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脊索瘤分子調(diào)控機制的研究進展

2019-01-06 15:39梁辰楊辰龍劉曉光
腫瘤防治研究 2019年2期
關(guān)鍵詞:甲基化受體調(diào)控

梁辰,楊辰龍,劉曉光

0 引言

脊索瘤是起源于胚胎殘余脊索組織的原發(fā)腫瘤,國外數(shù)據(jù)統(tǒng)計其發(fā)病率約為百萬分之一,占惡性骨腫瘤的1%~4%。肖建如等曾對近十年華東地區(qū)3個大型數(shù)據(jù)庫中的1 209例原發(fā)性骨腫瘤數(shù)據(jù)進行分析,結(jié)果顯示脊索瘤在惡性骨腫瘤中所占比例高達9.8%。該腫瘤發(fā)病年齡在50~60歲,男性多于女性,兒童罕見。組織學(xué)上,脊索瘤分為經(jīng)典型,軟骨型及去分化型,以經(jīng)典型為主。發(fā)生部位以中軸骨、骶骨最多,其次是顱底及脊柱其他節(jié)段[1-2]。脊索瘤為低、中度惡性腫瘤,生長緩慢,起病隱匿,癥狀不典型,確診時多數(shù)腫瘤體積較大,且臨近結(jié)構(gòu)復(fù)雜,手術(shù)切除難度高。脊索瘤對化療不敏感,對放療部分敏感,目前手術(shù)切除配合放療是治療脊索瘤的常規(guī)手段。然而,脊索瘤術(shù)后復(fù)發(fā)率較高,中位生存期6~7年,5年生存率約為65%,10年生存率約為35%[3]。雖然腫瘤的多模式治療發(fā)展迅速,然而脊索瘤的治療仍是困擾臨床醫(yī)生的難題。既往研究表明,脊索瘤的發(fā)生發(fā)展具有復(fù)雜的調(diào)控機制。近年來,有關(guān)脊索瘤分子生物學(xué)研究逐漸深入,包括Brachyury在內(nèi)的多個分子、信號通路及microRNA被相繼發(fā)現(xiàn),脊索瘤相關(guān)靶向治療也取得一定進展。本文主要對脊索瘤發(fā)生發(fā)展過程中關(guān)鍵分子、信號通路及表觀遺傳學(xué)等方面的最新研究進展進行綜述。

關(guān)鍵分子及信號通路的選擇,主要是將腫瘤發(fā)生的經(jīng)典途徑與脊索瘤的自身特點相結(jié)合,選取與脊索瘤發(fā)生高度相關(guān)的分子及信號通路進行闡述。其中,由于脊索瘤起源于胚胎殘余脊索組織,所以本文重點選取了與胚胎發(fā)育異常相關(guān)的基因及通路。此外,本文選取了與細胞周期相關(guān)及腫瘤干細胞相關(guān)的關(guān)鍵分子。最后,對表觀遺傳學(xué)在脊索瘤研究中的最新進展進行了闡述。

1 關(guān)鍵分子

1.1 胚胎相關(guān)分子

Brachyury基因,是T-box基因家族中的一員,位于6q27區(qū)域,編碼轉(zhuǎn)錄因子Brachyury蛋白,在胚胎發(fā)育過程中調(diào)控中胚層向脊索分化。Brachyury是近年來研究較為深入的脊索瘤標(biāo)志物,其在脊索瘤診斷中具有重要價值。

目前,體外研究已證實Brachyury是脊索瘤發(fā)生的關(guān)鍵分子。在脊索瘤細胞系中敲低Brachyury后,細胞增殖受到顯著抑制,細胞向衰老表型發(fā)展。最新研究發(fā)現(xiàn),Brachyury基因及其上下游信號通路參與脊索瘤的惡性形成。在顱底脊索瘤中,激活PI3K/Akt通路可上調(diào)Brachyury的基因表達,且該通路抑制劑可顯著抑制脊索瘤細胞的生長[4]。Shah等[5]發(fā)現(xiàn)Brachyury-YAP通路在調(diào)控脊索瘤的多能性及侵襲性方面具有重要作用。在分子診斷及預(yù)測脊索瘤預(yù)后方面,雖然Brachyury是公認的標(biāo)志物,但是其表達量高低與腫瘤預(yù)后的相關(guān)性仍存在爭議。最新的高通量測序及基因組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),Brachyury基因拷貝數(shù)目及SNP位點與脊索瘤預(yù)后可能存在一定相關(guān)性。Kelley等[6]前期研究表明Brachyury基因拷貝數(shù)增加是家族性脊索瘤重要的易感因素,SNP位點rs1056048及rs3816300可能與脊索瘤發(fā)病相關(guān)。Wang等[7]研究了Brachyury基因3種異構(gòu)體在脊索瘤及脊索組織中的表達情況,脊索瘤組織及細胞系中長異構(gòu)體表達水平最高,而長/短異構(gòu)體比例在脊索瘤和脊索組織中存在明顯差異。異構(gòu)體差異表達是否影響脊索瘤發(fā)生發(fā)展,可能成為今后研究Brachyury基因的一個方向。

