物代謝成分,并結(jié)合主成分分析(PCA)和聚類分析(CA)對(duì)不同礦區(qū)的嗜酸性微生物進(jìn)行快速區(qū)分。
2實(shí)驗(yàn)部分
2.1儀器與試劑
常壓化學(xué)電離源為本實(shí)驗(yàn)室搭建[13\];LTQXL線性離子阱質(zhì)譜儀并配有Xcalibur數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)(美國(guó)ThermoScientific公司)。
微生物樣品:721礦嗜酸性混合菌種分離自721礦生物堆浸浸出液;721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種由721礦嗜酸性混合菌種進(jìn)一步純化得到;745礦嗜酸性混合菌種富集分離自745礦生物堆浸礦渣;745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種由745礦嗜酸性混合菌種進(jìn)一步純化得到。
9k培養(yǎng)基:(NH4)2SO43.0g/L;KCl0.1g/L;K2HPO40.5g/L;MgSO4·7H2O0.5g/L;Ca(NO3)20.01g/L;FeSO4·7H2O25g/L;二次蒸餾水1000mL。菌種選育和樣品培育在東華理工大學(xué)鈾礦生物溶浸工藝實(shí)驗(yàn)室提供的幫助下完成。
2.2微生物培育
所有微生物樣品活化之后以20%接種至9k培養(yǎng)基,在35℃條件下120r/min搖床培養(yǎng)24h后取樣進(jìn)行質(zhì)譜分析。
2.3常壓化學(xué)電離實(shí)驗(yàn)參數(shù)
常壓化學(xué)電離質(zhì)譜裝置圖如圖1所示。實(shí)驗(yàn)室環(huán)境為恒溫恒濕條件,溫度25℃,濕度45%。為使樣品分子最大限度地與初級(jí)帶電離子進(jìn)行碰撞并發(fā)生反應(yīng),參考實(shí)驗(yàn)室氣體檢測(cè)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化條件為:放電針與進(jìn)樣口角度α=30°,樣品通道口與質(zhì)譜口水平距離為l=6mm。設(shè)置檢測(cè)模式為正離子模式,質(zhì)量范圍為100~400Da,放電針電壓為4kV,離子傳輸管溫度為150℃,樣品載氣(氮?dú)猓兌葹?9.99%),壓力為0.1MPa,其他條件為系統(tǒng)自動(dòng)優(yōu)化。
3結(jié)果與討論
3.1常壓化學(xué)電離3種采樣方式對(duì)電離效率影響
為了考察采樣方法對(duì)細(xì)菌代謝產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果的影響,分別采用了頂空采樣、界面采樣和中性解吸采樣等3種方式進(jìn)行代謝產(chǎn)物的檢測(cè)(圖1),3種方法均利用N2將培養(yǎng)體系中的物質(zhì)萃取出來進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行檢測(cè),區(qū)別之處在于培養(yǎng)瓶中N2進(jìn)氣口與液面間的距離不同。比較3種不同的進(jìn)樣方式的檢測(cè)結(jié)果,
以745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌為例得出其指紋圖譜如圖2所示,檢測(cè)出主要成分質(zhì)荷比m/z119,139,223,295等區(qū)別不大,尤其是頂空采樣與界面采樣,但是中性解吸采樣譜圖c與前兩種采樣方式譜圖相比,所得譜圖信號(hào)略有增加,可能是由于隨著N2進(jìn)樣口與液面間距離不斷縮短,氣體從培養(yǎng)基中萃取的物質(zhì)也越多,采取中性解吸采樣檢測(cè)到的可能不僅僅是揮發(fā)性代謝產(chǎn)物,培養(yǎng)基和培養(yǎng)基中一些非揮發(fā)性的代謝產(chǎn)物也有可能被檢測(cè)到,所以得到了較多復(fù)雜的質(zhì)譜信號(hào)。
3.2嗜酸性微生物代謝產(chǎn)物指紋譜圖分析
分別對(duì)721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種、721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌混合菌種、745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種和745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌混合菌種代謝產(chǎn)物進(jìn)行質(zhì)譜分析,得到指紋譜圖如圖3所示。比較4種樣品指紋譜圖可知,4種微生物都存在明顯的m/z119,139,223,295等離子峰,說明4種微生物樣品都會(huì)產(chǎn)生一些相同的代謝產(chǎn)物,且相對(duì)強(qiáng)度較為一致。
