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CT圖像特征的高精度區(qū)域分割

2019-01-23 09:24:44李定麗蔣霜霜周丹
生物醫(yī)學(xué)工程研究 2018年4期
關(guān)鍵詞:區(qū)域分割高精度灰度

李定麗,蔣霜霜,周丹

(四川省綿陽市中心醫(yī)院放射科,四川 綿陽 621000)

1 引 言

計算機(jī)層析醫(yī)學(xué)成像(computed tomograph,CT)是最先進(jìn)的一種醫(yī)學(xué)疾病檢測技術(shù),該技術(shù)通過圖像的形式,直觀地展示出被檢測對象體內(nèi)的結(jié)構(gòu)和形狀,該技術(shù)常用于醫(yī)學(xué)疾病的診斷和工業(yè)精密零件的無損檢測[1],因此,采用CT圖像處理技術(shù)對被測對象進(jìn)行量化的自動分析,逐漸成為研究熱點。高精度信息對CT圖像的分割至關(guān)重要,因此,相關(guān)學(xué)者提出了一些好的方法[2]。文獻(xiàn)[3]基于圖割和邊緣分析的肝臟 CT 序列圖像分割方法,具有較強(qiáng)的抗噪性能,但是分割精度并不是很高。文獻(xiàn)[4]利用光線透射法并結(jié)合ITK和VTK函數(shù)庫對CT掃描圖像序列進(jìn)行三維重建,得到胸腔三維模型,之后利用區(qū)域生長法進(jìn)行冠狀動脈三維分割,實現(xiàn)冠脈模型的重建任務(wù)。但是該方法卻存在運用單一約束條件的情況,導(dǎo)致分割精度較低。

針對上述問題,本研究提出一種新的CT圖像特征的高精度區(qū)域分割方法。

2 CT圖像特征高精度區(qū)域分割方法設(shè)計

2.1 血管的初步分割

2.1.1CT圖像的灰度腐蝕運算 灰度腐蝕運算是將具有包含類似性質(zhì)的像素點聚集在一起構(gòu)成一片區(qū)域[5]。在原始CT圖像的待分割區(qū)域中,隨機(jī)選取一個種子點作為生長起點,并在與該種子點相鄰的區(qū)域中篩選與種子點相似度符合生長準(zhǔn)則的像素,將這些符合要求的像素與種子所在區(qū)域合并,此時將合并后的新像素作為新種子點,并重復(fù)進(jìn)行上述像素搜索與合并操作,直至無可合并像素。

灰度腐蝕運算通過在感興趣(region of interest,ROI)區(qū)域中選擇初始種子點S(i,j),利用公式(1)對該初始種子在3×3領(lǐng)域的灰度值進(jìn)行計算,并將該結(jié)果作為該種子區(qū)域的初始值[6-7],即可降低錯選種子和噪聲對分割過程的干擾。

(1)

式(1)中g(shù)(x,y)代表待歸并的初始像素點(x,y)的灰度值,p和q分別為常數(shù)。

采用公式(2)計算該種子點5×5鄰域的方差值,將該結(jié)果作為生長準(zhǔn)則的歸并閾值。

(2)

式(2)中,(x,y)為種子區(qū)域中心的坐標(biāo)。生長準(zhǔn)則表達(dá)式見公式(3):

|g(x,y)-AveGray|<δ

(3)

式(3)中AveGray表示當(dāng)前區(qū)域的平均灰度均值,其初始值用mean(x,y)表示。至此完成對CT圖像的灰度腐蝕運算。

2.1.2CT醫(yī)學(xué)圖像的濾波處理 在對CT圖像進(jìn)行了灰度腐蝕運算之后,再對分割圖像進(jìn)行濾波處理,具體過程如下:

(1)對待分割的所有圖像進(jìn)行濾波處理[8],濾波處理過程是一種非線性的圖像平滑處理法,該處理過程受脈沖干擾的效果好且能有效保護(hù)CT圖像的邊緣。利用濾波處理對滑動窗口內(nèi)的所有像素值按灰度進(jìn)行排列,將窗口中心像素原始的灰度值用中值替換。

