王麗婷,郭會(huì)明,洪厚勝
(1.南京工業(yè)大學(xué) 化學(xué)與分子工程學(xué)院,南京 211816;2.南京工業(yè)大學(xué) 生物與制藥工程學(xué)院,南京 211816)
醋酸菌是一大類革蘭氏陰性、嚴(yán)格需氧菌,主要棲息于含糖、酸或乙醇的原料中[1]。從1989年醋酸桿菌屬(Acetobacter)被Beijerinck提出到目前為止,一共發(fā)現(xiàn)了19個(gè)醋酸菌屬,其中Acetobacter,Gluconobacter,Gluconacetobacter,Asaia,Komagataeibacter5個(gè)屬中均含有大量不同的菌種[2,3]。醋酸菌綱的微生物是嚴(yán)格需氧的,氧在呼吸代謝中是電子的最終受體,醋酸菌中除Asaia外,都能通過呼吸作用氧化乙醇,最終產(chǎn)生醋酸[4]。對(duì)醋酸菌進(jìn)行分離、培養(yǎng)、保存、鑒定,篩選出高產(chǎn)酸的醋酸菌菌種,對(duì)生產(chǎn)高酸度醋具有重要的指導(dǎo)作用。
高酸度醋是指總酸含量為9%~25%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))的釀造醋,具有殺菌效果好、保鮮時(shí)間長、成本較低等優(yōu)勢[5]。采用液態(tài)深層發(fā)酵法直接轉(zhuǎn)化食用酒精為醋酸是生產(chǎn)高酸度醋的重要方法[6]。我國高酸度醋的生產(chǎn)水平與世界先進(jìn)水平相比仍有較大差距,而生產(chǎn)高酸度醋的關(guān)鍵是要掌握菌種、工藝、設(shè)備等方面的先進(jìn)技術(shù)[7]。本文主要對(duì)高產(chǎn)酸菌種的選育和醋酸菌的耐酸機(jī)制進(jìn)行了綜述,為高酸度醋生產(chǎn)菌種的選育提供了研究思路。
傳統(tǒng)的篩選優(yōu)良菌種的方法是采集發(fā)酵中的醋醅,進(jìn)行梯度稀釋得到不同濃度的發(fā)酵培養(yǎng)液,在含有碳酸鈣的分離培養(yǎng)基上培養(yǎng),可以在平板上產(chǎn)生透明圈的菌株,即為產(chǎn)酸的醋酸菌,然后進(jìn)行初篩,對(duì)那些形態(tài)優(yōu)良、H/C(透明圈直徑與菌落直徑的比值)值較大的單菌落劃線純化培養(yǎng),并斜面保藏,對(duì)初篩的菌種進(jìn)行產(chǎn)醋酸定性試驗(yàn)及產(chǎn)酸量測定,對(duì)高產(chǎn)酸的菌株劃線純化培養(yǎng)后并保藏[8]。
陳洋等從工業(yè)醋醅中分離篩選出5株耐乙醇、耐高溫的醋酸菌菌株,通過發(fā)酵性能測定,發(fā)現(xiàn)其中FY4的耐受性最強(qiáng),進(jìn)行發(fā)酵罐發(fā)酵,發(fā)現(xiàn)在相同條件下FY4發(fā)酵特性始終優(yōu)于工業(yè)菌株AS1.41,在37 ℃、10%乙醇的條件下,工業(yè)菌株AS1.41幾乎停止產(chǎn)酸,而FY4仍有較高的產(chǎn)酸量[9]。
用這種傳統(tǒng)的自然選育方法,使醋醅中的混合菌分離開,篩選出性狀優(yōu)良的高產(chǎn)酸菌株,這種方法簡便易行,但是醋醅中的醋酸菌自然突變率很低,往往篩選得到的菌種的性狀遠(yuǎn)不及食醋釀造工業(yè)上常用的純種AS1.41和滬釀1.01。
誘變育種是使用化學(xué)方法或物理方法對(duì)菌株進(jìn)行誘變,目的是定向篩選出所需優(yōu)良性狀的菌株。
