曾 濤，孫思維，田 勇，陳 黎，盧立志，干賢通，干方本，吳春琴，*

(1.浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 畜牧獸醫(yī)研究所，浙江 杭州 310021; 2.溫州科技職業(yè)學(xué)院 動物科學(xué)系，浙江 溫州 325006; 3.浙江綠雁農(nóng)業(yè)開發(fā)有限公司，浙江 樂清325615)

利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析雁蕩土雞及其他3個雞群體遺傳多樣性

曾 濤1，孫思維2，田 勇1，陳 黎1，盧立志1，干賢通3，干方本3，吳春琴2，*

(1.浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 畜牧獸醫(yī)研究所，浙江 杭州 310021; 2.溫州科技職業(yè)學(xué)院 動物科學(xué)系，浙江 溫州 325006; 3.浙江綠雁農(nóng)業(yè)開發(fā)有限公司，浙江 樂清325615)

為探討浙江省不同地方雞群體的遺傳多樣性及遺傳距離，促進浙江境內(nèi)雞群體遺傳資源的合理利用和保護，本試驗利用STR分型技術(shù)對雁蕩麻雞Ⅰ系、Ⅱ系、蕭山雞、龍游麻雞和仙居雞5個群體(440只個體)在28個位點上的遺傳多樣性進行了檢測。結(jié)果表明，所有位點在5個群體中的平均有效等位基因(Ne)、期望雜合度(He)和多態(tài)信息含量(PIC)分別為3.709 0、0.664 1和0.621 5，其中龍游麻雞的平均Ne、He和PIC最高(3.941 9、0.702 2和0.661 3)；仙居雞最低(3.505 1、0.653 9和0.609 3)；雁蕩麻雞2個品系平均值處于龍游麻雞和仙居雞之間(Ⅰ系分別為3.785 5、0.670 6和0.628 8，Ⅱ系分別為3.695 7、0.654 6和0.611 4)。遺傳距離和系統(tǒng)聚類結(jié)果顯示，5個雞群體聚為3類，雁蕩麻雞2個群體為一類，仙居雞為一類，蕭山雞與龍游麻雞為一類。雁蕩麻雞Ⅰ系和Ⅱ系是浙江境內(nèi)不同于仙居雞、蕭山雞和龍游麻雞而單獨存在的一個品種。

雞；微衛(wèi)星；遺傳多樣性；遺傳距離

微衛(wèi)星DNA 核心序列重復(fù)次數(shù)的不同和重復(fù)程度的不同導(dǎo)致了每個基因座的多態(tài)性[1]，微衛(wèi)星DNA 或標(biāo)記因其有數(shù)量多、分布廣、多態(tài)性豐富、呈共顯性遺傳方式等優(yōu)點，已經(jīng)在動物遺傳育種中得到廣泛應(yīng)用。目前，全球生物多樣性正在下降，研究和保護動物的遺傳多樣性已成為保護生物學(xué)關(guān)注的熱點。微衛(wèi)星作為理想的遺傳標(biāo)記，已應(yīng)用于動物遺傳多樣性和建立遺傳譜系的研究中，推動了保護遺傳學(xué)的發(fā)展。國內(nèi)外已有多位學(xué)者用微衛(wèi)星標(biāo)記研究了不同家禽品種的遺傳結(jié)構(gòu)、親緣關(guān)系和遺傳多樣性[2-7]。

