吳萍 郭俊霞 李青苗 夏燕莉 張美 肖特 方清茂
摘要 [目的] 建立適用于白芷種子的SDS-PAGE蛋白質(zhì)樣品提取方法。[方法]比較5種提取方法所獲得白芷種子總蛋白質(zhì)產(chǎn)量以及SDS-PAGE電泳的譜帶數(shù)目、強(qiáng)度和電泳分辨率等方面的差異。[結(jié)果] 方法a所提蛋白質(zhì)含量高,雜質(zhì)少,電泳譜帶清晰;方法b所提蛋白質(zhì)溶液電泳譜帶清晰,分辨率較高,但提取含量較低;方法c和d所提蛋白質(zhì)雜質(zhì)較多,純度不高,分辨率較低;方法e所提蛋白質(zhì)純度較高,但蛋白條帶缺失較多。[結(jié)論]方法a提取白芷種子蛋白質(zhì)的效果最好,所提蛋白效率較高,雜質(zhì)少,電泳譜帶清晰,分辨率高,譜帶數(shù)多,優(yōu)于其他提取法。
關(guān)鍵詞 白芷種子;蛋白質(zhì)提取;聚丙烯酰氨凝膠電泳
中圖分類(lèi)號(hào) S567.1+9 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 0517-6611(2017)06-0118-03
Comparison of Protein Extraction Methods for Angelica dahurica Seeds
WU Ping, GUO Jun-xia, LI Qing-miao et al (Sichuan Academy of Traditional Chinese Medicine Sciences, Chengdu, Sichuan 610041)
Abstract [Objective] To establish a suitable protein extraction protocol for total proteins extraction from Angelica dahurica seeds. [Method] We compared the total protein yield and SDS-PAGE electrophoretic band number and strength, lectrophoresis resolution by five different methods. [Result] Method a had higher protein content, less impurity and clearer electrophoresis band. Method b had clearer electrophoresis band, higher resolution, but lower protein content. Methods c and d had more impurity, lower purity and resolution. Method e had higher protein purity, but more lack of protein bands. [Conclusion] Method a has the best extraction effects of protein from A. dahurica seeds, which has higher protein extraction efficiency, less impurity, clearer band, higher resolution, more band number. Thus, method a is superior to other four methods.
Key words Angelica dahurica seed;Protein extraction;Polyacrylamide gel electrophoresis
種子是遺傳因素的載體之一。受遺傳基因控制的蛋白質(zhì)分子普遍存在于種子內(nèi),并在植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中起著重要作用[1]。種子蛋白是基因表達(dá)的產(chǎn)物,能在種子內(nèi)積累到很大量而不降解,其電泳譜帶具有高度穩(wěn)定性、專(zhuān)一性和疊加性,在植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中起著重要作用[2]。種子蛋白作為一種遺傳標(biāo)記被越來(lái)越多地應(yīng)用于種、屬關(guān)系,種間或種內(nèi)遺傳多樣性分析,品種鑒定、物種起源及植物種質(zhì)資源的研究[3]。1991年,國(guó)際種子檢驗(yàn)協(xié)會(huì)將蛋白質(zhì)電泳方法正式定為標(biāo)準(zhǔn)的品種鑒定方法,并納入種子檢驗(yàn)規(guī)程[4]。目前,蛋白質(zhì)電泳技術(shù)已廣泛應(yīng)用于農(nóng)作物、蔬菜、牧草等種子的品種鑒定[5]、純度測(cè)定[6]、親緣關(guān)系分析[7]。但藥用植物種子的蛋白質(zhì)電泳研究報(bào)道甚少,而關(guān)于白芷種子蛋白質(zhì)電泳的研究鮮有報(bào)道。
