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基于線性回歸的玉米生物量預(yù)測(cè)模型及驗(yàn)證

2018-06-05 06:54:52仇瑞承苗艷龍
關(guān)鍵詞:決定系數(shù)喇叭口農(nóng)科

仇瑞承,苗艷龍,張 漫※,李 寒,孫 紅

(1. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)現(xiàn)代精細(xì)農(nóng)業(yè)系統(tǒng)集成研究教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 北京 100083; 2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)信息獲取技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100083)

0 引 言

玉米生物量可以表征玉米生長(zhǎng)過(guò)程中的株型結(jié)構(gòu)、光吸收和碳同化情況、營(yíng)養(yǎng)狀況等,是玉米生態(tài)學(xué)參數(shù)的一個(gè)重要指標(biāo)[1-2]。玉米生物量包括地表生物量和地下生物量?jī)刹糠諿3]。由于地下生物量難以測(cè)量,地表生物量也可以用于評(píng)估玉米地下根系的長(zhǎng)勢(shì),所以大部分研究集中在玉米地表生物量的測(cè)量[4]。

傳統(tǒng)的玉米地表生物量測(cè)量多是破壞性的,通過(guò)人工采集玉米植株,稱量其鮮質(zhì)量后,進(jìn)行干燥處理,再測(cè)量干質(zhì)量。這種測(cè)量方法工作量大,且對(duì)玉米的破壞是不可逆的。因此,目前國(guó)內(nèi)外對(duì)玉米生物量的測(cè)量研究,多是應(yīng)用玉米相關(guān)表型參數(shù)來(lái)估算其生物量,建立生物量的測(cè)量或者預(yù)測(cè)模型[5]。Freeman等[6]的研究表明,玉米株高是估算玉米生物量的重要指標(biāo),Wang等[7]、Li等[8]、Tilly等[9]在研究中應(yīng)用機(jī)載雷達(dá)測(cè)量玉米株高,用以估算玉米生物量,決定系數(shù)大于 0.80。但是,應(yīng)用單一變量預(yù)測(cè)玉米生物量,存在模型魯棒性差等缺陷。

氮元素作為作物生長(zhǎng)不可缺少的元素,直接影響作物生物量的積累[10-12],Mistele等[13]指出應(yīng)用光譜傳感器測(cè)量玉米的氮含量也可以預(yù)測(cè)玉米生物量,Montes等[14]將光柵傳感器測(cè)得的玉米株高與光譜傳感器測(cè)得的光譜數(shù)據(jù),采用支持向量機(jī)的方法進(jìn)行回歸分析,進(jìn)而對(duì)玉米生物量進(jìn)行預(yù)測(cè),提高了模型的準(zhǔn)確度,決定系數(shù)達(dá)到 0.97。此外,應(yīng)用光譜數(shù)據(jù)也可推算玉米的植被指數(shù)[15-16],如葉面積指數(shù) LAI[6]、歸一化植被指數(shù)NDVI[4,17-19]、土壤校正植被指數(shù)SAVI[20]等,將其與玉米株高相結(jié)合,也可對(duì)玉米生物量進(jìn)行高精度的預(yù)測(cè)[21]。但是,應(yīng)用光譜傳感器測(cè)量玉米的氮含量及植被指數(shù)易受外界光照影響,使得測(cè)量結(jié)果存在差異,且其設(shè)備價(jià)格昂貴,測(cè)量成本較高。

Pordesimo等[22]、Ciampitti等[23]通過(guò)分析玉米莖桿,提出應(yīng)用玉米莖粗和株高預(yù)測(cè)玉米生物量,決定系數(shù)分別達(dá)到0.83和0.75。但是研究所提出的模型較為復(fù)雜,莖桿待測(cè)量部位為玉米莖桿中部,莖粗參數(shù)較難獲得。

針對(duì)上述問(wèn)題,本文擬以玉米株高、莖桿末端的長(zhǎng)軸、短軸為輸入?yún)?shù),進(jìn)行線性回歸分析,建立玉米小喇叭口期的地表生物量預(yù)測(cè)模型,并應(yīng)用所建立的模型對(duì)玉米大喇叭口期的生物量進(jìn)行預(yù)測(cè),以評(píng)估模型的通用性,從而為實(shí)現(xiàn)玉米生物量的快速測(cè)量提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 數(shù)據(jù)獲取

