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MRI紋理分析在大鼠膠質(zhì)瘤模型分級(jí)中的應(yīng)用

2018-12-03 06:41張歡歡林麗萍王嬌燕
關(guān)鍵詞:特征參數(shù)膠質(zhì)瘤紋理

張歡歡,林麗萍*,王嬌燕

1.復(fù)旦大學(xué)附屬上海市第五人民醫(yī)院放射科,上海 200240;2.上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬曙光醫(yī)院放射科,上海 200021;

膠質(zhì)瘤是腦內(nèi)最常見(jiàn)的原發(fā)性惡性腫瘤,根據(jù)惡性程度不同,分為低級(jí)別膠質(zhì)瘤(I~I(xiàn)I級(jí))及高級(jí)別膠質(zhì)瘤(III~I(xiàn)V級(jí))。膠質(zhì)瘤的準(zhǔn)確分級(jí)對(duì)治療決策、療效檢測(cè)和管理以及預(yù)后評(píng)估具有重要臨床意義[1]。紋理分析技術(shù)可快速地從影像圖像提取定量特征數(shù)據(jù),并對(duì)其進(jìn)行分析、建模和分類(lèi),可用于輔助鑒別診斷良惡性病變、評(píng)估腫瘤的侵襲、分級(jí)與分期、治療療效和預(yù)測(cè)預(yù)后等[2-5]。但由于醫(yī)學(xué)圖像及其紋理特征的復(fù)雜性,不同特點(diǎn)的醫(yī)學(xué)圖像需要采用有針對(duì)性的最合理紋理分析方法[6]。同時(shí),特定的磁共振紋理特征與腫瘤亞型之間的關(guān)系尚不明確[7]。為探究適合膠質(zhì)瘤分級(jí)的最佳紋理分析方法,以及分析紋理特征與膠質(zhì)瘤級(jí)別之間的相關(guān)性,本研究通過(guò)建立穩(wěn)定可靠、接近人腦膠質(zhì)瘤特性的大鼠膠質(zhì)瘤模型,從MRI圖像中提取特征,采用影像組學(xué)的處理流程,進(jìn)行高、低級(jí)別膠質(zhì)瘤的紋理分析研究。

1 材料與方法

1.1 動(dòng)物模型制備 雄性 Wistar大鼠 35只,體重250~300 g,SPF級(jí),購(gòu)于上海斯萊克實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司。C6膠質(zhì)瘤細(xì)胞株購(gòu)于上海生命科學(xué)研究院,在RPMI-1640培養(yǎng)基+10%胎牛血清的培養(yǎng)液中培養(yǎng)。于細(xì)胞處于狀態(tài)良好的對(duì)數(shù)期,配制成濃度為106個(gè)/μl的細(xì)胞懸液。大鼠麻醉消毒后,俯臥位固定于立體定向儀上,于顱中線行2~3 cm切口,用微型手持式顱鉆在冠狀縫前1 mm、矢狀縫右側(cè)3 mm處鉆一骨孔。微量進(jìn)樣器經(jīng)骨孔垂直進(jìn)針至硬膜下6 mm,后退1 mm,以1 μl/min緩慢推注,10 min推注完畢,留針10 min,緩慢退針,骨蠟封閉,單籠飼養(yǎng)。

1.2 MRI檢查 大鼠分別于接種后 7、14、21 d行MRI檢查。21 d后存活大鼠出現(xiàn)精神萎靡、抽搐、偏癱、眶周淤血等瀕死狀態(tài)時(shí),立即行MRI檢查。所選大鼠掃描前以1%戊巴比妥鈉腹腔麻醉備用。MRI檢查采用Siemens 3.0T Skyra醫(yī)用MR掃描儀,配小動(dòng)物專(zhuān)用線圈,以視交叉為中心,序列:軸位SE-T1WI、FSE-T2WI、T2-FLAIR及軸位T1WI增強(qiáng)掃描。掃描參數(shù)為,T1WI序列:TR 350 ms,TE最小值,激勵(lì)次數(shù)(NEX)4;T2WI序列:TR 3 000 ms,TE 120 ms,NEX 4;T2-FLAIR 序列:TR 9000 ms,TE 155 ms,NEX 1;增強(qiáng)掃描:腹腔注射0.15 g/ml釓噴替酸葡甲胺(3 ml/kg)后約20 min掃描。掃描視野均為8 cm×8 cm,層厚3.0 mm,層間距0,矩陣192×192。