目前,脊索瘤中Brachyury基因上下游分子機制相關(guān)研究仍處于初始階段,生物信息學(xué)預(yù)測的信號通路有待于進一步驗證。構(gòu)建以Brachyury為中心的網(wǎng)絡(luò),尋找治療脊索瘤的有效靶點,開發(fā)應(yīng)用小分子抑制劑進行治療,可能成為脊索瘤治療的新途徑。

1.2 細胞周期相關(guān)分子

1.2.1 P53及相關(guān)蛋白 P53是維持細胞正常功能的重要調(diào)控者,當(dāng)出現(xiàn)DNA損傷時,P53基因通過調(diào)控細胞周期阻滯及凋亡發(fā)揮抑癌作用。作為研究最為廣泛的抑癌基因,超過50%的腫瘤中可見P53變異。然而,脊索瘤中有關(guān)P53基因遺傳變異的研究較少,而關(guān)于P53蛋白表達水平的報道也不盡相同。早期研究表明,脊索瘤中P53表達水平與預(yù)后之間無顯著相關(guān)性,P53基因在脊索瘤中無變異表現(xiàn)。也有研究報道,P53蛋白在脊索瘤中高表達且與患者預(yù)后不良相關(guān)。Yakkioui等[8]對25例脊索瘤標(biāo)本中細胞周期相關(guān)標(biāo)志物進行免疫組織化學(xué)染色,P53陽性占28%,且P53表達水平與脊索瘤細胞增殖能力及患者預(yù)后不良相關(guān)。

P53蛋白在脊索瘤中的表達水平及其與預(yù)后的相關(guān)性,需要進一步加大樣本量進行檢測及數(shù)據(jù)分析。p53基因作為公認的抑癌基因,在脊索瘤中未有變異發(fā)生,且表達水平增高與臨床預(yù)后不良相關(guān),提示可能存在抑制P53蛋白功能的機制,從而抑制P53對脊索瘤發(fā)生發(fā)展的調(diào)控。

鼠雙微基因2(mouse double murine 2,MDM2)是一種原癌蛋白,可與P53蛋白結(jié)合,抑制P53介導(dǎo)的反式轉(zhuǎn)錄激活,并通過泛素化修飾導(dǎo)致P53降解,抑制其功能。MDM2基因擴增可在7%的腫瘤中檢測到,而在未檢測出該基因擴增的腫瘤中MDM2蛋白表達明顯增多[9]。有研究報道,15%的脊索瘤中存在MDM2基因擴增。在脊索瘤中,P53的表達水平降低與MDM2過表達顯著相關(guān),也提示MDM2通過抑制P53蛋白功能,促進脊索瘤的生長[10]。

P53凋亡刺激蛋白(ASPP)是通過與P53蛋白家族相互作用,調(diào)控P53家族細胞凋亡誘導(dǎo)功能的一類蛋白。P53凋亡刺激蛋白抑制因子(inhibitor of apoptosis stimulating protein of p53, iASPP)是ASPP家族的一員,在多種腫瘤中呈過表達狀態(tài)。Ma等[11]研究表明,在脊索瘤中,iASPP高表達,且表達水平與預(yù)后不良顯著相關(guān),iASPP可促進脊索瘤的增殖、侵襲,敲低iASPP表達可以增加脊索瘤對順鉑的敏感度。

