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外泌體研究、轉(zhuǎn)化和臨床應(yīng)用專家共識(shí)

2018-12-19 10:15:32
轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志 2018年6期
關(guān)鍵詞:泌體外泌體共識(shí)

細(xì)胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)是由細(xì)胞分泌的具有磷脂雙分子層結(jié)構(gòu)的囊泡,能夠通過其攜帶的生物大分子,調(diào)節(jié)受體細(xì)胞的生物學(xué)特性,參與細(xì)胞的生理學(xué)和病理生理學(xué)過程[1-2]。外泌體是EVs一個(gè)重要的亞群[1],通常被認(rèn)為是經(jīng)由多泡體與細(xì)胞膜融合而釋放到細(xì)胞外的,直徑為40~100nm的膜性囊泡狀小體[3]。檢測外泌體標(biāo)志物,能夠?qū)崟r(shí)動(dòng)態(tài)地反映患者的疾病狀態(tài)[4-7],因此在疾病的早期篩查、無創(chuàng)診斷、療效監(jiān)控、輔助用藥等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用前景。此外,其作為藥物載體的潛在形式,在腫瘤等疾病的治療中也展現(xiàn)出誘人的潛力[8-10]。

近年來與外泌體相關(guān)的研究呈井噴式發(fā)展,以國際細(xì)胞外囊泡協(xié)會(huì)(International Society for Extracellular Vesicles,ISEV)為代表的學(xué)術(shù)團(tuán)體通過廣泛合作與探討,針對(duì)研究領(lǐng)域中的一些關(guān)鍵性問題撰寫了意見書[11-12]。雖然我國科研工作者在外泌體研究領(lǐng)域也作出了重要貢獻(xiàn),但迄今為止國內(nèi)還沒有就外泌體研究形成共識(shí)或指南。參考基因測序等技術(shù)的發(fā)展歷程,我們不難發(fā)現(xiàn)新的診斷技術(shù)在疾病的診斷、治療以及預(yù)防方面提供有力支持的同時(shí),也曾因?yàn)槿狈y(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)及規(guī)范化流程而走了一些彎路。為響應(yīng)發(fā)改委及有關(guān)單位在《“十三五”生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃》中提出以服務(wù)民生需求為根本,加速生物產(chǎn)業(yè)在各領(lǐng)域廣泛應(yīng)用的指導(dǎo)思想,中國抗癌協(xié)會(huì)腫瘤標(biāo)志專業(yè)委員會(huì)外泌體技術(shù)專家委員會(huì)組織專家撰寫了本共識(shí)。旨在促進(jìn)國內(nèi)外泌體特別是外泌體腫瘤標(biāo)志物的產(chǎn)學(xué)研結(jié)合,推動(dòng)相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范的建立,理性引導(dǎo)技術(shù)轉(zhuǎn)化,并服務(wù)于民生。

1 外泌體經(jīng)歷了“從無到有,由冷到熱”的發(fā)展歷程

共識(shí)專家回顧外泌體研究的發(fā)展歷史。關(guān)于外泌體的報(bào)道可追溯到1985年,最早被認(rèn)為是細(xì)胞的“排泄物”并沒有引起重視[13]。直到最近幾年,人們發(fā)現(xiàn)這種微小膜泡中含有細(xì)胞特異的蛋白、脂質(zhì)和核酸,能作為信號(hào)分子傳遞給其他細(xì)胞從而改變受體細(xì)胞的功能,才開始逐漸受到大家的關(guān)注。隨著里程碑式的研究成果不斷涌現(xiàn),包括外泌體在內(nèi)的EVs的研究已進(jìn)入了一個(gè)新的高潮。

(1)1985年,Johnstone研究組首次在體外培養(yǎng)的綿羊紅細(xì)胞上清中發(fā)現(xiàn)了一種有膜結(jié)構(gòu)的小囊泡,并在1987年的論文中將其命名為Exosome。

(2)1996年,Raposo發(fā)現(xiàn)類似于B淋巴細(xì)胞能分泌抗原提呈外泌體,能攜帶MHC-Ⅱ類分子、共刺激分子和粘附分子。

(3)1999年,Théry等發(fā)現(xiàn)樹突細(xì)胞也可以產(chǎn)生有抗原提呈能力的外泌體。

(4)2007年,Valadi等發(fā)現(xiàn)細(xì)胞之間可以通過外泌體中的RNA交換遺傳物質(zhì),這意味著細(xì)胞可以通過外泌體影響另外一個(gè)細(xì)胞。

