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APE1基因(Asp148Glu)多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間關(guān)系的Meta分析

2017-11-02 00:59:55于海躍劉正昊崔君鵬劉寶林
臨床外科雜志 2017年10期
關(guān)鍵詞:易感性多態(tài)性基因型

于海躍 劉正昊 崔君鵬 劉寶林

APE1基因(Asp148Glu)多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間關(guān)系的Meta分析

于海躍 劉正昊 崔君鵬 劉寶林

目的對APE1基因(Asp148Glu)多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的關(guān)系進(jìn)行Meta分析。方法在PubMed,CNKI,MEDLINE等數(shù)據(jù)庫中查找APE1基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌發(fā)生易感性之間關(guān)系的研究。檢索自數(shù)據(jù)庫建立至今全部已發(fā)表的相關(guān)文獻(xiàn),根據(jù)確定的準(zhǔn)入標(biāo)準(zhǔn)對文獻(xiàn)進(jìn)行篩選,提取資料,對納入文獻(xiàn)的時效性,權(quán)威性等進(jìn)行評價。應(yīng)用RevMan 5.3軟件進(jìn)行Meta分析。APE1基因分為AA,A/G,GG型,構(gòu)建以A為顯性基因模型,則進(jìn)行AA,A/G與GG的比較;構(gòu)建以A為隱性基因模型,則進(jìn)行GG,G/A與AA的比較。結(jié)果符合標(biāo)準(zhǔn)文獻(xiàn)4篇,均為病例-對照研究,共計3397例。其中結(jié)直腸癌1492例,對照組1905例。分析顯示顯性基因模型OR=1.44,95%CI(1.22,1.70),P<0.05;隱性基因模型OR=1.17,95%CI(1.02,1.36),P<0.05。結(jié)論無論隱性及顯性基因模型,APE1基因(Asp148Glu)的基因型A均促進(jìn)結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展。

結(jié)直腸癌; APE1; Meta分析

腫瘤的發(fā)生發(fā)展與多種因素有關(guān),包括飲食、環(huán)境、遺傳等各種因素,結(jié)直腸癌的發(fā)病機(jī)制仍不完全清楚。基因的多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的關(guān)系是研究的熱點。APE1基因是14q11.2-q12上長度為2.21kb的一個包含有5個外顯子及4個內(nèi)含子的片段。同時編碼317個氨基酸蛋白質(zhì)[1-2]。APE1具有3'磷酸二脂酶活性可有效去除3'端磷酸甘油酯基團(tuán)。他通過水解5'端骨架,來啟動DNA堿基切除修復(fù)(BER)[3]。同時,APE1/Ref-1也起到氧化還原劑的作用,維持癌癥發(fā)生發(fā)展過程中例如ap-1,核因子-κB,myb,缺氧誘導(dǎo)因子-1α,HLF,PAX和p53與低活躍狀態(tài)[1,2,4-6]。有研究顯示,在APE1 Asp148Glu的Glu等位基因和hOGG1 Ser326Cys多態(tài)性的Cys等位基因的個體中觀察到,結(jié)直腸癌增加的風(fēng)險表明多種基因-基因相互作用。這種BER中的基因間相互作用,可能暗示炎癥過程及氧化壓力在結(jié)腸癌中的作用。APE1 Asp148Glu及hOGG1 Ser326cys基因被認(rèn)為是BER途徑的一部分,用于修復(fù)氧化損傷[7]。我們對APE1(Asp148Glu)基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的關(guān)系進(jìn)行Meta分析,將同質(zhì)性研究行定量合并,從而確定APE1(Asp148Glu)基因的多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的關(guān)系。

材料與方法

一、檢索策略

主要檢索APE1(Asp148Glu)基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的關(guān)系。從PubMed,CNKI等數(shù)據(jù)庫搜索已公開發(fā)表的全部研究。以“APE1”和“colorectal”為主題詞進(jìn)行搜索,無語言限制,出版日期截止至2017年4月,同時檢索納入研究的參考文獻(xiàn)。如出現(xiàn)多篇文獻(xiàn)出現(xiàn)相同數(shù)據(jù)或數(shù)據(jù)重疊,則納入數(shù)據(jù)量最大或最新發(fā)表的文獻(xiàn)。

二、文獻(xiàn)的納入與排除標(biāo)準(zhǔn)

文獻(xiàn)納入標(biāo)準(zhǔn)僅限于全部已公開發(fā)表的文獻(xiàn),同時使用有效的分子生物學(xué)方法檢驗基因型,選取圍繞APE1(Asp148Glu)基因型多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間關(guān)系的病例對照研究。文獻(xiàn)報告應(yīng)全面清楚,可計算出各個基因型的詳細(xì)人數(shù)及OR值。對重復(fù)報告、質(zhì)量較差等無法利用的文獻(xiàn)予以排除,不納入綜述或摘要類文獻(xiàn)。

