杜英俠++任浩杰++張菊林++付晚濤
摘要 本文用5種分離培養(yǎng)基從大連海域潮間帶采集的2種海綿中分離培養(yǎng)放線菌,以副溶血弧菌、哈維弧菌和鰻弧菌3種海水養(yǎng)殖病原菌為指示菌對放線菌進(jìn)行抑菌活性的篩選,并基于16S rDNA序列對篩選出的抑菌活性較強(qiáng)的海綿放線菌進(jìn)行多樣性分析。結(jié)果表明:從海綿中共分離出57株海綿放線菌,以寡營養(yǎng)的M2培養(yǎng)基分離效果最好。抑菌活性篩選有55株對3株指示菌中的至少1株具有抑菌活性;有11株抑菌活性較強(qiáng),對3株指示菌均具有抑菌活性,初步鑒定均屬于鏈霉菌屬。由此表明,海綿放線菌多能夠產(chǎn)生對海水養(yǎng)殖病原菌較強(qiáng)的抑菌活性,是天然活性物質(zhì)的重要來源,在海水養(yǎng)殖應(yīng)用方面具有較大的開發(fā)價值。
關(guān)鍵詞 海綿放線菌;抑制弧菌;抑菌活性;多樣性分析
中圖分類號 Q939.13 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A 文章編號 1007-5739(2017)07-0229-03
Isolation of Sponge-associated Actinobacteria and Its Antibacterial Activity Screening
DU Ying-xia 1 REN Hao-jie 1 ZHANG Ju-lin 2 FU Wan-tao 2,3 *
(1 College of Fisheries and Life Science,Dalian Ocean University,Dalian Liaoning 116023; 2 College of Marine Science-Technology and Environment,Dalian Ocean University; 3 Key Laboratory of Nearshore Marine Environmental Science and Technology of Liaoning Province′s University)
Abstract This text isolated actinomycetes from 2 kinds of sponge taken from Dalian ocean intertidal zone with 5 kinds of separation medium.The antibacterial activity of sponge-associated actinobacteria was screened with Vibrio parahaemolyticus,Vibrio harveyi and Vibrio anguillarum as indicator bacteria.The diversity analysis of sponge-associated actinobacteria with strong antibacterial activity was conducted based on 16S rDNA sequence.The study showed that 57 strains in total were isolated from the sponges,and the separation effect of oligo-culture M2 was the best.The result of antibacterial activity screening found that 55 strains had antibacterial effect on at least one of the 3 indicator bacteria.There were 11 strains preliminarily identified as Streptomyces sp. having stronger antibacterial effect on all the 3 indicator bacteria.The results showed that most of the sponge-associated actinobacteria which was an important source of bioactive natural products had quite strong inhibition on mariculture pathogen.It has a great development value in the field of mariculture.
Key words sponge-associated actinobacteria;inhibition of vibrio;antibacterial activity;diversity analysis