試驗(yàn)地點(diǎn)為中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)上莊實(shí)驗(yàn)站(40.08°N,116.11°E)。試驗(yàn)用玉米品種為平展型的農(nóng)大84和緊湊型的京農(nóng)科728。玉米于2015年5月21日播種,行長(zhǎng)度12 m,行距60 cm,株距30 cm,每個(gè)品種各45行。相關(guān)參數(shù)測(cè)量日期分別為2015年6月21日(小喇叭口期)和2015年6月28日(大喇叭口期)。測(cè)量時(shí),每3~4行選擇 1行目標(biāo)行,在目標(biāo)行選擇具有代表性的樣本 4~5個(gè),分別測(cè)量玉米的株高 H(玉米葉片最高點(diǎn)至地面的距離)和最底端莖節(jié)的長(zhǎng)軸L、短軸S,然后收獲玉米的地上部分,裝入塑封袋中密封。試驗(yàn)當(dāng)天將樣本運(yùn)輸?shù)綄?shí)驗(yàn)室,人工稱量玉米植株的鮮質(zhì)量 FW 后,放入烘干箱進(jìn)行烘干,烘干溫度為75 ℃,待玉米植株質(zhì)量恒定后稱量其干質(zhì)量DW。

1.2 數(shù)據(jù)處理

首先對(duì)獲得的玉米株高、莖粗和生物量數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,剔除異常數(shù)據(jù);然后應(yīng)用SPSS軟件對(duì)玉米小喇叭口期的數(shù)據(jù)進(jìn)行線性回歸分析,建立玉米生物量的預(yù)測(cè)模型,并應(yīng)用玉米大喇叭口期的數(shù)據(jù)對(duì)模型進(jìn)行驗(yàn)證。

1.2.1 數(shù)據(jù)篩選

計(jì)算玉米樣本鮮質(zhì)量和干質(zhì)量的比值,得到玉米各生育期的質(zhì)量含水率[24]。對(duì)玉米樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,剔除含水率遠(yuǎn)高于均值的樣本,獲得農(nóng)大84小喇叭口期樣本40例和大喇叭口期樣本40例,京農(nóng)科728小喇叭口期樣本40例和大喇叭口期樣本37例。應(yīng)用玉米小喇叭口期樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行建模分析,應(yīng)用大喇叭口期樣本數(shù)據(jù)對(duì)模型進(jìn)行檢驗(yàn)。

1.2.2 數(shù)據(jù)分析

以玉米株高H、莖桿長(zhǎng)軸L、莖桿短軸S為自變量,玉米鮮質(zhì)量FW、干質(zhì)量DW為因變量,應(yīng)用SPSS軟件和Matlab軟件對(duì)樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,包括共線性檢驗(yàn)、線性回歸分析、事后檢驗(yàn)和交叉驗(yàn)證。

首先,對(duì)回歸分析中的自變量進(jìn)行共線性檢驗(yàn)。計(jì)算自變量之間的相關(guān)系數(shù),選擇方差膨脹因子(VIF)作為評(píng)判指標(biāo)[25],如式(1)所示。

式中 r表示自變量之間的相關(guān)系數(shù)。如果 VIF值大于10[26],則認(rèn)為自變量之間存在共線性。

應(yīng)用SPSS軟件對(duì)樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行線性回歸分析,包括多元線性回歸和逐步回歸。應(yīng)用玉米小喇叭口期的數(shù)據(jù)建立玉米鮮質(zhì)量、玉米干質(zhì)量的預(yù)測(cè)模型,并對(duì)玉米大喇叭口期的數(shù)據(jù)進(jìn)行測(cè)試。選用決定系數(shù) R2、均方根誤差RMSE(式(2))和相對(duì)均方根誤差rRMSE(式(3))作為模型預(yù)測(cè)精度的評(píng)價(jià)指標(biāo)[5]。

式中 n表示樣本數(shù)量,Si表示人工測(cè)量值,iS′表示預(yù)測(cè)值。通常較大的R2、較小的RMSE和rRMSE表明回歸效果較好。選用 P值對(duì)回歸模型中各參數(shù)的顯著性進(jìn)行檢驗(yàn),評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)如下:

