梁 濱 董 冬
(山東省濱州市鄒平縣魏橋中學(xué) 山東濱州 256212)
植物在生長過程中會(huì)受到生物逆境(病原菌侵入、病蟲害等)和非生物逆境(高溫、高鹽、干旱等)的脅迫(圖1),從而抑制植物的生長發(fā)育,造成各種作物質(zhì)量、產(chǎn)量的下降,給人類生產(chǎn)帶來極大危害。在長期進(jìn)化過程中,植物為了適應(yīng)這些不利的環(huán)境因素,在體內(nèi)形成了一套既復(fù)雜且又高效的植物防衛(wèi)反應(yīng)機(jī)制。當(dāng)植物受到逆境脅迫時(shí),胞外的信號(hào)(高溫、高鹽、干旱、病原菌等)通過一系列信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑(例如通過MAPK 激酶等進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo))級(jí)聯(lián)放大進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi),通過與其他防御相關(guān)蛋白之間的相互作用,進(jìn)而激活或抑制下游相關(guān)防御基因的轉(zhuǎn)錄,從而響應(yīng)植物對(duì)相關(guān)逆境脅迫的應(yīng)答反應(yīng)[1]。其中,轉(zhuǎn)錄因子(MYC、NAC、WRKY、ERF、bZIP 等)在這一系列調(diào)控中起到非常重要的作用[2]。在這一系列的轉(zhuǎn)錄因子中,WRKY是近年研究比較廣泛的一類轉(zhuǎn)錄因子,研究表明,WRKY 在植物生長發(fā)育和防衛(wèi)反應(yīng)機(jī)制中起重要調(diào)控作用。
轉(zhuǎn)錄因子WRKY 是近年在植物中新發(fā)現(xiàn)的一類超大家族的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子[2],已發(fā)現(xiàn)的WRKY轉(zhuǎn)錄因子,在擬南芥、水稻等作物中參與免疫反應(yīng)調(diào)節(jié)的WRKY 家族成員既有起正調(diào)節(jié)作用的,也有起負(fù)調(diào)節(jié)作用的,但二者的N-末端均含有高度保守的WRKYGQK 氨基酸序列[3]。不同的WRKY家族成員均通過核心結(jié)構(gòu)域(WRKYGQK)結(jié)合靶基因啟動(dòng)子區(qū)域保守的W-BOX 調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄表達(dá),由此產(chǎn)生的一個(gè)突出問題是: 不同的WRKY家族成員如何實(shí)現(xiàn)其在植物應(yīng)答逆境過程中的特異功能?最近大量報(bào)道表明,除W-BOX 側(cè)翼序列能在一定程度上影響WRKY 蛋白特異調(diào)節(jié)靶基因外,還能與其他蛋白的互作并調(diào)節(jié)其功能以實(shí)現(xiàn)功能的特異性。該家族的WRKY 基因分別相繼從甜馬鈴薯、野燕麥、皺葉歐芹、擬南芥等植物中分離獲得。同時(shí),諸多專家也研究了其相應(yīng)的分子生物學(xué)功能,目前已在擬南芥中發(fā)現(xiàn)WRKY 基因74 個(gè),玉米中發(fā)現(xiàn)119 個(gè),水稻中發(fā)現(xiàn)105 個(gè),油菜中發(fā)現(xiàn)46 個(gè)。這些研究都表明了WRKY 轉(zhuǎn)錄因子確實(shí)參與植物的多種逆境脅迫的應(yīng)答,同時(shí)還參與植物生長的重要生理生化活動(dòng)的調(diào)控[4-6],在植物抗逆反應(yīng)過程中具有重要的作用(圖2)。
WRKY 轉(zhuǎn)錄因子是植物中廣泛存在的一類超基因家族,通過其保守的氨基酸序列(WRKYGQK)對(duì)靶基因啟動(dòng)子區(qū)域的W-box[(T)TGACC(AT)]特異識(shí)別,并調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。WRKY 家族在代謝調(diào)控、種子的萌發(fā)及發(fā)育衰老調(diào)控、植物防御應(yīng)答、形態(tài)學(xué)建成等生命過程中都起到重要作用。