隨著陸源微生物資源的開發(fā)難度越來越大,海洋豐富的微生物資源愈發(fā)受到人們的廣泛重視。海洋放線菌因為生存環(huán)境的特殊性,能夠產(chǎn)生結(jié)構(gòu)新穎、抑菌活性顯著的次級代謝產(chǎn)物[1]。海綿是海洋放線菌最重要的一種共附生生物,其體內(nèi)的微生物可高達(dá)海綿生物量的50%~60%[2-3],因而是目前尋找新型天然活性化合物的重要途徑之一。近年來,已有不少學(xué)者從海綿中分離獲得具有強(qiáng)抑菌活性的放線菌菌株,在產(chǎn)生抗細(xì)菌、真菌等活性物質(zhì)上具有較大的潛能[4-7]。
我國作為水產(chǎn)養(yǎng)殖大國,隨著海水養(yǎng)殖行業(yè)的繁榮發(fā)展,由弧菌引起的水產(chǎn)病害仍是人們治療防范的重點(diǎn)。本研究從海綿中分離篩選出3種常見的海水弧菌,即副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、哈維弧菌(Vibrio harveyi)、鰻弧菌(Vibrio anguillarum),三者均屬于具有抑制作用的放線菌。本文通過16S rDNA序列對具有較強(qiáng)抑菌活性的海綿放線菌進(jìn)行分子鑒定,旨在發(fā)現(xiàn)具有海水養(yǎng)殖應(yīng)用價值的海洋放線菌。
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.1.1 海綿樣品。繁茂膜海綿(Hymeniacidon perlevis)、軟海綿屬海綿(Halichondria sp.)均采自大連黑石礁海域潮間帶,30 min內(nèi)迅速帶回實驗室。
1.1.2 分離培養(yǎng)基。①M(fèi)2培養(yǎng)基:甘油6 mL,精氨酸1 g,K2HPO4·3H2O 1 g,NaCl 20 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,瓊脂粉18 g,蒸餾水1 L,pH值自然。②M2′培養(yǎng)基:甘油0.6 mL,精氨酸 0.1 g,K2HPO4·3H2O 1 g,NaCl 20 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,瓊脂粉18 g,蒸餾水1 L,pH值自然。③M8′培養(yǎng)基:酪蛋白胨0.02 g,天冬氨酸0.01 g,丙酸銨4 g,K2HPO4·3H2O 0.05 g,MgSO4·7H2O 0.1 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g,瓊脂粉18 g,蒸餾水1 L,pH值7.0。④RH培養(yǎng)基:棉籽糖1 g,組氨酸0.25 g,K2HPO4·3H2O 0.5 g,NaCl 20 g,MgSO4·7H2O 0.1 g,瓊脂粉18 g,蒸餾水1 L,pH值7.0。⑤GT培養(yǎng)基:甘露糖1 g,胱氨酸0.25 g,K2HPO4·3H2O 0.5 g,NaCl 20 g,MgSO4·7H2O 0.25 g,CaCO3 0.05 g,瓊脂粉18 g,蒸餾水1 L,pH值7.0。
1.1.3 指示菌。副溶血弧菌、哈維弧菌和鰻弧菌均來自大連海洋大學(xué)農(nóng)業(yè)部北方海水增養(yǎng)殖重點(diǎn)實驗室。
1.2 試驗方法
1.2.1 海綿放線菌的分離。用無菌海水浸洗海綿5遍,除去表面附著的雜質(zhì)物,再用無菌研缽研磨成漿,加入無菌海水稀釋10倍[8]后,取100 μL研磨液在不同的分離培養(yǎng)基上進(jìn)行平板涂布,于28 ℃培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)。培養(yǎng)基中均分別加入15 mg/L萘啶酮酸和50 mg/L重鉻酸鉀[9]抑制細(xì)菌和真菌的生長。
1.2.2 具有抑菌活性的海綿放線菌篩選。將分離純化的放線菌在改良高氏一號培養(yǎng)基[8]上28 ℃培養(yǎng)8~10 d至成熟,采用瓊脂塊法[10]進(jìn)行抑菌活性篩選。用無菌打孔器(直徑10 mm)在長滿放線菌的平板上打孔,將瓊脂塊菌面向下分別置于涂布3種指示菌的營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基平板上,30 ℃培養(yǎng)24 h,觀察抑菌結(jié)果。
1.2.3 具有抑菌活性的海綿放線菌的多樣性。以抑菌圈直徑(ID)大小為判斷海綿放線菌抑菌活性強(qiáng)弱的指標(biāo),對篩選出的抑菌活性較強(qiáng)(ID≥15 mm)的海綿放線菌進(jìn)行分子鑒定。將海綿放線菌單菌落接入裝有5 mL滅菌 ISP2液體培養(yǎng)基的15 mL試管中,于30 ℃恒溫振蕩培養(yǎng)2~3 d。收集1 mL培養(yǎng)液,按照TaKaRa MiniBEST Bacteria Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0 試劑盒說明提取放線菌基因組DNA。以提取的基因組DNA為模板,參照信艷娟等[9]的引物F8/R1492的PCR反應(yīng)條件擴(kuò)增16S rDNA片段。擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海生工進(jìn)行測序,測序結(jié)果在NCBI 的GenBank 進(jìn)行Blast 比對,利用MEGA 5.0軟件中的Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
