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云南地區(qū)月季灰霉病病原菌的分離鑒定

2019-02-06 10:03:58張雙艷孟靜韓洋琳吳紅芝
關(guān)鍵詞:孢屬切花菌核

張雙艷,孟靜,韓洋琳,吳紅芝

(云南農(nóng)業(yè)大學(xué)園林園藝學(xué)院,昆明650201)

月季(Rosa hybridaL.)屬于薔薇科(Rosaceae)薔薇屬(Rosa)植物,以其品種多、花色艷、形態(tài)美、花期長(zhǎng)等特點(diǎn)深受人們喜愛,有“花中皇后”的美稱。月季切花居世界五大切花之首,其盆花和綠籬的應(yīng)用也十分流行,同時(shí)也是多種高級(jí)食品、化妝品的重要香料原料,具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。切花作為月季的主要產(chǎn)品形式,其采后品質(zhì)直接決定了月季的觀賞和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。近年來,隨著月季種植面積的擴(kuò)大和溫室大棚月季的大量增長(zhǎng),月季病害日益嚴(yán)重,成為影響月季采后品質(zhì)的重要因素。其中灰霉病是月季生產(chǎn)中常見且危害較嚴(yán)重的一種真菌性病害,花、葉、莖均可發(fā)病,由于其在低溫高濕條件下生存與繁殖力很強(qiáng)[1],已成為月季采后最嚴(yán)重的病害,被稱為月季切花采后的“癌癥”。

灰霉病是由葡萄孢屬真菌(Botrytisspp.)引起的死體營養(yǎng)型真菌病害,其病原菌是一種兼性寄生病菌,屬于半知菌亞門、絲孢綱、絲孢目、暗叢梗孢科、葡萄孢屬[1]?;颐共∈锹兜?、保護(hù)地作物中常見的一種真菌性病害。當(dāng)溫度和濕度適宜時(shí),寄主植物表面的分生孢子萌發(fā)長(zhǎng)出芽管并分化發(fā)育成菌絲,通過氣孔和傷口或分泌一些細(xì)胞壁降解酶穿過寄主表皮,進(jìn)入寄主組織,引起組織軟化、腐爛,后期在寄主表面產(chǎn)生大量的無性分生孢子進(jìn)行再次侵染[2-3],也可以通過產(chǎn)生一系列不同的毒素來降低植物抵抗感染的能力,以達(dá)到侵染的目的[4]。在惡劣的條件下,大量的菌絲體相互扭結(jié),形成表皮比較堅(jiān)硬的菌核,可抵御不利的生存環(huán)境,一旦條件適宜,便能直接產(chǎn)出分生孢子,恢復(fù)感染周期,在灰霉病的病害循環(huán)中起重要作用[5]。

云南是中國70%以上月季切花的生產(chǎn)基地,也是全球重要的月季切花生產(chǎn)地,該地區(qū)栽培月季的時(shí)間長(zhǎng)、規(guī)模大、種類豐富,為月季灰霉病的發(fā)生和不同病菌的生存提供了良好的條件。從昆明花拍中心和云南地區(qū)月季種植農(nóng)戶處調(diào)查得知,灰霉病對(duì)月季切花采后造成嚴(yán)重危害,直接影響了月季切花的采后品質(zhì)和價(jià)格,月季灰霉病成為花拍中心和月季種植戶亟待解決的問題。但關(guān)于云南地區(qū)月季灰霉病的研究尚未見報(bào)道;因此,本研究從云南18個(gè)月季切花產(chǎn)區(qū)采集月季灰霉病樣本,采用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)觀察和現(xiàn)代分子技術(shù)相結(jié)合的方法對(duì)病原分離物進(jìn)行鑒定,以確定引起云南地區(qū)月季灰霉病的病原菌種類和特征,研究結(jié)果可為月季灰霉病的防治提供重要支撐。

1 材料與方法

1.1 病樣的采集和病原菌的分離與純化

從云南18 個(gè)月季切花生產(chǎn)基地采集帶有典型灰霉病病斑的月季花瓣、葉或嫩莖,裝在自封袋里,標(biāo)上切花品種、采集日期和采集地,帶回實(shí)驗(yàn)室,保存在4 ℃冰箱中,待分離。用澆注平板法對(duì)采集的病樣進(jìn)行分離、純化[6-7]。切取病樣發(fā)病部位放入5 mL 離心管中,加入2 mL 無菌水,充分振蕩,然后按1×10-1、1×10-2、1×10-3、1×10-4、1×10-5、1×10-6濃度梯度稀釋,取1×10-4、1×10-5、1×10-6菌液各200 μL注入滅菌培養(yǎng)皿中,然后倒入15~20 mL 冷卻至45~50 ℃的馬鈴薯葡萄糖瓊脂(potato dextrose agar,PDA)培養(yǎng)基,水平搖晃均勻,每個(gè)濃度設(shè)置3個(gè)重復(fù)。將接種好的培養(yǎng)皿倒置于20 ℃恒溫培養(yǎng)箱中黑暗培養(yǎng),將獲得的分離物多次純化后得到目標(biāo)菌株。在超凈工作臺(tái)上用直徑6 mm的滅菌打孔器在培養(yǎng)3 d 的菌落邊緣打取菌餅,放入裝有1.8 mL 20%甘油的凍干管中,每管保存3個(gè)菌餅,于4 ℃冰箱中保存24 h 后,再放入-20 ℃冰箱中凍藏,待凝固后轉(zhuǎn)移至-80 ℃冰箱中保存[8]。

