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交叉引物等溫擴增-核酸試紙條技術檢測蠟樣芽孢桿菌

2018-03-26 06:22:44萊蕪檢驗檢疫局
食品安全導刊 2018年33期
關鍵詞:蠟樣條帶芽孢

□ 劉 敏 萊蕪檢驗檢疫局

蠟樣芽孢桿菌(Bacillus cereus)是比較常見的引發(fā)食源性疾病的病原菌[1]。目前,用于蠟樣芽抱桿菌的檢測方法有常規(guī)平板培養(yǎng)篩選法、PCR、酶反應法、免疫學技術等。近年發(fā)展起來的交叉引物等溫擴增技術(Cross Priming Amplification,CPA)對儀器設備的要求低[2]。本文擬結合交叉引物等溫擴增技術和核酸試紙條技術,建立一種高靈敏、高通量、特異性好、操作簡捷的蠟樣芽胞桿菌快速檢測方法。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

1.1.1 菌種與試劑

蠟樣芽孢桿菌(ATCC7064)、沙門氏菌(ATCC14028)、大腸埃希氏菌(ATCC25922)、金黃色葡萄球菌(ATCC6538)和志賀氏菌(ATCC12022)均為萊蕪檢驗檢疫局技術中心凍存菌株。甜菜堿、MgS04購自Sigma公司,DNA Ladder Marker、BstDNA聚 合 酶、dNTPs、10×PCR Buffer、10×loading Buffer、rTaq DNA 和DNA快速提取試劑盒購自TaKaRa公司,核酸檢測試劑條和檢測裝置購自杭州優(yōu)思達生物技術有限公司。試驗中所涉及的微生物培養(yǎng)基均購自北京陸橋公司。

1.1.2 CPA引物與探針的設計

CPA引物及探針序列如表1所示。

1.2 試驗方法

1.2.1 菌株DNA模板的制備

分別接種蠟樣芽孢桿菌菌株及非蠟樣芽孢桿菌菌株于營養(yǎng)瓊脂平板上,培養(yǎng)18~24h后抽提單菌落細菌DNA,-20℃保存待用。

表1 CPA引物及探針序列

1.2.2 目的基因重組克隆質粒的構建

以蠟樣芽孢桿菌基因組為模板,用外圍引物進行PCR擴增,瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增產物。該PCR反應體系為 BCOF 0.8μmol/L 、BCOR 0.8 μmol/L、10×PCR Buffer 2.5 μL、dNTPs 2.0 μL 以 及 rTaq 0.3 μL,加水補足至25.0 μL。反應條件:94℃ 5min;94℃ 30s、60℃ 30s、72℃30s,30個循環(huán);72℃5min。1%瓊脂糖凝膠電泳驗證PCR產物是否與目的片段大小一致。切膠回收轉化至感受態(tài)細胞,提取重組克隆質粒進行測序分析,驗證產物是否為蠟樣芽孢桿菌核酸反應的特異性目標片段。

1.2.3 CPA反應體系的建立與優(yōu)化

以蠟樣芽孢桿菌基因組為模板,用1對外圍引物、1對交叉引物及2條標記后的探針,按照通用的CPA擴增條件組成20 μl的反應體系。在63℃恒溫條件下反應60min,凝膠電泳對擴增產物進行檢測,驗證用于CPA擴增的引物及探針是否可行[3]。

1.2.4 CPA結合核酸試紙條法判定檢測結果

取擴增產物,采用核酸試紙條進行結果判定。當檢測線和質控線同時出現紅色條帶,則判為陽性,表明樣本中含有被檢測的目標核酸產物。若檢測線沒有條帶出現,而只有質控線出現紅色條帶,則判為陰性,表明未檢測出目的核酸產物[4]。

2 結果與分析

2.1 蠟樣芽孢桿菌gyrB基因片段陽性克隆質粒的構建與驗證

電泳結果表明,該擴增片段與目的序列一致,其大小約為330bp,測序結果也表明該PCR擴增產物即為蠟樣芽孢桿菌gyrB基因的特異性序列。

2.2 CPA擴增反應體系的優(yōu)化結果

圖1 CPA擴增反應體系的優(yōu)化

結果如圖1所示,A中當Mg2+濃度為3.0~4.5mmol/L時,均出現電泳條帶;但當Mg2+濃度為4.0mmol/L時,條帶最亮,即為最佳Mg2+使用濃度。B中,dNTPs濃度在0.2~0.6mmol/L范圍內均能發(fā)生有效擴增,但當濃度為0.5mmol/L時,電泳條帶最亮,即為最佳dNTPs濃度。C中,在甜菜堿濃度為0.6~1.2mol/L時均有較清晰的電泳條帶出現,且亮度隨著甜菜堿濃度增大而增大,當1.0mol/L時條帶最亮,即甜菜堿的最佳濃度。D中,當Bst DNA polymerase濃度為8U和10U時電泳條帶最亮,且目測二者亮度基本相當,為節(jié)約試驗成本,選取8.0U為最佳的Bst DNA polymerase使用濃度。E中,當溫度為60℃時,出現較為明顯的電泳條帶,最亮條帶出現在62℃,高于此溫度后,擴增條帶開始變暗,則最佳反應溫度為62℃。F中,當反應時間為30min時CPA反應無法發(fā)生,45min時有輕微的擴增條帶出現但較暗,最亮電泳條帶出現在60~75min,反應時間超過75min后條帶逐漸變暗,則最佳反應時間為60min。

3 討論

本研究針對蠟樣芽胞桿菌特異性基因gyrB保守區(qū)域設計引物進行交叉引物恒溫擴增,建立了可用于快速篩選蠟樣芽胞桿菌的CPA-核酸試紙條法。在該反應體系的建立過程中,通過分析比較反應體系中多個因素的優(yōu)化結果,發(fā)現Mg2+、dNTPs、甜菜堿、Bst DNA polymerase濃度以及反應溫度、反應時間均能影響檢測效果。但該方法的檢測靈敏度有待進一步研究。

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