三、數(shù)據(jù)提取

使用保準(zhǔn)數(shù)據(jù)提取表進(jìn)行數(shù)據(jù)提取,由兩位作者獨立提取,交叉核對,對異議處進(jìn)行討論解決。提取的信息包括第一作者,出版年份,種族,病例組及對照組樣本容量以及NOS評分。

四、文獻(xiàn)質(zhì)量評價

使用NOS量表作為納入文獻(xiàn)質(zhì)量評價尺度,評價內(nèi)容包括:病例確定是否恰當(dāng),病例的代表性,對照的選擇,對照的定義,組間可比性,對照組及病例組是否采用了相同的確定方法。6~9分為高質(zhì)量(或低偏倚風(fēng)險)的研究,4~5分為中度偏倚風(fēng)險,1~3分為具有高度偏倚風(fēng)險。本研究以結(jié)直腸癌作為疾病的“端點”,因引用文獻(xiàn)數(shù)較少,未利用漏斗圖評價潛在的發(fā)表偏倚。

五、統(tǒng)計學(xué)分析

表1 納入文獻(xiàn)的一般資料

采用RevMan 5.3軟件進(jìn)行Meta分析,以O(shè)R及其95%CI作為效應(yīng)分析統(tǒng)計量。以卡方檢驗,I2檢驗進(jìn)行合并數(shù)據(jù)異質(zhì)性評估,若P>0.1,則認(rèn)為合并數(shù)據(jù)同質(zhì)性較好,采用固定效應(yīng)模型合并后分析。反之,使用隨機(jī)效應(yīng)模型。根據(jù)I2值評估異質(zhì)性程度,I2<25%可認(rèn)為低度異質(zhì)性,I2在25%~50%之間認(rèn)為中度異質(zhì)性,I2>75%可認(rèn)為高度異質(zhì)性。因引用文獻(xiàn)較少,未采用漏斗圖檢測發(fā)表偏倚。數(shù)據(jù)合并統(tǒng)計分析采用隱性基因模型和顯性模型。采用雙側(cè)檢驗,若P<0.05 則認(rèn)為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

結(jié) 果

一、文獻(xiàn)檢索

初步檢索出相關(guān)文獻(xiàn)37篇,PubMed33篇,CNKI4篇,經(jīng)過篩選最終有4篇符合標(biāo)準(zhǔn),均為英文文獻(xiàn),均符合準(zhǔn)入標(biāo)準(zhǔn)[1,8-10]。篩選流程見圖1。

圖1 文獻(xiàn)篩選流程及結(jié)果圖

二、文獻(xiàn)評價

納入的4篇文獻(xiàn)經(jīng)過NOS評分,均大于6分,皆可納入。文獻(xiàn)基本信息提取見表1。

三、納入文獻(xiàn)的特征

4篇參考文獻(xiàn)均為病例-對照研究,共計3406例,其中1501例結(jié)直腸癌病例,1905例對照組病例。篩選過程中有因無APE1(Asp148Glu)數(shù)據(jù)信息,無法提取APE1(Asp148Glu)基因型相關(guān)數(shù)據(jù),APE1與其他因素結(jié)合對結(jié)直腸癌易感性的影響,非APE1(Asp148Glu)基因多態(tài)性研究等相關(guān)文獻(xiàn)而被排除。

四、Meta分析結(jié)果

本次研究共納入4篇病例對照試驗研究,包括1501例病例及1905例對照。薈萃分析結(jié)果如圖2~3所示。根據(jù)異質(zhì)性檢驗合并數(shù)據(jù),兩種模型I2均較大,均選擇隨機(jī)效應(yīng)模型。APE1(Asp148Glu)基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的關(guān)系,兩種模型結(jié)論相同,結(jié)果均顯示兩者之間有直接相關(guān)。因納入文獻(xiàn)數(shù)過少,未進(jìn)行漏斗圖檢驗發(fā)表偏倚結(jié)果。

圖2 顯性基因模型

圖3 隱性基因模型

討 論

我們對APE1(Asp148Glu)基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的試驗研究進(jìn)行Meta分析,結(jié)果顯示,APE1(Asp148Glu)基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性呈直接相關(guān)關(guān)系。本次研究結(jié)果主要在亞洲人中成立,未納入其他人種。

