(作者:劉奕,王俏琦,張波,章元兵,張子恒,周爽來源:《知識(shí)分子》)
俗話說,民以食為天。基因編輯技術(shù)不僅在醫(yī)學(xué)上有很大的用途,在農(nóng)業(yè)應(yīng)用中也能大顯身手,基因編輯技術(shù)不僅能讓我們吃飽,而且還能夠吃得更好。
很多人都吃過西紅柿。有人喜歡切片涼拌,有人喜歡西紅柿炒蛋。但大家有沒有注意過,市場(chǎng)上能買到的西紅柿分多個(gè)品種,有的又大又甜,有的又小又酸。既然都是西紅柿,為什么它們有那么大的區(qū)別呢?
這些差異源于西紅柿不同的基因調(diào)控?;蚓拖褚槐窘炭茣?,告訴西紅柿應(yīng)該怎么長(zhǎng)。既然西紅柿不是生來就注定被人類吃掉,它們的基因教科書自然也不會(huì)教它們?cè)趺锤菀椎乇蝗顺缘簟?/p>
西紅柿的先祖不長(zhǎng)這樣,它們現(xiàn)在的樣子得益于人類數(shù)百年來的培育。人工育種時(shí)常會(huì)遇到一個(gè)這樣的哲學(xué)問題:為什么把幾個(gè)好品種一起培育的時(shí)候,反而組合出了一些不好的后代,而好的品種和不好的品種雜交的后代卻更好?造成這個(gè)問題的主要原因是,基因在重組時(shí),往往會(huì)丟失掉一些已經(jīng)“寫好的段落”,而換上一些不好的。
所以,科學(xué)家選擇了CRISPR來解決好片段丟失,而這就帶來了口味不佳的問題,這種技術(shù)就像是基因教科書上的“修正帶”和“熒光筆”,可以有目的地修改和編輯基因。有的基因教科書上的段落寫得不好,就可以用修正帶去掉錯(cuò)誤內(nèi)容,甚至在原來的段落上加上更好的內(nèi)容,從而得到更好的西紅柿品種。
美國(guó)冷泉港實(shí)驗(yàn)室Zachary Lippman教授一直熱衷于西紅柿品種的改良,他將CRISPR當(dāng)作熒光筆使用,去強(qiáng)調(diào)一些基因教科書上的重點(diǎn)段落。這些段落叫做數(shù)量性狀決定段落(QTL,quantitative traits locations),在這些決定段落前面打個(gè)“五角星”,西紅柿就知道要重點(diǎn)關(guān)注這些地方;而同樣地,可以用“熒光筆”叉掉一些不需要的“段落”,就少表達(dá)這些地方,這相當(dāng)于用“修正帶”去刪除基因。給基因劃重點(diǎn)可更靈活地讓西紅柿產(chǎn)量得到提高,避免了之前人工育種遇到段落丟失的問題。即使多劃了一處重點(diǎn),或者劃錯(cuò)了一處重點(diǎn),其影響也比較小。
CRISPR還能夠通過控制西紅柿的其他基因,在不影響果實(shí)本身的基礎(chǔ)上,讓西紅柿長(zhǎng)得更好,如修改西紅柿的分枝和開花數(shù)量,可把營(yíng)養(yǎng)集中于更少的西紅柿果實(shí)上,讓它們變得更美味;修改西紅柿柄的形狀和枝節(jié)的牢固程度,可讓西紅柿在枝頭上掛得時(shí)間更長(zhǎng),不容易掉到地上腐爛;修改西紅柿開花和結(jié)果的周期,讓西紅柿在中高緯度等寒冷的地方也能更快地成熟。隨著科學(xué)家對(duì)西紅柿的基因理解越來越深入,CRISPR作為“修正帶”和“熒光筆”可更好地注釋這本基因教科書,推出更新版的教科書。
水稻是中國(guó)人的重要主食,科學(xué)家也在不懈地進(jìn)行水稻品種改良。袁隆平院士致力于通過水稻雜交技術(shù)得到了超級(jí)水稻,解決了億萬人口的吃飯問題。現(xiàn)在有了CRISPR技術(shù),新型水稻品種的研發(fā)也如虎添翼。