對(duì)比721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種和混合菌種,混合菌種中在質(zhì)荷比m/z158,195,223,295等處質(zhì)譜信號(hào)強(qiáng)度較721礦嗜酸性混合菌種均有不同程度的升高,且在m/z100~300之間出現(xiàn)了一些強(qiáng)度較小的離子峰,如m/z244等,而721純菌種則相對(duì)干凈。同樣的現(xiàn)象在745礦純菌種和混合菌種也存在??赡艿脑蚴怯捎诨旌暇N中含有微生物種類較多從而產(chǎn)生的化學(xué)成分比較復(fù)雜,導(dǎo)致在此質(zhì)荷比區(qū)間差異明顯。而相比于745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種,721礦純菌種的m/z119,173信號(hào)強(qiáng)度更大,另外,721礦純菌種還出現(xiàn)m/z158,295,391質(zhì)譜信號(hào)峰,未見m/z301的質(zhì)譜信號(hào)峰。為了快速識(shí)別鑒定嗜酸性微生物的種類,選擇721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種中豐度較高的一些物質(zhì)如m/z119等離子進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜鑒定。
圖4為通過碰撞誘導(dǎo)解離實(shí)驗(yàn)(CID)得到的串聯(lián)質(zhì)譜圖。m/z119離子的二級(jí)質(zhì)譜圖如圖4a所示,產(chǎn)生主要碎片離子m/z91,為母體離子丟失中性碎片C2H4形成的,可能與酯類物質(zhì)丟失碎片規(guī)律一致,推測(cè)m/z119為一酯類物質(zhì),通過文獻(xiàn)和標(biāo)準(zhǔn)品串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)一步確認(rèn)了m/z119為質(zhì)子化的乳酸乙酯\[CH3CH(OH)COOCH2CH3+H\]+。m/z151的二級(jí)質(zhì)譜圖如圖4b所示,產(chǎn)生主要碎片離子m/z133,掉落碎片18,同時(shí)產(chǎn)生m/z105離子碎片,由此推測(cè)其為質(zhì)子化苯甲酸乙酯,與參考文獻(xiàn)對(duì)比進(jìn)一步確認(rèn)該化合物[16\]。m/z135的二級(jí)質(zhì)譜圖和三級(jí)質(zhì)譜圖如圖4c所示,產(chǎn)生主要碎片離子為m/z107,因此推測(cè)m/z135為酰胺物質(zhì),然后通過標(biāo)準(zhǔn)品的三級(jí)質(zhì)譜圖和文獻(xiàn)對(duì)比進(jìn)一步確認(rèn)了m/z135為離子化的乙酰苯胺\[CH3CONHC6H5\]+。m/z136的二級(jí)譜圖和三級(jí)譜圖如圖4d所示,與m/z135的串聯(lián)譜圖類似,由乙酰苯胺質(zhì)子化之后得到\[CH3CONHC6H5+H\]+。
3.3常壓化學(xué)電離質(zhì)譜主成分分析(PCA)
主成分分析(PCA)在復(fù)雜樣品的分析檢測(cè)中已得到廣泛地應(yīng)用[17~20\]。為了更直觀地揭示嗜酸性微生物之間的差異和進(jìn)一步論證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的正確性,本研究通過Matlab軟件將采集的大量質(zhì)荷比在m/z100~400范圍內(nèi)的一級(jí)質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行規(guī)一化處理,利用“Princomp”函數(shù)對(duì)每一類樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行PCA分析,自動(dòng)得到各個(gè)主成分的得分圖及相應(yīng)的載荷圖。
對(duì)721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種和混合菌種指紋譜圖進(jìn)行PCA分析(圖5a),結(jié)果表明,兩類生物樣品可以得到很好的區(qū)分。由3個(gè)主成分載荷分布圖(圖5b)可見,m/z135,136,158,223,295,296等對(duì)區(qū)分兩種樣品的貢獻(xiàn)較大,說明這些物質(zhì)在兩種樣品中的含量存在有較大差異。同樣,對(duì)745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種和混合菌種指紋譜圖進(jìn)行PCA分析,得到主成分分析圖和載荷圖如圖5c和5d所示。從圖5c可見,PC1,PC2和PC3對(duì)方差貢獻(xiàn)率分別為51.5%,29.8%和7.1%,三者之和達(dá)到88.4%,因而這3個(gè)主成分包含了被分析樣品的絕大部分信息,同時(shí)兩種樣品能夠被明顯區(qū)分開。
3.4常壓化學(xué)電離質(zhì)譜聚類分析(CA)