賀小賢等對(duì)保藏的某菌株先進(jìn)行微波誘變篩選出較高產(chǎn)酸的菌株,再用化學(xué)試劑鹽酸羥胺進(jìn)行誘變,最終篩選出的突變株的產(chǎn)酸量提高了43.55%[10]。彭桂蘭等將通過傳統(tǒng)分離培養(yǎng)方法得到的2種醋酸菌的菌懸液,放在波長為253.7 nm、15 W的紫外光下照射一定的時(shí)間,紫外誘變后得到的2種醋酸菌的產(chǎn)酸率都得到了提高[11]。吳曉英利用室溫等離子體誘變技術(shù)選育了1株乙醇耐受性菌株,該菌株的醋酸產(chǎn)量比原始菌株提高了近4倍,同時(shí)發(fā)現(xiàn)該誘變菌株與原始菌株相比,細(xì)胞膜通透性變小,海藻糖合成量變大[12]。
誘變育種選育醋酸菌操作簡單,突變頻率高,有利于篩選新的優(yōu)良菌種,但是有益突變頻率較低,變異的方向和性質(zhì)難以控制。
王靖等發(fā)現(xiàn)巴氏醋桿菌AC2005的核酸修復(fù)酶uvrA的轉(zhuǎn)錄水平會(huì)隨著菌體所處醋酸濃度的增大而增加,于是構(gòu)建了uvrA基因敲除菌株和uvrA重組表達(dá)菌株,將菌株放置于一定的醋酸濃度下培養(yǎng),比較它們的生長情況,uvrA重組表達(dá)菌株的生長量遠(yuǎn)高于原始菌株和uvrA基因敲除菌株,即使在較高酸度下,uvrA重組表達(dá)菌株的存活率也高于uvrA基因敲除菌株,在相同的發(fā)酵培養(yǎng)基中,uvrA重組表達(dá)菌株的產(chǎn)酸量比原始菌株高,而uvrA基因敲除菌株的產(chǎn)酸量比原始菌株低[13],說明uvrA基因表達(dá)量的提高有利于醋酸菌的生長和產(chǎn)酸量的提高。脫氧核糖核酸(DNA)是細(xì)胞中重要的物質(zhì),當(dāng)細(xì)胞處于高酸高溫等不利條件下時(shí),DNA會(huì)損傷,核酸修復(fù)酶可以使DNA恢復(fù)結(jié)構(gòu)的完整性,所以u(píng)vrA的過表達(dá)可能有利于醋酸菌在高酸度環(huán)境下進(jìn)行正常的生理代謝活動(dòng)。
宋山等通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增乙醇脫氫酶基因片段,構(gòu)建了乙醇脫氫酶過表達(dá)的基因工程菌株,該菌株的乙醇耐受性和平均產(chǎn)酸速率都優(yōu)于原始菌株[14]。乙醇脫氫酶是醋酸菌細(xì)胞膜上氧化乙醇生產(chǎn)醋酸的關(guān)鍵酶[15],該酶的過量表達(dá)會(huì)提高乙醇的轉(zhuǎn)化率,防止胞外的乙醇流入胞內(nèi)使醋酸菌死亡。
徐澤明將編碼磷酸組氨醇氨基轉(zhuǎn)移酶的hisl基因成功導(dǎo)入巴氏醋桿菌中,構(gòu)建了耐乙醇的基因工程菌株T1,該菌株在9%乙醇濃度的條件下發(fā)酵產(chǎn)酸,產(chǎn)酸量幾乎達(dá)到原始菌株的3倍[16],將hisl基因過表達(dá)的菌株與親本菌株進(jìn)行發(fā)酵性能比較,發(fā)現(xiàn)乙醇脫氫酶和乙醛脫氫酶的酶活均會(huì)影響到產(chǎn)酸量,酶活越高,產(chǎn)酸量越大,且在乙醇脅迫下醋酸菌的糖酵解途徑和三羧酸循環(huán)途徑會(huì)受到抑制,與碳代謝、氨基酸代謝、脂肪酸代謝相關(guān)的小分子代謝物含量會(huì)發(fā)生變化。