WRKY 是鋅指結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄因子,它的DNA 結(jié)合區(qū)通常包含1 個(gè)或2 個(gè)保守的WRKY 核心結(jié)構(gòu)域,根據(jù)其DNA 結(jié)合區(qū)的核心結(jié)構(gòu)域的個(gè)數(shù)及鋅指結(jié)構(gòu)類型將WRKY 轉(zhuǎn)錄因子分為三大類:第1 類具有2 個(gè)WRKY 核心結(jié)構(gòu)域及Cys2His2 型鋅指結(jié)構(gòu);第2 類具有1 個(gè)WRKY 核心結(jié)構(gòu)域及Cys2His2 型鋅指結(jié)構(gòu);第3 類具有1 個(gè)WRKY 核心結(jié)構(gòu)域及Cys2HisCys 型鋅指結(jié)構(gòu)。WRKY 轉(zhuǎn)錄因子是植物中最大的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子家族之一(擬南芥中有74 個(gè)成員,水稻中100 多個(gè)成員,辣椒中有報(bào)道的也已經(jīng)有40 多個(gè)),它能與各種蛋白質(zhì)相互作用,包括MAP 激酶,MAP 激酶的激酶,14-3-3 蛋白,鈣調(diào)蛋白,組蛋白去乙?;福剐缘鞍缀推渌鸚RKY 轉(zhuǎn)錄因子,構(gòu)成完整的信號(hào)網(wǎng)路調(diào)節(jié)許多植物生理過程。
植物有2 套固有的可誘導(dǎo)的免疫機(jī)制: 病原菌相關(guān)分子模式觸發(fā)的免疫機(jī)制(PTI)及效應(yīng)子觸發(fā)的免疫機(jī)制(ETI)[2],而WRKY 轉(zhuǎn)錄因子在這2 種免疫機(jī)制中都起重要作用。擬南芥中AtWRKY48和AtWRKY7 在抗丁香假單孢桿菌中分別起正調(diào)節(jié)和負(fù)調(diào)節(jié)作用;AtWRKY51,AtWRKY70 在JA,SA,ET信號(hào)通路中起作用;AtWRKY25,AtWRKY40,AtWRKY28,AtWRKY70 同時(shí)受到生物及非生物脅迫的調(diào)控。同時(shí)WRKY 也受到機(jī)械損傷的誘導(dǎo),例如煙草的NtWRKY6,NtWRKY3,參與糖代謝,以及對(duì)低溫、干旱脅迫的應(yīng)答。關(guān)于辣椒WRKY家族的研究還很不深入,到2014年NCBI 才公布了11 條辣椒WRKY 基因序列。
擬南芥中AtWRKY58 作為NPR1(獲得性防御系統(tǒng)SAR 的一個(gè)負(fù)調(diào)節(jié)子)的下游基因參與NPR1 基因介導(dǎo)的信號(hào)傳遞。CaWRKY58 在辣椒對(duì)病原菌的防御反應(yīng)過程中起到轉(zhuǎn)錄負(fù)調(diào)節(jié)作用,青枯病侵染的辣椒中,CaWRKY58 的表達(dá)先出現(xiàn)先下調(diào)后上調(diào)的情況,而且CaWRKY58 的表達(dá)被茉莉酸和脫落酸所抑制,同時(shí)將CaWRKY58 轉(zhuǎn)化煙草,使煙草在病原菌侵染下表現(xiàn)出更嚴(yán)重的病狀,同時(shí)在轉(zhuǎn)化CaWRKY58 的煙草中很多重要的過敏反應(yīng)相關(guān)的標(biāo)記基因及一些防御相關(guān)的標(biāo)記基因都出現(xiàn)下調(diào),而且CaWRKY58 基因沉默后的辣椒植株表現(xiàn)出對(duì)病原菌的更耐受性及各種防御相關(guān)基因的上調(diào)。WRKY58 的作用可能是提供一個(gè)保障機(jī)制,以防止防衛(wèi)反應(yīng)的激活停留在高SA 水平。
