何慶夢,高 翔,2,楊明明,2,董 劍,2,李曉燕,2,趙萬春,2
(1.西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院,陜西楊凌 712100; 2.陜西省小麥工程技術(shù)研究中心/陜西省小麥新品種培育工程研究中心,陜西楊凌 712100)
小麥產(chǎn)量由單位面積穗數(shù)、穗粒數(shù)和粒重構(gòu)成。由于受品種遺傳特性和壞境條件的制約,粒重的增加幅度相對有限;而穗粒數(shù)的變異相對較大,所以通過提高穗粒數(shù)來提高小麥單產(chǎn)的潛力大于通過增加粒重的潛力[1]。而穗粒數(shù)的形成主要取決于每穗分化小穗數(shù)、每穗分化小花數(shù)和分化小花的結(jié)實數(shù),其中每穗實際分化的小穗數(shù)對穗粒數(shù)的形成具有重要意義。前人在對控制小穗數(shù)基因的研究中發(fā)現(xiàn), Photoperiod-1( Ppd-1)基因能夠通過抑制FLOWERINGLOCUST(FT)基因的表達(dá)來增加小麥穗粒數(shù)[2]。而擬南芥 Terminal Flower 1(TFL1)與FT基因也表現(xiàn)出了明顯的相互抑制,在擬南芥和水稻等植物中過表達(dá) TFL1及其同源基因也表現(xiàn)出了成花數(shù)的增加[3-4]。由于 Ppd-1與 TFL1基因都能抑制FT基因的表達(dá),因此 TaTFL1也可能對小麥的穗部發(fā)育及其小穗數(shù)的形成具有重要的作用。
迄今,對 TFL1基因的研究主要是在擬南芥和水稻等模式植物中進(jìn)行。 TFL1基因在擬南芥中被首次發(fā)現(xiàn),Shannon等[5]通過對擬南芥進(jìn)行EMS誘變,得到了頂端成花的 tfl-1( terminal flowerl-1)突變體,該突變體提早開花,花序發(fā)育受到抑制,且花序被頂花和1~2個側(cè)花所組成的花序結(jié)構(gòu)所終止。TFL1被認(rèn)為在莖端阻止接受LEAFY(LFY)、APETALA1(AP1)傳導(dǎo)的信號,又或是延遲LFY、AP1的上調(diào),以此來抑制LFY、AP1的活性,形成合適的花序結(jié)構(gòu);LFY、AP1則在花分生組織頂端的外圍抑制 TFL1的轉(zhuǎn)錄,形成并維持花分生組織的特性[6-8]。在對黑麥草的研究中發(fā)現(xiàn), LpTFL1基因在除成熟的種子外的組織中都有表達(dá),并受到溫度與長日照的調(diào)控[9]。另外,長日照條件也能誘導(dǎo) TFL1在植株的營養(yǎng)頂端分生組織中產(chǎn)生較弱水平的表達(dá),隨后其表達(dá)開始逐漸增強(qiáng)[12]。而水稻中的4個 TFL1同源基因則分別表現(xiàn)出不同的時空表達(dá)模式,且有3個基因主要在次級分生組織中表達(dá), Oscen1基因在各時期各組織中都有微弱的表達(dá);而 Oscene2在根和黃化苗中的表達(dá)量較強(qiáng); Oscen3在除葉片外的其他組織表達(dá)量較高; Oscen4基因在葉片和葉鞘中未檢測到表達(dá),而在根部與黃化苗中表達(dá)強(qiáng)烈,在花序和幼苗中表達(dá)較弱[11]。Serrano等[3]對擬南芥 TFL1的5′和3′端的順式調(diào)控元件進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)其表達(dá)是基于不同的順式調(diào)控區(qū),且3′端的編碼序列對 TFL1的表達(dá)最為重要。Guan等[12]在探究激素對擬南芥花序發(fā)育影響的研究中發(fā)現(xiàn),細(xì)胞分裂素和生長素可能通過誘導(dǎo)分生組織特征基因 TFL1的表達(dá)來調(diào)節(jié)擬南芥花序的形態(tài)建成及發(fā)育過程,表明激素也參與調(diào)控 TFL1基因的表達(dá)。這些研究表明, TFL1及其同源基因的表達(dá)受諸多因素的影響,在不同植物中存在一定的表達(dá)模式差異。
TFL1及其同源基因在植物開花及花序結(jié)構(gòu)的發(fā)育中具有重要的作用,且該基因控制植物開花和花序結(jié)構(gòu)的機(jī)制可能相對保守[13]。但小麥中尚未見到對該基因的表達(dá)特征的相關(guān)研究報道。本研究通過克隆小麥第五同源群上 TaTFL1部分同源基因,并利用生物信息學(xué)技術(shù)對其序列組成、結(jié)構(gòu)特征及進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行初步分析,對啟動子區(qū)順式作用元件進(jìn)行預(yù)測,進(jìn)一步運用qRT-PCR技術(shù)分析 TaTFL1在小麥不同組織中的表達(dá)特征,以期為進(jìn)一步探究該基因的功能機(jī)制奠定理論基礎(chǔ)。
普通小麥中國春(CS)由西北農(nóng)林科技大學(xué)小麥品質(zhì)實驗室提供,部分種子在室內(nèi)培養(yǎng),在種子萌發(fā)后的2、5和10 d分別收集幼根和葉片,并用液氮處理后置于-80 ℃保存?zhèn)溆谩M瑫r以室內(nèi)培養(yǎng)的中國春的幼苗為材料,采用CTAB法提取基因組DNA。部分中國春的種子種植于田間,自小麥種植后分別采集1~2 cm、2~4 cm、4~5 cm和5~6 cm幼穗,同時采集花前穗下莖、穎殼和旗葉以及花后5、10和15 d的穗下莖、穎殼、籽粒和旗葉,用液氮速凍后置于-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