(5)2013年,Rothman、Schekman和Südhof 3位科學(xué)家獲得諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng),以表彰他們?cè)诩?xì)胞內(nèi)部囊泡運(yùn)輸調(diào)控機(jī)制方面做出的貢獻(xiàn)。

(6)2015年6月,美國M.D.Anderson Cancer Center的研究者發(fā)現(xiàn)早期胰腺癌患者血清中外泌體的GPC1(glypican-1)豐度顯著高于正常人群。

(7)2016年1月,Exosome Diagnostics公司推出世界首款外泌體癌癥診斷產(chǎn)品ExoDx Lung(ALK)。

(8)2016年5月,牛津大學(xué)開發(fā)出名為EvOx的外泌體治療產(chǎn)品。

(9)2017年,Kamerkar等采用外泌體作為載體遞送RNAi,靶向治療胰腺癌。

不難發(fā)現(xiàn),外泌體研究之所以能迅猛發(fā)展,一方面得益于本身具有重要的生物學(xué)功能,另一方面分析和檢測技術(shù)的持續(xù)進(jìn)步也為之奠定了良好基礎(chǔ)。盡管捷報(bào)頻傳,但目前對(duì)外泌體的了解依舊有限。共識(shí)專家認(rèn)為現(xiàn)有的一些基于單中心、小樣本量的研究結(jié)果包括上述里程碑中提到的工作,還需進(jìn)一步的研究和多中心臨床試驗(yàn)予以驗(yàn)證。雖然外泌體研究還存在諸多尚未解決的難題,共識(shí)專家堅(jiān)信,這也正是值得研究與探索的魅力所在,隨著相關(guān)知識(shí)的逐步積累,外泌體一定有更豐富的奧秘等待我們?nèi)グl(fā)現(xiàn)。

2 外泌體分離方法豐富多樣,但缺乏標(biāo)準(zhǔn)

EVs一詞是ISEV創(chuàng)造的術(shù)語,是細(xì)胞釋放的囊泡的統(tǒng)稱[11]。EVs有不同的亞群,除外泌體之外,還有質(zhì)膜來源的囊泡,名稱包括微囊泡、脫落囊泡、外膜囊泡、癌小體以及凋亡小體等。這些EVs亞群在粒徑范圍、內(nèi)含物類型,以及生物學(xué)功能上,存在不同程度的重疊與區(qū)分。分離和提取外泌體的方法很多,但都是基于外泌體的某一種或若干種的理化性質(zhì)來實(shí)現(xiàn)的[14-15],包括以下方法[16-23]。

2.1 超速離心法 依據(jù)密度特性,通過超高速離心將外泌體從生物流體中分離出來的方法。若結(jié)合蔗糖墊使用,能夠讓外泌體富集在密度1.13~1.19 g/mL的餾分中,從而提高產(chǎn)物純度。

2.2 超濾法 根據(jù)特定截留分子量的超濾膜,將粒徑較大的外泌體從生物流體中分離出來的方法。

2.3 排阻色譜法 當(dāng)生物流體通過排阻色譜柱時(shí)不同分子量的顆?;蚍肿訒?huì)因流速不同而被分配到不同餾分中,可用于外泌體的純化。

2.4 免疫磁珠法 通過將涂覆有抗標(biāo)記抗體(如CD63、CD81和CD9)的磁珠與外泌體結(jié)合,可以選擇性分離外泌體。

2.5 聚乙二醇沉淀法 聚乙二醇能夠在水溶液中形成網(wǎng)狀聚合物結(jié)構(gòu)并通過“劫持”水分子的方式改變外泌體溶解度,在較低的離心力下與外泌體共沉淀。

2.6 微流控芯片技術(shù) 利用微流控芯片技術(shù)可以將外泌體的分離、回收、檢測等多種操作整合至微米級(jí)別的芯片上進(jìn)行。

2.7 其他分離方法 除上述方法外,還有利用細(xì)胞膜親和性、靜電作用、不同水溶性聚合物或有機(jī)溶劑對(duì)外泌體進(jìn)行提取的方法,在此不一一贅述。

共識(shí)專家認(rèn)為上述的所有分離方法,都存在各自的局限性。到目前為止,外泌體的分離方法還尚無公認(rèn)的“金標(biāo)準(zhǔn)”。無論那種方法都不能將外泌體與其他EVs亞群徹底分離??紤]到分離方法還沒有標(biāo)準(zhǔn)化,為確定研究工作中所描述的內(nèi)含物分子或生物學(xué)功能的確來自于EVs而非其他雜質(zhì),ISEV提出了最小化實(shí)驗(yàn)要求(MISEV2014),建議對(duì)EVs進(jìn)行必要的鑒定表征和功能學(xué)實(shí)驗(yàn)。但我們也認(rèn)識(shí)到這套方法對(duì)于非EVs雜質(zhì)的鑒定并不充分。設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)對(duì)產(chǎn)物中非EVs雜質(zhì)含量進(jìn)行表征,又或者設(shè)法耗盡非EVs雜質(zhì)及其生物學(xué)活性,可能有助于提高研究結(jié)果的可靠性。