白芷為傘形科植物白芷[Angelica dahurica (Fisch. ex Hoffm.) Benth. et Hook.f]或杭白芷[Angelica dahurica(Fisch. ex Hoffm.) Benth. et Hook. f. var. formosana (Boiss.) Shan et Yuan]的干燥根,因初生根桿為芷,色白,故名白芷,以根入藥,其性溫,氣芳香,味辛、微苦,歸胃、結(jié)腸、肺經(jīng),具有散風(fēng)除濕、通竅鎮(zhèn)痛、消腫排膿等功效[8],可藥食兩用。白芷以種子繁殖為主,多采用育苗移栽,在常規(guī)保存手段下,隔年陳種子發(fā)芽率不高,而制約種子發(fā)芽率的原因尚不清楚。細(xì)胞或組織中受體分子、信號(hào)分子等參與基因表達(dá)調(diào)控,即基因調(diào)控均需要蛋白質(zhì)的參與[9],陳年白芷種子發(fā)芽率降低也是基因表達(dá)調(diào)控的結(jié)果。蛋白質(zhì)提取是電泳
的第1步,蛋白質(zhì)樣品制備的好壞直接決定結(jié)果的成敗。筆者以白芷種子為材料,采用5種蛋白質(zhì)提取方法進(jìn)行比較分析,以期優(yōu)化出一套適于白芷種子的蛋白質(zhì)提取方法,為探索白芷種子衰老等理論機(jī)制的研究提供技術(shù)平臺(tái)。
1 材料與方法
1.1 供試材料
供試白芷(Angelica dahurica)種子來(lái)源于遂寧市永興鎮(zhèn)中脊村,2015年采收。
1.2 主要儀器與試劑
Mini-PROTEAN Tetra小型垂直電泳槽、PowerPacTM HC高電流電泳儀購(gòu)自美國(guó)Bio-rad伯樂(lè)公司;Heraeus Multifuge X3低溫離心機(jī)購(gòu)自美國(guó)Thermo公司;甘氨酸、三羥甲基氨基甲烷、十二烷基磺酸鈉(SDS)、尿素、硫脲、3-[3-(膽酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸內(nèi)鹽(CHAPS)、三氯乙酸(TCA)、β-巰基乙醇(2-ME)、TEMED、過(guò)硫酸銨均購(gòu)自Sigma公司。
1.3 方法
1.3.1 蛋白質(zhì)提取。
方法a:取種子粉碎,過(guò)40目篩,稱(chēng)0.1 g 于離心管中,加入2 mL預(yù)冷的提取液A (7 mol/L尿素,2 mol/L 硫脲,4% CHAPS,40 mmol/L Tris-base, 2% 2-ME),混懸后冰上靜置3~4 h,4 ℃、12 000 r/min 離心20 min,上清液置于-80 ℃冰箱中備用。
方法b:取種子粉碎,過(guò)40目篩,稱(chēng)0.1 g于離心管中,加入預(yù)冷的提取液B(100 mmol/L HEPES, pH 7.5, 5 mmol/L EDTA, 5 mmol/L EGTA, 10 mmol/L Na3VO4, 10 mmol/L NaF, 5% 甘油, 2% 2-ME) 2 mL,混懸后冰上靜置3~4 h,4 ℃、12 000 r/min 離心20 min,上清液置于-80 ℃冰箱中備用。
方法c:取種子粉碎,過(guò)40目篩,稱(chēng)0.1 g于離心管中,加入2 mL預(yù)冷的提取液C(150 mmol/L Tris-HCl, pH 8.0, 25% 甘油,2% 2-ME),混懸后冰上靜置3~4 h,4 ℃、12 000 r/min 離心20 min,上清液置于-80 ℃冰箱中備用。
方法d:取種子粉碎,過(guò)40目篩,稱(chēng)0.1 g于離心管中,加入稀釋8倍的濃縮膠緩沖液2 mL [含4.95%丙烯酰胺混合液(29∶1),12.5% 0.5 mol/L Tris-HCl,pH 6.8,0.1% SDS,0.1% 過(guò)硫酸銨,1% TEMED],冰浴30 min后,60 ℃水浴40 min,冷卻,10 000 r/min離心15 min取上清,-80 ℃冰箱中備用。
方法e:每份材料取研磨后過(guò)40目篩的種子粉末0.1 g于離心管中,加入2 mL樣品提取液E (50 mmol/L Tris-HCl, pH 6.8,2%SDS,5% 2-ME,10%甘油,0.1%溴酚蘭),混勻,室溫放置1~2 h。10 000 r/min離心10 min,取上清液進(jìn)行電泳,-80 ℃冰箱中備用。上樣時(shí)100 ℃沸水加熱4 min 后進(jìn)行。
1.3.2 紫外分析儀定量測(cè)定蛋白質(zhì)含量。以牛血清白蛋白為標(biāo)準(zhǔn)蛋白,采用紫外分析儀定量測(cè)定上述樣品的蛋白質(zhì)含量。
1.3.3 聚丙烯酰氨凝膠電泳。
采用SDS-PAGE法,分離膠12%,濃縮膠5%,垂直平板電泳,加樣量為10 μL。電泳緩沖液為T(mén)ris-Gly(pH 8.3)系統(tǒng),起始電壓75 V,在指示劑進(jìn)入分離膠后改為150 V,恒壓電泳,待指示劑至膠板下沿1 cm左右停止電泳。