RNA的提取按照RNAprep Pure Plant Kit(天根,北京)說明書進(jìn)行,并通過瓊脂糖凝膠電泳檢測所提取RNA的完整性,使用NanoDropTMOne(Thermo Scientific,美國)測定RNA的濃度。然后根據(jù)PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser(TaKaRa,日本)說明書合成cDNA第一鏈。
根據(jù)NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)已公布的擬南芥 TFL1基因(GenBank登錄號:NM_120465.3)序列在Ensembl plants(http://plants.ensembl.org/Triticum_aestivum/Tools/Blast?db=core)進(jìn)行在線比對,利用比對的最優(yōu)結(jié)果設(shè)計特異性引物(表1),以中國春gDNA及cDNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增。PCR體系與程序參考2×Es Taq MasterMix(康為世紀(jì),北京)說明書,其中循環(huán)數(shù)為30,退火溫度為62 ℃,延伸時間為5 min。PCR產(chǎn)物回收后與克隆載體pEASY-T1(全式金,北京)連接,轉(zhuǎn)化,挑選陽性克隆送公司測序,測序所得結(jié)果使用NCBI-BLASTN(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome)及DNAMAN 5.0進(jìn)行序列比對分析。
在Ensembl plants中搜索得到 TaTFL1基因5′端上游2 500 bp大小的序列,并根據(jù)其保守區(qū)設(shè)計引物TP-F和TP-R(表1)進(jìn)行擴(kuò)增。PCR體系與程序參考2×Es Taq MasterMix(康為世紀(jì),北京)說明書,其中循環(huán)數(shù)為30,退火溫度為60 ℃,延伸時間為2 min。利用Promoter 2.0 Prediction Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/)在測序結(jié)果中預(yù)測啟動子區(qū)域,再利用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)對預(yù)測的啟動子區(qū)域進(jìn)行順式調(diào)控元件分析。
首先將測序結(jié)果提交至NCBI-ORF Finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/),預(yù)測 TaTFL1基因的ORF,利用NCBI-CDD(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/docs/cdd_search.html)預(yù)測該基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)域。然后,利用GSDS(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)預(yù)測基因外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。進(jìn)一步,利用ExPASy-ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)、ExPASy-ProtScale(https://web.expasy.org/protscale/)、Cell-PLoc 2.0( http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/plant-multi/)、CBS-SignalP(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)和CBS-ProtFun(http://www.cbs.dtu.dk/services/ProtFun/)等分別預(yù)測該基因編碼蛋白的理化性質(zhì)、疏水性、亞細(xì)胞定位、信號肽及功能;利用NCBI-BLASTP(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&PAGE_TYPE=Blast Search&LINK_LOC=blasthome)對所得序列進(jìn)行同源搜索,獲得不同植物中TFL1同源蛋白序列及其登錄號,再通過DNAMAN 5.0和MEGA 6.0等軟件對TaTFL1同源蛋白進(jìn)行序列比對及NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建,bootstrap值設(shè)置為1 000,其他均采用軟件默認(rèn)參數(shù)。
由于 TaTFL1基因三個部分同源基因序列的一致性很高,因而未能設(shè)計出針對每一個基因組進(jìn)行熒光定量的引物,而是根據(jù)三者共同的保守序列設(shè)計了共同的熒光定量引物,為避免cDNA中有未除盡的基因組DNA的干擾,熒光定量引物按照跨兩個外顯子區(qū)進(jìn)行設(shè)計,以小麥Actin基因(GenBank登錄號:AB181991.1)作為內(nèi)參基因,引物信息見表1。在ABI 7300 Plus Real Time PCR System(ABI,美國)進(jìn)行qRT-PCR,體系與程序按照SYBR○RPremix Ex TaqTMII(Tli RNaseH Plus)(TaKaRa,日本)說明書進(jìn)行,其中循環(huán)數(shù)為40,退火溫度為60 ℃,退火時間為30 s。每個樣品設(shè)置3次生物學(xué)重復(fù)及3次技術(shù)重復(fù),利用 2-ΔΔCT法[14]計算 TaTFL1基因的相對表達(dá)量。