在P<0.05條件下,進(jìn)行單因素方差分析(ANOVA)Duncan檢驗(yàn),以評(píng)估不同模型之間的差異性[27]。應(yīng)用Matlab軟件,采用“留一法”對(duì)模型進(jìn)行交叉驗(yàn)證。

2 結(jié)果與分析

2.1 玉米小喇叭口期生物量模型

2.1.1 樣本特征

對(duì)農(nóng)大84和京農(nóng)科728樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,在不同生育時(shí)期的主要特征參數(shù)如表1所示。由表1可知,玉米的鮮質(zhì)量、干質(zhì)量與玉米株高、莖桿長(zhǎng)軸、短軸相比,具有較高的變異系數(shù),呈現(xiàn)更廣的空間變異。

表1 農(nóng)大84、京農(nóng)科728樣本的主要特征Table 1 Main characteristics of Nongda 84 and Jingnongke 728 samples

2.1.2 變量共線性檢驗(yàn)

為了保證線性回歸的準(zhǔn)確性,對(duì)自變量玉米株高H,莖桿長(zhǎng)軸L和莖桿短軸S進(jìn)行共線性檢驗(yàn)。農(nóng)大84和京農(nóng)科728中,3個(gè)參數(shù)之間的相關(guān)系數(shù)、VIF值如表2所示。農(nóng)大84的VIF值范圍為1.090~2.342;京農(nóng)科72的VIF值范圍為1.393~2.189,都滿足VIF<10,表明H、L、S之間的共線性可以被忽略,3個(gè)自變量都可用于建立模型。

2.1.3 玉米生物量預(yù)測(cè)多元回歸模型建立

分別以H、L、S單一變量為自變量,或幾個(gè)變量組合為自變量,以玉米小喇叭口期鮮質(zhì)量FW,干質(zhì)量DW為因變量,建立多元回歸模型。農(nóng)大84、京農(nóng)科728的鮮質(zhì)量、干質(zhì)量預(yù)測(cè)模型如表3所示。

表2 農(nóng)大84、京農(nóng)科728中H、L、S間的相關(guān)系數(shù)和VIF值Table 2 Correlations and VIF values among H, L, and S of Nongda 84 and Jingnong 728

表3 農(nóng)大84、京農(nóng)科728生物量模型及評(píng)價(jià)Table 3 Biomass model and evaluation indicators of Nongda 84 and Jingnongke 728

上述生物量模型中,各自變量P值均小于0.001,表明統(tǒng)計(jì)結(jié)果非常顯著。

以H、L和S為單一輸入量,建立表3中的模型1、2、3。由結(jié)果可知,L、S與玉米鮮質(zhì)量和干質(zhì)量的相關(guān)性高于H,且模型2、3的精度優(yōu)于模型1。

以 H、L、S為輸入量,建立的生物量預(yù)測(cè)模型 4,與玉米鮮質(zhì)量和干質(zhì)量呈現(xiàn)的相關(guān)性最高,且預(yù)測(cè)精度也最高。針對(duì)農(nóng)大84的鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,模型4的決定系數(shù)R2分別為0.908和0.910;均方根誤差RMSE分別為5.503和0.575 g;相對(duì)均方根誤差rRMSE分別為7.21%和 7.05%。針對(duì)京農(nóng)科 728的鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,模型 4的決定系數(shù)R2分別為0.919和0.929;均方根誤差RMSE分別為6.408和0.533 g;相對(duì)均方根誤差rRMSE分別為7.70%和6.79%。

在玉米的鮮質(zhì)量和干質(zhì)量中,玉米莖桿質(zhì)量所占比例最高,且玉米莖桿橫切面近似為橢圓,玉米莖桿可近似看作一橢圓柱體,可由此建立玉米生物量模型。橢圓的面積、橢圓柱體的體積可分別由式(5)、(6)計(jì)算獲得。

式中Sellipse表示橢圓面積,l、s分別表示橢圓的長(zhǎng)半軸和短半軸,Vellipse表示橢圓柱體體積,h表示柱體高度。以此為依據(jù),建立表3中的模型5~9。其中,模型5、6與Ciampitti等[23]建立的玉米生物量模型相似。