1.3 病理學(xué)檢查 每次MRI檢查后,采用隨機(jī)數(shù)表法抽取6只大鼠以4%多聚甲醛溶液心臟灌注固定全腦,開(kāi)顱取全腦,將所有標(biāo)本投入 4%多聚甲醛溶液繼續(xù)固定24 h。以視交叉為參照,行0.3 μm常規(guī)病理切片,行HE染色及GFAP免疫組化檢查,按WHO膠質(zhì)瘤分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)確定其病理級(jí)別。

1.4 紋理分析 采用 MaZda軟件(4.6版,http://www.eletel.p.lodz.pl/programy/mazda/)進(jìn)行圖像紋理分析。

1.4.1 感性興趣(ROI)的選擇 將 MRI圖像以DICOM格式導(dǎo)出至紋理分析軟件MaZda。在神經(jīng)影像學(xué)專(zhuān)家指導(dǎo)下,以T1WI增強(qiáng)圖像作為參照確定腫瘤邊界,勾畫(huà)ROI。若腫瘤強(qiáng)化不明顯,則以T2WI圖像確定邊界。各序列(T1WI、T2WI、FLAIR 和 T1WI增強(qiáng))ROI保持一致。不同序列上ROI之間的差異通過(guò)計(jì)算其面積的組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(ICC)評(píng)價(jià),ICC>0.80為一致性佳,ICC0.61~0.80為一致性中等,ICC0.41~0.60為一致性一般,ICC0.11~0.40為一致性較低,ICC<0.10為無(wú)一致性。為更全面地分析病灶紋理特征,各序列上選擇病灶較大的2個(gè)層面用于后續(xù)分析。

1.4.2 紋理特征計(jì)算 所有圖像在提取特征參數(shù)前行灰度標(biāo)準(zhǔn)化處理,通過(guò)灰度變換法增強(qiáng)紋理信息的可檢測(cè)性。MaZda使用3種特征計(jì)算方法:統(tǒng)計(jì)學(xué)、基于模型、圖像變換,每個(gè)圖像最終得到6組(直方圖、絕對(duì)梯度、共生矩陣、游程矩陣、自回歸模型、小波變換)近400個(gè)紋理特征數(shù)據(jù)。

1.4.3 紋理特征選擇和提取 MaZda軟件自帶 4種獨(dú)立的方法,可自動(dòng)選擇有價(jià)值的紋理特征,包括特征子集選擇(optimal subsets,OS)、費(fèi)希爾系數(shù)(fisher score,F(xiàn)S)、分類(lèi)錯(cuò)誤概率聯(lián)合平均相關(guān)系數(shù)(probability of classification error and average correlation coefficients,PA)、互信息系數(shù)(mutual information,MI),以上每種方法可以自動(dòng)選擇10個(gè)最具價(jià)值的特征參數(shù),后 3種方法聯(lián)合應(yīng)用(MI+PA+FS)可以提供30個(gè)特征參數(shù)。將選擇的特征參數(shù)進(jìn)一步進(jìn)行特征提取,在B11模塊中通過(guò)主成分分析(principal component analysis,PCA)、線性判別分析(linear discriminant analysis,LDA)和非線性判別分析(nonlinear discriminant analysis,NDA)進(jìn)行數(shù)據(jù)降維。

1.4.4 紋理分類(lèi) PCA和LDA數(shù)據(jù)以B11模塊中的K近鄰算法(k-nearest neighbor,K-NN, K=1)分類(lèi)器進(jìn)行分類(lèi),NDA數(shù)據(jù)通過(guò)人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(artificial neural network,ANN)分類(lèi)器進(jìn)行分類(lèi)。

1.4.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 通過(guò)雙向無(wú)序R×C表比較5種特征選擇方法(OS、FS、PA、MI、MI+PA+FS)分別通過(guò) 3種特征提取/分類(lèi)方法(PCA/K-NN、LDA/KNN、NDA/ANN)得出的最小誤判率。在最佳分類(lèi)序列上所篩選出誤判次數(shù)最低的紋理特征組,通過(guò)SPSS 22.0軟件,采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)比較高、低級(jí)別膠質(zhì)瘤各特征參數(shù)間是否存在差異,將單因素分析得出差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的特征參數(shù)納入二元Logistic回歸模型進(jìn)一步分析,P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用受試者工作特性(ROC)曲線比較與膠質(zhì)瘤的病理分級(jí)相關(guān)的紋理特征對(duì)膠質(zhì)瘤分級(jí)的診斷效能。