表1 本研究所用的引物信息Table 1 Primers used in this study
通過在NCBI中搜索 TFL1基因,獲得了擬南芥 TFL1基因的mRNA,將此序列在Ensembl plants中與小麥基因組序列進(jìn)行比對,獲得5AL、5BL和5DL上的 TaTFL1基因。以中國春的gDNA和cDNA為模板,同樣以 TaTFL1-F1/ TaTFL1-R1和 TaTFL1-F2/ TaTFL1-R2為引物進(jìn)行擴(kuò)增,分別從gDNA和cDNA中擴(kuò)增得到1 200 bp和520 bp左右的目的條帶(圖1A)。
M:Trans 2K DNA marker;1: TaTFL1-5A和 TaTFL1-5B cDNA擴(kuò)增產(chǎn)物; 2: TaTFL1-5D cDNA擴(kuò)增產(chǎn)物; 3: TaTFL1-5A和 TaTFL1-5B gDNA擴(kuò)增產(chǎn)物; 4: TaTFL1-5D gDNA擴(kuò)增產(chǎn)物; 5: TaTFL1啟動子擴(kuò)增產(chǎn)物M:Trans 2K DNA marker; 1:The amplicon of TaTFL1-5A and TaTFL1-5B from cDNA; 2:The amplicon of TaTFL1-5D from cDNA; 3:The amplicon of TaTFL1-5A and TaTFL1-5B from gDNA; 4:The amplicon of TaTFL1-5D from gDNA; 5:The amplicon of TaTFL1 promoter.
將本研究中所獲得的3條序列分別命名為 TaTFL1-5A、 TaTFL1-5B和 TaTFL1-5D,并提交至NCBI數(shù)據(jù)庫,得到的序列登錄號分別為MF805802.1、MF805803.1和MF805804.1。GSDS預(yù)測結(jié)果表明, TaTFL1-5A、 TaTFL1-5B和 TaTFL1-5D與其他物種的 TFL1同源基因都具有4個外顯子和3個內(nèi)含子,三者之間只在第一外顯子和第二外顯子處存在少量的堿基數(shù)量差異。將 TaTFL1-5A、 TaTFL1-5B和 TaTFL1-5D的CDS序列及其預(yù)測的蛋白質(zhì)進(jìn)行相互比對發(fā)現(xiàn)彼此之間只存在個別堿基的差異,且大部分堿基差異并未引起氨基酸的改變,除了第190位的堿基差異使與之對應(yīng)的第64位氨基酸殘基在TaTFL1-5D蛋白中表現(xiàn)為M(甲硫氨酸)而TaTFL1-5A與TaTFL1-5B為L(亮氨酸)(圖2B)。
利用NCBI-ORF Finder對 TaTFL1基因的ORF進(jìn)行預(yù)測,發(fā)現(xiàn) TaTFL1-5A、 TaTFL1-5B和 TaTFL1-5D均含有一個522 bp的ORF,編碼173個氨基酸。使用NCBI-CDD對 TaTFL1基因編碼蛋白的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)TaTFL1-5A、TaTFL1-5B和TaTFL1-5D都具有典型的BEBP家族結(jié)構(gòu)域(圖3)。由ExPASy-ProtParam預(yù)測結(jié)果可知, TaTFL1基因編碼蛋白為不穩(wěn)定蛋白。ExPASy-ProtScale分析結(jié)果表明, TaTFL1基因編碼蛋白屬于兼性蛋白。通過CBS-SignalP對TaTFL1蛋白的信號肽進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果顯示,TaTFL1蛋白不存在信號肽,為非分泌蛋白。Cell-PLoc 2.0的預(yù)測結(jié)果表明,TaTFL1蛋白定位于細(xì)胞質(zhì)中。通過CBS-Protfun2.2對編碼蛋白進(jìn)行功能預(yù)測,結(jié)果顯示,TaTFL1蛋白在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、免疫應(yīng)答及生長因子方面的幾率均超過0.5,且行使轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能的可能性最大, TaTFL1-5A、TaTFL1-5B和TaTFL1-5D蛋白的幾率分別為0.613、0.613和0.705;三者屬于酶的可能性均達(dá)到了0.46~0.47,幾率均大于1.6,表明TaTFL1蛋白可能屬于酶。
A:ATG 和 TGA分別代表起始密碼子和終止密碼子,黑色方框和直線分別代表外顯子和內(nèi)含子,數(shù)字表示外顯子和內(nèi)含子的長度(bp)。A:ATG and TGA represent initiation codon and termination codon,respectively. Black box and lines represent exonic and intronic regions,respectively. Numbers indicate the length of exons and introns(bp).