由表3的回歸結(jié)果可知,模型7的擬合效果最優(yōu),優(yōu)于模型5、6。針對(duì)農(nóng)大84的鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,模型7的決定系數(shù)R2分別為0.874和0.877;均方根誤差RMSE分別為6.449和0.674 g;相對(duì)均方根誤差rRMSE分別為8.02%和8.00%。針對(duì)京農(nóng)科728的鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,模型 7的決定系數(shù) R2分別為 0.893和0.903;均方根誤差RMSE分別為7.363和0.628 g;相對(duì)均方根誤差rRMSE分別為8.82%和7.48%。

2.1.4 玉米生物量預(yù)測(cè)逐步回歸模型建立

參考多元線性回歸所建立的模型,以H、L、S、S×H、L×H、L×S、L×S×H 為自變量,F(xiàn)W、DW 為因變量,應(yīng)用逐步回歸方法,建立玉米生物量預(yù)測(cè)模型。逐步回歸方法可確保模型中只包含顯著性變量,可與多元線性回歸模型進(jìn)行比較。農(nóng)大84和京農(nóng)科728的鮮質(zhì)量、干質(zhì)量預(yù)測(cè)模型如圖1所示。

圖1 小喇叭口期玉米生物量逐步回歸模型預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值比較Fig.1 Comparison of measured value and step regression model predicted value of maize biomass at small trumpet stage

其中,針對(duì)農(nóng)大84的鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,模型的決定系數(shù)R2分別為0.914和0.916;均方根誤差RMSE分別為6.839和0.801 g;相對(duì)均方根誤差rRMSE分別為8.21%和9.06%。針對(duì)京農(nóng)科728的鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,模型的決定系數(shù)R2分別為0.920和0.928;均方根誤差RMSE分別為6.392和0.777 g;相對(duì)均方根誤差rRMSE分別為7.57%和10.13%。

2.1.5 模型交叉驗(yàn)證

為了從有限的樣本數(shù)據(jù)中獲得盡可能多的信息,采用“留一法”[28]對(duì)多元回歸模型4、7和逐步回歸模型進(jìn)行內(nèi)部交叉驗(yàn)證,以檢驗(yàn)?zāi)P偷姆€(wěn)定性和可靠性,結(jié)果如表 4所示。由交叉驗(yàn)證結(jié)果可知,交叉驗(yàn)證獲得的決定系數(shù)R2和均方根誤差RMSE[29]與原模型相近。與原模型相比,模型4的決定系數(shù)差值小于0.027,RMSE的差值小于 0.993和 0.081 g;模型 7的決定系數(shù)差值小于0.016,RMSE的差值小于0.503和0.039 g;逐步回歸模型的決定系數(shù)差值小于 0.017,RMSE的差值小于 1.016和0.192 g,說(shuō)明所建模型具有較好的穩(wěn)定性和預(yù)測(cè)能力。

表 4 農(nóng)大84、京農(nóng)科728小喇叭口期生物量模型交叉驗(yàn)證Table 4 Cross-validation of biomass model for Nongda 84 and Jingnongke 728 at small trumpet stage

2.2 玉米大喇叭口期生物量預(yù)測(cè)

隨著玉米的生長(zhǎng),田間采樣難度逐漸增大,玉米的烘干時(shí)間也相應(yīng)延長(zhǎng),人工測(cè)量玉米生物量變得更加困難。應(yīng)用2.1節(jié)建立的玉米生物量模型對(duì)玉米大喇叭口期生物量進(jìn)行預(yù)測(cè),以降低生物量測(cè)量的工作強(qiáng)度。

單因素方差分析結(jié)果顯示,表 3所建立的多元回歸模型4、7和2.1.4節(jié)所建立的逐步回歸模型沒(méi)有明顯差異,應(yīng)用 3個(gè)模型對(duì)大喇叭口期數(shù)據(jù)進(jìn)行檢驗(yàn),預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值比較結(jié)果如圖2、圖3所示。

圖2 農(nóng)大84大喇叭口期生物量預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值比較Fig.2 Comparison of measured value and model predicted value for Nongda 84 biomass at large trumpet stage

