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擬南芥成花調(diào)控途徑的研究進(jìn)展

2018-09-05 11:09齊仙惠巫東堂李改珍趙軍良李梅蘭
關(guān)鍵詞:春化光周期成花

齊仙惠,巫東堂,李改珍,趙軍良,李梅蘭

(1.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 蔬菜研究所,山西 太原 030031;2.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 園藝學(xué)院,山西 太谷 030801)

植物的成花過程是高等植物從營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段向生殖發(fā)育階段轉(zhuǎn)化的中心樞紐,是個(gè)體發(fā)育的核心內(nèi)容[1]。無論農(nóng)作物的產(chǎn)品器官是營(yíng)養(yǎng)組織還是果實(shí)或種子,適宜的開花時(shí)間對(duì)生產(chǎn)和育種工作都十分重要。植物的成花包括不同花器官的形成、不同發(fā)育方式的轉(zhuǎn)變以及外界環(huán)境因子與內(nèi)部信號(hào)之間的相互作用[2],是一個(gè)多環(huán)節(jié)多步驟的網(wǎng)絡(luò)發(fā)生過程。隨著分子生物技術(shù)的快速發(fā)展,現(xiàn)已分離鑒定出一系列植物開花基因,對(duì)模式植物擬南芥的成花調(diào)控途徑也已明確。

1 植物成花調(diào)控的主要途徑

植物成花具有復(fù)雜的調(diào)控機(jī)制和途徑,這樣才能保證其在適宜的時(shí)間完成成花轉(zhuǎn)變,在擬南芥中,主要涉及6條調(diào)控途徑:春化途徑、光周期途徑、赤霉素途徑、自主途徑、溫敏途徑和年齡途徑。這些調(diào)控途徑彼此獨(dú)立又相互交聯(lián),形成了具有精密調(diào)控功能的成花調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

1.1 春化途徑

某些二年生植物和冬性一年生植物必須經(jīng)歷一段時(shí)間的持續(xù)低溫才能由營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)轉(zhuǎn)為生殖生長(zhǎng),這一低溫誘導(dǎo)效應(yīng)稱為春化作用,依賴春化作用的成花調(diào)控途徑即為春化途徑。在春化過程中,植物會(huì)發(fā)生一系列的生理變化,從而具備成花的潛能。植物的這一生理轉(zhuǎn)變主要是因?yàn)殚_花抑制蛋白的沉默,在擬南芥中是指FLOWERING LOCUS C(FLC)蛋白[3]。也就是說,春化途徑是通過抑制FLC的表達(dá)來調(diào)控植物的成花。擬南芥的春化過程包括3個(gè)階段:通過激活FLC建立春化需求、低溫處理下FLC染色質(zhì)動(dòng)態(tài)重組、后續(xù)發(fā)育過程中表觀修飾導(dǎo)致FLC基因沉默[4]。

FLC編碼一個(gè)MADS-box蛋白,是開花抑制因子,也是調(diào)控?cái)M南芥春化途徑的關(guān)鍵基因。擬南芥中所有高表達(dá)的FLC突變體和生態(tài)型都表現(xiàn)為晚花,且在FLC低水平轉(zhuǎn)錄的情況下都能提早開花[5~6]。FLC的下游基因是開花促進(jìn)因子SUPPRESSOROFOVEREXPRESSIONOFCONSTANS1(SOC1)和FLOWERINGLOCUST(FT),F(xiàn)LC抑制二者的表達(dá),并間接抑制APETALA1(AP1)和LEAFY(LFY)的表達(dá),從而抑制成花[7]。