雁蕩土雞原產(chǎn)于樂清市雁蕩山區(qū)一帶，是在特定的地理、氣候等環(huán)境和傳統(tǒng)飼養(yǎng)管理方式下，經(jīng)過長期擇優(yōu)繁育而形成的蛋肉兼用品種。2004年以來，課題組對散養(yǎng)在雁蕩山區(qū)一帶的土雞進行收集和閉鎖繼代選育，根據(jù)土雞的羽色和生產(chǎn)性能重點培育了兩個品系，分別是Ⅰ系快長型，羽色為黑羽黑腳，生長速度較快；Ⅱ系優(yōu)質(zhì)型，羽色為黃麻羽黃腳，生長速度較慢。雁蕩土雞雞肉品質(zhì)細嫩，雞蛋營養(yǎng)價值高，深受當(dāng)?shù)厝藗儦g迎。本研究選取與雁蕩土雞相近的浙江省本地蛋肉兼用型雞品種蕭山雞、龍游麻雞和仙居雞，進行遺傳多樣性比較及遺傳距離的分析，以揭示雁蕩土雞的遺傳特征，為地方雞品種資源開發(fā)利用提供科學(xué)依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗動物

本試驗采集浙江省主要的5個雞(Gallusgallus)群體的血樣。5個群體樣本信息詳見表1。所有群體公母比例為1∶1。

1.2 血液采集及DNA提取

采取翅靜脈采血，收集于醫(yī)用2 mL一次性真空采血管(含抗凝劑)帶回實驗室，-20 ℃保存?zhèn)溆?。使用TaKaRa Blood Genome DNA Extraction Kit提取總DNA。0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測其純度，用紫外分光光度計法估計含量，稀釋DNA樣品至 50 ng·μL-1，用于后續(xù)微衛(wèi)星分型分析。

1.3 引物設(shè)計及PCR擴增

根據(jù)GenBank和相關(guān)文獻所提供的雞的SSR序列及引物進行篩選。選擇核心重復(fù)序列較多，且在多個品種中多態(tài)性豐富的位點。最終選取30對引物進行擴增，其中28對引物擴增成功，引物由上海英捷生物有限公司合成，詳見表2。

PCR反應(yīng)體系為15 μL，具體為：10×Buffer 1.5 μL，DNA 1.0 μL，25 mmol·L-1Mg2+1.5 μL，酶0.3 μL，10 pmol·μL-1上下游引物各0.15 μL，ddH2O補至15 μL。擴增反應(yīng)程序如下：94 ℃ 預(yù)變性3 min；94 ℃變性15 s，52～65 ℃退火15 s，72 ℃延伸 30 s，共35個循環(huán)；72 ℃延伸3 min，4 ℃保存。

表1 各群體樣本信息

Table 1 Information of the population sample

品種Breeds樣本量Samplesize來源Source雁蕩麻雞Ⅰ系YandangchickenⅠ(YDⅠ)100浙江綠雁農(nóng)業(yè)開發(fā)有限公司ZhejiangLvyanAgriculturalDevelopmentCo．，Ltd．雁蕩麻雞Ⅱ系YandangchickenⅡ(YDⅡ)100浙江綠雁農(nóng)業(yè)開發(fā)有限公司ZhejiangLvyanAgriculturalDevelopmentCo．，Ltd．蕭山雞Xiaoshanchicken(XS)60杭州蕭山東海養(yǎng)殖有限責(zé)任公司HangzhouXiaoshanEastSeaAquacultureCo．，Ltd．龍游麻雞Longyouchicken(LY)60衢州某雞場AchickenfarminQuzhou仙居雞Xianjuchicken(XJ)120浙江禮仕得仙居雞開發(fā)有限公司ZhejiangLishideXianjuChickenDevelopmentCo．，Ltd．

