李蒙,田國祥,賀海蓉,耿輝,曾憲濤,呂軍
作者單位:1 710061 西安,西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院內(nèi)分泌科;2 100700 北京,陸軍總醫(yī)院干四科;3 710061 西安,西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院臨床研究中心;4 710061 西安,西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院體檢部;5 430071 武漢,武漢大學(xué)中南醫(yī)院循證與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心·武漢大學(xué)循證與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心·武漢大學(xué)第二臨床學(xué)院循證醫(yī)學(xué)與臨床流行病學(xué)教研室
重復(fù)測量設(shè)計在臨床研究中較為常見,即在給予一種或多種處理后,在多個時間點上從同一個受試對象重復(fù)獲得指標(biāo)的觀察值[1];重復(fù)測量設(shè)計的目的是探討同一研究對象在不同時間點某指標(biāo)的變化情況[2]。對重復(fù)測量數(shù)據(jù)進(jìn)行合理的管理,能夠使臨床研究數(shù)據(jù)采集過程順利實施?;诰W(wǎng)絡(luò)的電子數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)REDCap是由美國國立衛(wèi)生院(National Institutes of Health,NIH)出資支持,由美國Vanderbilt大學(xué)研發(fā)的免費電子數(shù)據(jù)采集軟件[3]。美國大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)研究普遍使用,目前全球已有117個國家共2659所大學(xué)使用該軟件。
縱向研究通常涉及到重復(fù)測量設(shè)計[4]。REDCap設(shè)計了縱向模塊以便能夠在特定的時間段內(nèi)多次捕獲相同的變量。這一模塊在結(jié)構(gòu)上類似于傳統(tǒng)的項目類型,通常會定義多個數(shù)據(jù)采集工具,并且在登錄REDCap時輸入所有數(shù)據(jù)。但是,啟用縱向模塊后,數(shù)據(jù)采集工具將以網(wǎng)格顯示以指明收集某一變量的不同時間點。臨床試驗經(jīng)常使用這個模塊,所有患者都在明確的時間段內(nèi)提供同樣的變量數(shù)據(jù)。因此,REDCap系統(tǒng)可通過縱向模塊輕松實現(xiàn)重復(fù)測量數(shù)據(jù)的管理。本研究以一篇已經(jīng)發(fā)表的臨床試驗文章中的數(shù)據(jù)為例,介紹REDCap實現(xiàn)重復(fù)測量數(shù)據(jù)的相關(guān)設(shè)置要點及數(shù)據(jù)錄入方法。
本研究以Gommoll等2015年發(fā)表的Ⅲ期臨床試驗“固定劑量的維拉唑酮治療廣泛焦慮障礙(GAD)的有效性和安全性”[5]為例,介紹REDCap實現(xiàn)重復(fù)測量數(shù)據(jù)的錄入、設(shè)定方法。該研究的數(shù)據(jù)采集情況(簡化版)如下:
(1)篩選期(week -1):HAMA評分、HDRS17評分、CGI-S評分、不良反應(yīng)(AEs)、C-SSRS評分、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
(2)基線期(week 0):年齡、性別、種族、體重、BMI、GAD病史(GAD病程、GAD發(fā)病年齡、GAD既往治療、GAD既往治療是否有效)、HAMA評分、SDS評分、HDRS17評分、CGI-S評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)C-SSRS評分、CSF-Q評分。
(3)試驗階段:
①week 1:HAMA評分、CGI-S評分、CGI-I評分、C-SSRS評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
②week 2:HAMA評分、SDS評分、CGI-S評分、CGI-I評分、C-SSRS評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
③week 3:CGI-S評分、C-SSRS評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
④week 4:HAMA評分、SDS評分、CGI-S評分、CGI-I評分、C-SSRS評分、CSF-Q評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
