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泛醌細(xì)胞色素C還原酶核心蛋白1基因甲基化與阿爾茨海默病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性

2018-10-31 07:10:48徐亞南孔祥怡叢樂(lè)樂(lè)李松濤
中國(guó)老年學(xué)雜志 2018年19期
關(guān)鍵詞:甲基化線粒體功能障礙

王 靜 趙 晴 徐亞南 孔祥怡 叢樂(lè)樂(lè) 李松濤

(吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院,吉林 長(zhǎng)春 130033)

阿爾茨海默病(AD)是老年人認(rèn)知功能障礙最常見(jiàn)的癡呆類(lèi)型〔1〕,其特征在于不可逆的記憶喪失和認(rèn)知能力下降〔2〕。AD的發(fā)病受諸多因素的影響,其中表觀遺傳學(xué)在AD的發(fā)病早期發(fā)揮重要作用〔3,4〕。DNA甲基化是基因調(diào)控常見(jiàn)的表觀遺傳學(xué)之一,近幾年的研究檢測(cè)到AD患者體內(nèi)多個(gè)AD相關(guān)基因的甲基化水平與正常人存在明顯差異〔5〕,外周血中基因甲基化有可能成為早期診斷AD的指標(biāo)。泛醌細(xì)胞色素C還原酶核心蛋白(UQCRC)1基因是編碼線粒體呼吸作用復(fù)合體Ⅲ(呼吸鏈的重要組成部分)的一個(gè)亞基,線粒體功能障礙在AD發(fā)病過(guò)程中起著關(guān)鍵作用,當(dāng)UQCRC1基因發(fā)生甲基化時(shí)可能造成線粒體呼吸鏈功能障礙,與AD的發(fā)病可能有一定的關(guān)系。本研究分析AD患者外周血中UQCRC1基因甲基化狀態(tài),旨在探討UQCRC1基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化與AD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性,以期尋找可以早期診斷AD的檢測(cè)方法,同時(shí)為AD提供一個(gè)新的治療靶點(diǎn)。

1 材料與方法

1.1材料

1.1.1實(shí)驗(yàn)對(duì)象 AD組選取2015年9月至2016年12月吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科記憶障礙門(mén)診及住院部收治的老年AD患者,同時(shí)選取吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院體檢中心與AD組年齡、教育程度、血壓、身體基本情況等基線資料相匹配的非AD患者為對(duì)照組。研究對(duì)象共105例,AD組50例,對(duì)照組55例。兩組一般資料包括性別、年齡、高血壓、糖尿病史、飲酒史、高密度脂蛋白、吸煙史、同型半胱氨酸、纖維蛋白原、低密度脂蛋白、谷草轉(zhuǎn)氨酶、載脂蛋白A1、谷丙轉(zhuǎn)氨酶、肌酐、總膽固醇、空腹血糖、三酰甘油、葉酸、載脂蛋白B 等比較,未發(fā)現(xiàn)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性,見(jiàn)表1。吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院倫理委員會(huì)已批準(zhǔn)本研究,所有研究對(duì)象簽署知情同意書(shū)。AD診斷標(biāo)準(zhǔn):采用美國(guó)精神病學(xué)會(huì)的精神障礙診斷和統(tǒng)計(jì)手冊(cè)第4修訂版(DSM-Ⅳ)中AD的診斷標(biāo)準(zhǔn)〔6〕。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)伴嚴(yán)重的肝、腎、心、肺功能障礙的患者;(2)伴重度的內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病及嚴(yán)重感染性疾病和中毒性腦病的患者;(3)抑郁癥患者;(4)有精神病史,先天性精神發(fā)育遲緩;(5)有腦卒中、頭部創(chuàng)傷史患者;(6)有吸毒史。

1.1.2主要試劑及儀器 全基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自promega公司;EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit(59824)和EpiTect MSP Kit(206143)購(gòu)自QIAGEN公司;DNA Marker、上樣緩沖液購(gòu)自Takara公司;瓊脂糖購(gòu)自Invitrogen公司;無(wú)水乙醇、異丙醇、70%乙醇購(gòu)自北京化工;TAE(1×)、綠如藍(lán)染料、1.5 ml無(wú)菌微型離心管、無(wú)菌移液頭購(gòu)自上海生工;臺(tái)式低溫高速離心機(jī)、恒溫水浴鍋、實(shí)時(shí)定量PCR儀、電泳儀、超低溫冰箱、全自動(dòng)凝膠成像系統(tǒng)、微量加樣器、分析天平、臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器由吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院科研中心提供; UQCRC1基因甲基化引物、非甲基化引物通過(guò)MethPrimer軟件設(shè)計(jì),由上海生工合成;引物序列:UQCRC1甲基化引物:上游5'GTT TTA AGT GAT TTA TTT GTT TCG G3′,下游5′TTT CTC CAT ATT AAC CAA TTT TAC G3′,擴(kuò)增長(zhǎng)度131 bp;UQCRC1非甲基化引物:上游5'GTT TTA AGT GAT TTA TTT GTT TTG G3′,下游5′ATT TCT CCA TAT TAA CCA ATT TTA CAC3′,擴(kuò)增長(zhǎng)度132 bp。