表2 雞微衛(wèi)星引物信息

Table 2 Microsatellite primers sequences of chicken

座位名稱(Loci)染色體Chromosome引物序列Primerssequences退火溫度Annealingtemperature/℃ADL1369TGTCAAGCCCATCGTATCACCACCTCCTTCTCCTGTTCA53ADL1665TGCCAGCCCGTAATCATAAAGCACCACGACCCAATCTA55ADL1852CATGGCAGCTGACTCCAGATAGCGTTACCTGTTCGTTTGC60ADL1951AGATGGAAGACAGGACAAATAGCACAGACAATGTTATGC52ADL21011ACAGGGAGGATAGTCACACATGCCAAAAAGATGAATGAGTA55ADL2122TTTCAAAAGTGCCCTCACACTTCCTCCCTAAACTATGCTG52ADL22513CCAAAAAGCTGTATCACCTTGCCTGTTGTAAACCACCTGA59ADL12311GCTGTGTCAAGATTAGAATCACAACAATGAAAAACACTACCTGA53ADL201ZGCTGAGGATTCAGATAAGACAATGGCTGACGTTTCACAGC52ADL1762TTGTGGATTCTGGTGGTAGCTTCTCCCGTAACACTCGTCA52LEI01663AAGCAAGTGCTGGCTGTGCTCTCCTGCCCTTAGCTACGCAC58LEI006614GATCAGATGCATCCAAAGTTCGAAGCAGGAAAATAGAAAAGGC56LEI00944CAGGATGGCTGTTATGCTTCCAGGCCAACCCATACAAGAAAC63MCW02954ATCACTACAGAACACCCTCTCTATGTATGCACGCAGATATCC62MCW00146AAAATATTGGCTCTAGGAAACCGGAAATGAAGGTAAGACTAGC63MCW6710GCACTACTGTGTGCTGCAGTTTGAGATGTAGTTGCCATTCCGAC65MCW00815GTTGCTGAGAGCCTGGTGCAGCCTGTATGTGGAATTACTTCTC63MCW1837ATCCCAGTGTCGAGTATCCGATGAGATTTACTGGAGCCTGCC64MCW294ZACTGAACAGAAACAGTCTTCCCTTCTCTAGATGTCCACTACC63MCW33017TGGACCTCATCAGTCTGACAGAATGTTCTCATAGAGTTCCTGC63MCW00854GTGCAGTTATATGAAGTCTCTCGGTATACAGGGCTTCTGAAACA57MCW2642AGACTGAGTCACACTCGTAAGCTTACTTTTCACGACAGAAGC56MCW1349GGAGACTTCATTGTGTAGCACACCAAAAGACTGGAGGTCAAC58MCW10413TAGCACAACTCAAGCTGTGAGAGACTTGCACAGCTGTGACC64MCW1451ACTTTATTCTCCAAATTTGGCTAAACACAATGGCAACGGAAAC61MCW1503TCCTGACTGAAATGGTACAGCCATGAAAACCTTTGCCCTCAG61MCW325AAGTTCCTTGTACAATTGTTATCATTACTAGTACAATCAAGATGG56MCW43GGATTACAGCACCTGAAGCCAAACCAGCCATGGGTGCAGATTGG64MCW1207CTATGTAAAGCTTGAATCTTCAATTCCTGGGTGCTAATTTACC57MCW1744TGGACTTAACACTGCTATTGCCTCTCTACCTTGGAGGGCTGA54

含熒光標(biāo)記的PCR產(chǎn)物用ABI-3730XL DNA Analyzer全自動測序儀檢測。上樣總體積為10 μL，其中包括已經(jīng)混有ROX500標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)參的上樣液Hi-Di Formamide 9 μL，PCR產(chǎn)物1 μL。

1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析

采用GeneMapper 4.0導(dǎo)出圖譜文件，根據(jù)圖譜中最大波峰位置判斷目標(biāo)條帶的大小，單波峰為純合子，雙峰為雜合子，并生成Excel數(shù)據(jù)表格。利用microsatellite-toolkit軟件計算有效等位基因數(shù)目(Ne)、期望雜合度(He)、多態(tài)信息含量(PIC))。用Popgene32軟件進行F-統(tǒng)計量分析，群體Nei氏遺傳距離及相似性分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 微衛(wèi)星位點檢測分型