2 結(jié)果

2.1 大鼠膠質(zhì)瘤模型MRI表現(xiàn) 對(duì)35只大鼠實(shí)施立體定向接種,排除未成瘤及圖像質(zhì)量不佳病例,共32只荷瘤大鼠的MRI圖像納入分析。接種早期,腫瘤呈小結(jié)節(jié)狀或條狀異常信號(hào),T1WI上呈等或稍高信號(hào),T2WI及T2 FLAIR上呈稍高信號(hào),增強(qiáng)掃描后強(qiáng)化不明顯。第2周起腫瘤明顯增大,信號(hào)不均勻,境界不清,部分病灶內(nèi)見(jiàn)點(diǎn)狀出血信號(hào)。第 3~4周腫瘤明顯增大,占位效應(yīng)明顯,晚期腫瘤信號(hào)混雜,內(nèi)可見(jiàn)壞死、出血信號(hào),增強(qiáng)掃描后呈明顯不均勻環(huán)形強(qiáng)化(圖1A~D)。

圖1 接種C6細(xì)胞后第3周大鼠MRI掃描圖像及病理圖像,腫瘤位于大鼠右側(cè)大腦半球。T1WI示腫瘤呈等-稍高信號(hào)(星號(hào)),邊界不清(A);T2WI示腫瘤以高信號(hào)為主,內(nèi)可見(jiàn)斑點(diǎn)狀低信號(hào)區(qū)(箭,B);FLAIR示腫瘤周?chē)?jiàn)斑片狀水腫(箭,C);T1WI增強(qiáng)示腫瘤呈環(huán)形強(qiáng)化,中央壞死(箭頭)未強(qiáng)化(D);HE染色示病灶周?chē)?jiàn)較多腫瘤細(xì)胞浸潤(rùn),正常神經(jīng)元數(shù)量減少,細(xì)胞間隙增寬,瘤周間質(zhì)水腫(×40,E);GFAP免疫組織化學(xué)染色示棕黃色部分即為腫瘤GFAP陽(yáng)性表達(dá)區(qū)域(×200,F(xiàn))

2.2 病理結(jié)果 光鏡下顯示腫瘤細(xì)胞聚集、排列緊密、生長(zhǎng)活躍,與正常組織交界處可見(jiàn)腫瘤細(xì)胞浸潤(rùn)(圖1E)。免疫組化顯示腫瘤組織內(nèi)見(jiàn)GFAP陽(yáng)性細(xì)胞(圖1F)。按照WHO膠質(zhì)瘤分級(jí)標(biāo)準(zhǔn),本研究32例大鼠膠質(zhì)瘤模型,其中 I~I(xiàn)I級(jí) 15例(低級(jí)別組),III~I(xiàn)V級(jí)17例(高級(jí)別組)。

2.3 紋理分析結(jié)果 64個(gè)層面的圖像均包含4個(gè)序列,共256幅圖像納入分析,其中低級(jí)別膠質(zhì)瘤120幅,高級(jí)別膠質(zhì)瘤136幅。各序列上ROI之間的ICC值為0.925(95%CI0.890~0.950,P<0.01)。5種紋理特征選擇方法篩選出的紋理參數(shù)主要集中在共生矩陣、游程矩陣和直方圖,見(jiàn)表1。

表1 5種自動(dòng)選擇方法在MRI各序列上篩選出具有價(jià)值的紋理特征參數(shù)的個(gè)數(shù)

紋理提取和分類(lèi)結(jié)果顯示,T2WI圖像提取的特征對(duì)不同級(jí)別膠質(zhì)瘤有較好的分類(lèi)能力(圖2A),低于3%的誤判率出現(xiàn)7次,其次分別為T(mén)1WI(5次)、增強(qiáng)T1WI(3次)和FLAIR(1次)。

紋理特征選擇方法中,PA法及MI+PA+FS法較其他3種單一的特征選擇方法(OS、FS、MI)誤判率更低,前兩者在T2WI圖像特征得出的誤判率相近(0/64~1/64),但其余各序列(T1WI、FLAIR、增強(qiáng)T1WI)中MI+PA+FS法選擇紋理特征得出的誤判率更低(1/64)(圖2B)。