堿基切除修復(fù)始于DNA磷酸二酯鏈5'端至一個無嘧啶位點,然后聚集DNA聚合酶β和DNA連接酶Ⅲ,其中APE1基因在啟動堿基切除修復(fù)至關(guān)重要[11-12]。眾所周知,APE1等位基因的變異包括外顯子5中天冬氨酸變成谷氨酸,而這可能與對電離輻射及患癌危險因素高度敏感有關(guān)[1,6,12-13],部分功能研究證實這一觀點。功能研究顯示,APE1 148Glu等位基因改變了核酸內(nèi)切酶及DNA結(jié)合活性,從而削弱了與其他堿基切除修復(fù)蛋白的傳達(dá)能力,增加了暴露在電離輻射時的有絲分裂延遲[6,8]。考慮到APE1在多種生物學(xué)功能中的重要作用,例如基因轉(zhuǎn)錄及DNA修復(fù),APE1 Asp148Glu多態(tài)性可能調(diào)節(jié)結(jié)直腸癌發(fā)展的風(fēng)險在生物學(xué)上是合理的。有研究表明,APE1(Asp148Glu)及hOGG1(ser326cys)基因被認(rèn)為是BER途徑的一部分,用于修復(fù)氧化損傷。最近在健康受試者中突出了這些基因多態(tài)性與功能表達(dá)之間的關(guān)系,表明兩個多態(tài)性的變異等位基因與顯著降低的BER率相關(guān)[7,14]。有研究指出,乳腺癌病例中延長的細(xì)胞周期延遲與APE1 Asp 148 Glu XRCC1 ARG399Gln 等位基因變異數(shù)量有關(guān)[6]。此外,APE1的轉(zhuǎn)錄增加在具有OGG1 326 ser等位基因的結(jié)直腸癌病人中被觀察到。這些結(jié)果表明,APE1(Asp148Glu)多態(tài)性可能是導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的其他基因的協(xié)同因子[15-16]。

結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展是一個復(fù)雜的過程,與環(huán)境、飲食、習(xí)慣及基因等多種因素有關(guān)。本Meta分析結(jié)果表明,APE1(Asp148Glu)基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間呈直接相關(guān)關(guān)系,無論是顯性基因模型或者隱性基因模型,基因型A都可增加結(jié)直腸癌易患性,同時APE1通過多種復(fù)雜機(jī)制參與到結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展過程。

APE1基因作為DNA堿基切除修復(fù)基因,多種因素可引起其發(fā)生變異,從而導(dǎo)致APE1基因原有功能發(fā)生變化,繼而引起細(xì)胞發(fā)生多方面生化及生物學(xué)行為改變。根據(jù)實驗分析推測APE1變異可通過改變癌癥發(fā)生發(fā)展過程中的部分相關(guān)因子ap-1,核因子-κB,myb,缺氧誘導(dǎo)因子-1α,HLF,PAX和p53的活躍性、長期慢性炎癥刺激對細(xì)胞功能及細(xì)胞生物學(xué)行為的影響、電離輻射下細(xì)胞有絲分裂改變以及BER基因相關(guān)功能之間的關(guān)系改變來促進(jìn)結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展。APE1(Asp148Glu)基因型多態(tài)性與結(jié)直腸癌易患性呈直接相關(guān)關(guān)系,未來是否可將其納入為結(jié)直腸癌一項輔助檢查指標(biāo),需進(jìn)行更多實驗對腫瘤的分型、浸潤深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移程度以及病人年齡、性別等進(jìn)行詳細(xì)的分組及分析研究,以證實APE1(Asp148Glu)基因型在結(jié)直腸癌篩查及診斷中的意義。

本研究未納入歐洲、非洲等其他地區(qū)及人種的數(shù)據(jù),并且納入文獻(xiàn)數(shù)目較少,且納入病例皆為病例對照研究,無法控制各種偏倚因素,降低了研究分析的可靠性,分析過程中有較多混雜因素。仍需大樣本及多種人種實驗研究來確證此結(jié)論。

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AssociationbetweenAPE1(Asp148Glu)genepolymorphismandcolorectalcancersusceptibilityameta-analysis

YUHaiyue,LIUZhenghao,CUIJunpeng,etal.

(DepartmentoftheGeneralSurgery,ShengjingHospital,ChinaMedicalUniversity,Shenyang110001,China)

ObjectiveTo preliminary discuss the relationship between APE1(Asp148Glu) gene polymorphism and colorectal cancer susceptibility.MethodsDatabases including PUBMED,CNKI,MEDLINE as well as others were searched for the studies in the field of APE1(Asp148Glu) polymorphism and colorectal cancer susceptibility.Then we searched all of the relevant literature from the data of their establishment to April 4,2017,screened the literature according to established access criteria,extracted useful information and evaluated the timeliness and authority of the literature.We used the RevMan 5.3 software to perform the meta-analysis.And finally we had included in 4 case-control studies,involving 3397 cases in total(1492 cases in colorectal cancer group and 1905 cases in control group).APE1 gene is divided into AA,A/G,GG type,If we set A as dominant gene,genotyping can be combined to compare AA+A/G with GG.If we set A as recessive gene,genotyping can be combined to compare GG+A/G with AA.ResultsMeta-analysis showed that A was a dominant gene[OR=1.44,95% CI (1.22,1.70),P<0.05]; A was a recessive gene[OR=1.17,95% CI (1.02,1.36),P<0.05 ].ConclusionRegardless of recessive and dominant gene model,the genotype A of APE1 gene (Asp148Glu) promotes the development of colorectal cancer.

colorectal cancer; APE1; Meta-analysis

2017-04-13)

(本文編輯:楊澤平)

10.3969/j.issn.1005-6483.2017.10.015

110001 遼寧沈陽,中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院普外科

劉寶林,Email:liubl55@hotmail.com

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