胡倩倩,張同剛,尤麗琴,羅瑞明,李俊麗
(寧夏大學(xué)農(nóng)學(xué)院,寧夏銀川 750021)
冷鮮灘羊肉微生物菌群代謝物與其關(guān)聯(lián)性分析
胡倩倩,張同剛,尤麗琴,羅瑞明*,李俊麗
(寧夏大學(xué)農(nóng)學(xué)院,寧夏銀川 750021)
本文以冷鮮灘羊肉為研究對(duì)象,采用選擇性培養(yǎng)基得出了寧夏鹽池縣冷鮮灘羊肉表面初始菌相構(gòu)成為假單胞菌、腸桿菌、乳酸菌及熱死環(huán)絲菌。結(jié)合課題組成員使用GC-TOF-MS技術(shù)所得的微生物差異代謝物,用主成分分析微生物菌群與其關(guān)聯(lián)性。主成分分析的結(jié)果表明:與假單胞菌關(guān)聯(lián)程度較大的差異代謝物為D-甘油酸和苯丙氨酸,且代謝物D-甘油酸與苯丙氨酸之間、菌群與代謝物之間均呈現(xiàn)出正相關(guān)關(guān)系(相關(guān)系數(shù)矩陣值為正)。而1-磷酸葡萄糖、5′-肌苷酸和乳酸菌關(guān)聯(lián)性較大,且代謝物1-磷酸葡萄糖與5′-肌苷酸之間呈現(xiàn)出正相關(guān)關(guān)系,而代謝物與菌群呈現(xiàn)出負(fù)相關(guān)關(guān)系(相關(guān)系數(shù)矩陣值為負(fù))。差異代謝物天冬氨酸、天冬酰胺、乙酰苯胺和核糖與腸桿菌及熱死環(huán)絲菌菌群相互聯(lián)系與影響的程度較大,且代謝物天冬酰胺、乙酰苯胺和核糖與菌群之間負(fù)相關(guān),而代謝物天冬氨酸與菌群之間正相關(guān);代謝物天冬氨酸與代謝物天冬酰胺、核糖負(fù)相關(guān),與乙酰苯胺正相關(guān)。本文為揭示菌落變化的內(nèi)在機(jī)制提供理論參考,為冷鮮肉保鮮分子生態(tài)學(xué)理論構(gòu)建提供借鑒。
冷鮮灘羊肉,微生物菌群,差異代謝物,關(guān)聯(lián)性
健康動(dòng)物由于自身具備完善的防御系統(tǒng),一般情況下其血液和肌肉處于無菌狀態(tài),而肉品變質(zhì)主要源于外源性微生物污染[1]。在屠宰、加工和貯藏過程中,肉品表面首當(dāng)其沖的被外環(huán)境中的好氧微生物污染[2],隨著微生物不斷的生長(zhǎng)繁殖,微生物間開始相互競(jìng)爭(zhēng),而最終能抵抗或適應(yīng)一切不利的生長(zhǎng)條件,且對(duì)肉品腐敗發(fā)揮主要作用的微生物只有一小部分[3-5],深入探究這些優(yōu)勢(shì)菌群的種類、生長(zhǎng)狀態(tài)及代謝過程能使我們?cè)诮鉀Q肉類腐敗變質(zhì)問題時(shí)做到對(duì)癥下藥[6-7]。由于肉品自身質(zhì)構(gòu)及生產(chǎn)加工工藝的不同,其初始菌相存在差異。羅欣等[8]在研究乳酸鈉在冷卻牛肉保鮮中的應(yīng)用時(shí),鑒定出實(shí)驗(yàn)牛肉材料的初始菌相由假單胞菌屬(Pseudomonasspp.)、乳酸菌(Lactobacillus)、熱死環(huán)絲菌(Brchothrixthermosphacta)、酵母菌(Saccharomycetes)等構(gòu)成;李苗云等[9]發(fā)現(xiàn)冷卻豬肉貯藏過程中的優(yōu)勢(shì)菌為假單胞菌屬、熱死環(huán)絲菌、氣單孢菌屬(Aeromonas),然而只要初始菌相中存在葡萄球菌(Staphylococcus),它會(huì)逐步躍升為優(yōu)勢(shì)菌。林惠珍[10]初步鑒定冰鮮鴨腿肉的主要腐敗菌除假單胞菌、乳酸菌、腸桿菌科(Enterobacter)之外,還有氣單孢菌屬、葡萄球菌、節(jié)桿菌(Arthrobacter)、熱死環(huán)絲菌。對(duì)于羊肉,劉瑩瑩等[11]采用選擇性培養(yǎng)基分析了寧夏吳忠地區(qū)冷卻羊肉初始菌相,指出該地區(qū)冷卻灘羊肉主要腐敗菌為假單胞菌、乳酸菌、腸桿菌科、葡糖球菌。但已有研究沒有揭示冷鮮肉微生物菌落差異代謝產(chǎn)物與其的關(guān)聯(lián)性。
