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熱提取法和離心柱吸附法提取DNA病原的比較

2018-04-16 01:11梁柱良王瑞深
今日畜牧獸醫(yī) 2018年3期
關(guān)鍵詞:豬丹毒上機(jī)生物科技

梁柱良,王瑞深

(深圳市光明新區(qū)動植物檢驗(yàn)檢測中心,深圳518107)

1 實(shí)驗(yàn)器材和耗材

ABI7500實(shí)時熒光PCR儀,雅馬拓DKM610C送風(fēng)定溫恒溫器,ESCOAC2-4S1生物安全柜,Eppendorf5424微量離心機(jī),移液槍,無核酸EP管,熱提取法試劑、離心柱吸附法試劑盒和熒光PCR試劑盒均選擇在有效期內(nèi)廣州某生物科技有限公司的產(chǎn)品等。

2 實(shí)驗(yàn)方法

2.1 分組

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2.2 提取

2.2.1熱提取法:50μl已研磨處理后樣品加入50μl核酸提取液,100℃恒溫處理10min,13000rpm離心5min,取上清液轉(zhuǎn)移至新1.5mlEP管,-20℃保存待用。

2.2.2離心柱吸附法:100μl已研磨處理后樣品按廣州某生物科技有限公司的離心柱吸附法試劑盒的產(chǎn)品說明書提取后-20℃保存待用。

2.3 上機(jī)

按廣州某生物科技有限公司熒光PCR試劑盒的產(chǎn)品說明書操作,熒光通道為FAM,反應(yīng)體系為25μl。

3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

圖1豬丹毒桿菌熒光PCR圖

圖2豬圓環(huán)2型病毒熒光PCR圖

陰性和陽性質(zhì)控品符合豬丹毒桿菌和豬圓環(huán)2型熒光PCR試劑盒的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),實(shí)驗(yàn)有效?,F(xiàn)整理實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:

4 分析討論

表1 豬丹毒桿菌熒光PCR結(jié)果分析

表2 豬圓環(huán)2型病毒熒光PCR結(jié)果分析

根據(jù)此次實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以分析得出,熱提取法和離心柱吸附法提取豬丹毒桿菌和豬圓環(huán)2型病毒陽性組織樣品和10*陽性對照樣品DNA后進(jìn)行熒光PCR實(shí)驗(yàn)定性檢測結(jié)果的準(zhǔn)確率均為100%,二者在準(zhǔn)確性上無差異;熱提取法上機(jī)CT值RSD%范圍在0.25~3.31內(nèi),離心柱吸附法上機(jī)CT值RSD%范圍在0.55~1.91內(nèi),兩者均在可接受范圍內(nèi),無明顯區(qū)別。熱提取法操作簡單,耗時少,實(shí)驗(yàn)儀器需要能達(dá)到100℃的恒溫箱,儀器條件要求較高,較適合任務(wù)急和批量大的檢測任務(wù);離心柱吸附法操作要求較嚴(yán)格,實(shí)驗(yàn)過程中需要多次轉(zhuǎn)移液體,容易產(chǎn)生交叉污染,但去雜質(zhì)提純能力強(qiáng),適合需要開展下游實(shí)驗(yàn)的核酸提取實(shí)驗(yàn)。

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