⑤week 5:CGI-S評分、C-SSRS評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
⑥week 6:HAMA評分、SDS評分、CGI-S評分、CGI評分、C-SSRS評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
⑦week 7:CGI-S評分、C-SSRS評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
⑧week 8:HAMA評分、SDS評分、HDRS17評分、CGI-S評分、CGI-I評分、C-SSRS評分、CSF-Q評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
(4)Down-taper期(week 9):C-SSRS評分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實驗室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。
使用REDCap錄入重復(fù)測量數(shù)據(jù)前,必須定義時間點和數(shù)據(jù)采集工具。也可使用REDCap的Schedule模塊為測量時間和測量事件提供日歷提醒。
2.1 建立數(shù)據(jù)采集工具 在建立數(shù)據(jù)采集工具前,應(yīng)充分研究研究方案。根據(jù)方案中每個時間點收集的數(shù)據(jù)情況設(shè)計數(shù)據(jù)采集工具。每個量表應(yīng)為單獨的數(shù)據(jù)采集模塊。患者基本信息、物理檢查、實驗室檢查、生命體征、不良反應(yīng)應(yīng)為單獨的數(shù)據(jù)采集模塊。
數(shù)據(jù)采集工具的設(shè)置參考文獻(xiàn)“如何利用REDCap數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)實現(xiàn)病例報告表的設(shè)計”。具體操作是:在主頁面上點擊“Design your data collection instrument”下的“Online Designer”。隨后設(shè)計數(shù)據(jù)采集工具,點擊“Create”創(chuàng)建新的工具(時間點),點擊“Choose action”可對工具進(jìn)行重命名、復(fù)制、刪除等。建立好的數(shù)據(jù)采集工具(簡化版)見圖1。
圖1 簡化版數(shù)據(jù)采集工具
2.2 時間點和事件的設(shè)置 臨床研究中,往往要在研究方案中指明指標(biāo)測量的時間。在REDCap中,時間點、事件的設(shè)置至關(guān)重要。
首先在REDCap項目設(shè)置界面的“Main project settings”中,點擊 “Use longitudinal data collection with repeating forms?”前的“Enable”,允許項目使用重復(fù)測量數(shù)據(jù)。此時會出現(xiàn)定義事件選項“Define your events and designate instruments for them”,點擊“Define My Events”即可定義事件并設(shè)置事件。此外,在實際的實驗方案執(zhí)行過程中,當(dāng)患者納入時,往往要設(shè)定好該患者指標(biāo)測量的時間點。點擊“Enable optional modules and customizations”下“Scheduling module(longitudinal only)”前的“Enable”即可設(shè)置事件執(zhí)行的時間(測量時間點)(圖2)。
在事件設(shè)定界面,可根據(jù)實驗方案設(shè)定事件的名稱和執(zhí)行的時間點(圖3)。其中,“Event”列是自動產(chǎn)生,不可編輯?!癉ays Offset”列指每個事件進(jìn)行的時間點(即測量時間點)?!癘ffset Range”列指時間點的前后范圍。通常情況下,時間點范圍的設(shè)置要考慮周末雙休日,因此通常設(shè)置為時間點的前后2 d,即-2和+2?!癊vent name”列指事件名稱,可自行定義。在本例中,每周都會測量一些指標(biāo),隨機對照試驗共8周,開始前有患者篩選期和基線數(shù)據(jù)收集期,分別定義為Screening(week -1)和Baseline(week 0)。隨機對照試驗結(jié)束后有一周的Down-taper,共11個事件。本研究重點介紹重復(fù)測量數(shù)據(jù)的錄入設(shè)置,因此我們僅用Arm 1,后續(xù)介紹隨機對照試驗時會詳細(xì)介紹不同的arm的設(shè)定。
圖2 項目主頁關(guān)于重復(fù)測量數(shù)據(jù)的設(shè)定
圖3 事件設(shè)置及時間點設(shè)定