2 結(jié)果與分析
2.1 海綿放線菌的分離
利用5種分離培養(yǎng)基從海綿中共分離出57株放線菌,并且選用不同培養(yǎng)基對海綿放線菌的分離效果差別很大[10] 。
由圖1可以看出,分離效果較好的培養(yǎng)基有M2、RH和GT,其中M2培養(yǎng)基中共分離得到22株放線菌,分離效果最好。有研究發(fā)現(xiàn),在培養(yǎng)基中加入低比例的營養(yǎng)成分能分離出更多的海洋特有放線菌[11]。M2培養(yǎng)基中除甘油和精氨酸外,僅提供了簡單的K、P和Mg等無機(jī)鹽,適合海綿放線菌的分離,這與很多研究發(fā)現(xiàn)甘油-精氨酸培養(yǎng)基的分離效果較好相符[12-14];RH和GT培養(yǎng)基除提供了唯一的碳源和氮源外,其中加入的一些無機(jī)離子成分作為無機(jī)營養(yǎng)鹽,都是成分簡單的寡營養(yǎng)培養(yǎng)基,滿足了海綿放線菌的特殊需求。
2.2 具有抑菌活性的海綿放線菌篩選
以抑菌圈直徑大小為海綿放線菌抑菌活性強(qiáng)弱的判斷指標(biāo),其結(jié)果見表1??梢钥闯觯瑥闹泻Y選出11株活性較強(qiáng)(對3株指示菌均具有抑菌效果,且至少對1株指示菌的抑菌圈直徑ID≥15 mm)的海綿放線菌。分離出的57株海綿放線菌中有55株對3株指示菌中的至少1株有抑菌活性,表明海洋放線菌廣泛的抑菌活性具有無限的開發(fā)潛能,值得人們關(guān)注研究。
2.3 具有抑菌活性的海綿放線菌的多樣性
對篩選出的11株抑菌活性較強(qiáng)的海綿放線菌進(jìn)行16S rDNA序列分析,利用MEGA 5.0軟件對這些序列進(jìn)行分析,采用鄰接法,重復(fù)取樣1 000次,構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹如圖2所示??梢钥闯觯Y選出的這11株海綿放線菌均屬于鏈霉菌屬的不同種,對3種指示菌均具有抑菌活性,展現(xiàn)出海綿放線菌的多樣性。
3 討論
海綿是一種簡單而古老的多細(xì)胞動物,能產(chǎn)生比其他海洋生物物種更為豐富的生物活性物質(zhì),是海洋天然產(chǎn)物的重要來源。其體內(nèi)大量的微生物資源得到分離并成功培養(yǎng)的占整個海綿微生物群落的不足0.1%[15]。對于海綿放線菌的分離培養(yǎng),仍需要更積極地探索。其中,選擇性分離培養(yǎng)基的成分對于海洋放線菌的分離具有重要影響。研究發(fā)現(xiàn),營養(yǎng)簡單的培養(yǎng)基更適合放線菌的分離[8]。常顯波等[16]用9種分離培養(yǎng)基對青島海區(qū)潮間帶的沉積物進(jìn)行放線菌分離,培養(yǎng)基M1、M6分離得到的放線菌數(shù)目較多,主要碳源為可溶性淀粉和棉籽糖,是放線菌的偏好營養(yǎng)成分[17]。M8含有放線菌喜好的精氨酸和甘油成分[18-20],分離到的數(shù)量也較多,與本文中M2培養(yǎng)基分離效果最好一致,低營養(yǎng)的RH和GT培養(yǎng)基同樣分離效果較好。
采用瓊脂塊法篩選海綿放線菌抑菌活性,海綿放線菌展現(xiàn)出較好的抑菌活性,在分離出的57株放線菌中有55株對3株指示菌中的至少1株有抑菌活性,僅有2株未表現(xiàn)出抑菌活性,說明海綿放線菌在開發(fā)抑菌活性物質(zhì)上有廣闊的前景。由于本文中指示菌的廣譜性不高,或者受分離方法的限制,對于未表現(xiàn)出抑菌活性的海綿放線菌并不能判定無活性,需要針對不同的指示菌或者采用不同的篩選方法進(jìn)一步的篩選驗證。
本研究中,從57株海綿放線菌中篩選出11株抑菌活性較強(qiáng)的海綿放線菌,對3株海水養(yǎng)殖病原指示菌均有抑制作用,且對至少1株指示菌產(chǎn)生的抑菌圈直徑>15 mm,值得進(jìn)一步進(jìn)行抑制海水養(yǎng)殖弧菌的生物活性等方面的研究。李 俠等[21]從山東日照海域潮間帶分離篩選出4株對半滑舌鰨鰻弧菌(Vibrio anguillarum)和副溶血弧菌(Vibrio paraha-emolyticus)同時具有較強(qiáng)拮抗作用的海洋放線菌,基本滿足海水養(yǎng)殖弧菌病防治要求。海洋放線菌對海水養(yǎng)殖病原菌具有較強(qiáng)的抑制作用,在海水養(yǎng)殖病害防治方面具有潛在的應(yīng)用價值。
放線菌以產(chǎn)生豐富的次級活性代謝產(chǎn)物而著稱,特別是鏈霉菌屬作為已知放線菌中最大的族群,是產(chǎn)生抗生素最多的種屬[22],受到人們的高度重視。本文對篩選出的11株抑菌活性較強(qiáng)的海綿放線菌進(jìn)行了16S rDNA序列分析,初步鑒定均屬于鏈霉菌屬,進(jìn)一步說明海洋鏈霉菌是獲得活性代謝產(chǎn)物的重要資源。
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