FRIGIDA(FRI)能促進(jìn)FLC的表達(dá),加強(qiáng)其對(duì)成花的抑制作用,但春化作用對(duì)成花的促進(jìn)并非是通過調(diào)節(jié)FRI的表達(dá),而是另一條與FRI促進(jìn)FLC平行的途徑[8]。擬南芥中的EARLYFLOWERING7(ELF7)和ELF8能夠通過形成復(fù)合物,協(xié)同F(xiàn)RI促進(jìn)FLC的轉(zhuǎn)錄,此外PHOTOPERIOD-INDEPENDENTEARLYFLOWERING1(PIE1)、VERNALIZATIONINDEPENDENCE3(VIP3)、VIP4和EARLYFLOWERINGINSHORTDAYS(EFS)也能促進(jìn)FLC的表達(dá)[9]。

擬南芥的VERNALIZATION1(VRN1)、VRN2和VERNALIZATIONINSENSITIVE3(VIN3)也參與了春化作用。VIN3的作用是識(shí)別低溫處理的時(shí)長(zhǎng),進(jìn)而抑制FLC的表達(dá)[10]。VRN1和VRN2的表達(dá)不受春化作用的誘導(dǎo),其功能是在VIN3開始抑制FLC的表達(dá)后,持續(xù)這種抑制作用[11]。

此外也有研究認(rèn)為,溫度降低后FLC的表達(dá)下降是由染色質(zhì)聚合物拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的改變導(dǎo)致的。該研究認(rèn)為,對(duì)溫度變化的初始響應(yīng)是物理性的,涉及拓?fù)潇匾鸬娜旧|(zhì)聚合物折疊和循環(huán)結(jié)構(gòu)的重組,這種拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的局部重組能迅速抑制FLC的轉(zhuǎn)錄,并促進(jìn)染色質(zhì)的重組,從而使這種抑制作用由瞬時(shí)逐漸變?yōu)槌志肹3]。在春化過程中,多梳蛋白與Long noncoding RNAs(lncRNAs)結(jié)合,可在FLC位點(diǎn)形成抑制性染色質(zhì)環(huán),使其變?yōu)榉€(wěn)定的抑制結(jié)構(gòu),這一過程需要COLDAIR 和COLDWRAP的參與[12]。

在春化起始階段,當(dāng)溫度下降到某一閾值時(shí)FLC的表達(dá)受到抑制,但當(dāng)溫度回升后這一抑制作用將無法繼續(xù),只有低溫時(shí)期足夠長(zhǎng)時(shí),F(xiàn)LC的表達(dá)下降才不會(huì)被溫度回升所逆轉(zhuǎn)[13,14]。春化效應(yīng)只能隨著有絲分裂在莖端生長(zhǎng)點(diǎn)保持,而在減數(shù)分裂或其它有性生殖過程中消失,不能傳遞給子代,F(xiàn)LC的表達(dá)水平在胚中被還原為春化前的狀態(tài),以此保證子代植株具有同樣的春化響應(yīng)能力。春化效應(yīng)會(huì)在胚胎發(fā)生過程中重建,且需要FLC的表達(dá)調(diào)控因子PROTEASOME ALPHA SUBUNIT F1(PAF1)復(fù)合體和FRI復(fù)合體的存在[15]。

1.2 光周期途徑

光對(duì)于植物的生長(zhǎng)發(fā)育非常重要,在為生長(zhǎng)提供能量的同時(shí)也是重要的外界信號(hào)。植物在接收光信號(hào)后由光感受系統(tǒng)完成對(duì)光的有無、方向以及強(qiáng)度和質(zhì)量的感受,并做出相應(yīng)的反應(yīng)[16]。光周期途徑通過植物對(duì)不同光照時(shí)間的響應(yīng)來調(diào)控植物的成花[17]。