本研究以冷鮮灘羊肉表面微生物為研究目標(biāo),將其接種于選擇性培養(yǎng)基上鑒定其類別并觀察其生長(zhǎng)繁殖的狀況,并結(jié)合本課題組成員所得的差異代謝物,分析討論菌落代謝物與其關(guān)聯(lián)性,為揭示菌落變化的內(nèi)在機(jī)制提供理論參考,為冷鮮肉保鮮分子生態(tài)學(xué)理論構(gòu)建提供借鑒。
1.1 材料與儀器
灘羊后腿肉 購(gòu)自寧夏大夏牧場(chǎng)清真食品有限公司(灘羊飼養(yǎng)期間不做任何生物性防疫工作,且定期進(jìn)行清糞、消毒處理);瓊脂培養(yǎng)基:甘露醇鹽瓊脂(MSA)、假單胞菌選擇培養(yǎng)瓊脂(PSA)、紫紅膽鹽葡萄糖瓊脂(VRBGA)、MRS瓊脂、STA瓊脂平板計(jì)數(shù)瓊脂(PCA) 均購(gòu)自上海麗臣商貿(mào)有限公司。
YXQ-SG46-280S手提式滅菌鍋 上海博訊醫(yī)療生物儀器有限公司;BPH-9052恒溫培養(yǎng)箱 上海一恒科學(xué)儀器有限公司;WT-B3003電子天平 杭州萬特衡器有限公司;JJ-2組織搗碎機(jī) 常州恒隆儀器有限公司;SW-CJ-1FD無菌工作臺(tái) 上海博迅科技有限公司;BCD-251冰箱 青島海爾股份有限公司。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 樣品處理 新鮮采購(gòu)的灘羊當(dāng)天屠宰后立刻放入冷藏箱,運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室后迅速放入-20 ℃冰箱1 h,使其中心溫度降至0 ℃,在無菌條件下,將灘羊后腿肉分割成重量為250 g相等的4塊,保鮮膜密封包裝,放在0 ℃冰箱分別貯藏0、4、8、12 d[12]后,在無菌條件下,處理得到后腿肉的表面刮擦物,充分進(jìn)行破碎。
1.2.2 冷鮮灘羊肉微生物胞內(nèi)差異代謝物的獲取 本課題組成員采用氣相色譜-飛行時(shí)間質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-TOF-MS),且Agilent 7890氣相色譜-飛行時(shí)間質(zhì)譜聯(lián)用儀配有Restek Rxi-5Sil MS毛細(xì)管柱(30 m×250 μm×0.25 μm),Restek,USA的工作條件下獲得了30種冷鮮灘羊肉微生物胞內(nèi)差異代謝物。
1.2.3 冷鮮灘羊肉表面腐敗菌的培養(yǎng) 本課題組成員采用宏基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)冷鮮灘羊肉微生物多樣性[13]的研究指出,肉品中酵母和霉菌菌落數(shù)量的對(duì)數(shù)值均小于1,而優(yōu)勢(shì)菌集中在假單胞菌屬、腸桿菌科、熱死環(huán)絲菌、乳酸菌和葡萄球菌等細(xì)菌菌群上,因此本實(shí)驗(yàn)以選擇性培養(yǎng)基為基礎(chǔ),應(yīng)用平板計(jì)數(shù)法對(duì)細(xì)菌總數(shù)、假單胞菌屬、腸桿菌科、熱死環(huán)絲菌屬、乳酸菌、葡萄球菌數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。
取被充分破碎后的冷鮮灘羊肉表面刮擦物25 g,加入225 mL、0.85%滅菌生理鹽水,振蕩均勻,取上清液1 mL進(jìn)行10倍遞增梯度稀釋,取三個(gè)合適的稀釋梯度,平行梯度三次重復(fù),傾注平板計(jì)數(shù)[14]。表面主要腐敗菌培養(yǎng)條件見表1。
表1 主要腐敗菌培養(yǎng)條件Table 1 Culture conditions for major spoilage organisms
1.2.4 主成分分析 使用SPSS 13.0軟件選擇了12個(gè)組份進(jìn)行了主成分分析,包括D-甘油酸(X1)、1-磷酸葡萄糖(X2)、天冬酰胺(X3)、核糖(X4)、5′-肌苷酸(X5)、乙酰苯胺(X6)、天冬氨酸(X7)和苯丙氨酸(X8)八種差異代謝物間接濃度和假單胞菌(X9)、腸桿菌科(X10)、乳酸菌(X11)及熱死環(huán)絲菌(X12)四種主要腐敗菌數(shù)量。
