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中華蜜蜂促分裂原活化蛋白激酶ERK-A基因的克隆與低溫表達(dá)分析

2018-03-22 03:43:20陳文鳳張衛(wèi)星王紅芳胥保華
中國蜂業(yè) 2018年2期
關(guān)鍵詞:昆蟲蜜蜂低溫

陳文鳳 張衛(wèi)星 王紅芳 胥保華

(山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院,泰安 271018)

細(xì)胞對環(huán)境變化的反應(yīng)部分是由一系列胞內(nèi)信號途徑來誘導(dǎo)的,信號通路接替、放大并整合來自胞外刺激的信號,最終導(dǎo)致基因和生理的改變。昆蟲為適應(yīng)極端環(huán)境,體內(nèi)會啟動一系列代謝和調(diào)控反應(yīng)。絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信號通路參與細(xì)胞的生長、發(fā)育、分化、凋亡等多種生理過程,不僅應(yīng)答生物脅迫中的病原體感染,也對鹽、高溫、低溫、干旱等非生物脅迫有響應(yīng)[1,2]。MAPK信號通路主要由ERK(extracellular signalregulated kinases)、JNK(The c-Jun amino-terminal kinases)和p38等并行的幾條信號通路組成。JNK主要參與細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,p38主要參與細(xì)胞對炎癥因子和環(huán)境脅迫(UV、溫度、缺血缺氧)的響應(yīng),而ERK信號通路主要參與調(diào)控細(xì)胞分裂過程。ERK信號通路在MAPK信號通路中最早被發(fā)現(xiàn)且研究得最為深入。ERK包括ERK-1和ERK-2兩種激酶,該途徑主要介導(dǎo)有絲分裂信號向胞內(nèi)和核內(nèi)傳遞,調(diào)控細(xì)胞的生長過程[3]。

應(yīng)激反應(yīng)是受細(xì)胞內(nèi)信號系統(tǒng)調(diào)節(jié)的復(fù)雜過程,MAPK、G蛋白耦聯(lián)受體以及TGF-β等信號通路都參與應(yīng)激反應(yīng)[4,5]。當(dāng)動物處于冷應(yīng)激條件下時,動物機體作為一個整體發(fā)生反應(yīng),其神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)、心血管系統(tǒng)、消化系統(tǒng)以及免疫系統(tǒng)等均發(fā)生一系列多系統(tǒng)、多層次的協(xié)調(diào)效應(yīng),以提高機體的適應(yīng)能力和維持內(nèi)環(huán)境的相對穩(wěn)定。動物應(yīng)激及動物對應(yīng)激原的適應(yīng)具有分子基礎(chǔ),可以認(rèn)為是一種基因行為[6,7]。任何機體酶和蛋白質(zhì)的差異,其根本原因是基因表達(dá)的差異。在冷應(yīng)激過程中主要表現(xiàn)為蛋白合成率的總體下降,但是某些蛋白的合成反而上升或嚴(yán)重下降,說明他們的表達(dá)受到了冷應(yīng)激的特異性調(diào)節(jié),并可能在冷應(yīng)激過程中扮演重要角色[8]。ERK-A信號通路可將胞外刺激與胞內(nèi)功能聯(lián)系起來,通過研究ERK信號通路調(diào)節(jié)機制可以了解冷應(yīng)激對細(xì)胞活動的影響。研究發(fā)現(xiàn),ERK通路通過調(diào)節(jié)類固醇和山梨醇的合成來終止家蠶幼蟲的滯育過程,表明ERK通路參與了昆蟲在低溫條件下的代謝調(diào)節(jié)[9,10]。

雖然對蜜蜂抵抗低溫的生理生化機制已有很多研究[11],但信號通路在中華蜜蜂低溫響應(yīng)機制中的作用還鮮有報道,本研究通過將中華蜜蜂成蟲置于4℃環(huán)境下4 h,并在處理過程中取樣,取樣在3 min內(nèi)完成,取樣后立即將蜜蜂放回原處理條件下。利用實時定量PCR檢測ERK-A基因的表達(dá)量,探討ERK-A基因是否在中華蜜蜂適應(yīng)低溫環(huán)境中發(fā)揮作用。

1 材料與方法

1.1 供試蜂種

中華蜜蜂(簡稱中蜂,A.cerana cerana),飼養(yǎng)于山東農(nóng)業(yè)大學(xué)實驗研究基地。

1.2 主要試劑

BL21(DE)和感受態(tài)細(xì)胞DH5α購自北京全式金生物技術(shù)有限公司,克隆載體pEasy-T3購于TransGen公司,原核表達(dá)載體Pet-30a(+)由本實驗室提供。TaqDNA聚合酶、T4 DNA連接酶、dNTP、DNA Marker、SYBR PrimeScriptTM RT-PCR Kit、各種限制性內(nèi)切酶購于寶生物工程(大連)有限公司(TaKaRa);瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購于Solarbio公司;質(zhì)粒提取試劑盒Plasmid Mini Kit購于OMEGA公司;引物合成和測序由上海生工生物工程股份有限公司完成。