利用 28對引物分別對440個樣本進行PCR擴增，利用ABI-3730XLDNA Analyzer全自動測序儀對所檢位點進行毛細管電泳掃描、判讀基因型(圖1)。

2.2 群體的遺傳多樣性比較

所有位點在5個群體中的平均He、PIC和Ne分別為0.664 1、0.621 5和3.709 0，其中龍游麻雞的平均He、PIC和Ne最高(0.702 2、0.661 3和3.941 9)，仙居雞最低(0.653 9、0.609 3和3.505 1)，雁蕩麻雞2個品系處于龍游麻雞和仙居雞之間， 但與兩者又具有顯著差異(Ⅰ系分別為0.670 6、0.628 8和3.785 5；Ⅱ系分別為0.654 6、0.611 4和3.695 7)(表3)。

2.3 群體間的遺傳距離和系統(tǒng)聚類

利用Popgene32軟件對5個雞群體間的Nei氏相似性和遺傳距離進行了分析，同時根據(jù)遺傳距離，采用UPGMA法進行聚類，詳見表4和圖2。雁蕩麻雞Ⅰ系和Ⅱ系的相似性最高為0.904 9，其次是蕭山雞與龍游麻雞(0.820 6)；雁蕩麻雞與其他3個品種的相似性高低依次為仙居雞>龍游麻雞>蕭山雞；雁蕩麻雞與其他3個品種間的遺傳距離大于3個品種內(nèi)部的遺傳距離，說明雁蕩麻雞是屬于單獨的一個品種；聚類分析顯示，雁蕩麻雞2個品系單獨聚成一類，與仙居雞遺傳距離小于與蕭山雞和龍游麻雞的遺傳距離，而蕭山雞和龍游麻雞聚成一類。遺傳距離和系統(tǒng)聚類結(jié)果均表明，雁蕩麻雞Ⅰ系和Ⅱ系是不同于仙居雞、蕭山雞和龍游麻雞而單獨存在的一個品種。

圖1 位點ADL225的某基因型Fig.1 One of genotyping of ADL225

表3 二十八個微衛(wèi)星位點在各個群體中的期望雜合度(He)、多態(tài)信息含量(PIC)、有效等位基因數(shù)(Ne)

Table 3 Expected heterozygosities， polymorphism information content and the number of effective alleles of 28 microsatellite loci in each population

位點Loci群體Population雁蕩麻雞Ⅰ系(YDⅠ)雁蕩麻雞Ⅱ系(YDⅡ)蕭山雞(XS)龍游麻雞(LY)仙居雞(XJ)平均值MeanADL136He085040836307904089070850708437PIC083220811207568087310830408207Ne753015719346228768546208963533ADL166He079410811308493082490808608176PIC076920781608243079370780707899Ne538655887563293548785133656449ADL185He083980841808153058740381106931PIC081770821207823056040367506698Ne645196756852189239301611644864ADL195He077390721407561082080669407483PIC073620664507056078830606907003Ne387574371539898536072995341186ADL210He062700534907574079640799407030PIC054110490907073076380763906534Ne262471833739950471504840036016ADL212He063420601305595070660686806376PIC060830556005121067810628305966Ne243692828522441333623159728010ADL225He085610802006161087690859008020PIC083440770005658085520839107729Ne619005878925705765426912958413ADL123He052550472702467044700480804345PIC050310444202323041440441304070Ne217461838613238179551918418101ADL201He001990000861000212PIC001960000817000203Ne100001020210000109331000010227ADL176He070330768105549080630729507124PIC064690728704945077390686306661Ne441353757622223498373655938066LEI0166He058400596606453060210463105782PIC050400507205744053000382604996Ne249202442927756248081855824094LEI0066He088300955008990094100945009190PIC071760705407998081830767607617Ne396564505556023619114880650290MCW0295He067880543807556066700668906628PIC061690476007145061040612406060Ne294682367739874295222994830497

續(xù)表1

表4 五個雞群體間的Nei氏遺傳相似性系數(shù)和遺傳距離

Table 4 Nei’s unbiased measures of genetic identity and genetic distance

品種Breeds雁蕩麻雞Ⅰ系(YDⅠ)雁蕩麻雞Ⅱ系(YDⅡ)蕭山雞(XS)龍游麻雞(LY)仙居雞(XJ)雁蕩麻雞Ⅰ系(YDⅠ)????09049063230716007556雁蕩麻雞Ⅱ系(YDⅡ)01000????063190689207171蕭山雞(XS)0458404590????0820606506龍游麻雞(LY)033400372301977???? 08082仙居雞(XJ)02802033250429802130????