1.2 病原菌的形態(tài)學(xué)鑒定

將保存的菌株在PDA 培養(yǎng)基上活化培養(yǎng)3 d后,用直徑6 mm 的滅菌打孔器在菌落邊緣打取菌餅,轉(zhuǎn)接到新的PDA 中,每皿1 個(gè)菌餅,每個(gè)菌株3個(gè)重復(fù),分別測(cè)量24 h和48 h菌落的直徑,計(jì)算菌絲生長(zhǎng)速度,觀察菌落的形狀、顏色及菌核和分生孢子的產(chǎn)生等,15 d 后計(jì)算菌核產(chǎn)量和測(cè)量菌核直徑。菌絲生長(zhǎng)速度=(48 h菌落直徑-24 h菌落直徑)/2。

菌株的顯微特征觀察采用蓋玻片插片培養(yǎng)法[9]。將病原菌制成孢子懸浮液,用澆注平板法將菌液接種在培養(yǎng)皿中,然后將滅過菌的蓋玻片按約45 ℃角斜插在凝固的培養(yǎng)基上,20 ℃黑暗培養(yǎng)7~10 d 后,用鑷子將蓋玻片取下,放置在載玻片上,置于顯微鏡下觀察。

1.3 病原菌的分子鑒定

根據(jù)菌落形態(tài)的多樣性,結(jié)合樣本來源,從每個(gè)月季切花產(chǎn)區(qū)選擇4~6個(gè)代表菌株共88個(gè)菌株進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定。將保存的代表菌株在PDA上20 ℃活化培養(yǎng)6~8 d后刮取菌絲,用液氮充分研磨,然后用Hipure 真菌DNA 迷你試劑盒(美基生物科技有限公司)提取DNA。對(duì)代表菌株的內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)ITS、依賴RNA 的DNA 聚合酶Ⅱ亞基基因RPB2進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增和測(cè)序,引物合成和擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序均由昆明碩擎生物科技有限公司完成。引物序列信息見表1。

PCR 反應(yīng)體系(25 μL)[12]:2×RapidTaq預(yù)混液12.5 μL,正、反向引物各1.0 μL,DNA 模板1.0 μL,ddH2O 補(bǔ)充至25 μL。PCR 反應(yīng)程序[12]:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性1 min,55 ℃(ITS)或56 ℃(RPB2)退火1 min,72 ℃延伸1.5 min,共35個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸8 min。

測(cè)序結(jié)果在NCBI 網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上進(jìn)行BLAST 比對(duì),用Geneious 8.0 軟件對(duì)自測(cè)序列和從GenBank 上下載的相關(guān)序列進(jìn)行比對(duì)和修飾,用SequenceMatrix-Windows-1.8 軟件對(duì)2 段基因序列進(jìn)行拼接處理。以核盤菌屬(Sclerotinia sclertiorum)和 叢 梗 孢 屬(Monilinia fructicola)作為外群,通過MEGA 7.0 軟件,利用鄰接法進(jìn)行聯(lián)合系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建,自展支持率分析采用1 000次重復(fù)。

表1 引物序列信息Table1 Information of primer sequences

2 結(jié)果與分析

2.1 云南地區(qū)月季灰霉病的癥狀

月季灰霉病在月季生長(zhǎng)的各個(gè)時(shí)期均可發(fā)生,云南地區(qū)每年3—4 月天氣轉(zhuǎn)暖和8—10 月雨季時(shí)是月季灰霉病的高發(fā)期,莖、葉、花均可發(fā)病,其中花瓣發(fā)病最為嚴(yán)重。嫩莖和花蕾受侵染時(shí),病斑呈黑褐色,阻止嫩莖生長(zhǎng)和花蕾開放,最后整個(gè)受侵部位變褐枯死。當(dāng)侵害葉片時(shí),在葉緣或葉尖處往往出現(xiàn)暗綠色水漬狀斑塊(如開水燙傷),并不斷向葉內(nèi)擴(kuò)展直至腐爛?;ò瓯磺秩境跗?,部分花瓣出現(xiàn)玫紅色、褐色或白色斑點(diǎn)(隨月季品種而不同),然后斑點(diǎn)進(jìn)一步擴(kuò)大,漸漸變成水漬狀或變褐皺縮、腐敗(圖1)。在溫暖潮濕的環(huán)境下,灰色霉層即分生孢子可以完全長(zhǎng)滿受侵染部位。

