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基于擴(kuò)散算法的CT圖像中肺實(shí)質(zhì)的分割算法

2017-12-07 20:19馬新利

馬新利

摘要:在肺癌,肺氣腫等肺部疾病的計(jì)算機(jī)輔助診斷中,肺實(shí)質(zhì)的正確分割是計(jì)算機(jī)輔助診斷中的重要先行步驟。文中提出了一種基于定向擴(kuò)散算法的CT圖像的自動分割。在本算法中綜合利用了閾值分割、區(qū)域增長及數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)等算法,能夠?qū)崿F(xiàn)對圖像的粗分割,其中對于左右肺粘連的CT圖像采用行掃描的方法將左右肺片進(jìn)行有效分離,最后采用定向擴(kuò)散算法對粗分割得到的肺部輪廓進(jìn)行修復(fù),得到完整的肺實(shí)質(zhì)。從肺部圖像數(shù)據(jù)庫聯(lián)盟(LIDC)中取出50張CT圖像,采用本文提出的分割算法進(jìn)行處理。結(jié)果表明,所提出的算法能夠有效的實(shí)現(xiàn)肺部區(qū)域的完整分割,并且與滾球法相比較,分割準(zhǔn)確率和精度都較高,為計(jì)算機(jī)輔助診斷奠定了良好基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞:計(jì)算機(jī)輔助診斷;肺實(shí)質(zhì)分割;行掃描;擴(kuò)散算法

中圖分類號:TP391.4 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1007-9416(2017)09-0136-03

1 引言

近年來,癌癥的發(fā)病率急劇上升,尤其是肺癌的發(fā)病率及死亡率更是在逐年攀升。我國由于吸煙人數(shù)多,空氣污染等原因,肺癌的發(fā)病率增長較為嚴(yán)重。來自國家計(jì)生委的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)顯示,目前我國的肺癌發(fā)病率以每年26.9%的速度增長,近半個(gè)世紀(jì)來,每10到15年肺癌患者的人數(shù)增加一倍。[1]

如果肺癌能在早期被診斷和治療,其5年生存率將從14%上升到49%。由于計(jì)算機(jī)斷層掃描(Computed Tomography,CT) 能夠提供高清晰度的圖像,并且為圖像中各組織提供很高的對比度,因此被廣泛用于肺部疾病檢測診斷中。對肺部進(jìn)行一次掃描就會得到幾百張的圖像,這增加了醫(yī)生的閱片負(fù)擔(dān)。因此,計(jì)算機(jī)輔助診斷(compute-aided diagnose,CAD)得到了廣泛的研究和使用。[2]而從CT 圖像中準(zhǔn)確快速的提取出肺實(shí)質(zhì)則是計(jì)算機(jī)輔助診斷的關(guān)鍵。[3,4]

在CT圖像中分割出肺實(shí)質(zhì)是CAD的前期工作。本文根據(jù)影像學(xué)和解剖學(xué)特征, 結(jié)合最佳閾值法、數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)方法, 對圖像進(jìn)行粗分割; 然后利用定向擴(kuò)散算法修復(fù)掩膜圖像,得到最終肺實(shí)質(zhì),為計(jì)算機(jī)輔助診斷和醫(yī)學(xué)圖像在臨床和生命科學(xué)研究領(lǐng)域的應(yīng)用打下良好的基礎(chǔ)。

2 肺實(shí)質(zhì)分割

2.1 Ostu(最大類間方差法)法

肺部和周圍區(qū)域密度不同,因此其灰度值相差明顯,可用閾值法分割。閾值分割的目的是把CT圖像中對應(yīng)于肺實(shí)質(zhì),肺實(shí)質(zhì)邊界和肺實(shí)質(zhì)周圍組織的像素區(qū)分開。[5]在本文中采用的是Ostu算法[6,7]對肺部區(qū)域進(jìn)行粗分割,該方法可以自動的選擇閾值,得到較好的結(jié)果。

2.2 區(qū)域生長

區(qū)域生長實(shí)質(zhì)是對像素點(diǎn)或選定的子區(qū)域進(jìn)行操作,讓其在滿足所定義的準(zhǔn)則下去聚合成更大區(qū)域,以達(dá)到生長目的。其基本思想是先獲取種子點(diǎn),然后從生長點(diǎn)開始,將與生長點(diǎn)性質(zhì)相似的相鄰像素或區(qū)域與生長點(diǎn)合并,形成新的生長點(diǎn),不斷重復(fù)直到無法生長為止。[8]

本文對CT圖像進(jìn)行區(qū)域生長處理的算法實(shí)現(xiàn)步驟為:

(1)在肺實(shí)質(zhì)部分定位得到種子點(diǎn);

(2)利用區(qū)域增長算法,在種子點(diǎn)的8*8*8鄰域內(nèi)進(jìn)行增長,閾值在灰度范圍內(nèi)自動選取最優(yōu)閾值;

(3)相鄰區(qū)域的像素被合并,對圖像中黑色像素點(diǎn)進(jìn)行連通區(qū)域標(biāo)記,面積最大的連通區(qū)域是該CT圖像的掩膜圖像。

2.3 肺部圖像預(yù)分割

肺部圖像經(jīng)上述處理后,與原始圖像(圖1)進(jìn)行邏輯與運(yùn)算,得到預(yù)分割圖像(圖2)。

2.4 左右肺的分離

CT圖像中常出現(xiàn)肺片粘連情況,粘連發(fā)生在CT圖像的上部分。對圖像的上1/3部分掃描,并統(tǒng)計(jì)圖像每一行中的邊緣點(diǎn)的個(gè)數(shù),當(dāng)邊緣點(diǎn)數(shù)大于等于4的時(shí)候,表明肺片并未粘連,但是,當(dāng)邊緣點(diǎn)數(shù)小于4的時(shí)候,左右肺是粘連的。[10]肺片粘連情況下,對上半部分投影積分,將積分值最小的一列及其左右4列的像素值取反,從而實(shí)現(xiàn)左右肺的準(zhǔn)確分離。