在光周期途徑中,擬南芥通過光受體接收光信號(hào)后,將之傳遞給生物鐘,由其檢測(cè)日長(zhǎng)的變化,并最終通過CONSTANS(CO)基因?qū)⒐庑盘?hào)轉(zhuǎn)化為成花信號(hào)[18]。擬南芥的光受體——光敏色素和隱花色素都能調(diào)控成花。光敏色素的調(diào)控作用表現(xiàn)為PHYTOCHROME A(PhyA)通過抑制SPAs-COP1復(fù)合體的活性而穩(wěn)定CO蛋白,從而促進(jìn)成花;相反,PhyB 能促進(jìn)CO的降解,從而抑制開花[19],但也有研究認(rèn)為GmPHYB1過表達(dá)能使大豆在短日條件下開花提前[20]。此外,PhyB的兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子VOZ1和VOZ2在擬南芥中能通過調(diào)節(jié)CO促進(jìn)開花[21];PhyC在長(zhǎng)日照條件下與PhyA共同促進(jìn)成花,而在短日照條件下抑制成花[22];PhyD、PhyE則是在長(zhǎng)日照和短日照條件下均抑制成花[23]。隱花色素CRYPTOCHROME 1(CRY1)、CRY2是功能重疊的藍(lán)光受體,二者都能促進(jìn)成花[24]。

擬南芥光受體在感受光周期后,通過PhyTOCHROMEINTERACTINGFACTOR3(PIF3)、ELF3、TIMEFORCOFFEE(TIC)等將光信號(hào)傳遞給生物鐘,這些基因同時(shí)具有生物鐘調(diào)節(jié)因子的功能[25~27]。擬南芥的生物鐘由三個(gè)相互連鎖的反饋環(huán)組成,反饋環(huán)中的基因通過各自表達(dá)的晝夜周期變化調(diào)節(jié)生物鐘的晝夜節(jié)律變化。

生物鐘進(jìn)一步將光周期變化的信號(hào)輸出給CO。CO是生物鐘和開花途徑間監(jiān)測(cè)日長(zhǎng)的重要元件,為長(zhǎng)日照促進(jìn)開花所必需,有促進(jìn)成花的功能,其過表達(dá)可使擬南芥提前開花[28]。FT和SOC1是CO的下游靶基因。植物感受光周期的部位是葉片,而發(fā)生反應(yīng)的部位卻是莖端生長(zhǎng)點(diǎn),故推測(cè)二者之間存在一種物質(zhì)或信號(hào)的傳遞,即開花素,后來被確定為FLOWERING LOCUS T(FT)蛋白[29]。FT轉(zhuǎn)運(yùn)至莖端后,激活FLOWERINGLOCUSD(FD),并與之共同激活A(yù)P1、LFY等基因,從而最終啟動(dòng)成花進(jìn)程[30]。

1.3 赤霉素途徑

赤霉素(gibberellins,GA)是一類四環(huán)二萜類化合物,能夠調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育的眾多過程,包括促進(jìn)種子萌發(fā)和莖稈伸長(zhǎng)、延緩葉片及果實(shí)衰老等,尤其是對(duì)植物成花具有顯著的促進(jìn)作用,甚至可以代替環(huán)境信號(hào)誘導(dǎo)成花。不經(jīng)過春化途徑和光周期途徑的調(diào)控,而僅由GA誘導(dǎo)的成花途徑即為赤霉素途徑。

GA3能促進(jìn)多種植物開花,曾一度被認(rèn)為是成花素的組分之一。對(duì)擬南芥施加外源GA1和GA3能夠促使其在短日照條件下開花,而內(nèi)源GA的生物合成受阻或信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)基因發(fā)生突變,都會(huì)影響開花時(shí)間[31],因此將赤霉素途徑的相關(guān)基因分為兩類:GA生物合成的相關(guān)基因(包括GA20OX、GA2OX、GA3OX等)和GA信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的相關(guān)基因(包括GAI、RGA、RGL1、RGL2和RGL3等)[31,33]。GAI、RGA、RGL1、RGL2和RGL3屬于DELLA蛋白,該蛋白阻遏GA的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),是赤霉素途徑的負(fù)調(diào)控因子[33,34]。GA能夠使DELLA蛋白泛素化,并通過26S蛋白酶體將其降解,從而解除其對(duì)開花的抑制作用,促進(jìn)成花[35],同時(shí)還能解除DELLA對(duì)SPOROCYTELESS(SPL)的抑制作用,激活MADS-box基因和miR172,從而調(diào)控開花時(shí)間[36]。此外,對(duì)于另一開花抑制基因SHORTVEGETATIVEPHASE(SVP),GA也能抑制其在莖端的表達(dá)[37]。另一方面,GA能在莖端促進(jìn)SOC1、FT、LFY等基因的表達(dá),從而直接誘導(dǎo)成花[38]。GA可與光周期途徑協(xié)同調(diào)控成花誘導(dǎo)。有研究表明,DELLA抑制開花誘導(dǎo)部分依賴于CO/FT介導(dǎo)的光周期信號(hào)途徑,并已證實(shí)DELLA能直接抑制CO,從而協(xié)同調(diào)控植物在長(zhǎng)日照條件下的開花誘導(dǎo)過程[39]。