WRKY 轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)含有DNA 結(jié)合區(qū)域、核定位信號(hào)區(qū)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)域和寡聚化位點(diǎn)[7]。結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是其DNA 結(jié)合區(qū)域中都至少含有一個(gè)WRKY 結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域的N-末端含有高度保守的WRKYGQK 氨基酸殘基和CX4-5CX22-23HXH 型或CX7CX23HXC 型的C-末端鋅指結(jié)構(gòu)。根據(jù)WRKY 的結(jié)構(gòu)特征,可分為3 種類型:Ⅰ類為WRKY 轉(zhuǎn)錄因子含有2 個(gè)WRKY 結(jié)構(gòu)域,鋅指結(jié)構(gòu)類型為C2H2(CX4-5CX22-23HX1H),其DNA 結(jié)合功能主要是通過C-末端的WRKY 結(jié)構(gòu)域介導(dǎo);Ⅱ類為WRKY轉(zhuǎn)錄因子只含1 個(gè)WRKY 結(jié)構(gòu)域,鋅指結(jié)構(gòu)類型也為C2H2(CX4-5CX22-23HX1H),而且大部分高等植物WRKY 轉(zhuǎn)錄因子是屬于這類型;Ⅲ類為WRKY 轉(zhuǎn)錄因子也僅含1 個(gè)WRKY 結(jié)構(gòu)域,鋅指結(jié)構(gòu)為C2HC (CX7CX23HX1C),但這類型轉(zhuǎn)錄因子一般只存在高等植物中,在一些低等植物中是不存在的。
眾多研究表明:WRKY 轉(zhuǎn)錄因子能特異結(jié)合啟動(dòng)子上的順式作用元件W-box[(T)(T)TGAC(C/T)],其中高度保守序列TGAC 對(duì)于WRKY 的結(jié)合功能是必要的,任一核苷酸被替代,與之結(jié)合的能力都大幅度下降甚至可能完全消失。研究還發(fā)現(xiàn)WRKY 轉(zhuǎn)錄因子不僅與自身基因啟動(dòng)子上的順式作用元件W-box 結(jié)合,而且與大量抗病相關(guān)基因啟動(dòng)子的W-box 結(jié)合參與表達(dá)調(diào)控[8],且這些W-box 多存在于抗病等相關(guān)基因的啟動(dòng)子區(qū)域,說明WRKY 轉(zhuǎn)錄因子參與植物的抗逆反應(yīng)及其生長過程中生理生化等的調(diào)控。為了進(jìn)一步研究W-box 順式作用元件在基因表達(dá)調(diào)控中的作用,通常利用人工合成只含W-box 順式作用元件的啟動(dòng)子研究其在植物中的防御反應(yīng)[9],結(jié)果表明僅含W-box 的啟動(dòng)子也能介導(dǎo)植物的逆境脅迫和防衛(wèi)反應(yīng)。
3.1 參與生物逆境脅迫 目前大量報(bào)道表明,WRKY 轉(zhuǎn)錄因子在生物脅迫中的作用方面的研究既廣泛又深入。植物免疫系統(tǒng)包括PTI (PAMPtriggered immunity),ETI (Effector- triggered immunity),MTI(MAMP-triggered immunity)及SAR(Systemic acquired resistance)等多種免疫系統(tǒng),WRKY基因在其中發(fā)揮著正調(diào)控或負(fù)調(diào)控的作用,而且在參與植物的抗病反應(yīng),既存在正調(diào)控調(diào)節(jié)又有負(fù)調(diào)控途徑[10]。
研究發(fā)現(xiàn),擬南芥的大部分WRKY 基因受SA(水楊酸)和病原菌的誘導(dǎo),并且這些WRKY 基因自身的啟動(dòng)子中富含W-box,說明這類轉(zhuǎn)錄因子在植物抗病反應(yīng)中形成一個(gè)復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。很多WRKY 轉(zhuǎn)錄因子被報(bào)道能調(diào)控抗病基因(PR)的表達(dá)。擬南芥AtWRKY70 在SA(水楊酸)和JA(茉莉酸)途徑中扮演了重要的調(diào)控角色,其功能的缺失將使植物易感染灰霉病菌、葉斑病菌和真菌性白粉病菌等[11]。擬南芥AtWRKY18,AtWRKY40和AtWRKY60 結(jié)構(gòu)非常相似,參與植物抗病并且在功能上存在冗余[12],此外,AtWRKY18 還作為正調(diào)控因子參與系統(tǒng)獲得性抗性,而AtWRKY40沒有參與其中[13]。