1.3 PCR引物(表1)

表1 PCR引物

1.4 中華蜜蜂ERK-A基因的生物信息學(xué)分析

利用DNAMAN 6.0軟件將ERK-A基因的開放讀碼框翻譯成氨基酸序列,得到蛋白,在NCBI網(wǎng)站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上將ERK-A同其它物種進行Blast同源比對。在亞細(xì)胞定位預(yù)測網(wǎng)站(http://psort.hgc.jp/form.html)上預(yù)測該蛋白質(zhì)在細(xì)胞中的位置,利用MEGA 5軟件對不同物種ERK-A基因序列進行多重比對,通過NJ(neighbor joining)方法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。

1.5 中華蜜蜂的低溫處理

選取正常蜂群中的中華蜜蜂320只,分成4組,每組80只,隨機選取三組在4℃冰箱中放置15 min、30 min、1 h、2 h、2.5 h、3 h、4 h,另一組放置于25℃恒溫恒濕培養(yǎng)箱中,處理后直接將蜜蜂凍存在液氮中,將25℃飼養(yǎng)的蜜蜂成蟲作為對照,不作低溫處理直接凍存在液氮中,以單只蜜蜂為一個樣品,每個處理共3只蜜蜂(即3次重復(fù))。

1.6 中華蜜蜂總RNA的提取、cDNA的合成以及實時熒光定量PCR

每群選取2只蜜蜂液氮研磨,Trizol法提取總mRNA,然后使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(TaKaRa:DRR037A)立即反轉(zhuǎn)錄為cDNA,調(diào)節(jié)樣品cDNA濃度于相同水平后,-20℃保存?zhèn)溆谩RT-PCR取1000 ng cDNA加入到20 μl熒光定量體系中,按照熒光定量試劑盒(TaKaRa)操作指南,用7500 Real-Time PCR儀(ABI 7500,USA)檢測目的基因相對表達(dá)量。反應(yīng)程序:預(yù)變性95℃,10 s;變性95℃,5 s;退火60℃40 s,40個循環(huán),熔解曲線添加,1個循環(huán)。目的基因引物設(shè)計參考序列來自于NCBI數(shù)據(jù)庫,以action為內(nèi)參,采用Primer 5.0進行引物設(shè)計,委托生工生物科技有限公司合成引物。

2 結(jié)果與分析

2.1 中華蜜蜂ERK-A基因cDNA的克隆(圖1)

圖1 ERK-A基因克隆

2.2 中華蜜蜂ERK-A基因cDNA的序列分析

通過DNAMAN 6.0軟件進行分析獲得中華蜜蜂ERK-A基因的開放讀碼框,含有1098 bp的堿基,編碼365個氨基酸,編碼蛋白質(zhì)命名為ERK-A,其分子量為42 kDa,等電點為6.03。ERK-A1/2 是細(xì)胞對外界信號產(chǎn)生應(yīng)答的上游樞紐,通過亞細(xì)胞定位預(yù)測(http://psort.hgc.jp/form.html),ERK-A主要存在于細(xì)胞質(zhì)中,且無信號肽編碼序列,無跨膜結(jié)構(gòu)(圖2)。ERK-A具有MAPK超家族的序列特征,即存在激酶的保守區(qū)和磷酸化位點(下劃線標(biāo)的TEY序列)。

圖2 中華蜜蜂ERK-A的核酸與氨基酸序列

2.3 中華蜜蜂ERK-A蛋白的同源性分析

圖3 中華蜜蜂與其他物種的同源比對

將ERK-A的氨基酸序列在NCBI網(wǎng)站進行Blast比對,結(jié)果表明ERK-A與同為蜜蜂科Apis mellifera(GenBank登錄號:XP_393029.2)的相似性最高,一致性99.18%,與Harpegnathos saltator (GenBank登錄號:XP_017789097.1)的一致性97.81%。與Eufriesea Mexicana和Melipona quadrifasciata的一致性都在97%以上(圖3),說明該基因在進化上高度保守。

2.4 中華蜜蜂ERK-A基因的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測及磷酸化位點分析

MAPK的激活都是通過TEY基序中蘇氨酸(T)和酪氨酸(Y)的同時磷酸化實現(xiàn)的。利用SWISSMODEL(http://www.swissmodel.expasy.org/)預(yù)測ERK-A激酶的三級結(jié)構(gòu)(圖4),可以看出,N端結(jié)構(gòu)域主要由β折疊組成,C端結(jié)構(gòu)域主要由α螺旋組成,兩個結(jié)構(gòu)域之間的裂痕(即無規(guī)則卷曲)為ATP結(jié)合的激活環(huán),TEY基序就位于激活環(huán)內(nèi)[12]。

圖4 ERK-A的三維結(jié)構(gòu)剖面圖

2.5 中華蜜蜂ERK-A激酶與其他物種ERK-A激酶的系統(tǒng)樹構(gòu)建

從NCBI網(wǎng)站下載相近物種的部分ERK-A激酶序列,利用MEGA軟件,以酵母Saccharomyces merevisiae的ERK-A作為外群,通過Test Neighbor Joining Tree方法構(gòu)建以氨基酸序列為基礎(chǔ)的系統(tǒng)發(fā)生樹(圖5),結(jié)果表明:中華蜜蜂ERK-A和同為蜜蜂科的意大利蜜蜂Apis mellifera的ERK-A聚為一支,與蟻科的收獲蟻Pogonomyrmex barbatus和擬步甲科的赤擬谷盜Tribolium castaneum親緣關(guān)系較近。小鼠ERK-A和人ERK-A聚為一支,昆蟲ERK-A與哺乳動物ERK-A有更近的起源。