1.3.4 染色與脫色。
膠剝離后放入加有R250染色液的染色皿中,染液漫過(guò)膠即可,置于搖床上,轉(zhuǎn)速約為45 r/min,時(shí)間約1 h,完成后染液倒去并用水洗去染液。取出染色過(guò)的膠放于加有脫色液的染缸里,脫色液漫過(guò)膠即可,置于搖床上,轉(zhuǎn)速約為45 r/min,本底色脫凈,條帶清晰可見(jiàn)即可,完成后倒掉脫色液。
1.3.5 圖譜分析。用Quantity one軟件進(jìn)行拍照并做圖像分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 蛋白質(zhì)產(chǎn)量的比較
蛋白質(zhì)產(chǎn)量和純度是評(píng)價(jià)提取方法的重要指標(biāo)。產(chǎn)量越高,蛋白質(zhì)提取越完全。蛋白質(zhì)純度不同,對(duì)電泳的影響也不同,較多的雜質(zhì)將嚴(yán)重影響電泳結(jié)果。因此,蛋白質(zhì)產(chǎn)量越高,純度越好,提取方法越好。
由圖1可知,提取方法a、b、c、d、e的蛋白質(zhì)含量測(cè)定結(jié)果分別為93.2,52.5,66.4,90.3,40.6 mg/g。其中,方法a所提的蛋白質(zhì)含量最高,為93.2 mg/g,方法e所提的蛋白質(zhì)含量最低,為40.5 mg/g,極差為52.7 mg/g。
2.2 電泳結(jié)果比較
圖2為5種白芷種子蛋白質(zhì)提取方法的SDS-PAGE電泳圖譜。結(jié)果顯示,不同的提取方法所得的PAGE圖譜各異,存在條帶數(shù)目、強(qiáng)度、清晰度等方面的差異。泳道A譜帶較全且清晰;泳道B譜帶高分子量蛋白質(zhì)有缺失,條帶較弱;泳道C、D、E譜帶缺失較多,其中泳道C出現(xiàn)紋理狀,樣品中雜質(zhì)較多;泳道D條帶模糊且背景較深,拖尾嚴(yán)重,可能是由于樣品中雜質(zhì)和不溶性蛋白質(zhì)較多;泳道E條帶較弱,蛋白質(zhì)缺失嚴(yán)重。
由表1可知,白芷種子的SDS-PAGE電泳圖譜共有15條譜帶,均為中、低分子量蛋白質(zhì),主要集中在14.4~66.2 kD。方法a譜帶數(shù)目最多為14條,其次是方法b有11條,方法c有6條,而方法d和e均僅有4條。不同泳道譜帶的分子量見(jiàn)圖3。結(jié)果顯示,方法a提取的蛋白質(zhì)(泳道A)種類(lèi)較多,提取效率較高,這與蛋白質(zhì)產(chǎn)量的分析結(jié)果一致。
3 結(jié)論與討論
種子保存的核心問(wèn)題是如何控制種子的生命力[10]。蛋白質(zhì)在種子抗衰老過(guò)程中作用很大,貯藏過(guò)程中蛋白質(zhì)分解是種子老化乃至活力喪失的明顯特征及原因[11]。種子活力在基因水平上的差異也是通過(guò)基因表達(dá)的產(chǎn)物蛋白體現(xiàn)出來(lái)的。聚丙烯酰胺凝膠電泳是常用研究蛋白質(zhì)表達(dá)的方法之一,具有設(shè)備簡(jiǎn)單、操作方便和分辨率高等優(yōu)點(diǎn)。蛋白質(zhì)樣品的提取是電泳的第一步,直接決定結(jié)果的成敗。該研究針對(duì)白芷種子蛋白質(zhì)樣品制備設(shè)計(jì)5種方法,通過(guò)蛋白質(zhì)產(chǎn)量及電泳結(jié)果的分析,得出方法a更適合于白芷種子蛋白質(zhì)的制備,可能是因?yàn)榉椒╝中蛋白質(zhì)提取液含有尿素和硫脲,兩者發(fā)揮協(xié)同作用增強(qiáng)了蛋白質(zhì)的溶解,甚至可以溶解一些非水溶的貯藏蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)產(chǎn)量和純度是評(píng)價(jià)提取方法的重要指標(biāo)[1]。該研究以白芷種子為材料,選取5種不同的蛋白質(zhì)提取方法進(jìn)行比較分析。結(jié)果顯示,方法a和d所提蛋白質(zhì)含量明顯高于其他3種提取方法。其中,方法d提取的蛋白質(zhì)溶液,電泳譜帶背景較深,雜質(zhì)較多,分辨率較低;而方法a和b所提蛋白質(zhì)溶液,電泳譜帶清晰,分辨率較高;雖然方法a所提蛋白質(zhì)溶液的電泳譜帶在部分條帶出現(xiàn)高豐度蛋白質(zhì),致使譜帶展寬,但對(duì)電泳的分辨率影響不大。方法c雖然所提蛋白質(zhì)含量高于方法b和e,但雜質(zhì)較多,提取純度較低,影響電泳的分辨率。方法e雖然所提蛋白質(zhì)純度較高,但蛋白質(zhì)損失嚴(yán)重,蛋白質(zhì)條帶缺失較多。因此,綜合各方面情況,方法a提取白芷種子蛋白質(zhì)的效果最好,其提取效率高,雜質(zhì)少,電泳譜帶清晰,分辨率高,譜帶數(shù)多。
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