水稻的生長(zhǎng)需依賴土壤和農(nóng)民不斷地灌溉。但由于廢棄電池的胡亂丟棄和一些金屬電鍍工業(yè)廢水的排放,土壤本身和用于灌溉水稻的水,都被“鎘”等重金屬污染。鎘會(huì)在人體內(nèi)緩慢堆積,你吃進(jìn)去多少,就留下來多少,量一多問題就來了。20世紀(jì)60年代,日本出現(xiàn)過一種怪病——痛痛病,患病的人渾身關(guān)節(jié)疼痛,難以忍受,最后查明是由于工業(yè)廢水排放的鎘污染造成人體內(nèi)鎘含量超標(biāo)。
水稻中就是有這樣一些基因,在它們的調(diào)控下水稻會(huì)吸收土壤以及灌溉水中的鎘離子與其他的重金屬離子,在水稻被人吃掉后,重金屬離子就會(huì)堆積在體內(nèi)。相對(duì)于玉米和其他糧食作物而言,水稻的產(chǎn)量改良已趨于完善,而除去鎘對(duì)水稻的污染成了棘手的問題,超級(jí)稻和雜交稻對(duì)鎘元素的親和能力更強(qiáng)。如何規(guī)避水土污染對(duì)水稻品質(zhì)造成的危害,看上去成了一個(gè)兩難的問題。
袁隆平帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)用CRISPR技術(shù)來挑戰(zhàn)這個(gè)問題。鎘離子要想進(jìn)入水稻,首先要從土壤進(jìn)入水稻的根部,再通過內(nèi)部的管道,轉(zhuǎn)運(yùn)到水稻的胚芽中,最后被人吃掉吸收。所以,袁隆平選擇從水稻根部入手,利用CRISPR技術(shù)修改掉根部細(xì)胞中調(diào)控金屬離子跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、韌皮部鎘轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白等,多個(gè)鎘吸收相關(guān)蛋白的基因的表達(dá)量,以達(dá)到降低水稻胚芽中鎘離子濃度的目的。但這些蛋白除了吸收鎘離子之外,還會(huì)吸收錳原子等水稻生長(zhǎng)必需的離子。所以這個(gè)問題不僅是個(gè)定性問題,更是個(gè)定量問題。結(jié)合原先水稻雜交技術(shù),袁隆平篩選出了在盡可能不影響產(chǎn)量的情況下,含鎘量更少的新一代抗鎘超級(jí)稻。
除此之外,中科院上海植物逆境生物學(xué)研究中心朱健康研究組也利用CRISPR技術(shù)實(shí)現(xiàn)了對(duì)水稻的多基因編輯。
CRISPR不僅能直接修改基因,來優(yōu)化農(nóng)作物的果實(shí),還能通過其他的方式保護(hù)農(nóng)作物的茁壯成長(zhǎng)。很多昆蟲會(huì)將農(nóng)作物作為食物,影響農(nóng)作物的正常生長(zhǎng)。由于昆蟲會(huì)自己分泌抗菌肽而抵抗各種病原菌的感染,所以,在自然條件下的昆蟲對(duì)周圍環(huán)境有很強(qiáng)的抵抗力,法國(guó)的科學(xué)家Emmanuelle Jacquin-Joly將CRISPR技術(shù)用于防止蟲害。他們將一種鱗翅目害蟲的特定氣味感受分子從基因組中敲除,并發(fā)現(xiàn)70%的后代可以遺傳這種突變。通過放飛一些“間諜昆蟲”來傳播“聞”不到作物的氣味的基因,讓農(nóng)作物免收摧殘。事實(shí)上,研究者還可直接通過CRISPR改造出帶有“不孕不育”基因的“間諜昆蟲”,直接讓害蟲“斷子絕孫”。