1.2.5 數(shù)據(jù)處理 使用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,測(cè)定結(jié)果以均數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)差表示。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析載荷圖和相關(guān)系數(shù)矩陣得出結(jié)論。
2.1 冷鮮灘羊肉表面的初始菌相
以選擇性培養(yǎng)基為基礎(chǔ),應(yīng)用平板計(jì)數(shù)法對(duì)細(xì)菌總數(shù)、假單胞菌屬、腸桿菌科、熱死環(huán)絲菌、乳酸菌、葡萄球菌數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果如表2所示。
從表2中可得出,托盤密封包裝的冷鮮灘羊肉表面的初始菌相主要包含假單胞菌屬、腸桿菌科、乳酸菌、熱死環(huán)絲菌四類腐敗菌。其中初始優(yōu)勢(shì)菌群為假單胞菌,其次為腸桿菌科。
表2 冷鮮灘羊肉初始菌相分布Table 2 The initial distribution of bacterial phase in chilled Tan sheep meat
這與劉瑩瑩[15]等報(bào)道的寧夏吳忠地區(qū)冷卻灘羊肉初始菌相構(gòu)成存在差異的菌相為熱死環(huán)絲菌,可能是由于屠宰分割、胴體冷卻、殺毒滅菌工藝不同或地域區(qū)別而引起的。此外,袁東曉等研究將冷鮮肉初始菌數(shù)控制在102~103cfu/g范圍內(nèi),有助于其貨架期的延長(zhǎng)[16]。本實(shí)驗(yàn)樣本初始菌落總數(shù)對(duì)數(shù)值為3.89 lg cfu/g,超出了有助于延長(zhǎng)貨架期的控制范圍,因而推定該冷鮮灘羊肉保質(zhì)期可能不會(huì)很長(zhǎng)。
2.2 灘羊肉表面主要腐敗菌菌相變化態(tài)勢(shì)
托盤密封包裝的冷鮮灘羊肉貯藏在0 ℃時(shí),表面主要腐敗菌菌相變化態(tài)勢(shì)見圖1。
圖1 冷鮮灘羊肉主要腐敗菌菌相變化趨勢(shì)圖Fig.1 Bacteria phase change of the main spoilage organisms of chilled Tan sheep meat
在0 ℃冷鮮貯藏過程中,托盤密封包裝灘羊肉主要腐敗菌總體上均呈現(xiàn)出菌落數(shù)不斷增長(zhǎng)的態(tài)勢(shì),但是乳酸菌在0~4 d菌落數(shù)有所下降,扈麟等人研究此現(xiàn)象原因可能有兩個(gè)[17]:一是乳酸菌為厭氧菌,外部環(huán)境中的氧氣組分會(huì)阻礙其生長(zhǎng);二是微生物間相互作用,使乳酸菌的生長(zhǎng)受到抑制。就平均增長(zhǎng)速率而言,假單胞菌屬和腸桿菌科的平均增長(zhǎng)率整體上大于乳酸菌和熱死環(huán)絲菌,再加上假單胞菌和腸桿菌科的初始污染菌量也遠(yuǎn)大于乳酸菌及熱死環(huán)絲菌,因此,冷鮮灘羊肉表面優(yōu)勢(shì)腐敗菌為假單胞菌和腸桿菌科。該結(jié)果與本課題組成員張赫宇等人采用宏基因組學(xué)技術(shù)測(cè)定的冷鮮灘羊肉表面優(yōu)勢(shì)腐敗菌為假單胞菌和腸桿菌科結(jié)果[13]相一致。
通常情況下,106cfu/g的細(xì)菌總數(shù)被認(rèn)為是冷鮮肉品質(zhì)劣變的臨界點(diǎn),一旦菌落總數(shù)突破該臨界點(diǎn)增長(zhǎng)到107cfu/g時(shí),冷鮮肉在感官品質(zhì)方面(氣味、顏色及觸感)有明顯的變質(zhì)跡象,而當(dāng)菌落總數(shù)飆升到108cfu/g時(shí),其表面會(huì)形成一層粘液,失去食用價(jià)值。一些國(guó)家冷鮮肉的細(xì)菌總數(shù)合格標(biāo)準(zhǔn)為106cfu/g[18],若以該標(biāo)準(zhǔn)作為評(píng)判依據(jù),實(shí)驗(yàn)條件下冷鮮灘羊肉的貨架期可能為在7~8 d;若以出現(xiàn)明顯劣變現(xiàn)象為標(biāo)準(zhǔn),實(shí)驗(yàn)條件下冷鮮灘羊肉的貨架期可能在9~10 d[19]??紤]到以第一種依據(jù)得到的貨架期更為嚴(yán)格,基于安全第一原則,建議以國(guó)家細(xì)菌總數(shù)合格標(biāo)準(zhǔn)為評(píng)判依據(jù)。