共識(shí)專家認(rèn)為雖然目前還無所謂的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但未來出現(xiàn)更好的EVs分離技術(shù)是大概率事件。而且,隨著我們對(duì)EVs認(rèn)識(shí)的不斷深入,問題也可能以另外的途徑得到解決。例如,有人提議使用sEV(即small extracellular vesicle)這樣的表述來定義直徑小于200 nm的囊泡。雖然看似缺乏生物學(xué)意義,實(shí)質(zhì)更具可操作性。共識(shí)專家對(duì)此持開放態(tài)度,實(shí)踐是最好的檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)。對(duì)于希望開展外泌體研究的科研工作者,建議根據(jù)樣本類型和下游的科學(xué)問題來選擇提取方法。

3 外泌體分析方法需要“量體裁衣”

3.1 外泌體形貌分析 使用透射電子顯微鏡或原子力顯微鏡,能夠?qū)蝹€(gè)EV的形貌和粒徑進(jìn)行表征。

3.2 外泌體群體的粒徑分析 納米粒子示蹤分析技術(shù)、動(dòng)態(tài)光散射,或電阻脈沖傳感,能夠統(tǒng)計(jì)大量外泌體的粒徑分布情況。

3.3 外泌體蛋白質(zhì)分析 蛋白質(zhì)印跡、流式細(xì)胞儀、ELISA或質(zhì)譜技術(shù)可用于分析外泌體(EVs)所攜帶的蛋白標(biāo)志物。

3.4 RNA分析 二代測序可以了解外泌體中的RNA組成,對(duì)于已知的RNA可以通過qPCR或Northern印跡進(jìn)行驗(yàn)證。測序可能因?yàn)槠唇悠?,?dǎo)致轉(zhuǎn)錄表達(dá)錯(cuò)誤。微陣列技術(shù)可用于RNA含量的表達(dá)譜分析,但不能用于發(fā)現(xiàn)新序列。

3.5 DNA分析 與RNA分析相似,PCR、微陣列技術(shù)可以用于分析已知的DNA分子,二代測序可以用于新序列的發(fā)現(xiàn)。

3.6 代謝分析 外泌體代謝物包括脂質(zhì)、糖、氨基酸等小分子,代謝物的變化可以反映來源細(xì)胞的生化狀態(tài)。

一方面,外泌體因其尺度特點(diǎn),對(duì)原有的分析技術(shù)提出了新的挑戰(zhàn)。例如,傳統(tǒng)流式細(xì)胞儀無法測量粒徑<300 nm的顆粒,然而結(jié)合了瑞利散射和鞘流單分子熒光檢測技術(shù)的超高靈敏流式檢測系統(tǒng)可以對(duì)粒徑低至40 nm的EVs的進(jìn)行快速表征[24]。

另一方面,分析外泌體標(biāo)志物豐度普遍偏低。例如,即使是外泌體中含量較高的microRNA平均每個(gè)外泌體內(nèi)還不足一個(gè)拷貝[25]。類似的,為了解決外泌體中蛋白質(zhì)定量的技術(shù)挑戰(zhàn),新一代的蛋白分析方法正在開發(fā)中,如小顆粒流式細(xì)胞儀、微核磁共振、納米等離子體外體傳感器等。與傳統(tǒng)的檢測方法相比,這些方法所需樣本量更少,并且操作簡單。

種植抗病品種是最經(jīng)濟(jì)有效的防治方法,目前尚無玉米瘤黑粉病免疫品種,但自交系和雜交種之間抗病性有明顯差異。利用抗黑粉病自交系材料,配制雜交種用于生產(chǎn)。

由此可見,根據(jù)外泌體的特性“量身定制”分析方法和檢測手段,未來會(huì)成為常態(tài)。雖然外泌體有著豐富的內(nèi)含物,但針對(duì)外泌體RNA的報(bào)道要多于其他內(nèi)含物,這一定程度上是檢測技術(shù)發(fā)展不均衡所導(dǎo)致的結(jié)果。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步,分析方法的選擇勢(shì)必會(huì)擁有更廣泛的空間。于此同時(shí),多學(xué)科的交叉,如基于人工智能的多組學(xué)算法開發(fā),有望改變傳統(tǒng)單一標(biāo)志物的概念,以組學(xué)的、圖譜式的方式對(duì)標(biāo)志物進(jìn)行重新定義。共識(shí)專家認(rèn)為實(shí)現(xiàn)這一目的,離不開多學(xué)科人才的積極參與跟配合。