黑色方框代表PEBP家族典型的氨基酸結(jié)構(gòu)和TFL1獨特的氨基酸殘基;黑色粗線條部分為TFL1同源蛋白底物結(jié)合保守域;Ta:小麥;Br:蕪菁;Fc:無花果;Vu:豇豆;Hv:大麥;Lp:黑麥草;Tu:烏拉爾圖小麥;Gm:大豆;Aet:山羊草;Bd:二穗短柄草;Os:水稻;Ob:短花藥野生稻;TFL1和ZCN3分別來自擬南芥和玉米。Black box region represents a typical amino acid structure of PEBP gene family and unique amino acid residues of TFL1; the thick black line represents substrate binding conservative domain of TFL1 homologous protein; Ta:Triticum aeativum L.; Br:Brassica rapa; Fc:Ficus carica; Vu:Vigna unguiculate; Hv:Hordeum vulgare subsp; Lp:Lolium prernne; Tu:Triticum urartu; Gm:Glycine max; Aet:Aegilops tauschii; Bd:Brachypodium distachyon; Os:Oryza sativa; Ob:Oryza brachuantha; TFL1 and ZCN3 are derived from Arabidopsis thaliana and Zea mays,respectively.
用DNAMAN 5.0軟件將烏拉爾圖小麥(EMS48180.1)、黑麥草(AAG31808.1)、青稞(ABF85670.1)、玉米(ABX11005.1)、山羊草(XP_020199337.1)、二穗短柄草(XP_003578901.1)、水稻(XP_015617887.1 )、短花藥野生稻(XP_006662737.1)等植物的TFL1同源蛋白與TaTFL1-5A(ATI23645.1)、 TaTFL1-5B(ATI23646.1)、 TaTFL1-5D(ATI23647.1)蛋白進(jìn)行多重比對(圖3)。從圖3中可以看出,TaTFL1蛋白與其他物種的TFL1同源蛋白均具有PEBP家族典型的氨基酸結(jié)構(gòu):如70~74殘基間的D-P-D-V-P模塊及116~119之間的G-I-H-R模塊,而且還具有TFL1亞家族獨特的His88和Asp144殘基,此結(jié)果進(jìn)一步證實所獲得的 TaTFL1基因序列的正確性。TaTFL1蛋白與其他單子葉植物的TFL1同源蛋白進(jìn)行比對,其相似度為91.9%~100%,其中TaTFL1-5A和TaTFL1-5B蛋白與烏拉爾圖小麥的同源蛋白一致, TaTFL1-5D蛋白與山羊草的一致,該結(jié)果表明,TFL1蛋白在單子葉植物中具有高度的保守性。而與雙子葉植物比對的相似度也達(dá)到了69.27%~79.19%,可知TFL1蛋白在單子葉和雙子葉中存在較大的差異。
利用MEGA 6.0軟件,采用NJ法構(gòu)建進(jìn)化樹,對TFL1蛋白在各物種中的進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行了分析,結(jié)果(圖4)表明,單子葉與雙子葉植物的TFL1同源蛋白分別聚為兩類,本研究得到的TaTFL1蛋白與烏拉爾圖小麥和山羊草的親緣關(guān)系最近,而與大豆和豇豆的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。
●代表本研究中 TaTFL1基因的編碼蛋白?!?indicates the deduced proteins of three TaTFL1 genes obtained in this study.