圖2 紋理分析。A為各MRI掃描序列圖像通過(guò)不同方法所得誤判率;B為5種紋理特征選擇方法所得誤判率;C為通過(guò)3種方式進(jìn)行紋理特征提取和分類(lèi)后所得誤判率。FS為費(fèi)希爾系數(shù),PA為分類(lèi)錯(cuò)誤概率聯(lián)合平均相關(guān)系數(shù),MI為互信息系數(shù),OS為特征子集選擇,MI+PA+FS為前3種方法聯(lián)合使用,PCA/K-NN為主成分分析聯(lián)合K近鄰算法,LDA/K-NN為線性判別分析聯(lián)合K近鄰算法,NDA/ANN為非線性判別分析聯(lián)合人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

紋理特征提取和分類(lèi)中,NDA/ANN法可以獲得較低的誤判率,平均誤判率為3.95%,PCA/K-NN法誤判率最高,平均17.7%,LDA/K-NN法居兩者之間,平均11.3%(圖2C)。本研究中得出區(qū)分大鼠高、低級(jí)別膠質(zhì)瘤的最低誤判率為0(0/64),在T2WI圖像上通過(guò)PA聯(lián)合NDA/ANN所得,出現(xiàn)1次(表2)。

表2 不同MRI序列上5種方法對(duì)64個(gè)高、低級(jí)別膠質(zhì)瘤的誤判情況[例(%)]

在最佳分類(lèi)序列T2WI中所篩選出的3類(lèi)(共生矩陣、游程矩陣、直方圖)特征參數(shù)中,經(jīng)獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)共有10個(gè)紋理參數(shù)在高、低級(jí)別膠質(zhì)瘤之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),包括直方圖第10、50、90、99百分位數(shù)(percentile,Perc)、平均值(histogram's mean,Mean)、總熵值(sum entropy,SumEntrp)、游程圖像分?jǐn)?shù)(fraction of image in runs,F(xiàn)raction)、長(zhǎng)游程因子(long run emphasis,LngREmph)、灰度非均勻度(grey level nonuniformity,GLevNonU)、游程長(zhǎng)非均勻度(run length nonuniformity,RLNonUni)(表3)。將上述紋理參數(shù)納入二元Logistic回歸模型分析,最終篩選出與病理級(jí)別有相關(guān)性(P<0.05)的特征參數(shù)包括RLNonUni和GLevNonU(表4)。對(duì)篩選出的影像組學(xué)特征進(jìn)行ROC曲線分析,以ROC曲線下面積(AUC)為判斷模型擬合效果,其中以RLNonUni診斷效能相對(duì)最佳,AUC為 0.839±0.049(P<0.01),截?cái)嘀禐?245.44,對(duì)應(yīng)的敏感度為0.824,特異度為0.733(圖3)。

圖3 T2WI提取的游程長(zhǎng)非均勻度(RLNonUni)和灰度非均勻度(GLevNonU)鑒別高、低級(jí)別膠質(zhì)瘤的ROC曲線

表3 T2WI圖像3類(lèi)特征參數(shù)獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)結(jié)果

表4 T2WI最佳紋理特征Logistics回歸分析結(jié)果

3 討論

3.1 膠質(zhì)瘤的影像特征 顱內(nèi)膠質(zhì)瘤影像表現(xiàn)多樣,不同級(jí)別、分子亞型膠質(zhì)瘤MRI信號(hào)存在重疊[8],并且膠質(zhì)瘤內(nèi)部不同區(qū)域隨著疾病的發(fā)展,可出現(xiàn)不同分子亞型的腫瘤細(xì)胞,即腫瘤內(nèi)部的異質(zhì)性[9-10],上述因素導(dǎo)致膠質(zhì)瘤MRI術(shù)前分級(jí)、分型存在較大的困難[11]。

3.2 紋理分析技術(shù)在膠質(zhì)瘤診療中的價(jià)值 紋理分析技術(shù)通過(guò)基于計(jì)算機(jī)運(yùn)算反映數(shù)字圖像中像素灰度分布特征,可高通量地提取 MRI圖像的大量紋理特征[12],通過(guò)統(tǒng)計(jì)分析數(shù)據(jù)、建立模型,可提供腫瘤診斷、分級(jí)、預(yù)后評(píng)估等信息,可能有助于揭示腫瘤的異質(zhì)性[13]。Yu等[14]研究腦膠質(zhì)瘤MRI圖像特征與異檸檬酸脫氫酶(IDH1)基因突變的關(guān)系,通過(guò)提取、篩選圖像紋理特征并建立預(yù)測(cè)模型,獲得80%的分類(lèi)準(zhǔn)確率。吳亞平等[15]利用互信息和Logistic回歸模型對(duì)腦膠質(zhì)瘤T2WI數(shù)據(jù)分析,獲得19個(gè)紋理特征,模型預(yù)測(cè)腦膠質(zhì)瘤分級(jí)準(zhǔn)確率為90.7%。