在脊索瘤中,是否存在其他抑制P53功能的蛋白、MDM2影響脊索瘤生物學(xué)功能的機制及iASPP對脊索瘤的其他作用,有待于進一步深入研究。

1.2.2 CDKN2A P16蛋白是由CDKN2A基因編碼,調(diào)控細胞周期的重要蛋白。P16主要通過阻止CDK4/cyclinD1復(fù)合體形成、抑制RB蛋白磷酸化,將細胞周期阻滯于G1期。P16是一種公認的抑癌蛋白,在多種腫瘤中低表達。早期研究報道稱,CDKN2A基因在70%脊索瘤中出現(xiàn)同源或雜合缺失,該基因失活可能在脊索瘤發(fā)生中發(fā)揮重要作用。Liu等[12]研究發(fā)現(xiàn),與軟骨相比,脊索瘤中P16表達明顯降低,且表達水平與腫瘤的侵襲呈負相關(guān)。Choy等[13]發(fā)現(xiàn)脊索瘤中CDKN2A基因位點變異導(dǎo)致拷貝數(shù)減少,進一步提示CDKN2A與脊索瘤發(fā)生顯著相關(guān)。

1.3 腫瘤干細胞相關(guān)分子

腫瘤干細胞(cancer stem cell, CSC)是具有自我更新和多向分化功能的腫瘤細胞,在腫瘤生長、侵襲、復(fù)發(fā)等方面具有重要作用。干細胞的標(biāo)志物主要包括c-myc、SSEA-1、Oct4、Klf4、Sox2、Nanog等。早期研究發(fā)現(xiàn)干細胞標(biāo)志物在脊索瘤組織及細胞系中均表達,檢測腫瘤干細胞是預(yù)測脊索瘤復(fù)發(fā)及轉(zhuǎn)移的重要途徑。Sox9基因在胚胎發(fā)育、器官發(fā)生、軟骨分化及干細胞屬性等方面具有重要作用。Chen等[14]研究發(fā)現(xiàn)Sox9基因在脊索瘤中高表達,且表達水平與脊索瘤預(yù)后不良相關(guān)。Sox9敲低后,不僅抑制了脊索瘤的生長和侵襲,促進凋亡、導(dǎo)致細胞周期阻滯,還可引起干細胞標(biāo)志物Nanog、c-myc的表達降低,提示Sox9可作為脊索瘤診斷及治療的靶點。尋找影響脊索瘤中腫瘤干細胞表型的分子,通過抑制腫瘤干細胞活性治療脊索瘤,可能成為今后研究的方向。

1.4 其他分子

SMARCB1基因又名INI1/SNF5,編碼INI1蛋白,被認為是抑癌基因。該基因在非典型畸胎瘤及橫紋肌肉瘤中缺失。Li等[15]研究表明,SNF5低表達與顱底脊索瘤預(yù)后不良相關(guān)。Antonelli等[16]最新報道,8例兒童脊索瘤病例中,4例出現(xiàn)SMARCB1/INI1表達缺失,并發(fā)現(xiàn)3個新致病突變位點,提示該基因與兒童脊索瘤相關(guān)。Owosho等[17]發(fā)現(xiàn)在去分化脊索瘤中,存在大量SMARCB1/INI1表達缺失。Cha等[18]報道了2例去分化兒童脊索瘤病例SMARCB1/INI1陰性表達,其中1例存在SMARCB1/INI1基因缺失。去分化脊索瘤罕見,主要侵犯兒童,預(yù)后較差,SMARCB1/INI1基因與去分化脊索瘤高度相關(guān),需進一步研究該基因缺失影響去分化脊索瘤發(fā)生的具體機制,尋找治療去分化脊索瘤的有效方法。

2 信號通路

2.1 受體酪氨酸激酶相關(guān)通路

受體酪氨酸激酶相關(guān)信號通路是細胞內(nèi)外信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的重要途徑,有助于維持正常細胞功能,同時也介導(dǎo)多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展。受體酪氨酸激酶主要包括表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor, EGFR)家族、血小板生長因子受體(platelet derived growth factor receptor, PDGFR-β)家族、肝細胞生長因子受體(hepatocyte growth factor receptor, HGFR)等。脊索瘤中,EGFR等多個受體酪氨酸激酶表達增高,PI3K/Akt/mTOR等多條信號通路處于激活狀態(tài),與脊索瘤發(fā)生關(guān)系密切。