另一方面,也有許多WRKY 基因參與植物防御的負(fù)調(diào)控。在擬南芥中,AtWRKY7 功能缺失體將導(dǎo)致細(xì)菌性葉斑病菌抗性的增強(qiáng),且在AtWRKY7 和AtWRKY11 雙突變中得到進(jìn)一步的提高,說明兩者在抗病過程中起到負(fù)調(diào)控作用[14]。AtWRKY25,AtWRKY38 和AtWRKY62 在植物防御中也起到負(fù)調(diào)控作用,其過表達(dá)植株都顯著抑制 了PR 基因的表達(dá)[15-16]。
此外,還有許多非模式植物中WRKY 基因參與了抗病反應(yīng),如皺葉歐芹中PcWRKY1,2,3,4,5,紅辣椒中CaWRKY1,40,大麥中的HvWRKY1,2,10,19,28 等都在抗病調(diào)控方面起到重要的作用。
3.2 參與非生物逆境脅迫 近年越來越多的研究證實(shí)了WRKY 基因在高溫、高鹽、機(jī)械損傷、干旱等非生物逆境脅迫下,其表達(dá)量會(huì)發(fā)生特異地變化,表明其在非生物逆境中扮演重要的角色,對(duì)于了解植物適應(yīng)復(fù)雜多變的環(huán)境的分子機(jī)制具有重要的指導(dǎo)意義。qRT-PCR 研究發(fā)現(xiàn),擬南芥AtWRKY25,28,40,70 均受到高鹽、高溫及滲透脅迫的誘導(dǎo)[17],AtWRKY25,26,33,39 則能應(yīng)答熱激反 應(yīng)[18-19],AtWRKY57 能通過激活與ABA 相關(guān)基因的表達(dá)增強(qiáng)擬南芥耐干旱的能力[20]。此外還發(fā)現(xiàn)擬南芥AtWRKY7 中含有一個(gè)鈣調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合域,能特異結(jié)合鈣調(diào)蛋白并介導(dǎo)Ca2+離子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[21]。這些研究有力地說明了WRKY 轉(zhuǎn)錄因子在抵御高溫、高鹽、干旱和熱等復(fù)雜環(huán)境中發(fā)揮著重要的作用。
3.3 參與植物的生長發(fā)育及物質(zhì)代謝 研究表明,WRKY 家族還參與了調(diào)控植物種子形成、休眠和萌發(fā)及葉片衰老等生長發(fā)育及物質(zhì)代謝等一系列生理活動(dòng)。例如擬南芥AtWRKY10 參與種子的發(fā)育過程,AtWRKY6 不僅參與植物的防御應(yīng)答而且還參與植物的衰老調(diào)控,擬南芥AtWRKY44 參與調(diào)控種皮和表毛皮的發(fā)育,其功能突變體后使得表毛皮出現(xiàn)未分支且數(shù)量顯著下降,同樣地,水稻OsWRKY78 也參與調(diào)控種子大?。?]。此外,棉花GaWRKY1 參與調(diào)控棉子酚的合成。這些結(jié)果都表明WRKY 基因在植物生長發(fā)育、物質(zhì)代謝等生理過程中發(fā)揮了極其重要的作用。
其實(shí),在應(yīng)用基因工程培育作物抗逆新品種方面,人們已經(jīng)從植物基因組的角度進(jìn)行了深入的研究,這些研究成果在分子水平上對(duì)植物的相關(guān)表達(dá)調(diào)控機(jī)制的研究具有重要的指導(dǎo)意義。而啟動(dòng)子是基因表達(dá)調(diào)控的重要元件,是基因在轉(zhuǎn)錄水平的表達(dá)模式及調(diào)控機(jī)制中的一個(gè)關(guān)鍵元素。因此,研究WRKY 轉(zhuǎn)錄因子等相關(guān)抗病基因啟動(dòng)子的調(diào)控特性,分離并分析其順式作用元件的分布及逆境應(yīng)答對(duì)于闡明植物抗病性極其重要,可為作物抗病育種開辟出一條新途徑。大量報(bào)道表明,除了W-BOX 側(cè)翼序列能在一定程度上影響WRKY 蛋白特異調(diào)節(jié)靶基因外,還能與其他蛋白的互作并調(diào)節(jié)其功能以實(shí)現(xiàn)功能的特異性。而迄今僅分離鑒定了部分的WRKY 蛋白的互作蛋白,大多數(shù)WRKY 家族成員的互作蛋白仍未見報(bào)道。因此,分離相關(guān)的互作蛋白,同時(shí)對(duì)其互作驗(yàn)證及功能和作用機(jī)制的研究將成為今后的研究熱點(diǎn)。