1.2DNA的提取、DNA亞硫酸氫鹽修飾、甲基化特異性PCR(MSP) 于清晨空腹應(yīng)用EDTA抗凝管采血8 ml,3 000 r/min離心10 min,吸取中間白細(xì)胞層,分裝在與實(shí)驗(yàn)樣本對(duì)應(yīng)編號(hào)的1.5 ml Eppendoff管,于吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院組織標(biāo)本庫(kù)-80℃冰箱保存待用;集中檢測(cè)。首先解凍-80℃白細(xì)胞樣品(白細(xì)胞/紅細(xì)胞混合物),嚴(yán)格按照DNA提取試劑盒操作說(shuō)明書(shū)提取DNA樣品,然后嚴(yán)格按EpiTect Fast DNA Bisulfite Kit(59824)操作說(shuō)明書(shū)對(duì)提取的純度較高的DNA樣品進(jìn)行亞硫酸氫鹽修飾,最后采用UQCRC1基因甲基化引物及非甲基化引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)總體積為25 μl,包括EpiTect Master Mix 12.5 μl,上游引物及下游引物各0.5 μl,亞硫酸氫鹽修飾后的DNA模板1 μl,RNase-free水10.5 μl。PCR擴(kuò)增條件:預(yù)變性95℃,10 min;擴(kuò)增(40個(gè)循環(huán)):變性94℃,15 s;退火50℃,30 s;延伸:72℃,30 s;最后延伸:72℃,10 min。PCR擴(kuò)增的結(jié)果,利用凝膠電泳及凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行檢測(cè),如果UQCRC1基因發(fā)生甲基化,以甲基化引物擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物出現(xiàn)條帶;如果未發(fā)生甲基化,以非甲基化引物擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物出現(xiàn)條帶。

表1 AD組與對(duì)照組一般資料比較

1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS22.0軟件行t檢驗(yàn),進(jìn)行t檢驗(yàn)前對(duì)計(jì)量資料進(jìn)行方差齊性檢驗(yàn),UQCRC1基因甲基化與AD相關(guān)性分析采用χ2檢驗(yàn)。

2 結(jié) 果

2.1MSP法檢測(cè)基因甲基化 AD組中樣本1、樣本2由甲基化引物擴(kuò)增的產(chǎn)物出現(xiàn)相應(yīng)條帶,說(shuō)明樣本1和樣本2發(fā)生甲基化改變。對(duì)照組中樣本1由非甲基化引物擴(kuò)增的產(chǎn)物出現(xiàn)相應(yīng)的條帶,說(shuō)明對(duì)照組樣本1未發(fā)生甲基化改變;對(duì)照組樣本2由甲基化引物擴(kuò)增的產(chǎn)物出現(xiàn)相應(yīng)條帶,說(shuō)明樣本2發(fā)生甲基化。見(jiàn)圖1。

Marker:2 000 bp DNA; U:非甲基化 M:甲基化圖1 AD組與對(duì)照組凝膠電泳

2.2AD組與對(duì)照組甲基化結(jié)果 AD組中有32例(64.00%)發(fā)生甲基化,對(duì)照組中有14例(25.45%)發(fā)生甲基化,兩組甲基化率比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=15.807,P<0.05)。

2.3在AD組中UQCRC1基因甲基化按性別、年齡分層比較 對(duì)AD組進(jìn)一步按性別、年齡分組,發(fā)現(xiàn)UQCRC1基因甲基化與性別無(wú)關(guān),差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義〔男性甲基化16例(61.54%,16/26),女性為16例(66.67%,16/24),χ2=0.142,P>0.05〕,與年齡有關(guān),年齡可能為其危險(xiǎn)因素〔≥65歲組甲基化29例(74.36%,29/39),<65歲組為3例(27.27%,3/11),χ2=8.256,P<0.05〕。

3 討 論

研究表明:DNA甲基化介導(dǎo)的調(diào)節(jié)在包括AD在內(nèi)的幾種慢性神經(jīng)退行性疾病的發(fā)展中起關(guān)鍵作用〔7〕。DNA甲基化是AD非常重要的表觀遺傳學(xué)機(jī)制,它通常表現(xiàn)為通過(guò)DNA的甲基化抑制基因的表達(dá)〔8〕。Smith等〔9〕研究發(fā)現(xiàn)位于髓細(xì)胞觸發(fā)受體(TREM)2基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游289 bp的CpG位點(diǎn)在AD患者大腦的顳上回呈現(xiàn)高甲基化狀態(tài)。在一項(xiàng)中國(guó)人群的研究發(fā)現(xiàn)UQCRC1基因在AD患者中高度甲基化,甲基化率高達(dá)97.3%〔10〕。國(guó)外的一項(xiàng)前瞻性研究分析表明AD易感基因的甲基化水平與AD病理改變相關(guān),并且附近基因的表達(dá)水平也發(fā)生了改變,例如ATP-結(jié)合盒A7基因(ABCA7)和橋連整合蛋白(BIN)1基因〔11〕。Ji等〔12〕研究發(fā)現(xiàn)κ阿片受體(OPRK)1基因啟動(dòng)區(qū)甲基化與AD發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)。隨著基因檢測(cè)技術(shù)的提高,越來(lái)越多與AD相關(guān)的易感基因被發(fā)現(xiàn),其中一些易感基因的甲基化狀態(tài)與AD的發(fā)生發(fā)展高度相關(guān)〔13,14〕,未來(lái)希望建立一個(gè)AD易感基因譜。

