張高陽,鄧接樓,黃思齊,李德芳*
(1.江西上饒師范學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,江西上饒334001;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所,長沙410205)
酵母雙雜交技術(shù)于1989年由Fields等最先應(yīng)用,是一種有效的真核活細(xì)胞內(nèi)研究蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)平臺,其試驗(yàn)過程中省去了蛋白質(zhì)表達(dá)純化及抗體制備的繁瑣步驟,因其簡便、快捷、高通量篩選,能夠反映在正常生理狀態(tài)下蛋白質(zhì)的活性特征等優(yōu)點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)相互作用方面的研究[1]。
紅麻(Hibiscus cannabinus)為錦葵科木槿一年生草本韌皮纖維作物,富含大量優(yōu)質(zhì)天然纖維素,是目前世界上麻紡工業(yè)重要的原料[2]。β-酮脂酰-CoA合成酶(Ketoacyl coenzyme A synthetase,KCS)是植物體內(nèi)超長鏈脂肪酸和表皮蠟質(zhì)合成的關(guān)鍵酶,表皮蠟質(zhì)是防止植物水分散失和抵御不良環(huán)境危害的重要屏障,對植物的生長發(fā)育及應(yīng)對生物和非生物脅迫方面具有重要作用[3,4]。目前,有關(guān)KCS基因的研究主要集中在對其基因序列和功能的研究上,而對該基因的作用網(wǎng)絡(luò)以及與體內(nèi)蛋白和蛋白之間的相互作用研究目前尚未見報道。因此,本研究主要集中構(gòu)建紅麻酮脂酰輔酶A合成酶(KCS)酵母雙雜交誘餌載體并檢測該蛋白自激活活性,旨在為下一步利用酵母雙雜交研究與酮脂酰輔酶A合成酶相互作用的蛋白奠定基礎(chǔ)。
菌株Mav103、DB3.1、pGBKT7質(zhì)粒、salmon DNA購自美國biolab公司;篩選培養(yǎng)基SD/-Trp、SD/-Trp-His、SD/-Trp-His-Ura、X-Gal購自美國 Clontech公司;DNA限制內(nèi)切酶、T4連接酶、Blue taq DNA聚合酶購自生工生物工程(上海)股份有限公司;引物由華大基因合成;其它試劑為國產(chǎn)分析純。
1.2.1 KCS基因片段獲得及誘餌載體構(gòu)建
提取紅麻葉片RNA,采用AccuScript反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA第一條鏈,根據(jù)基因和載體序列信息設(shè)計(jì)KCS基因擴(kuò)增引物,上游引物5’-GAATTCTCCCCTCTGTCGTGCAAGACAATGC-3’;下游引物5’-GCGGCCGCCTAGAGCTTGACAACTTCGGGGATG-3’,以 cDNA為模板進(jìn)行 PCR擴(kuò)增,利用EcoRⅠ、NotⅠ酶分別對PCR產(chǎn)物和pGBKT7質(zhì)粒進(jìn)行酶切,PCR產(chǎn)物和酶切載體回收純化后,利用T4連接酶進(jìn)行連接反應(yīng),構(gòu)建酵母誘餌表達(dá)載體pGBKT7-KCS。
1.2.2 酵母感受態(tài)細(xì)胞制備及載體轉(zhuǎn)化
挑取單個Mav103酵母菌,接種于50 mL YPD培養(yǎng)基中,于30℃以250 r/min振蕩培養(yǎng)16~18 h至A600nm在0.3~0.5之間。然后室溫離心(4000 rpm/min)5 min收集酵母細(xì)胞,棄上清,加入50 mL無菌水重懸菌體,離心5 min,沉淀用1.5 mL 1 X TE/LiAc重懸,離心,再用600μL 1 X TE/LiAc重懸菌體,酵母感受態(tài)細(xì)胞置于冰上備用。操作之前準(zhǔn)備PEG/LiAc溶液,以此加入誘餌載體3μL、Carrier DNA 4μL(20 mg/mL)、50μL酵母感受態(tài)細(xì)胞及0.6 mL PEG/LiAc溶液于1.5 mL離心管中,同時設(shè)置陰性對照質(zhì)粒、陽性對照質(zhì)粒,顛倒混勻后,置于30℃ 水浴30 min,每隔10 min顛倒混勻一次,30 min后加入20μL 100%DMSO溶液,混勻,于42℃熱激15 min,每隔5 min混勻一次,冰浴5 min。于室溫以3000 rpm/min離心5 min。棄上清,用1 mL YPD培養(yǎng)基重懸菌體,離心,棄上清,用0.5%NaCl重懸菌體,取50μL菌液涂布于相應(yīng)營養(yǎng)缺陷平板上,于30℃倒置培養(yǎng)3~5 d。