有研究發(fā)現(xiàn),GA既能終止?fàn)I養(yǎng)生長(zhǎng)誘導(dǎo)成花,也會(huì)抑制花器官的形成。GA通過多種途徑最終促進(jìn)LFY的表達(dá),但LFY含量的增加卻誘導(dǎo)了一個(gè)細(xì)胞色素P450基因ELA1在莖尖分生組織中的表達(dá)。ELA1阻礙GA碳骨架C13的羥基化,減少GA4的合成,使依賴于GA-DELLA-AP1通路的花器官形成機(jī)制受到破壞,阻礙花芽形成,可見GA在花芽分化過程有既促進(jìn)又抑制的雙重作用[40]。

1.4 自主途徑

迄今為止發(fā)現(xiàn)的擬南芥開花突變體中還沒有完全不開花的,這說明植物還存在另外的成花調(diào)控途徑。在缺乏外界誘因,春化途徑、光周期途徑和赤霉素途徑調(diào)控受阻時(shí),植物還能通過感受自身的生長(zhǎng)發(fā)育狀況,在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)達(dá)到一定階段時(shí)開花,這條成花調(diào)控途徑即為自主途徑,該途徑由內(nèi)源信號(hào)所調(diào)控,主要涉及8 個(gè)基因:FLOWERINGCONTROLLOCUSA(FCA)、FPA、FLOWERINGLOCUSKHDOMAIN(FLK)、FY、FLD、FVE、RELATIVEOFEARLYFLOWERING6(REF6)和LD[41]。這些基因之間彼此互不調(diào)控表達(dá),也不產(chǎn)生級(jí)聯(lián)放大效應(yīng),而是平行的抑制FLC的表達(dá),進(jìn)而促進(jìn)成花。擬南芥的各組織器官中幾乎都有這些基因的表達(dá),尤其是根端和莖端[42]。根據(jù)自主途徑基因編碼蛋白的類型及發(fā)揮作用的方式,可將其分為兩類,一類調(diào)節(jié)RNA的加工,另一類參與染色質(zhì)的重塑。

調(diào)節(jié)RNA加工的基因有FCA、FPA、FLK和FY,這4個(gè)基因編碼RNA結(jié)合蛋白,調(diào)節(jié)FLC前體mRNA的加工,影響FLC的轉(zhuǎn)錄水平,進(jìn)而影響開花[42~46];參與染色質(zhì)重塑的蛋白包括FLD、FVE和REF6,它們參與FLC染色質(zhì)區(qū)域組氨酸的去乙?;?,抑制FLC轉(zhuǎn)錄[41,42];LD能調(diào)控LFY啟動(dòng)子的活性,還能與SUPPRESSOR OF FRIGIDA4(SUF4)結(jié)合,抑制其對(duì)FLC的促進(jìn)作用[47,48]。

參與自主途徑的基因除了上述8個(gè)外,還包括DORMANCY-ASSOCIATEDPROTEIN-LIKE1(DRM1)、AtPRP39-1、ENHANCEDDISEASESUCEPTIBILITY4(EDS4)等,其中DRM1和AtPRP39-1的擬南芥突變體植株均變現(xiàn)為開花延遲,而EDS4則能促進(jìn)FLC的表達(dá)[49]。綜合以上研究結(jié)果可以看出,自主途徑和春化途徑的調(diào)控節(jié)點(diǎn)都是FLC基因,二者均通過調(diào)控FLC的表達(dá)來調(diào)控成花轉(zhuǎn)變[50]。自主途徑雖然獨(dú)立于其它3條途徑而存在,但該途徑的基因突變引起的開花延遲可被春化作用、遠(yuǎn)紅光或GA所恢復(fù)[51]。