目前關(guān)于AD的發(fā)病機(jī)制中,線粒體級(jí)聯(lián)假說(shuō)受到越來(lái)越多人的關(guān)注。有研究報(bào)道腦內(nèi)的線粒體功能和葡萄糖代謝的改變是導(dǎo)致AD發(fā)病的前因,正電子發(fā)射斷層攝影術(shù)(PET)檢查顯示AD患者腦組織氧化和能量代謝受損,AD患者腦部對(duì)葡萄糖的吸收和利用與正常人相比減少21%~28%〔15〕。Swerdlow等〔16〕研究發(fā)現(xiàn)AD患者的腦組織存在Tau蛋白磷酸化、細(xì)胞周期重返和淀粉樣變性可能為線粒體功能障礙引起,可以很好地解釋非孟德?tīng)栠z傳因素導(dǎo)致的非常染色體顯性遺傳性AD的發(fā)病。線粒體功能障礙的特征在于缺乏關(guān)鍵呼吸酶的活性并且伴隨著活性氧的產(chǎn)生和積累。隨著β淀粉樣蛋白(Aβ)積聚,它會(huì)損害腦血流量,導(dǎo)致更少的葡萄糖可用于能量消耗,繼續(xù)惡性循環(huán)會(huì)加劇受損的腦血流量并導(dǎo)致神經(jīng)元變性,最終導(dǎo)致AD的發(fā)病〔17~19〕。Mancuso等〔20〕研究發(fā)現(xiàn)AD患者腦組織中線粒體電子傳遞鏈復(fù)合物Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ表達(dá)都下降,細(xì)胞色素C氧化酶活性降低。有研究表明,在神經(jīng)纖維纏結(jié)形成之前,線粒體內(nèi)細(xì)胞色素C氧化酶與線粒體DNA的水平有所改變,線粒體異常是AD病理的早期特征〔21〕。 Sorrentino等〔22〕利用線蟲(chóng)和小鼠作為模式生物,發(fā)現(xiàn)提高線粒體抵抗特定蛋白的應(yīng)激能力,能夠讓他們不僅保護(hù)自我,而且也會(huì)降低淀粉樣蛋白斑塊的形成。研究發(fā)現(xiàn)具有各種載脂蛋白E4等位基因的AD患者有線粒體功能障礙〔23,24〕。以上研究說(shuō)明線粒體功能障礙可能在AD的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。UQCRC1是編碼線粒體呼吸作用復(fù)合體Ⅲ(呼吸鏈的重要組成部分)的一個(gè)亞基,對(duì)維護(hù)線粒體正常功能至關(guān)重要。以往研究表明UQCRC1基因甲基化與腫瘤關(guān)系密切,如乳腺癌、卵巢癌及骨肉瘤、結(jié)腸癌等〔25〕。隨著線粒體級(jí)聯(lián)假說(shuō)深入的研究,UQCRC1基因甲基化與AD的關(guān)系也獲得了研究人員的關(guān)注。Ma等〔10〕的一項(xiàng)研究表明UQCRC1甲基化與AD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)。Lardenoije等〔26〕研究了幾種AD動(dòng)物模型中DNA甲基化和年齡的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)年齡相關(guān)的DNA甲基化增加。性別是AD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的一個(gè)重要因素,部分原因是因?yàn)榻^經(jīng)后女性失去了雌激素對(duì)神經(jīng)元線粒體抗Aβ毒性的保護(hù)作用。研究發(fā)現(xiàn)老年女性比年齡相當(dāng)?shù)哪行愿菀谆继悄虿『头逝值却x性疾病,增加患AD的風(fēng)險(xiǎn)〔27〕。目前關(guān)于性別與UQCRC1基因甲基化相關(guān)性未見(jiàn)報(bào)道,本實(shí)驗(yàn)性別與UQCRC1基因甲基化水平無(wú)相關(guān)性,而在 Lardenoije等〔26〕的動(dòng)物模型中,發(fā)現(xiàn)在3XTg-AD小鼠模型中基因甲基化與年齡之間顯著相關(guān),由于本實(shí)驗(yàn)樣本量有限,需要更多的實(shí)驗(yàn)研究闡明性別對(duì)表觀遺傳變化的影響。

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