2.3 冷鮮灘羊肉菌群代謝物與其關(guān)聯(lián)性分析
結(jié)合本課題成員采用GC-MS測(cè)得的30種冷鮮灘羊肉微生物胞內(nèi)差異代謝物中,D-甘油酸(D-Glyceric acid)、天冬酰胺(Asparagine)、1-磷酸葡萄糖(Glucose-1-phosphate)、5′-肌苷酸(Inosine-5′-monophosphate)、核糖(Ribose)、乙酰苯胺(Acetanilide)是在四個(gè)貯藏時(shí)間段內(nèi)呈現(xiàn)出兩次差異的代謝物,而差異代謝物中天冬氨酸(Aspartic acid)是必需氨基酸,異亮氨酸、蘇氨酸和賴氨酸的前體物質(zhì)及差異代謝物中必需氨基酸苯丙氨酸(Phenylalanine)的Similarity值大于900且OPLS-DA模型變異權(quán)重系數(shù)VIP值較大,故以D-甘油酸、天冬酰胺、1-磷酸葡萄糖、5′-肌苷酸、乙酰苯胺、核糖、天冬氨酸和苯丙氨酸八種差異物作為分析代謝物與不同時(shí)間段菌落差異代謝物,其間接表示相對(duì)濃度的峰面積平均值見表3。
表3 不同貯藏時(shí)間差異代謝物的峰面積平均值Table 3 The average peak area of differential metabolites during storage
使用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件將隨著貯藏時(shí)間變化而變化的差異代謝物峰面積平均值和表面主要腐敗菌數(shù)量進(jìn)行主成分分析,主成分分析的結(jié)果見表4~表6。
表4 代謝物與四種主要腐敗菌主成分分析數(shù)據(jù)集信息Table 4 PCA data information of metabolites and spoilage organisms
表5 代謝物與四種主要腐敗菌相關(guān)系數(shù)矩陣特征值Table 5 Correlation matrix eigenvalues of correlation analysis of metabolites and spoilage organisms
從表5中可得,第一主成分、第二主成分和第三主成分的特征值均大于1,故需再以貢獻(xiàn)率為著手點(diǎn),進(jìn)一步對(duì)其進(jìn)行考察,第一主成分的貢獻(xiàn)率0.6892,說明第一主成分能提供原始變量提供的綜合信息的一半以上,但不到80%;第二主成分的貢獻(xiàn)率為0.1889,與第一主成分貢獻(xiàn)率合并的累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到87%,說明前兩個(gè)主成分能提供87%以上原始變量的綜合信息,所以在冷鮮灘羊肉菌群代謝物與其關(guān)聯(lián)性分析中保留前兩個(gè)主成分。
表6 代謝物與四種主要腐敗菌相關(guān)分析特征向量Table 6 Eigenvector of correlation analysis of metabolites and spoilage organisms
表7 代謝物與菌群關(guān)聯(lián)性分析相關(guān)系數(shù)矩陣Table 7 Matrix of the correlation coeffient of metabolites and spoilage organisms