圖5 昆蟲ERK-A的系統(tǒng)進化樹

2.6 低溫脅迫下中華蜜蜂ERK-A基因的表達(dá)規(guī)律

為了研究ERK-A基因的表達(dá)是否對低溫脅迫做出響應(yīng),進行實時熒光定量PCR檢測。熒光實時定量PCR結(jié)果顯示,在低溫脅迫下ERK-A的表達(dá)均有顯著上調(diào)。在4℃脅迫30 min后,ERK-A的表達(dá)量就達(dá)到對照的2倍,2 h時達(dá)到最高峰是對照的4倍,此后雖有下降,但仍保持較高水平(圖6)。低溫表達(dá)分析說明,ERK-A基因的表達(dá)受到低溫的誘導(dǎo),可能在中華蜜蜂應(yīng)對低溫脅迫時發(fā)揮對細(xì)胞的調(diào)控作用。

圖6 低溫條件下ERK-A基因表達(dá)的變化

我們從蜜蜂轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中獲得ERK-A基因的cDNA序列的完整開放閱讀框長1098 bp,編碼365個氨基酸,編碼蛋白ERK-A的分子量為42 kDa,等電點為6.03。同源性分析發(fā)現(xiàn),該基因在進化上十分保守,在氨基酸水平上,與相近物種的ERK-A的一致性都達(dá)到97%以上,與意大利蜜蜂ERK-A的一致性達(dá)99.18%,表明ERK-A在生物體中都具有重要功能。本研究發(fā)現(xiàn)ERK-A在4℃呈上調(diào)表達(dá),說明ERK-A通路可能參與了中華蜜蜂耐寒機制的調(diào)控。

3 結(jié)論與討論

真核細(xì)胞已經(jīng)形成了特殊的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路來響應(yīng)細(xì)胞外的各種刺激,絲裂原蛋白激酶MAPK組成了一個絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族,通過磷酸化作用激活受體,調(diào)節(jié)細(xì)胞的增殖、分化和脅迫響應(yīng)[13]。在比較生物化學(xué)領(lǐng)域,MAPK信號通路在代謝調(diào)節(jié)和生化適應(yīng)方面的研究還比較少見,最初關(guān)于MAPK信號通路在缺氧狀態(tài)、熱應(yīng)激和冷應(yīng)激等方面的代謝應(yīng)答的研究也僅僅觸及其表面[14]。

通常認(rèn)為,ERK通路主要參與細(xì)胞存活和生長繁殖,其有效激活信號分子包括生長因子、激素、神經(jīng)遞質(zhì)、鈣離子等[15],而p38和JNK主要參與生長抑制和細(xì)胞凋亡,其有效激活因素有溫度、缺血缺氧等各種環(huán)境刺激[16]。ERK主要被生長因子、多肽類激素以及神經(jīng)遞質(zhì)激活,控制細(xì)胞增殖、分化、生存和凋亡。本研究中,ERK-A基因的表達(dá)受低溫誘導(dǎo),可能與ERK、p38和JNK三條通路的相互作用有關(guān)[17,18]。

本研究從中華蜜蜂轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中獲得ERK-A基因的cDNA,該基因在低溫條件下上調(diào)表達(dá),說明在中華蜜蜂中ERK通路可能參與了低溫下的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。昆蟲的一生會經(jīng)常性受到來自環(huán)境的各種各樣的刺激,昆蟲的誘導(dǎo)表達(dá)適應(yīng)機制提示人們,昆蟲對環(huán)境的適應(yīng)是一個能動的過程。昆蟲通過啟動與抗低溫有關(guān)的基因并使之表達(dá),給出逆境保護措施,從而協(xié)助昆蟲度過難關(guān)或逆境。因此,研究與冷應(yīng)激密切相關(guān)的基因,探討如何迅速誘導(dǎo)昆蟲冷適應(yīng)機制的高效運作,提高昆蟲在不利環(huán)境下的存活率,將是現(xiàn)在乃至將來昆蟲學(xué)家應(yīng)傾力研究的課題。此外,不同類型的應(yīng)激可以誘導(dǎo)不同的應(yīng)激蛋白,后者即可用來判斷昆蟲受到何種應(yīng)激和應(yīng)激的程度。研究冷應(yīng)激過程中發(fā)生改變的這些蛋白用以衡量應(yīng)激的程度,作為指導(dǎo)我們工作和生產(chǎn)的一個標(biāo)準(zhǔn)。因此,從分子水平上研究冷應(yīng)激的分子機制,將具有極大的基礎(chǔ)研究和實踐應(yīng)用價值,研究MAPK信號通路對低溫脅迫的調(diào)控,有助于全面了解昆蟲的耐寒機制。

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