*Nei氏遺傳相似性系數(shù)(對角線以上)和遺傳距離(對角線以下)

Nei’s genetic identity (above diagonal) and genetic distance (below diagonal).

圖2 五個雞群體基于Nei氏遺傳距離的UPGMA系統(tǒng)發(fā)育聚類圖Fig.2 UPGMA dendrogram of 5 breeds based on Nei’s genetic distance

3 討論

了解雁蕩麻雞的遺傳多樣性，有助于中國地方雞種的選育及開發(fā)利用。雁蕩麻雞體軀長方形，體型中等。羽色具有麻雞的特點，尾羽上翹。按照羽色和脛部皮膚顏色的不同，分Ⅰ系(黑麻羽青腳)、Ⅱ系(黃麻羽黃腳)兩個品系，具有豐富的多樣性。雁蕩麻雞是雁蕩山區(qū)獨特的家禽資源，體型偏小，抗病力強，肉蛋營養(yǎng)豐富，但目前，該品種尚未經(jīng)過省遺傳資源鑒定，因此有必要了解該品種的遺傳特性及其與周邊地方雞種的遺傳距離，為今后雁蕩土雞更好地開發(fā)提供參考。

由于微衛(wèi)星標(biāo)記具有多態(tài)豐富、共顯性、操作簡單等特點，被用于雞種多樣性，以及群體內(nèi)及群體間的遺傳結(jié)構(gòu)和差異研究[8-11]。通過分析遺傳雜合度(He)和多態(tài)信息含量(PIC)，可以看到不同座位在不同群體中的遺傳變異程度不同。從本研究的結(jié)果可以看出，28個微衛(wèi)星座位在5個不同雞群體，呈現(xiàn)出不同的多態(tài)現(xiàn)象。其中，S9的Ne、He和PIC較其他位點稍低，為低度多態(tài)位點，其他位點均處于中高度多態(tài)位點。5個群體中的平均He、PIC和Ne分別為0.664 1、0.621 5和3.709 0，其中龍游麻雞的平均He、PIC和Ne最高(0.702 2、0.661 3和3.941 9)，仙居雞的平均He、PIC和Ne最低(0.653 9、0.609 3和3.505 1)，雁蕩麻雞2個品系的平均He、PIC和Ne處于龍游麻雞和仙居雞之間，但與兩者又具有顯著差異(Ⅰ系He、PIC和Ne分別為0.670 6、0.628 8和3.785 5；Ⅱ系He、PIC和Ne分別為0.654 6、0.611 4和3.695 7)，結(jié)果表明,雁蕩麻雞是處于龍游麻雞和仙居雞之間的品種。

遺傳距離是指不同的種群或種間的基因差異的程度，并且以某種數(shù)值進行度量，通常由基因頻率的某個函數(shù)所確定。遺傳距離的信息已作為在決策保種計劃時群體結(jié)構(gòu)和品種分化最基本的指標(biāo)，準(zhǔn)確理解遺傳距離的概念和在不同的情況下選擇合適的度量方式是很重要的。遺傳距離是研究物種遺傳多樣性的基礎(chǔ)，它反映了所研究群體的系統(tǒng)分化，一般認為，群體分化時間越短，遺傳距離越小。哪種遺傳距離測定方法對分析品種遺傳變異最好并無定論，不同的遺傳距離得出的系統(tǒng)發(fā)生樹不同[12-13]。本試驗得到的聚類圖中，5個雞群體聚為3類，雁蕩麻雞2個群體單獨為一類，仙居雞為一類，蕭山雞與龍游麻雞為一類。結(jié)果表明，雁蕩麻雞Ⅰ系和Ⅱ系是不同于仙居雞、蕭山雞和龍游麻雞而單獨存在的一個品種。