傳統(tǒng)防止病蟲害的方法是使用殺蟲劑和抗生素,但濫用讓植物的病蟲害愈演愈烈。單一種作物使用同種抗蟲劑或抗生素久了,會(huì)讓病蟲害體內(nèi)產(chǎn)生耐受基因,最后導(dǎo)致無藥可用。同時(shí)種植種子的單一化也容易帶來植物間的“傳染病”,如《星際穿越》中描述的枯萎病一樣,當(dāng)一種病蟲害完全免疫了現(xiàn)有的所有抗生素或殺蟲劑,甚至可能毀掉一個(gè)國(guó)家的農(nóng)業(yè)。CRISPR技術(shù)能讓植物本身帶上抗性基因,而不是通過外用抗生素或殺蟲劑達(dá)到效果。康奈爾大學(xué)的Adam Bogdanove和其合作者JanLeach在研究如何激發(fā)水稻本身的免疫系統(tǒng),讓其能抵抗細(xì)菌性條紋和枯萎病在內(nèi)的多種疾病;新澤西州立大學(xué)的研究人員通過CRISPR研發(fā)出能自身抵抗霜霉病的釀酒葡萄;中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所研究員高彩霞將抵抗白粉病的基因引入了小麥中。
微生物通常和植物有著共生關(guān)系,如根瘤菌常常和豆類植物相互依賴、共同生存,因?yàn)楦鼍袠O強(qiáng)的固氮作用,能將空氣中的氮?dú)廪D(zhuǎn)化為植物生長(zhǎng)所需要的原料。華中農(nóng)業(yè)大學(xué)端木德強(qiáng)教授課題組通過CRISPR修改一種豆科植物百脈根的共生固氮作用的相關(guān)基因,以研究其機(jī)理并改進(jìn)這種共生關(guān)系,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對(duì)植物成長(zhǎng)的調(diào)控,促進(jìn)植物生長(zhǎng)。
CRISPR也能讓一些觀賞植物變得更加豐富多彩。牽?;伾梢粋€(gè)色素催化相關(guān)基因(DFR-B)控制,相當(dāng)于對(duì)應(yīng)基因教科書中的一行,把它刪掉后,牽?;ɑò昃蛷母哔F的紫色變成了純潔的白色。而通過進(jìn)一步的基因修飾,可通過精確控制色素酶表達(dá)量的多少來決定牽牛花的顏色,或者通過基因改造來達(dá)到不同的顏色。而另外一些植物的顏色變化是由于氧化作用,把A顏色分子加上一個(gè)氧原子,就變成了B顏色分子。比如,常見的蘑菇,通過對(duì)多酚氧化酶(PPO)來控制顏色的深淺,如果調(diào)控這些酶的表達(dá),蘑菇就會(huì)顯示一個(gè)深度的顏色,或者保持白色。
今天我們吃到的植物,無不是人類長(zhǎng)期培育得到的。CRISPR技術(shù)的誕生,不僅僅可以加速人類去探索更多未知的植物基因功能,更好地注釋這本基因教科書,也能讓我們?cè)诶斫饣蚬δ艿幕A(chǔ)上,去使用它。
相對(duì)于醫(yī)學(xué)和動(dòng)物而言,植物CRISPR的脫靶問題顯得不那么嚴(yán)重。最近,美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)發(fā)布了新規(guī),撤銷了對(duì)CRISPR作物的嚴(yán)格管控,將CRISPR立為支持發(fā)展的項(xiàng)目,鼓勵(lì)CRISPR植物的種植試驗(yàn)。
未來CRISPR可被用作一種開發(fā)更有價(jià)值作物的工具,通過對(duì)農(nóng)作物基因進(jìn)行直接改造,在安全性受保障的前提下,使得農(nóng)作物質(zhì)量得到更大的提升。這樣的作物在不久的將來,就能飛入尋常百姓家,來到我們的餐桌上,而不是僅僅活躍于實(shí)驗(yàn)臺(tái)上。