1.5 溫敏途徑

除了春化途徑中的低溫誘導(dǎo)作用外,植物營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段所處的環(huán)境溫度對(duì)于成花還有其它意義,表現(xiàn)為高溫促進(jìn)成花而低溫抑制成花,溫度對(duì)成花的這一調(diào)控方式稱為溫敏途徑。當(dāng)溫度為25~27 ℃時(shí),擬南芥在短日照條件下的開花時(shí)間與23 ℃時(shí)長(zhǎng)日照下的相似,說明較高的溫度促進(jìn)了擬南芥成花[52]。溫敏途徑涉及的主要影響因子有FLOWERINGLOCUSM(FLM)、SVP、HIGHEXPRESSIONOFOSMOTICALLYRESPONSIVEGENES1(HOS1)、1microRNA156/SQUAMOSAPROMOTERBINDINGPROTEIN-LIKE3(miR156/SPL3)、ACTIN RELATED PROTEIN 6(ARP6)等。

FLM是FLC的同源基因,其遺傳位點(diǎn)缺失是導(dǎo)致擬南芥高溫短日照下早花的主要原因。FLM功能缺失后,植株的溫度響應(yīng)能力減弱,說明FLM能調(diào)控溫度感知。高溫(27 ℃)短日照下,F(xiàn)LM轉(zhuǎn)錄本的剪接方式發(fā)生了改變,從而減弱了其對(duì)FT轉(zhuǎn)錄的抑制,促進(jìn)開花[52]。當(dāng)SVP表達(dá)量達(dá)到一定值時(shí)能與FLM發(fā)生協(xié)同作用,此外還能與FT和SOC1的啟動(dòng)子結(jié)合,抑制開花[53,54]。HOS1受低溫誘導(dǎo),通過泛素化作用負(fù)調(diào)控FVE和FLK,減弱二者對(duì)FT的激活作用,從而抑制開花,其突變體對(duì)溫度變化不敏感[55]。SPL能促進(jìn)FRUITFULL(FUL)、FT、SOC1、AGL42、LFY、AP1的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)成花[56],擬南芥中存在17個(gè)SPL成員,其中11個(gè)的表達(dá)受miR156調(diào)控[57],低溫(16 ℃)促進(jìn)了擬南芥miR156的表達(dá),進(jìn)而下調(diào)SPL的表達(dá)水平,尤其是AtSPL3,從而抑制開花[48]。ARP6是一種核蛋白,通過調(diào)控FLC的表達(dá)而抑制成花,是溫敏途徑的重要組分。目前雖已鑒定出一些響應(yīng)溫度的基因,但植物感應(yīng)溫度變化的分子機(jī)制仍不清楚[58]。

1.6 年齡途徑

植物中有一些表觀遺傳因子不依賴于春化、光周期、赤霉素等途徑,而僅與年齡的增長(zhǎng)相關(guān),能獨(dú)立調(diào)控成花,由此而形成的調(diào)控途徑稱為年齡途徑,其中包含2個(gè)重要調(diào)控因子:microRNA和miR172。

在溫敏途徑中,SPL能促進(jìn)成花,且大多數(shù)SPL的表達(dá)受miR156抑制。除了受溫度影響外,miR156的表達(dá)還受年齡的調(diào)控,隨著植物的生長(zhǎng),miR156的表達(dá)水平逐漸下降,而SPL的表達(dá)水平則逐漸上升,并在花芽形成前達(dá)到最高[59]。miR156的過表達(dá)會(huì)延長(zhǎng)植物的幼年期,出現(xiàn)分枝增多、葉片生長(zhǎng)加速及開花延遲等現(xiàn)象,而抑制miR156的活性或使其含量降低則能促使植物進(jìn)入成年期,開花提前[57]。