聚類分析是一種靜態(tài)數(shù)據(jù)分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法,目前已廣泛應(yīng)用于模式識(shí)別和圖像分析等領(lǐng)域。實(shí)驗(yàn)將正離子模式檢測(cè)下的嗜酸性微生物的質(zhì)譜數(shù)據(jù)(已進(jìn)行PCA分析)導(dǎo)入Matlab軟件的聚類分析程序中進(jìn)行分析,結(jié)果如圖6所示。嗜酸性微生物樣本為120個(gè),其中721礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種、721礦嗜酸性混合菌種、745礦嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌純菌種、745礦嗜酸性混合菌種各30個(gè)。
分析結(jié)果表明,721礦純菌種與745礦純菌種樣本具有一定的相似度,說明在不同礦區(qū)中同一純菌種代謝非常接近,而721礦混合菌種代謝產(chǎn)物中包含了部分純菌種代謝產(chǎn)物,表明混合菌種中包含有嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌。721礦混合菌種與745礦混合菌種差異較大,說明不同礦區(qū)的混合菌種代謝具有較大的差異。從圖6可見,A,B,C,D分別自聚成一類,反應(yīng)不同嗜酸性微生物樣品被區(qū)分開,這與PCA的分析結(jié)果相印證。
4結(jié)論
本研究采用常壓化學(xué)電離技術(shù),在無需樣品預(yù)處理的情況下,直接快速分析不同礦區(qū)嗜酸性氧化亞鐵硫桿菌代謝產(chǎn)物,從而高通量地實(shí)現(xiàn)對(duì)微生物的快速識(shí)別鑒定。尤其是對(duì)于化能自養(yǎng)型微生物的快速識(shí)別能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)目標(biāo)菌種的篩選及構(gòu)建生物浸礦體系具有重要的指導(dǎo)作用,有望在生物冶金中得到很好地應(yīng)用。同時(shí),本方法具有操作簡(jiǎn)單、靈敏度高、重現(xiàn)性好、分析速度快等特點(diǎn),為微生物的快速識(shí)別和鑒定提供了一種可靠的途徑。
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AbstractAmethodforrapiddeterminationofacidithiobacillusferrooxidans(At.f)metabolitesbyambientcoronadischargeionizationmassspectrometrywasestablished.Threeinjectionmodeswereappliedtostudytheeffectssuchasheadspacesampling,interfacesamplingandneutraldesorptionsampling.Undertheoptimizedexperimentalconditions,themetabolites,suchassmallmoleculeestersandaminesweredetectedbyambientcoronadischargeionizationmassspectrometryandconfirmedusingtandemmassspectrometry(MS/MS).Furtherprincipalcomponentanalysis(PCA)andclusteranalysis(CA)ofthemassspectrometricresultsallowedaconfidentdiscriminationofdifferentbacterialsamples.Ambientcoronadischargeionizationmassspectrometryhastheadvantagesofnosamplepretreatment,convenientoperation,highsensitivityandhighanalyticalspeed,whichwillbeanattractivemethodtorapidlyidentificationofmicroorganisms.
KeywordsAcidithiobacillusferrooxidans;Ambientcoronadischargeionization;Metabolites;Massspectrometry
HQWT6JY(Received12July2016;accepted2September2016)
ThisworkwassupportedbytheNationalNaturalScienceFoundationofChina(No.81460327),ProgramforChangjiangScholarsandInnovationResearchTeaminUniversities(PCSIRT)(No.IRT13054),ScienceandtechnologysupportprogramofJiangxiProvince(Nos.20152ACB21013,20152ACG70014).