2018年10月25日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所黃三文研究組與華中農(nóng)業(yè)大學(xué)羅杰研究組合作，揭示了番茄育種過程中代謝組的變化及其遺傳基礎(chǔ)。

代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分，在揭示生命活動規(guī)律等方面發(fā)揮重要作用。代謝組學(xué)不僅在基礎(chǔ)植物生物學(xué)研究中起重要作用，而且在作物育種等領(lǐng)域也有廣泛的應(yīng)用前景；因此，對代謝物遺傳基礎(chǔ)的研究將為解析作物育種及代謝網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理奠定基礎(chǔ)。馴化、改良、分化和漸滲是番茄育種中的4個重要階段，但是目前對這一人類選擇過程中代謝物的變化卻不是很清楚。為了解析番茄育種過程中代謝物的變化，黃三文研究組與羅杰研究組合作對610份番茄材料進(jìn)行了重測序分析；同時對其中399份番茄材料的果肉進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序分析及對其中442份材料的果肉進(jìn)行了代謝組學(xué)分析。獲得以下結(jié)論：通過優(yōu)異等位位點(diǎn)的組合可顯著降低抗?fàn)I養(yǎng)因子甾醇糖基生物堿類（SGAs）的含量；育種過程中SIMYB12除了在番茄果皮顏色的分化過程中起作用外, 還對番茄的風(fēng)味品質(zhì)有重要影響。

研究首次利用多組學(xué)手段系統(tǒng)解析了人工選擇對作物代謝物的影響，為番茄品質(zhì)改良奠定了良好的理論基礎(chǔ)。