4 外泌體——液體活檢的“第三駕馬車”

共識(shí)專家中許多位既往有或目前從事其他液態(tài)活檢技術(shù)如循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)和循環(huán)腫瘤細(xì)胞(circulating tumor cell,CTC)的經(jīng)歷。我們欣喜的看到在過去短短數(shù)年中,液體活檢技術(shù)發(fā)展迅速,已經(jīng)向臨床展示了其巨大的便捷性和信息豐度。由于能夠攜帶了母細(xì)胞來源的蛋白質(zhì)、RNA和DNA,外泌體提供了一種可以實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監(jiān)測疾病狀態(tài)的新方式,成為繼ctDNA和CTC之后液體活檢領(lǐng)域的“第三駕馬車”[26-27]。

共識(shí)專家認(rèn)為在3大液體活檢技術(shù)之中,CTC是從實(shí)體腫瘤脫落并侵入外周血循環(huán)的腫瘤細(xì)胞,不僅攜帶了腫瘤的全部分子特征,還有細(xì)胞形態(tài)學(xué)信息;ctDNA是血液中腫瘤來源的DNA片段,直接來源于實(shí)體腫瘤或CTC;外泌體論尺度和所攜帶的信息量均介于二者之間。多數(shù)專家認(rèn)為3種技術(shù)雖各有所長(表1),但總體而言,外泌體至少在2個(gè)方面更具優(yōu)勢(shì):①樣本形式更豐富。CTC和ctDNA主要來自于外周血,而幾乎所有體液樣本都含有外泌體,外泌體幾乎“無處不在”;②內(nèi)含物更穩(wěn)定,得益于磷脂雙分子層的保護(hù),外泌體內(nèi)含物具有較好的穩(wěn)定性,雖然CTC也有細(xì)胞膜,但是進(jìn)入外周血后只有極少數(shù)能夠抵達(dá)遠(yuǎn)端,多數(shù)CTC的命運(yùn)是失巢凋亡或被吞噬。

表1 現(xiàn)有液體活檢技術(shù)特點(diǎn)及對(duì)比

共識(shí)專家反復(fù)提到外泌體和腫瘤異質(zhì)性的關(guān)系。作為惡性腫瘤的一個(gè)特征,腫瘤異質(zhì)性是目前腫瘤診斷和治療的最大挑戰(zhàn)之一。深入研究腫瘤異質(zhì)性,可以更好地闡釋腫瘤發(fā)生、發(fā)展的原因,并可能指導(dǎo)人們制定更精細(xì)的治療策略。然而,腫瘤異質(zhì)性既體現(xiàn)在空間上也體現(xiàn)在時(shí)間上。受采樣區(qū)域和采樣時(shí)間的限制,傳統(tǒng)的組織活檢難以對(duì)腫瘤的異質(zhì)性進(jìn)行實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)的反映。液體活檢在很大程度上避免了這兩點(diǎn)限制,能夠涵蓋更廣泛的腫瘤亞群,并且可以多時(shí)間點(diǎn)采樣對(duì)腫瘤異質(zhì)性進(jìn)行動(dòng)態(tài)跟蹤。由于ctDNA只能反映基因組信息,無法全面反映轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組以及細(xì)胞形態(tài)學(xué)上的異質(zhì)性。CTC雖然攜帶了最為豐富的信息,但是因其豐度太低(0~102/mL),需要獲得多少數(shù)量的CTC才足夠反映整個(gè)腫瘤的異質(zhì)性,尚且無明確的結(jié)論。相比之下,來源于幾乎所有腫瘤細(xì)胞,且豐度較CTC更高的外泌體給人們帶來了希望。隨著分離和鑒定技術(shù)的發(fā)展和完善,外泌體是否能夠更好更全面的反映腫瘤的異質(zhì)性成為共識(shí)專家共同關(guān)心的議題。專家期待通過后續(xù)研究能夠得出更詳實(shí)的答案。

目前,雖然CTC、ctDNA和外泌體3大液體活檢技術(shù)在國際上均有診斷產(chǎn)品問世,但缺乏統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)似乎是液體活檢領(lǐng)域目前共通的問題,希望在多學(xué)科的共同努力之下,能夠盡快突破相應(yīng)的技術(shù)瓶頸,以達(dá)成統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范,將使得上述3種技術(shù)的臨床和應(yīng)用價(jià)值得以實(shí)質(zhì)性的體現(xiàn)。