(2)從多張CT圖像中任選一張圖像,從特征區(qū)域選取種子點,采用動態(tài)自適應(yīng)生長方法對該種子實施區(qū)域增長操作,獲取該CT圖像特征的分割結(jié)果,并將結(jié)果保存,記作集合A。

(3)將集合A映射到相鄰的CT圖像中,得到一組新的投影點記作B,將集合B作為相鄰CT圖像的初始分割區(qū)域,計算投影同式(3)一致。其中,g(x,y)則表示投影點B的灰度值,AveGray則為前一張CT圖像的區(qū)域平均灰度值。

(4)對投影點B所在區(qū)域內(nèi)的像素點實施區(qū)域增長處理,得到最后的CT圖像分割結(jié)果。

(5)對CT圖像中所有切片區(qū)域判斷是否全部分割,若全部進(jìn)行分割則退出方法,反之則返回步驟(3)。

2.1.3種子點的自動選取 經(jīng)過灰度腐蝕運算與濾波處理后的CT圖像屬于灰度圖像,其顏色的呈現(xiàn)是通過灰度直方圖實現(xiàn)的,但在單幅CT圖像灰度統(tǒng)計結(jié)果中,血管灰度特征有可能無法正確體現(xiàn),因此,需要對CT圖像實施灰度統(tǒng)計,依照灰度直方圖進(jìn)行種子點的自動選取,實現(xiàn)對血管的初步分割。

CT圖像的灰度級計算依照灰度直方圖的統(tǒng)計定義。設(shè)置一個自然數(shù)集合D和灰度級集合F={0,1,...,255}(F?D),定義CT圖像函數(shù)表達(dá)式為:f:M×N→F,將點(x,y)的灰度用f(x,y)表示,用ni表示灰度值i的像素數(shù)量,將Pi=ni/MN表示為灰度值i的出現(xiàn)概率[9]。圖像f(x,y)的灰度直方圖用{Pi;i∈G}表示,從中可直觀了解圖像相應(yīng)的動態(tài)區(qū)間情況和圖像的灰度集中范圍。圖1為單幅CT圖像的灰度統(tǒng)計直方圖和整個圖像CT的灰度直方圖。

由圖1可以看出,整個CT 圖像的灰度直方圖曲線較為光滑,峰值及其隸屬的灰度區(qū)間也相較單幅CT圖像穩(wěn)定。血管的灰度特性需要結(jié)合灰度統(tǒng)計結(jié)果的峰值,因此,選取的初始種子應(yīng)具有較高的灰度值,并且其相鄰種子點的灰度值也應(yīng)較高。經(jīng)分析可知灰度值的峰值h=160,將血管的灰度區(qū)間設(shè)置為[h-25,h+25],采用公式(4)來選擇種子點:

圖1 CT圖像的灰度直方圖統(tǒng)計Fig 1 Histogram statistics of CT images (h-25)I(i,j,k)(h-25)

(4)

式(4)中I(i,j,k)為待判斷種子點的灰度值。

對CT圖像中某一像素點以及25鄰域內(nèi)判斷所有像素的灰度值是否在血管的灰度值區(qū)間,若該像素點符合要求[10],標(biāo)記對應(yīng)像素點;反之,選取與該CT圖像相鄰圖像的種子點,重復(fù)進(jìn)行直至無符合要求灰度區(qū)間的像素。依照該過程選取的種子點,能獲取所有涵蓋血管輪廓的二值圖像,完成對血管的初步分割。

2.2 血管區(qū)域高精度分割

在上述血管初步分割的基礎(chǔ)上,先采用自適應(yīng)區(qū)域生長規(guī)劃對血管進(jìn)行區(qū)域分割,更新均值,對種子點進(jìn)行持續(xù)分割,分割流程見圖2。

圖2 血管高精度分割流程圖Fig 2 Flow chart of high precision blood vessel segmentation

(5)