3.3 MRI紋理分析最佳圖像序列的選擇 本研究分析了多個(gè) MRI序列圖像的紋理特征,從中篩選出的最佳分類(lèi)序列為T(mén)2WI主要是由于T2WI有較高的動(dòng)態(tài)范圍,即最低信號(hào)為0,最高信號(hào)由腦脊液決定,這可以使某些紋理特征計(jì)算更加準(zhǔn)確可靠[16]。增強(qiáng)T1WI可以反映腫瘤的血供特點(diǎn),也有學(xué)者直接提取該序列圖像的紋理特征進(jìn)行膠質(zhì)瘤分級(jí)、鑒別的研究[17-19]。本研究中增強(qiáng)T1WI提供的有價(jià)值紋理特征較T2WI少,可能是由于增強(qiáng)T1WI動(dòng)態(tài)范圍小所致。同時(shí),增強(qiáng)T1WI上腫瘤壞死、囊變、強(qiáng)化區(qū)域過(guò)小,可能無(wú)法提供高辨識(shí)度的紋理特征[7]。

3.4 適用于大鼠膠質(zhì)瘤模型分級(jí)診斷的最佳MRI紋理特征 游程矩陣是基于統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法的紋理特征,該特征適合于描述具有隨機(jī)性、非均勻性結(jié)構(gòu)的醫(yī)學(xué)圖像[6]。Kunimatsu等[18]回顧性分析了 44例膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者和16例原發(fā)中樞神經(jīng)系統(tǒng)淋巴瘤患者,發(fā)現(xiàn)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤MRI圖像RLNonUni明顯升高。Li等[20]通過(guò)對(duì)乳腺良惡性腫瘤鉬靶圖像的紋理分析,發(fā)現(xiàn)游程矩陣的紋理特征在兩者之間存在顯著差異。游程矩陣特征參數(shù)反映了具有某灰度值的像素于既定方向上連續(xù)出現(xiàn)的頻數(shù),可以間接反映圖像的粗糙程度[21]。RLNonUni可描述圖像中游程長(zhǎng)度的相似性,該數(shù)值越小,提示圖像上游程長(zhǎng)度相似;反之,提示圖像上游程長(zhǎng)度不一,即圖像紋理粗糙且粗細(xì)不均勻[22]。在本研究中通過(guò) Logistic回歸分析發(fā)現(xiàn),RLNonUni在區(qū)分高、低級(jí)別膠質(zhì)瘤方面較其他紋理特征更有價(jià)值。與低級(jí)別膠質(zhì)瘤組相比,高級(jí)別膠質(zhì)瘤組RLNonUni數(shù)值增大,表明圖像紋理粗細(xì)不均勻,與高級(jí)別膠質(zhì)瘤腦組織受損更嚴(yán)重,在宏觀圖像上信號(hào)不均,易出現(xiàn)出血、壞死、囊變一致。該特征參數(shù)在常規(guī)T2WI序列上的診斷效能中等(AUC=0.839),可能是由于膠質(zhì)瘤的異質(zhì)性特點(diǎn),不同級(jí)別腫瘤在微觀結(jié)構(gòu)上本身有一定的重疊,故單純依靠形態(tài)的常規(guī)MRI紋理分析結(jié)果存在一定的誤判率,在此基礎(chǔ)上聯(lián)合擴(kuò)散加權(quán)成像、灌注加權(quán)成像等功能MR圖像的紋理分析,可以提高膠質(zhì)瘤的分級(jí)診斷效能。

3.5 本研究的局限性 ①僅分析了 MR常規(guī)序列,未分析功能序列;②部分病灶較小,可能存在部分容積效應(yīng);③未對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行病例驗(yàn)證,以上不足將在進(jìn)一步研究中完善。

總之,對(duì)于大鼠 C6膠質(zhì)瘤模型,常規(guī) MR中T2WI的紋理特征可用于鑒別高、低級(jí)別腫瘤,其中游程長(zhǎng)非均勻度參數(shù)鑒別診斷效能相對(duì)最高,可為進(jìn)一步研究膠質(zhì)瘤治療、預(yù)后提供客觀依據(jù)。

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