5 外泌體標(biāo)準(zhǔn)化之路——道阻且長

在外泌體研究中,不可避免地會(huì)存在來自其他EVs亞群的干擾。此外,生物流體中還存在包括蛋白復(fù)合物(AGO2)、脂蛋白(高密度脂蛋白、低密度脂蛋白和乳糜微滴)以及微生物等可能對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)構(gòu)成影響的干擾物[28]。樣本采集和保存過程中的諸多因素,也可能對(duì)外泌體構(gòu)成未知的影響。共識(shí)專家認(rèn)為目前缺乏標(biāo)準(zhǔn)化的提取和分析技術(shù),外泌體標(biāo)志物豐度低等一系列問題,為外泌體研究的標(biāo)準(zhǔn)化之路構(gòu)成了重重障礙。

古語有云“道阻且長,行則將至”。多學(xué)科的交叉和相互促進(jìn)勢(shì)必為EVs及外泌體的研究和應(yīng)用帶來廣闊的前景,包括物理、化學(xué)、傳感以及工程學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)進(jìn)展,將有助于對(duì)外泌體的功能和化學(xué)計(jì)量進(jìn)行更精確的分析,甚至在單囊泡水平對(duì)其組份進(jìn)行鑒定及表征。人造EVs標(biāo)準(zhǔn)品的研制等工作,將有利于EVs及其內(nèi)含物回收效率的標(biāo)準(zhǔn)化校驗(yàn),并促進(jìn)獨(dú)立驗(yàn)證結(jié)果。隨著新技術(shù)的不斷發(fā)展,尤其是對(duì)外泌體的理化特性、生物學(xué)功能的理解進(jìn)一步加深,多學(xué)科的共同關(guān)注和研究投入,未來必定會(huì)有更好的外泌體分離、分析技術(shù)不斷涌現(xiàn)。面對(duì)這些標(biāo)準(zhǔn)化問題,各研究團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)當(dāng)主動(dòng)出擊,匯聚多方力量共同尋求突破口。

6 展望

隨著個(gè)體化和精準(zhǔn)醫(yī)療概念的提出,越來越多的研究者開始關(guān)注如何做到疾病的精準(zhǔn)診斷及治療。外泌體作為一個(gè)新的研究熱點(diǎn),由于它在體內(nèi)分布的廣泛性和獲取的便捷性,已經(jīng)成為疾病診斷治療的潛在有效方式,在精準(zhǔn)治療上有著光明的前景。未來外泌體標(biāo)志物不僅能夠用于疾病診斷、指導(dǎo)個(gè)性化治療,還可能用于疫苗開發(fā)與免疫治療、基因治療、靶向藥物治療等,為人類最終攻克癌癥等醫(yī)學(xué)難題帶來新的希望。

外泌體技術(shù)在臨床應(yīng)用研究仍然處于初級(jí)階段,其面臨的諸多挑戰(zhàn)也伴隨著誕生無數(shù)新發(fā)現(xiàn)和新技術(shù)的可能性。在重大疾病如惡性腫瘤中的功能研究及診療應(yīng)用已經(jīng)呈現(xiàn)其巨大的潛力及可能性,新興的領(lǐng)域中,新的認(rèn)知和共識(shí)將不斷出現(xiàn)甚至顛覆。雖然其標(biāo)準(zhǔn)化的產(chǎn)生,可能是一個(gè)漫長和反復(fù)的過程,但如同礦藏一般,深挖一尺,便有一尺的驚喜。

專家組組長:張 灝

執(zhí)筆者:張 灝,趙立波,葉國棟

專家組單位和成員(按照單位和姓氏拼音排序)

澳大利亞新南威爾士大學(xué)(李 勇)

北京恩澤康泰生物科技有限公司(趙立波)

大連醫(yī)科大學(xué)(劉婷姣)

廣州金域醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)集團(tuán)股份有限公司(李曉華)

國家納米科學(xué)中心(孫佳姝)

哈爾濱醫(yī)科大學(xué)(黃小義)

荷蘭格羅寧根大學(xué)(林宇晟)

暨南大學(xué)(董宏梅,王 通,葉國棟,張冬梅,張 灝)

南方醫(yī)科大學(xué)(李 欣)

上海華盈生物醫(yī)藥科技有限公司(張慶華)

上海中科新生命生物科技有限公司(寧嬋娟)

深圳大學(xué)(李曉武)

四川大學(xué)(賈 大)

廈門大學(xué)(蔡望宇,顏曉梅)

浙江大學(xué)(張 龍)

中國醫(yī)科大學(xué)(曲秀娟)

中山大學(xué)(李 疆,李孟鴻,宋立兵)

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