以CS的gDNA為模板,以TP-F/TP-R為引物克隆得到 TaTFL1基因的上游序列,電泳結(jié)果如圖1B所示。測序結(jié)果表明,共獲得三類序列,進(jìn)一步與Ensembl plants數(shù)據(jù)庫比對,確認(rèn)其分別為 TaTFL1-5A、 TaTFL1-5B和 TaTFL1-5D的上游序列。對啟動子區(qū)進(jìn)行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)起始密碼子上游1 200 bp的序列為啟動子區(qū)。利用PlantCARE分析其中的順式作用元件,結(jié)果發(fā)現(xiàn)這三個部分同源基因啟動子的順式作用元件組成完全一致,均含有多種參與光響應(yīng)的元件,如AE-box、AT1-motif、Box 4、G-Box、G-box、Gap-box和sp1等元件,同時還含有與分生組織表達(dá)相關(guān)的順式調(diào)控元件(CAT-box)、MYB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(MBS)、赤霉素響應(yīng)元件(P-box)、及與節(jié)律調(diào)控有關(guān)的順式調(diào)控元件(circadian)(圖5)。
圖5 TaTFL1-5A、 TaTFL1-5B和 TaTFL1-5D啟動子序列比對及其預(yù)測的元件分析
不同組織中 TaTFL1的表達(dá)分析表明, TaTFL1在不同組織不同時期均有表達(dá),但表達(dá)量存在差異。相對于其他組織,穗下莖中的表達(dá)量最高,且隨著植株的逐漸發(fā)育,其表達(dá)量呈下降趨勢(圖6A)。在葉片中, TaTFL1有較低水平的表達(dá),在剛萌發(fā)的芽中就開始表達(dá),在幼苗期和花前時期葉片中的表達(dá)量明顯高于花后灌漿期的表達(dá)量(圖6B)。而在幼穗中,其表達(dá)量僅次于穗下莖中的表達(dá)量,隨著幼穗的逐漸生長,其表達(dá)量逐漸降低(圖6C)。穎殼中 TaTFL1的表達(dá)量無論在花期還是在花后都始終維持在很低的水平(圖6D)。籽粒中的表達(dá)量總體較低,且隨著籽粒的逐漸成熟而有明顯的下降趨勢(圖6D),在幼根中也有低水平的表達(dá)(數(shù)據(jù)未列出)。由此可知, TaTFL1在小麥中的表達(dá)具有明顯的組織特異性,且主要在開花前期的幼穗與穗下莖中表達(dá)。
本試驗對TaTFL1蛋白的功能進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果表明該蛋白行使轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能的可能性最大,而前人的研究結(jié)果也表明了該基因具有轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能。擬南芥和其他植物中的 TFL1基因過表達(dá)導(dǎo)致了營養(yǎng)生長延長,次級花序的增加,以及轉(zhuǎn)基因擬南芥的開花延遲[15-19]。如在水稻中,過表達(dá)水稻的 TFL1同源基因?qū)е滤舅敕种υ黾?,開花數(shù)是野生型的3倍,小穗排列更緊密,同時也引起了植株營養(yǎng)生長期延長,說明水稻中也存在著對 TFL1功能的響應(yīng)途徑[4];將黑麥草 LpTFL1轉(zhuǎn)入擬南芥中過表達(dá),植株開花明顯延遲,側(cè)分枝大量增加[9];將玉米的 ZCN1到 ZCN6過表達(dá),發(fā)現(xiàn)同源性越高則表型表現(xiàn)得越強(qiáng)烈,能導(dǎo)致玉米晚花,花序的分枝大量增加[20];然而,將大麥 HvTFL1轉(zhuǎn)入水稻中,其轉(zhuǎn)化植株并未在開花時間和穗部結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,推測是大麥與水稻可能有著不同的開花途徑[21]。由此可知, TFL1及其同源基因的功能在許多植物中是保守的,因此我們推測小麥中 TaTFL1可能也在維持花序分生組織狀態(tài)和抑制開花的功能上存在相似性。
圖柱上不同字母表示差異顯著(P<0.05)。Different lower-case letters above bars indicate significant difference at 0.05 level.A1:花前;A2:花后5天;A3:花后10天;A4:花后15天;B1:芽;B2:萌發(fā)5天的葉;B3:萌發(fā)10天的葉;B4:花前的旗葉;B5:花后5天的旗葉;B6:花后10天的旗葉;B7:花后15天的旗葉;C1:1~2 cm幼穗;C2:2~4 cm幼穗;C3:4~5 cm幼穗;C4:5~6 cm幼穗。D1:花前的穎殼;D2:花后5天的穎殼;D3:花后10天的穎殼;D4:花后15天的穎殼;D5:花后5天的籽粒;D6:花后10天的籽粒;D7:花后15天的籽粒。A1:Pre-anthesis; A2:5 days after flowering;A3:10 days after flowering;A4:15 days after flowering; B1:Bud; B2:Leaf at 5 days after germination;B3:Leaf at 10 days after germination; B4:Flag leaf pre-anthesis; B5:Flag leaf at 5 days after flowering; B6:Flag leaf at 10 days after flowering;B7:Flag leaf at 15 days after flowering;C1:1-2 cm young spike; C2:2-4 cm young spike; C3:4-5 cm young spike;C4:5-6 cm young spike;D1:Glume pre-anthesis; D2:Glume at 5 days after flowering; D3:Glume at 10 days after flowering; D4:Glume at 15 days after flowering; D5:Grain at 5 days after flowering; D6:Grain at 10 days after flowering; D7:Grain at 15 days after flowering.