2.4 為事件添加變量 當(dāng)事件和數(shù)據(jù)采集工具設(shè)計好后,可為不同的事件(測量時間)添加該時期需要采集的變量。在定義事件界面,點擊“Designate Instruments for My Events”,將會出現(xiàn)事件-變量網(wǎng)格,點擊“Begin editing”,即可在不同的事件下根據(jù)需要檢測的指標(biāo)選擇數(shù)據(jù)采集工具,如圖4所示。點擊“Save”保存設(shè)置。
2.5 Schedule功能的應(yīng)用 計劃模塊(The scheduling module)是一個可選的附加功能,只在縱向項目中可用。計劃模塊主要用于維護(hù)項目日歷。這一功能將允許用戶根據(jù)“Define My Events”頁面上定義的事件及其時間開始的天數(shù)和范圍生成時間表,為用戶提供日歷提醒。 用戶可通過選擇開始日期來生成時間表以方便后續(xù)的隨訪計劃。設(shè)定好的時間計劃可在日歷上查看。計劃生成器可以在納入新的患者時使用,也可對已存在的患者進(jìn)行設(shè)置。
具體操作:點擊主頁左側(cè)的“Schedule”,根據(jù)實際情況選擇新納入的患者或已收錄的患者,“Start Date”是指第一個事件(本文為Screening)開始的時間,可根據(jù)實際情況選擇。點擊“Generate Schedule”,可創(chuàng)建日歷計劃(圖5)。
圖6顯示了患者1的日歷計劃,從圖中可以看出,生成日歷計劃后,REDCap會自動將周末的時間標(biāo)紅,已提醒某一事件的計劃時間是節(jié)假日。如果用戶不改變隨訪計劃,則不必理會這一提醒。如想改變隨訪時間,則可對紅色提醒前方的日期根據(jù)實際情況修改。修改好后點擊下方的“Create Schedule”即可完成患者1的錄入、隨訪計劃時間表。
時間表創(chuàng)建好后,打開日歷模塊,同樣可看到患者1的錄入、隨訪時間(圖7)。
圖6 患者1的日歷計劃
2.6 數(shù)據(jù)錄入 數(shù)據(jù)錄入的設(shè)置參考文獻(xiàn)“如何利用REDCap數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)實現(xiàn)病例報告表的設(shè)計”。具體操作是:點擊左側(cè)“Add/Edit Records”,選擇已添加好的患者“Choose an existing Study ID”或添加新的患者“Add new record”,此處我們選擇已在Schedule模塊添加的患者1。此時會出現(xiàn)患者1的事件-變量網(wǎng)格(圖8),與圖4一致。錄入某一事件的某個數(shù)據(jù)時,可點擊此事件下針對的數(shù)據(jù)采集工具的圓圈。
例:錄入患者1在“Baseline(week 0)”時期的“Demogreaphis”數(shù)據(jù)時,點擊上圖“Baseline(week 0)”列、“Demogreaphis”行對應(yīng)的圓圈。在數(shù)據(jù)錄入界面的上方會再次提醒患者的編號、事件、數(shù)據(jù)采集工具(圖9)。數(shù)據(jù)錄入完成后,“Baseline(week 0)”列、“Demogreaphis”行對應(yīng)的圓圈會變成不同顏色(紅色表示數(shù)據(jù)錄入未完成,黃色表示數(shù)據(jù)未被驗證,綠色表示數(shù)據(jù)錄入已完成)。
圖7 日歷中患者1的數(shù)據(jù)采集計劃
圖8 患者1的事件-變量網(wǎng)格
醫(yī)學(xué)研究常涉及到重復(fù)測量數(shù)據(jù),簡單、快捷、方便的數(shù)據(jù)管理軟件能夠輔助此類研究的順利進(jìn)行[6]。REDCap數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)具有數(shù)據(jù)安全、免費使用、簡單易學(xué)、可多用戶多地點同時輸入及訪問、數(shù)據(jù)可直接導(dǎo)出到常用統(tǒng)計軟件的優(yōu)點,已受到醫(yī)學(xué)科研工作者的青睞[7]。其獨特的縱向研究的模塊能夠?qū)崿F(xiàn)事件-變量網(wǎng)格,顯示不同時間點的變量采集情況,為重復(fù)測量數(shù)據(jù)的管理提供便利。
圖9 患者1 的數(shù)據(jù)采集頁面
本文主要介紹了REDCap實現(xiàn)重復(fù)測量數(shù)據(jù)的管理的具體操作。實際應(yīng)用中需要注意以下幾個問題:①項目設(shè)置時,應(yīng)點擊Enable optional modules and customizations下Scheduling module (longitudinal only)前的Enable,否則事件設(shè)定時無法設(shè)定事件執(zhí)行的時間;②計劃模塊(Schedule)是提前設(shè)置好的,在日歷中為某一患者添加提醒時不會出現(xiàn)在Schedule里;③為患者創(chuàng)建日歷計劃時,應(yīng)注意雙休、節(jié)假日的提醒;④項目主頁中(Project Home)會出現(xiàn)日歷提醒,項目管理者或者數(shù)據(jù)錄入者可以看到未來一周需做的工作。