EGFR是調(diào)控細胞生長分化的重要跨膜受體蛋白,與腫瘤的不良預(yù)后、化療及放療耐受等緊密相關(guān)。EGFR是脊索瘤中激活最為顯著的受體酪氨酸激酶,早期研究發(fā)現(xiàn)EGFR促進脊索瘤發(fā)生發(fā)展,應(yīng)用EGFR抑制劑治療脊索瘤的部分藥物已進入Ⅱ期臨床試驗,但是長期療效有待進一步觀察。Scheipl等[19]在3株脊索瘤細胞系中進行了1 097個化合物療效的篩選,其中EGFR抑制劑sapitinib療效最為顯著。Magnaghi等[20]研究了EGFR抑制劑對腫瘤細胞增殖的抑制作用,發(fā)現(xiàn)阿法替尼是唯一對所有脊索瘤細胞系均具有明顯抑癌作用的EGFR抑制劑,為阿法替尼進入臨床試驗提供了理論依據(jù)。Tosuner等[21]研究發(fā)現(xiàn),編碼HGFR的c-MET基因與脊索瘤復(fù)發(fā)相關(guān),可作為判斷預(yù)后的標(biāo)志物。

PI3K/Akt/mTOR通路是受體酪氨酸激酶相關(guān)的重要通路,該通路的激活與腫瘤發(fā)生相關(guān),抑癌蛋白PTEN是該通路的負向調(diào)控者。Chen等[22]探討了骶骨脊索瘤中PTEN和mTOR的表達水平與預(yù)后的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)兩者表達與腫瘤的局部侵襲相關(guān),可作為脊索瘤治療的潛在靶點。Wu等[23]對顱底脊索瘤骨侵襲的蛋白質(zhì)組學(xué)研究表明,PTEN與骨侵襲的程度相關(guān),PI3K/Akt/mTOR通路也與骨侵襲相關(guān)。

Hu等[24]研究發(fā)現(xiàn)另一條重要的受體酪氨酸激酶通路FGFR/MEK/ERK可以與Brachyury作用,預(yù)測該通路可以作為治療脊索瘤的新靶點??偟膩碚f,雖然與脊索瘤相關(guān)受體酪氨酸激酶較多,但是針對脊索瘤治療的有效靶點仍然欠缺,構(gòu)建RTKs與Brachyury等分子之間的信號網(wǎng)絡(luò),研發(fā)針對多個靶點及通路的復(fù)合藥物,可能成為改善脊索瘤化療耐受的重要方式。

2.2 Sonic Hedgehog(SHH)通路

Hedgehog基因最早是在果蠅中發(fā)現(xiàn)的,因其突變導(dǎo)致果蠅胚胎覆蓋尖齒,形似刺猬而得名。Hedgehog家族主要包括:SHH、Desert Hedgehog和Indian Hedgehog。Hedgehog通路不僅在人胚胎發(fā)生中起重要作用,而且在多種腫瘤中激活,然而在脊索瘤中相關(guān)研究較少。SHH是Hedgehog家族中研究最為廣泛的分子,被認為參與椎體的發(fā)育[3]。SHH是SHH通路的啟動子,SHH與其受體PTCH1結(jié)合后,解除了PTCH1對蛋白的抑制,激活下游效應(yīng)分子Gli1、Gli2、Gli3等[25]。Cates等[26]研究發(fā)現(xiàn),在一組28例脊索瘤標(biāo)本中,96%存在SHH高表達,82%存在PTCH1受體的陽性表達,而PTCH1受體正是SHH的下游分子。在脊索瘤中,尚缺乏SHH通路其他下游分子,如SMO、Gli1、GLli2、Gli3等的研究,SHH是否能夠成為脊索瘤的治療靶點,還有待于進一步探討。

2.3 Wnt通路

大量研究表明,Wnt通路參與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展。β-cantenin是Wnt通路中的關(guān)鍵分子,其在胞核內(nèi)積聚是腫瘤細胞發(fā)生的重要表現(xiàn)。個體發(fā)育過程中,Wnt通路在維持脊索功能中具有重要作用,通過干擾β-cantenin阻斷Wnt通路后,脊索功能發(fā)生障礙。有關(guān)細胞黏附分子在脊索瘤中表達的研究發(fā)現(xiàn),β-cantenin與脊索瘤的組織結(jié)構(gòu)形成及維持相關(guān),可能作為脊索瘤診斷的標(biāo)志物。早期針對細胞黏附分子的1項16例脊索瘤研究發(fā)現(xiàn),37.5%存在β-cantenin膜表達。Chen等[27]的最新研究發(fā)現(xiàn),在脊索瘤中microRNA185-5p可以通過Wnt信號通路發(fā)揮作用。以上研究結(jié)果提示,Wnt通路可能在脊索瘤發(fā)生發(fā)展中扮演重要角色,需深入研究Wnt通路中關(guān)鍵分子的表達水平及調(diào)控作用。