另一重要調(diào)控因子miR172是SPL的直接下游基因,SPL能激活其轉(zhuǎn)錄。miR172的靶基因是APETALA2(AP2)類轉(zhuǎn)錄因子家族,包括AP2、TARGETOFEARLYACTIVATIONTAGGED1(TOE1)、TOE2、TOE3、SCHLAFMUTZE(SMZ)和SCHNARCHZAPFEN(SNZ)等[60],miR172能通過抑制這些基因的表達(dá)而促進(jìn)成花。miR172與miR156具有拮抗效應(yīng),二者表達(dá)模式和作用相反,miR172的表達(dá)量隨著年齡增長(zhǎng)而升高,且過表達(dá)會(huì)導(dǎo)致擬南芥提前進(jìn)入成年期[61]。

2 成花調(diào)控途徑的整合

植物雖然存在多條成花調(diào)控途徑,且每條途徑都能獨(dú)立完成調(diào)控作用,但它們最終都是通過幾個(gè)整合基因?qū)崿F(xiàn)成花轉(zhuǎn)變調(diào)控的,目前擬南芥中的三個(gè)整合基因分別是FT、SOC1和LFY[58]。FT是光周期途徑關(guān)鍵基因CO、溫敏途徑FLM、年齡途徑SPL3等的下游靶基因,能促進(jìn)下游LFY的表達(dá);同時(shí)FT也是春化途徑和自主途徑關(guān)鍵基因FLC的靶基因;此外,莖端的FT表達(dá)還能被GA激活,可見該基因連接了這6條成花途徑。SOC1與FT類似。各途徑的信號(hào)最終匯集于莖端,促進(jìn)LFY和AP1的表達(dá),誘導(dǎo)成花并決定花器官的形成(圖1)。

3 小結(jié)與展望

擬南芥成花調(diào)控的6條途徑既彼此獨(dú)立又相互交聯(lián),共同調(diào)控了成花轉(zhuǎn)變過程。現(xiàn)階段,雖然各途徑的作用關(guān)系已基本明確,但對(duì)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的作用細(xì)節(jié)還需進(jìn)一步充實(shí),且各基因間的作用關(guān)系大多仍基于遺傳學(xué)假設(shè),需要進(jìn)一步證實(shí)。除上述內(nèi)容提到的大量基因外,一些代謝產(chǎn)物也參與了成花誘導(dǎo)途徑,如蔗糖可以通過FT促進(jìn)開花[62];海藻糖合成相關(guān)基因TREHALOSE-6-PHOSPHATESYNTHASE1(TPS1)對(duì)開花調(diào)控也十分重要[63];植物激素脫落酸、茉莉酸、油菜素內(nèi)酯等代謝過程的相關(guān)基因也參與了成花調(diào)控[64~67],但具體是通過哪條成花調(diào)控途徑起作用還有待進(jìn)一步研究。在6條調(diào)控途徑中,前4條途徑研究的較早且系統(tǒng),而對(duì)溫敏途徑和年齡途徑的研究還有待深入。綜上所述,今后可從成花轉(zhuǎn)錄因子的靶點(diǎn)分析、關(guān)鍵基因的表達(dá)模式、其他植物的成花機(jī)理、利用轉(zhuǎn)錄組等手段挖掘新基因等方面進(jìn)行研究,以不斷推進(jìn)對(duì)植物成花機(jī)理的認(rèn)識(shí)。

圖1 擬南芥成花途徑調(diào)控示意圖Fig.1 Diagrammatic sketch of the regulation of flowering pathway in Arabidopsis圖片源自張藝能[58]。黑色箭頭表示促進(jìn),紅色鈍化線表示抑制。The picture was adapted from Zhang Yineng[58]. Arrows represent promotion or gene activation and blunted lines represent gene repression.

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