本研究通過應(yīng)用28個多態(tài)性較好的微衛(wèi)星標(biāo)記對浙江省5個雞群體進行了遺傳多樣性分析，所得的聚類圖能夠準(zhǔn)確地反映5個群體間的分化關(guān)系，各品種的遺傳多樣性非常豐富，都具有各自的特性，在合理開發(fā)利用的同時，要保存其各自優(yōu)良的品種資源。同時，本研究也發(fā)現(xiàn)雁蕩麻雞是不同于仙居雞、蕭山雞和龍游麻雞而單獨存在的一個品種，應(yīng)申請省遺傳資源鑒定為新的保護品種。

[1] WEBER J L. Infomativeness of human (dC-dA)n·(dG-dT)npolymorphisms[J].Genomics， 1990， 7(4):524-530.

[2] 張細權(quán)，呂雪梅，楊玉華，等. 用微衛(wèi)星多態(tài)性和RAPD分析廣東地方雞種的群體遺傳變異[J]. 遺傳學(xué)報，1998， 25(2):112-119. ZHANG X Q， LU X M， YANG Y H， et al. Population genetic variability of microsatellite polymorphisms and RAPDs in Chinese chicken breeds in Guangdong[J].ActaGeneticaSinica， 1998， 25(2):112-119. (in Chinese with English abstract)

[3] 陳紅菊，岳永生，樊新忠，等. 利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析山東地方雞品種的遺傳多樣性[J]. 遺傳學(xué)報， 2003， 30(9):855-860. CHEN H J， YUE Y S， FAN X Z， et al. Analysis of genetic diversity of Shandong indigenous chicken breeds using microsatellite marker[J].ActaGeneticaSinica， 2003， 30(9):855-860. (in Chinese with English abstract)

[4] 吳信生，陳國宏，王德前，等. 利用微衛(wèi)星技術(shù)分析中國部分地方雞種的遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 遺傳學(xué)報，2004， 31(1):43-50. WU X S， CHEN G H， WANG D Q， et al. Analysis of genetic relationship among Chinese native chicken breeds using microsatellites marker[J].ActaGeneticaSinica， 2004， 31(1):43-50. (in Chinese with English abstract)

[5] TAKAHASHI H， NIRASAWA K， NAGAMINE Y， et al. Genetic relationships among Japanese native breeds of chicken based on microsatellite DNA polymorphisms[J].JournalofHeredity， 1998， 89(6):543-546.

[6] 李慧芳， 陳寬維， 朱文奇， 等. 中國家鴨的分子遺傳多態(tài)性及其起源[J]. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報， 2009， 17(5): 802-807. LI H F， CHEN K W， ZHU W Q， et al. molecular genetic polymorphism and origin of Chinese domestic ducks[J].JournalofAgriculturalBiotechnology， 2009， 17(5): 802-807. (in Chinese with English abstract)

[7] MAAK S， WIMMERS K， WEIGEND S， et al. Isolation and characterization of 18 microsatellites in the Peking duck (Anasplatyrhynchos) and their application in other waterfowl species[J].MolecularEcologyNotes， 2003， 3(2): 224-227.

[8] 白文林， 尹榮渙， 楊桂芹， 等. 應(yīng)用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記進行邊雞群體遺傳多樣性分析[J]. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報， 2007， 29(3): 423-428. BAI W L， YIN R H， YANG G Q， et al. Analysis on population genetic diversity of Bian chicken breed using microsatellite DNA markers[J].ActaAgriculturaeUniversitatisJiangxiensis， 2007，29(3):423-428. (in Chinese with English abstract)

[9] SMITH E J， LYONS L A， CHENG H H， et al. Comparative mapping of the chicken genome using the East Lansing reference population[J].PoultryScience， 1997， 76 (5):743-747.