本研究克隆得到小麥第五同源群上的 TaTFL1部分同源基因,并測定 TaTFL1在不同組織不同時期的表達(dá)水平。結(jié)果發(fā)現(xiàn)小麥 TaTFL1-5A、 TaTFL1-5B和 TaTFL1-5D部分同源基因與擬南芥中 TFL1基因結(jié)構(gòu)相同,同樣由4個外顯子和3個內(nèi)含子組成[22]。本研究獲得的3個 TaTFL1部分同源基因的CDS序列只存在較少的堿基差異,其預(yù)測的蛋白質(zhì)表現(xiàn)為 TaTFL1-5A與TaTFL1-5B蛋白完全一致,而TaTFL1-5D與前者只在第64位氨基酸殘基存在差異。本研究獲得的3條 TaTFL1基因所編碼蛋白的第88位氨基酸殘基皆為His,且還具有TFL1家族典型的氨基酸結(jié)構(gòu),有研究表明TFL1蛋白的His88對其結(jié)構(gòu)與活性具有至關(guān)重要的作用[19,23]。
TFL1基因雖然與FT基因的同源性較高,但兩者的表達(dá)模式具有明顯的差異。FT基因在葉片中的轉(zhuǎn)錄水平最高,其翻譯的蛋白質(zhì)作為成花素,從葉片中由韌皮部轉(zhuǎn)運到莖頂端分生組織處,活化花分生組織特性基因的表達(dá),從而促進(jìn)開花;而 TFL1基因在頂端分生組織中的表達(dá)量最高[24]。在本試驗中,小麥 TaTFL1在葉片中的表達(dá)量極低,結(jié)果與黑麥草[9]等相同,而與甘蔗[25]在頂端周圍葉片中大量表達(dá)不同。Ratcliffe等[26]的研究結(jié)果表明,過表達(dá) TFL1基因的擬南芥植株能產(chǎn)生更好的種子,也有人認(rèn)為擬南芥中 TFL1能引起胚乳細(xì)胞化從而控制籽粒的大小。而在本試驗中, TaTFL1在籽粒中的表達(dá)量較低,且隨著籽粒的逐漸成熟而呈現(xiàn)出下降趨勢,說明小麥 TaTFL1與擬南芥中 TFL1在籽粒發(fā)育中發(fā)揮的作用可能存在差異。為了明晰 TaTFL1是否參與了小麥幼穗的發(fā)育,本研究分析了 TaTFL1基因在不同大小幼穗中的表達(dá)情況,分析結(jié)果表明該基因在幼穗中的表達(dá)量較高,且隨著幼穗的逐漸長大而表現(xiàn)出下降的趨勢,推測小麥 TaTFL1基因主要在小麥幼穗發(fā)育初期起作用,該結(jié)果與擬南芥[27]、黑麥草[9]等植物中的研究結(jié)果相同,而且 TaTFL1啟動子元件分析結(jié)果也表明其啟動子中存在著分生組織表達(dá)相關(guān)的順式調(diào)控元件(CAT-box)。本試驗還發(fā)現(xiàn) TaTFL1在穗下莖中大量表達(dá),這與玉米中 ZCN1、ZCN2和 ZCN3在維管束中大量存在可能類似,具體原因還有待進(jìn)一步的研究[20]。