3 表觀遺傳學(xué)

表觀遺傳學(xué)是指在不改變基因序列的基礎(chǔ)上,通過DNA甲基化及非編碼RNA等修飾改變基因表達的過程。近年來,表觀遺傳學(xué)研究是腫瘤學(xué)研究的熱點領(lǐng)域。

3.1 DNA甲基化

DNA甲基化是不改變DNA序列,通過甲基化進行DNA化學(xué)修飾。目前研究表明,特定基因的DNA甲基化及去甲基化與腫瘤發(fā)生具有密切關(guān)系。早期研究發(fā)現(xiàn),20余個甲基化及去甲基化的基因可能與脊索瘤發(fā)生相關(guān)。Marucci等[28]探討了顱底脊索瘤中DNA修復(fù)蛋白O6-甲基鳥嘌呤DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(O-6-methylguanine-DNA methyltransferase, MDMT)的甲基化狀態(tài),發(fā)現(xiàn)在復(fù)發(fā)脊索瘤中MDMT基因啟動子存在甲基化。Alholle等[29]對復(fù)發(fā)及未復(fù)發(fā)的脊索瘤進行全基因組甲基化分析,初步確定了一系列與脊索瘤有關(guān)的甲基化位點。了解脊索瘤中基因甲基化水平,有助于深入理解脊索瘤的發(fā)生機制,挖掘腫瘤相關(guān)的分子標(biāo)志物。

3.2 非編碼RNA

非編碼RNA(noncoding RNA, ncRNA)主要包括微小RNA(microRNA)、環(huán)狀RNA(circular RNA, cirRNA)、長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)等。越來越多的研究表明,非編碼RNA參與腫瘤生物學(xué)功能的調(diào)控。目前,與脊索瘤相關(guān)的非編碼RNA研究集中在microRNA。microRNA是一類非編碼小RNA,通過與目的基因序列特異性結(jié)合參與轉(zhuǎn)錄后基因表達的調(diào)控。miR-1是最早被發(fā)現(xiàn)的、在脊索瘤組織、細胞系中下調(diào)最為顯著的microRNA,其表達增高可抑制脊索瘤細胞生長。隨后,Osaka等[30]研究證實, miR-1通過下調(diào)slug表達抑制脊索瘤的增殖、轉(zhuǎn)移及侵襲。Zhang等[31]發(fā)現(xiàn)miR-608可靶向調(diào)控EGFR、Bcl-xL。miR-34a可靶向調(diào)控MET,抑制脊索瘤的增殖和侵襲,促進脊索瘤的凋亡。microRNA中,與脊索瘤預(yù)后及腫瘤發(fā)生相關(guān)的還有miR-185-5p、miR-219-5p、miR-1237-3p、miR-155等[27,32-34]。總的來說,雖然脊索瘤相關(guān)microRNA研究層出不窮,然而一方面鮮有相同的差異microRNA報道,另一方面針對microRNA調(diào)控脊索瘤關(guān)鍵分子的功能研究尚缺乏,差異microRNA作用有待進一步研究證實。除此之外,lncRNA、cirRNA等非編碼RNA是目前腫瘤領(lǐng)域的熱點話題,而在脊索瘤中尚無相關(guān)研究,今后可以通過高通量測序篩選腫瘤及對照組間差異lncRNA及cirRNA,建立其調(diào)控上下游分子的交互信號網(wǎng)絡(luò),探討其影響脊索瘤生物學(xué)功能的機制。

4 問題與展望

近年來,有關(guān)脊索瘤分子調(diào)控機制的研究取得了一定進展,為脊索瘤的體內(nèi)外研究奠定了基礎(chǔ)。雖然多個潛在的治療靶點及關(guān)鍵通路相繼被發(fā)現(xiàn),但脊索瘤的有效治療仍任重道遠。探討lncRNA及cirRNA等非編碼RNA在脊索瘤中的作用、尋找影響腫瘤干細胞表型的分子,進一步構(gòu)建脊索瘤發(fā)生發(fā)展的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),是改善目前脊索瘤診治困難的重要途徑??傮w上,我們對脊索瘤的病因及發(fā)病機制了解甚微,且治療脊索瘤困難重重,深入研究脊索瘤的發(fā)病機制,研發(fā)新的治療方法,是未來研究的一個重要方向。

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