[10] SCHMID M， NANDRA I， BURT D W. First report on chicken genes and chromosomes[J].CytogeneticsandCellGenetics， 2000，90(3/4):169-218 .

[11] HILLEL J. Map-based quantitative trait locus identification[J].PoultryScience， 1997， 76(8):1115-1120 .

[12] CRAWFORD A M， LITTLEJOHN R P. The use of DNA marker in deciding conservation priorities in sheep and other livestock[J].AnimalGeneticResourcesInformation， 1998， 23: 21-26.

[13] GOLDSTEIN D B， LINARES A R， CAVAL LI-SFORZA L L， et al. An evaluation of genetic distances for use with microsatellite loci[J].Genetics， 1995， 139(1): 463-471.

(責(zé)任編輯 張 韻)

Genetic diversity of Yandang chicken and other three chicken populations using microsatellite markers

ZENG Tao1， SUN Siwei2， TIAN Yong1， CHEN Li1， LU Lizhi1， GAN Xiantong3， GAN Fangben3， WU Chunqin2，*

(1.InstituteofAnimalHusbandryandVeterinaryScience，ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences，Hangzhou310021，China; 2.DepartmentofAnimalScience，WenzhouVocationalCollegeofScienceandTechnology，Wenzhou325006，China; 3.ZhejiangLvyanAgriculturalDepartmentCo.，Ltd.，Yueqing325615，China)

In order to study the chicken populations’ genetic diversity and relationship and promote the rational use and protection of the chicken populations genetic resources in Zhejiang Province， 28 microsatellite loci were tested in the 5 chicken populations， which were Yandang chicken I， Yandang chicken II， Xiaoshan chicken， Longyou chicken and Xianju chicken， totally 440 samples. The results showed that the average effective number of alleles (Ne) was 3.709 0， the average expected heterozygosity (He) was 0.664 1， and the mean polymorphic information content (PIC) was 0.621 5. In addition， the Ne， He and PIC of Longyou chicken were the highest (3.941 9， 0.702 2 and 0.661 3). The Ne， He and PIC of Xianju chicken were the lowest (3.505 1， 0.653 9 and 0.609 3). The Ne， He and PIC of Yandang chicken were between the two populations (Ⅰ: 3.785 5， 0.670 6 and 0.628 8; Ⅱ: 3.695 7， 0.654 6 and 0.611 4). Phylogenetic tree analysis based on Nei’s genetic distance revealed that Yandang chicken (Ⅰ and Ⅱ)， Xianju chicken， Xiaoshan chicken and Longyou chicken was clustered into threes group separately. It indicated that Yandang chicken was a separate breed which is different from Xiaoshan chicken， Longyou chicken and Xianju chicken.

chicken; microsatellite; genetic diversity; genetic distance

http://www.zjnyxb.cn

10.3969/j.issn.1004-1524.2017.07.03

2017-01-12

浙江省農(nóng)業(yè)科技成果轉(zhuǎn)化資金資助項目(2013-101)；溫州市種子種苗科技創(chuàng)新專項項目(N20120031)；浙江省科學(xué)技術(shù)廳重大科技專項重大農(nóng)業(yè)項目(2014C02001)

曾濤(1987—)，男，安徽安慶人，博士，助理研究員，主要從事家禽遺傳育種研究。E-mail: zengtao4009@126.com

*通信作者，吳春琴，E-mail: nkywcq@163.com

S831.2

A

1004-1524(2017)07-1070-07

浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報ActaAgriculturaeZhejiangensis， 2017，29(7): 1070-1076

曾濤，孫思維，田勇，等. 利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析雁蕩土雞及其他3個雞群體遺傳多樣性[J].浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報，2017，29(7)： 1070-1076.