1.2.3 誘餌表達(dá)載體pGBKT7-KCS自激活檢測
待酵母培養(yǎng)3~5 d生長至3~5 mm時,用槍頭挑取酵母放入1.5 mL離心管中,置于液氮中,然后取出于室溫待其融化,反復(fù)5次,加入100μL無菌水作為模板,用PCR驗(yàn)證表達(dá)載體pGBKT7-KCS,驗(yàn)證正確的酵母轉(zhuǎn)移至SD-Leu培養(yǎng)上,培養(yǎng)3~5 d后,用NC膜將菌體復(fù)印在膜上,將沾有酵母的NC膜放入液氮中,反復(fù)3次,放入X-Gal染液中于30℃培養(yǎng),30 min后觀察菌落的顏色變化。
根據(jù)KCS基因序列設(shè)計(jì)PCR擴(kuò)增引物(F:5’-GAATTCTCCCCTCTGTCGTGCAAGACAATGC-3’,R:5’-GCGGCCGCCTAGAGCTTGACAACTTCGGGGATG-3’),PCR擴(kuò)增后用2%的凝膠電泳檢測,結(jié)果顯示有一條900 bp左右的條帶(圖1),經(jīng)回收測序驗(yàn)證后,將PCR產(chǎn)物與載體雙酶切連接,繼而轉(zhuǎn)化DB3.1細(xì)菌,提取質(zhì)粒,用EcoRⅠ、NotⅠ酶對質(zhì)粒酶切電泳后,發(fā)現(xiàn)一條與預(yù)期大小一致的片段(圖1),表明載體構(gòu)建正確,可用于下一步轉(zhuǎn)化試驗(yàn)。
圖1 KCS基因分離及酶切鑒定Fig.1 The isolation and enzyme digesting identification of KCSgene
待缺陷培養(yǎng)基上長出酵母單克隆后,用無菌槍頭挑取少量菌體于1.5 mL離心管中,以反復(fù)凍融后的菌體為模板,基因特異引物5’-CAATCGGACCGTTGGTTCTCCCGGC-3’和載體測序引物5’-GCAAAATTTTGGATTCTCAG-3’進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,單克隆能擴(kuò)增出一條800 bp左右的目的條帶(圖2)。
圖2 轉(zhuǎn)化酵母基因型鑒定Fig.2 The genotype detection of transformation yeast
經(jīng)驗(yàn)證正確的酵母單克隆轉(zhuǎn)移至SD-Leu篩選培養(yǎng)基上,待3~5 d后酵母細(xì)胞長至3.5 mm時,將細(xì)胞轉(zhuǎn)移至NC膜上,并置于液氮中反復(fù)凍融3次后放入預(yù)先備好的染色液中(Z buffer,10 mg/mL X-Gal),30 min后觀察酵母細(xì)胞顏色變化情況。結(jié)果顯示(見圖3),酵母陽性克隆細(xì)胞由白色變?yōu)樗{(lán)色,說明KCS蛋白上游DNA Binding Domain可與GAL4轉(zhuǎn)錄因子的上游激活位點(diǎn)(UAS)結(jié)合,自動激活報告基因β-半乳糖苷酶表達(dá),將KCS基因DNA Binding Domain刪除后,KCS蛋白在酵母中不具有自激活,可用于后期酵母雙雜交的誘餌蛋白研究與之相互作用的蛋白。
酵母雙雜交系統(tǒng)是在真核模式生物酵母中研究活細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)之間相互作用的方法之一,具有很高靈敏度,可以檢測到蛋白質(zhì)之間微弱的、瞬間的相互作用。酵母雙雜交技術(shù)不僅可以用來研究哺乳動物蛋白質(zhì)之間的互作,還可以用來研究高等植物蛋白質(zhì)之間的互作,因此,在目前生物學(xué)研究領(lǐng)域中被廣泛應(yīng)用[5]。KCS基因是超長鏈脂肪酸延伸過程中的關(guān)鍵酶,負(fù)責(zé)蠟質(zhì)成分前體的合成,表皮蠟質(zhì)與植物防止非氣孔性失水、機(jī)械損傷、低溫凍傷、病毒侵害、花粉與柱頭的信號識別、植物形態(tài)發(fā)育與育性等都密切相關(guān)[6-10]。目前,有關(guān)紅麻KCS蛋白在酵母中的研究還沒有報道。本研究構(gòu)建紅麻β-ketoacyl-coa synthase基因誘餌載體,結(jié)果顯示,該蛋白DNA binding區(qū)域能與酵母GAL4轉(zhuǎn)錄因子的上游激活位點(diǎn)(UAS)結(jié)合,自動激活下游報告基因的表達(dá),把KCS基因DNA Binding Domain刪除后,KCS蛋白在酵母中不具有自激活,因此,可用于后期酵母雙雜交的誘餌蛋白研究與之相互作用的蛋白。
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