冷鮮灘羊肉微生物群落變化是從復(fù)雜到簡(jiǎn)單的過程。本文確定了寧夏鹽池地區(qū)冷鮮灘羊肉的初始菌相為假單胞菌、腸桿菌、熱死環(huán)絲菌及乳酸菌;并指出其中的優(yōu)勢(shì)菌群為假單胞菌,其次為腸桿菌科。為了探明差異代謝物與菌群的關(guān)聯(lián)性,主成分分析及聚類分析相關(guān)數(shù)據(jù)說明與假單胞菌關(guān)聯(lián)程度較大的差異代謝物為D-甘油酸和苯丙氨酸,且代謝物D-甘油酸與苯丙氨酸之間、菌群與代謝物之間均呈現(xiàn)出正相關(guān)關(guān)系。而1-磷酸葡萄糖、5′-肌苷酸和乳酸菌關(guān)聯(lián)性較大,且代謝物1-磷酸葡萄糖與5′-肌苷酸之間呈現(xiàn)出正相關(guān)關(guān)系,而代謝物與菌群呈現(xiàn)出負(fù)相關(guān)關(guān)系。差異代謝物天冬氨酸、天冬酰胺、乙酰苯胺和核糖與腸桿菌及熱死環(huán)絲菌菌群相互聯(lián)系與影響的程度較大,且代謝物天冬酰胺、乙酰苯胺和核糖與菌群之間負(fù)相關(guān),而代謝物天冬氨酸與菌群之間正相關(guān);代謝物天冬氨酸與代謝物天冬酰胺、核糖負(fù)相關(guān),與乙酰苯胺正相關(guān)。宏基因組測(cè)序技術(shù)可被應(yīng)用于分析探究微生物群體豐度和多樣性,該方法既可將繁瑣的微生物培養(yǎng)分離過程避開,而且可靈敏的將外界環(huán)境對(duì)微生物群落結(jié)構(gòu)的影響探測(cè)出來,為微生物的研究開辟了新的思路與方向。
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特征向量是衡量主成分和原變量關(guān)聯(lián)性大小的,關(guān)聯(lián)性越大,則特征向量的絕對(duì)值越大。表6的結(jié)果表明:第一主成分與X12(熱死環(huán)絲菌)、X9(假單胞菌)、X11(乳酸菌)、X10(腸桿菌科)、X2(1-磷酸葡萄糖)、X7(天冬氨酸)、X8(苯丙氨酸)和X5(5′-肌苷酸)關(guān)系比較密切,第二主成分與X1(D-甘油酸)、X3(天冬酰胺)、X4(核糖)及X6(乙酰苯胺)的關(guān)系比較密切。主成分載荷圖見圖2。
圖2 主成分得分圖Fig.2 Plot of principal component analysis(PCA)
由主成分一和主成分二的載荷圖2和表7相關(guān)系數(shù)矩陣可知,與假單胞菌關(guān)聯(lián)程度較大的差異代謝物為D-甘油酸和苯丙氨酸,且代謝物D-甘油酸與苯丙氨酸之間、菌群與代謝物D-甘油酸與苯丙氨酸之間均呈現(xiàn)出正相關(guān)關(guān)系。而1-磷酸葡萄糖、5′-肌苷酸和乳酸菌關(guān)聯(lián)性較大,且代謝物1-磷酸葡萄糖與5′-肌苷酸之間呈現(xiàn)出正相關(guān)關(guān)系,而代謝物1-磷酸葡萄糖與5′-肌苷酸與菌群呈現(xiàn)出負(fù)相關(guān)關(guān)系。差異代謝物天冬氨酸、天冬酰胺、乙酰苯胺和核糖與腸桿菌及熱死環(huán)絲菌菌群相互聯(lián)系與影響的程度較大,且代謝物天冬酰胺、乙酰苯胺和核糖與菌群之間負(fù)相關(guān),而代謝物天冬氨酸與菌群之間正相關(guān);代謝物天冬氨酸與代謝物天冬酰胺、核糖負(fù)相關(guān),與乙酰苯胺正相關(guān)。
Correlation analysis of microbial community and their metabolites in cold fresh Tan lamb
HU Qian-qian,ZHANG Tong-gang,YOU Li-qin,LUO Rui-ming*,LI Jun-li
(College of Agricultural,Ningxia University,Yinchuan 750021,China)
In this paper,based on the cold fresh Tan lamb as the research object,using the selective culture method,the initial phases on the chilled meat surface of Tan sheep in Yanchi,Ningxia were determined asPseudomonas,Enterobacter,BrchothrixthermosphactaandLactobacillus,and the dominant bacteria wasPseudomonasfollowed byEnterobacter. The