由圖2可知,多元回歸模型4、7和逐步回歸模型對(duì)農(nóng)大84大喇叭口期的生物量預(yù)測(cè)精度較高,其中逐步回歸模型的決定系數(shù)最高,且RMSE、rRMSE值最低,針對(duì)鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,其決定系數(shù)分別為 0.866、0.875,RMSE分別為30.790和2.752 g,rRMSE分別為13.53%、11.41%。多元回歸模型 7的預(yù)測(cè)精度略低于逐步回歸模型,針對(duì)鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,其決定系數(shù)分別為 0.860和0.863,RMSE分別為36.047和2.957 g,rRMSE分別為17.83%和12.39%。但其模型相對(duì)簡(jiǎn)單,不需要株高H參與運(yùn)算,可降低生物量測(cè)量的工作量。

圖3 京農(nóng)科728大喇叭口期生物量預(yù)測(cè)值與實(shí)測(cè)值比較Fig.3 Comparison of measured value and model predicted value for Jingnongke 728 biomass at large trumpet stage

由圖3可知,多元回歸模型4、7和逐步回歸模型對(duì)京農(nóng)科 728大喇叭口期的生物量預(yù)測(cè)精度較低,都具有較小的決定系數(shù)和較大的RMSE、rRMSE。3個(gè)模型中,多元回歸模型7的預(yù)測(cè)精度最高,RMSE、rRMSE較小,其對(duì)京農(nóng)科 728大喇叭口期的鮮質(zhì)量的決定系數(shù)為0.539,RMSE為46.338 g,rRMSE為17.08%,對(duì)干質(zhì)量的決定系數(shù)為0.496,RMSE為7.298 g,rRMSE為25.67%。

由圖2、圖3可知,應(yīng)用玉米小喇叭口期的生物量模型對(duì)大喇叭口期的生物量進(jìn)行預(yù)測(cè),農(nóng)大84的預(yù)測(cè)精度優(yōu)于京農(nóng)科728。農(nóng)大84為平展型玉米,光照大部分集中于植株的上方,尤其在田間封壟后,影響作物的光能利用率。而京農(nóng)科 728為緊湊型玉米,上部葉片向上挺舉,株型較高,尤其在玉米生長(zhǎng)后期特征更加明顯。該株型擴(kuò)大了玉米的光合面積,群體受光率遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于平展型玉米,生物量能夠快速積累[30]。穗期的玉米生長(zhǎng)迅速,應(yīng)用京農(nóng)科 728小喇叭口期的生物量模型預(yù)測(cè)大喇叭口期生物量,使得預(yù)測(cè)結(jié)果偏差較大。

3 結(jié) 論

1)本文對(duì)單株玉米生物量樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,以單株玉米測(cè)得的株高和莖粗參數(shù)為輸入,建立玉米生物量的線性回歸模型。結(jié)果表明,與玉米株高參數(shù)相比,玉米莖粗與生物量的相關(guān)性較高,其決定系數(shù)高于0.738,可應(yīng)用莖粗參數(shù)建立模型預(yù)測(cè)玉米生物量。

2)應(yīng)用玉米的株高、莖粗參數(shù)建立了玉米小喇叭口期的生物量預(yù)測(cè)模型。其中,本文所提出的多元回歸模型4、7和逐步回歸模型對(duì)平展型農(nóng)大84、緊湊型京農(nóng)科728都具有較好的適用性,針對(duì)鮮質(zhì)量和干質(zhì)量,模型的決定系數(shù)分別高于 0.874和 0.877,RMSE分別小于 7.363和0.801 g、rRMSE分別小于8.82%和10.13%。對(duì)模型的“留一法”交叉驗(yàn)證結(jié)果表明,模型具有較好的穩(wěn)定性,可用于玉米小喇叭口期生物量的測(cè)量。

3)應(yīng)用建立的玉米小喇叭口期生物量預(yù)測(cè)模型對(duì)玉米大喇叭口期生物量進(jìn)行預(yù)測(cè),平展型農(nóng)大84的預(yù)測(cè)效果優(yōu)于緊湊型京農(nóng)科 728。逐步回歸模型對(duì)平展型農(nóng)大84大喇叭口期鮮質(zhì)量和干質(zhì)量的預(yù)測(cè)精度最高,其決定系數(shù)分別為0.866和0.875,RMSE分別為30.790和2.752 g,rRMSE分別為13.53%和11.41%,具有較好的適用性,可用于平展型玉米大喇叭口期生物量的預(yù)測(cè)。

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