Acetobacter和Komagataeibacter都是工業(yè)上常用的直接氧化乙醇產(chǎn)醋酸的醋酸菌屬,但是Komagataeibacter的最高產(chǎn)酸量比Acetobacter要高。Goto等通過比較細(xì)胞膜磷脂的化學(xué)組分發(fā)現(xiàn),Komagataeibacter的磷脂酰膽堿含量明顯高于Acetobacter[17]。在Komagataeibacter的菌種發(fā)酵產(chǎn)酸過程中,Higashide等發(fā)現(xiàn)隨著醋酸濃度的增加,細(xì)胞膜脂質(zhì)中磷脂酰膽堿的比例增加,磷脂酰甘油的比例減少[18]。Hanada等發(fā)現(xiàn)磷脂酰乙醇胺氮甲基轉(zhuǎn)移酶(phosphatidylethanolamine N-methytransferase,PMT)基因可以使磷脂酰乙醇胺轉(zhuǎn)化為磷脂酰膽堿,與正常表達(dá)pmt基因的菌株相比,pmt基因中斷突變株無法在細(xì)胞膜中產(chǎn)生磷脂酰膽堿,突變株的菌體生長速率變小,最大菌體密度下降[19]。因此,細(xì)胞膜中的磷脂酰膽堿含量被認(rèn)為與醋酸菌的耐酸性有關(guān)。
亓正良通過酸激復(fù)合紫外誘變篩選得到1株高產(chǎn)酸高耐酸的突變菌株A.pasteurianusCICIM B7003-02,該突變株在醋酸發(fā)酵過程中,細(xì)胞莢膜的分泌減少,細(xì)胞膜中不飽和脂肪酸的比例增加,細(xì)胞膜的流動(dòng)性增加[20]。因此,細(xì)胞膜的結(jié)構(gòu)和組成會(huì)影響醋酸菌的耐酸性。
Fukaya通過對(duì)突變株A.pasteurianus進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)aarA和aarC是醋酸耐受性基因,與三羧酸循環(huán)中的酶的編碼有關(guān),aarA編碼檸檬酸合成酶[21];aarC編碼琥珀酰輔酶A轉(zhuǎn)移酶和乙酰輔酶A轉(zhuǎn)移酶,使琥珀酰輔酶A轉(zhuǎn)化為琥珀酸,使胞內(nèi)醋酸轉(zhuǎn)化為乙酰輔酶A,進(jìn)入三羧酸循環(huán)[22]。Nakano發(fā)現(xiàn)順烏頭酸酶過表達(dá)菌株的產(chǎn)酸量與耐酸性都優(yōu)于原始菌株[23],順烏頭酸酶是在三羧酸循環(huán)中轉(zhuǎn)化檸檬酸為異檸檬酸的酶。三羧酸循環(huán)偶聯(lián)有氧呼吸產(chǎn)能途徑——巴氏醋酸桿菌TCA循環(huán)其琥珀酰輔酶A到琥珀酸和蘋果酸到草酰乙酸的代謝通路的酶不存在,要通過其他氨基酸回補(bǔ)途徑運(yùn)行并釋放能量。胞內(nèi)醋酸可以通過三羧酸循環(huán)途徑被消耗,構(gòu)建胞內(nèi)完整且高效的三羧酸循環(huán)通路,會(huì)提高醋酸菌的耐酸性能。
AatA是細(xì)胞膜上的ATP結(jié)合盒(ABC)轉(zhuǎn)運(yùn)體蛋白,可以將細(xì)胞內(nèi)的醋酸泵出[24]。Nakano等發(fā)現(xiàn)AatA基因中斷菌株在較高醋酸濃度的環(huán)境中,菌體生長速率下降,對(duì)醋酸的耐受性降低。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),攜帶AatA的大腸桿菌轉(zhuǎn)基因菌株對(duì)醋酸的耐受性得到了提高[25]。因此,AatA基因與醋酸菌的耐受性有關(guān)。