式(5)中,Xi為候選點的灰度值。

其生長規(guī)劃為:

(6)

(7)

3 實驗分析

3.1 肝臟CT圖像高精度分割分析結(jié)果

為驗證本研究方法有效性,進(jìn)行仿真實驗。實驗以南方某醫(yī)科大學(xué)醫(yī)療庫中的靜脈期肝臟CT序列圖像為檢測對象,采用本研究方法進(jìn)行肝臟CT圖像特征高精度區(qū)域分割,圖3為CT序列圖像中的第207層CT圖像采用本方法前后的濾波處理結(jié)果。

由圖3可以看出本研究方法對CT圖像中的噪聲進(jìn)行了有效過濾,經(jīng)過濾波處理后的圖3(c)CT圖像中的空洞,相較于圖3(a)和圖3(b)207層肝臟CT圖像,空洞現(xiàn)象有所減少。

之后,將本方法與專家手工分割進(jìn)行對比實驗。在靜脈期CT序列圖像中隨機(jī)選取5張圖像,由5位影像處理專家分別對該5幅圖像特征進(jìn)行肝臟高精度輪廓分割,將該分割結(jié)果與本研究方法的分割結(jié)果進(jìn)行比較,結(jié)果見表1。

(a)

(b)

(c)圖3 肝臟CT序列圖像特征區(qū)域分割結(jié)果 (a).207層肝臟序列圖像;(b).濾波前分割結(jié)果; (c).本研究方法濾波處理后分割結(jié)果Fig 3 Segmentation results of liver CT sequence image feature region

分析表1數(shù)據(jù)結(jié)果可知,采用本研究方法的CT圖像特征分割結(jié)果與實際手工分割結(jié)果在面積相對誤差不同時,CT圖像也有所不同,從表中數(shù)據(jù)可知圖像編碼為68、96、166、226和267,CT圖像的面積平均相對誤差百分比為1.098%,周長平均誤差為3.114%,質(zhì)心偏移像素平均值為3.6。其中,面積特征是最能反應(yīng)區(qū)域分割效果的好壞,從面積平均相對誤差百分比1.098可以看出,本研究方法的分割結(jié)果是比較滿意的。除此之外,在Dice相似度系數(shù)方面,本研究的Dice系數(shù)都超過了90%,而手工分割方法的Dice系數(shù)均低于80%,能看出本研究方法在分割結(jié)果方面具有較高的準(zhǔn)確度。

表1 手工分割與本研究方法分割結(jié)果

3.2 肝臟血管CT圖像高精度分割分析結(jié)果

為驗證本研究方法在分割肝臟血管的有效性,與目前使用范圍最廣的文獻(xiàn)[4]方法進(jìn)行對比實驗。實驗以第197幅、222幅的圖像為例,分別采用本研究方法和文獻(xiàn)[4]方法進(jìn)行分割,對比兩種方法的靈敏度、特異度以及Dice相似度系數(shù),結(jié)果見表2。

表2 文獻(xiàn)[4]與本研究方法分割對比結(jié)果

根據(jù)表2的對比結(jié)果可知,本研究方法無論是在靈敏度、特異度還是Dice系數(shù)方面都超過了90%,與文獻(xiàn)[4]方法具有較大的差距,分割精度較高。

4 結(jié)論

針對傳統(tǒng)CT圖像分割存在的精度較低的問題,本研究提出一種約束持續(xù)的CT圖像特征高精度區(qū)域分割方法。首先,對CT圖像進(jìn)行灰度腐蝕運算與濾波處理,并且根據(jù)處理結(jié)果確定種子點選取原則,以便能夠獲取所有涵蓋血管輪廓的二值圖像;其次,通過更新均值、對種子點的持續(xù)分割來確定無滿足灰度區(qū)間像素點,最終實現(xiàn)對CT圖像特征的高精度區(qū)域分割。對比實驗結(jié)果表明,所提方法能夠減少CT圖像的空洞現(xiàn)象,相較于手工方法與傳統(tǒng)方法,本研究所提方法的分割精度較高。

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