3 圖像修復(fù)

對肺部圖像進(jìn)行預(yù)處理的過程中,接近于肺壁的結(jié)節(jié)可能會被去掉,因此在預(yù)分割后要修補(bǔ)圖像。本文采用的修復(fù)算法是擴(kuò)散算法來。[11]

將完整的肺實(shí)質(zhì)圖像定義為函數(shù),在時(shí)刻,圖像質(zhì)量為。圖像受損過程可以用以下模型來表示,

拉普拉斯算子利用點(diǎn)的四鄰點(diǎn)來進(jìn)行離散,得到如下的式子

利用該方法可以對逐次對各個(gè)像素點(diǎn)進(jìn)行計(jì)算并修復(fù)。下面的圖像是當(dāng)取不同數(shù)值時(shí)相應(yīng)的恢復(fù)圖像。當(dāng)b取值較小時(shí),圖像變化不明顯,當(dāng)b的取值較大時(shí)候,圖像受損。經(jīng)反復(fù)調(diào)試,當(dāng)b取值在20~25中間時(shí),圖像的恢復(fù)情況最佳,本文中b取值為23。

圖3中的圖片從左至右分別為b的取值為0,5,10,15,20,23,25,30,35時(shí)的恢復(fù)圖像。

4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

在美國國家癌癥中心(NCI)的RIDER庫中選取了50張CT圖像,將本文算法與運(yùn)用”滾球法”修復(fù)的算法比較,計(jì)算處理之后圖像的準(zhǔn)確率和精度。[12]

圖4為結(jié)果對比,從上到下依次為原始CT圖像,醫(yī)生手工分割結(jié)果,本文分割結(jié)果,文獻(xiàn)[14]分割結(jié)果。

4.1 分割準(zhǔn)確率

CT圖像分割的準(zhǔn)確率即為肺實(shí)質(zhì)區(qū)域的重合程度。分割準(zhǔn)確率的公式為

其中表示準(zhǔn)確率,表示分割后圖像面積,表示醫(yī)生手動分割的區(qū)域面積。

根據(jù)上述公式可知,。的值越大,則結(jié)果與醫(yī)生手工分割的肺實(shí)質(zhì)越相近,即分割的準(zhǔn)確率越高。[13]的值越小,則準(zhǔn)確率越低。結(jié)果見表1。

4.2 分割精度

將本文算法和使用滾球法的文獻(xiàn)[14]與醫(yī)生手工分割方法相比較。通過計(jì)算兩種分割方法的最大輪廓距離和平均輪廓距離來確定其分割精度。本文的方法為方法1,文獻(xiàn)[14]的方法為方法2,手工分割方法為方法3.方法1,2,3分割后提取的邊界點(diǎn)分別為,,。定義方法1分和方法3分割后的輪廓邊界點(diǎn)之間的輪廓距離為endprint

分別計(jì)算本算法與手動分割算法、文獻(xiàn)[9]方法與醫(yī)生手動分割算法的平均輪廓距離和最大輪廓距離。

計(jì)算結(jié)果見表2。

因此,本文的算法和醫(yī)生手動分割方法的結(jié)果相比于文獻(xiàn)[14]的方法更為相近,本文的方法提取的肺實(shí)質(zhì)部分精度更高。

5 結(jié)論

在CT圖像中精確提取肺實(shí)質(zhì)是對肺部疾病計(jì)算機(jī)診斷的關(guān)鍵,重點(diǎn)是保證提取出來的肺實(shí)質(zhì)是完整的。本文的分割方法結(jié)合了最優(yōu)閾值分割,區(qū)域生長以及數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)方法,將CT圖像的胸腔和背景區(qū)域去除,從而避免了直接對肺實(shí)質(zhì)部分進(jìn)行操作所造成的信息損失。同時(shí),將左右肺相粘連的情況也考慮在內(nèi),采用了行掃描的方法來確定是否粘連,如果粘連則將其分離。并且對分割后得到的肺部邊界信息丟失的問題,采用定向擴(kuò)散的修復(fù)算法來對預(yù)分割圖像進(jìn)行修復(fù)以保證肺實(shí)質(zhì)的完整性。使用本文的算法對大量LIDC庫中CT圖像進(jìn)行處理,并與現(xiàn)有的滾球法修復(fù)算法相比較,本文方法分割的準(zhǔn)確率及其分割的精度都較高。因此,本文中所提到的在CT圖像中提取肺實(shí)質(zhì)的方法能夠準(zhǔn)確有效的對肺實(shí)質(zhì)進(jìn)行提取,為計(jì)算機(jī)輔助診斷工作奠定了基礎(chǔ)。

由于人體的胸部結(jié)構(gòu)存在著明顯的差異,因此任何一種分割方法都不能適用于所有的CT圖像?;诖?,接下來的工作任務(wù)就是在分割的基礎(chǔ)上,對每一步分割再進(jìn)行細(xì)化,以得到一種能夠正確分割絕大多數(shù)CT圖像的方法。

基于 CT 圖像的肺實(shí)質(zhì)分割技術(shù)是制約醫(yī)學(xué)圖像在臨床和生命科學(xué)研究領(lǐng)域的應(yīng)用的一個(gè)瓶頸, 我們將繼續(xù)研究更完善的分割方法,提高肺實(shí)質(zhì)的分割精度,為計(jì)算機(jī)輔助診斷奠定基礎(chǔ)。

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