Matsushita發(fā)現(xiàn)醋酸菌A.pasteurianus胞內(nèi)的醋酸濃度在呼吸底物存在的情況下較低,添加呼吸作用解偶聯(lián)劑后,胞內(nèi)醋酸濃度增加,外側(cè)的膜囊泡通過呼吸作用產(chǎn)生的能量將被動(dòng)運(yùn)輸進(jìn)入胞內(nèi)的醋酸泵出細(xì)胞外,內(nèi)側(cè)的膜囊泡通過呼吸作用積累醋酸,最終發(fā)現(xiàn)醋酸菌A.pasteurianus細(xì)胞膜上存在依靠質(zhì)子動(dòng)能勢的醋酸外排泵[26]。
Okamoto-Kainuma發(fā)現(xiàn)當(dāng)醋酸菌處在含有乙醇、醋酸、高溫的環(huán)境中時(shí),細(xì)胞內(nèi)會(huì)產(chǎn)生多種分子伴侶蛋白[27]。其中,GroES和GroEL含有熱休克啟動(dòng)子同源序列,這2種蛋白質(zhì)的表達(dá)受到RpoH基因的控制,實(shí)驗(yàn)表明,RpoH基因中斷突變菌株對(duì)乙醇、醋酸、溫度變化的耐受性比原始菌株差,而過量表達(dá)GroES的菌株的產(chǎn)酸量比原始菌株高[28]。
醋酸菌在細(xì)胞膜內(nèi)側(cè)的酶的催化作用下,將乙醇氧化為乙醛再氧化為醋酸。乙醇脫氫酶(ADH)將乙醇氧化為乙醛,乙醛脫氫酶(ALDH)將乙醛氧化為醋酸,電子從乙醇和乙醛轉(zhuǎn)移到輔酶Q,生成泛素醇[29,30],最終泛素醇氧化酶將電子從泛素醇轉(zhuǎn)移到氧中生成水[31]。當(dāng)不能反應(yīng)完全時(shí),會(huì)產(chǎn)生活性氧(ROS),如超氧陰離子和過氧化氫,Okamoto-Kainuma發(fā)現(xiàn),在含有乙醇和醋酸的培養(yǎng)基中培養(yǎng)醋酸菌,過氧化氫酶調(diào)節(jié)因子突變株不能調(diào)節(jié)胞內(nèi)過氧化氫濃度,其生長速率比原始菌株慢[32]。這些現(xiàn)象表明醋酸菌細(xì)胞內(nèi)活性氧的快速降解有利于實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定高效的醋酸發(fā)酵。
高產(chǎn)酸醋酸菌的選育方法包括自然育種、誘變育種和基因工程技術(shù)。選育出高產(chǎn)酸的菌種,提高菌體的比生長速率,可以使單位時(shí)間內(nèi)的產(chǎn)酸量提高,對(duì)高酸度液態(tài)醋的工業(yè)生產(chǎn)具有重要的指導(dǎo)意義。其中,通過基因工程技術(shù)改良菌種的方法更具有針對(duì)性,應(yīng)該作為高產(chǎn)酸菌種選育的研究重點(diǎn)。
醋酸菌的耐酸機(jī)制十分復(fù)雜,目前對(duì)醋酸菌耐酸機(jī)制的認(rèn)識(shí)并不透徹。已發(fā)現(xiàn)的醋酸菌耐酸機(jī)制,包括細(xì)胞膜的保護(hù)機(jī)制、醋酸同化機(jī)制、醋酸泵出機(jī)制、細(xì)胞對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)機(jī)制4個(gè)方面。尋找這些機(jī)制的聯(lián)系和紐帶,研究這些機(jī)制之間的協(xié)作關(guān)系,探索新的耐酸機(jī)制,對(duì)全面地闡明醋酸菌的耐酸機(jī)制具有重要的意義,有利于指導(dǎo)高產(chǎn)酸菌種的選育,為高酸度醋生產(chǎn)的菌種選育方面提供了幫助。