differential metabolites were obtained by gas chromatography time of flight mass spectrometry(GC-TOF-MS)in combination with the members of the group. Principal component analysis was used to discuss the relationship between the microbial community and their metabolites. The results of principal component analysis showed that it had greater relevance betweenPseudomonasand D-glyceric acid and phenylalanine,and the relationships of D-glyceric acid and phenylalanine as well as flora and metabolite had shown a positive correlation tendency. The correlation coefficient matrix was positive. The relevance between glucose-1-phosphate,Inosine-5′-monophosphate andLactobacilluswas significant. Among the metabolites of glucose 1-phosphate and 5′-inosinic acid showed a positive correlation,and the metabolites and bacteria showed a negative correlation. The correlation coefficient matrix was negative. Meanwhile,aspartic acid,asparagine,ribose and acetanilide had great interrelation withEnterobacterandBrchothrixthermosphacta. The metabolites of asparagine,acetanilide had the negative correlation with and ribose and bacterium group,while the aspartic acid and bacterium group had the positive correlation.The metabolite of aspartic acid had negative correlation with asparagine and ribose,positive correlation with acetanilide. This paper provides a theoretical reference for revealing the inner mechanism of colony change,reference for the construction of cold fresh meat molecular ecology theory.
the cold fresh Tan lamb;microbial community;differential metabolites;relatedness
2016-09-22
胡倩倩(1991-),女,碩士研究生,研究方向:畜產(chǎn)品加工,E-mail:1570687113@qq.com。
*通訊作者:羅瑞明(1964-),男,博士,教授,研究方向:畜產(chǎn)品貯藏與加工,E-mail:ruiming@126.com。
國(guó)家自然科學(xué)基金地區(qū)基金項(xiàng)目(31460431)。
TS251.5
A
1002-0306(2017)08-0322-05
10.13386/j.issn1002-0306.2017.08.054