2.2 病原菌的形態(tài)特征

本實(shí)驗(yàn)從云南昆陽、晉寧、安寧、石林、彌勒等地的18 個(gè)月季切花產(chǎn)區(qū)月季上采集了206 個(gè)灰霉病樣,根據(jù)菌落形態(tài)特征、分生孢子梗及分生孢子形態(tài),分離到124個(gè)灰霉病病原菌。

如圖2 所示,病原菌在PDA 培養(yǎng)基上20 ℃恒溫、黑暗培養(yǎng)15 d后,菌落特征表現(xiàn)出明顯的差異,根據(jù)菌落形態(tài)特征,將供試菌株分成3種類型:菌絲型、孢子型和菌核型。菌絲型有48 個(gè)菌株,生長(zhǎng)初期菌絲從無色到白色,放射狀生長(zhǎng),3~5 d后可覆蓋全皿,有少量氣生菌絲,培養(yǎng)至15 d 沒有分生孢子或很少有分生孢子產(chǎn)生,沒有菌核產(chǎn)生。孢子型有35 個(gè)菌株,生長(zhǎng)初期菌絲從無色到灰白色,放射狀或放射狀同心圓生長(zhǎng),3~4 d 后可長(zhǎng)滿培養(yǎng)皿,7~10 d時(shí)產(chǎn)生大量氣生菌絲,同時(shí)產(chǎn)生大量分生孢子,以同心圓分布或覆蓋全皿;分生孢子梗蓬松,單生或叢生,具橫隔,多數(shù)在梗中上部任意分支,或頂端任意分支,分支末端膨大,其上著生大量分生孢子,分生孢子形態(tài)可分為近圓形、卵圓形和長(zhǎng)瓜子型,無色至淡褐色(圖3);培養(yǎng)至15 d 時(shí)沒有菌核產(chǎn)生或產(chǎn)生少量菌核并常被菌絲和孢子覆蓋。菌核型有41 個(gè)菌株,生長(zhǎng)初期菌絲從無色到灰白色,放射狀或放射狀同心圓生長(zhǎng),3~6 d可覆蓋全皿,有少量氣生菌絲產(chǎn)生;培養(yǎng)至10 d 左右開始產(chǎn)生大量菌核,菌核以同心輪紋狀排列、沿培養(yǎng)皿邊緣分布或散亂分布在培養(yǎng)皿中,其中以同心輪紋狀排列的菌核通常較大;菌核以黑色居多,41 株菌核型菌株中只分離到1 株黃色菌核菌株,菌核大小(1.6~12.3)mm×(1.6~9.9)mm,每皿(32±5)個(gè)菌核;沒有分生孢子或很少有分生孢子產(chǎn)生。

圖1 月季灰霉病癥狀Fig.1 Symptoms of rose gray mold

圖2 云南地區(qū)不同月季灰霉菌培養(yǎng)3、15 d的菌落特征Fig.2 Colony characteristics of different pathogenic fungi of rose gray mold cultured for 3 and 15 days in Yunnan area

2.3 病原菌的分子鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析

對(duì)88個(gè)代表菌株的ITS、RPB2基因進(jìn)行擴(kuò)增和測(cè)序,分別得到長(zhǎng)度約為500 bp和1 100 bp的片段,部分?jǐn)U增結(jié)果如圖4 所示。在GenBank 中利用BLAST 進(jìn)行同源性比對(duì),結(jié)果表明:87 株菌株的2個(gè)基因片段與B.cinerea基因相似性均在99%以上,1 株菌株(SLJY-BLZ-2)的2 個(gè)基因片段與B.fabae相似性均在99% 以上。將測(cè)得的序列與從GenBank 上獲取的其他葡萄孢屬真菌進(jìn)行ITS和RPB2基因序列分析,并以核盤菌屬(Sclerotinia sclertiorum)和叢梗孢屬(Monilinia fructicola)真菌作為外群構(gòu)建聯(lián)合基因系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示:上述87株菌株與B.cinerea聚為一支,SLJY-BLZ-2與B.fabae聚為一支(圖5),自展支持率分別是76%和85%。因此,結(jié)合病原菌的形態(tài)特征,可以確定采集到的88 個(gè)侵染云南地區(qū)切花月季的病原菌為B.cinerea和B.fabae。?

圖3 云南地區(qū)月季灰霉病病原菌的顯微特征Fig.3 Microscopic characteristics of rose gray mold pathogens in Yunnan area

圖4 ITS、RPB2引物對(duì)云南地區(qū)月季灰霉病病原菌的PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.4 PCR amplification results of rose gray mold pathogens in Yunnan area by ITS and RPB2 primers

3 討論與結(jié)論

灰霉病是由葡萄孢屬真菌(Botrytisspp.)引起的一類重要病害,Botrytisspp.是一類在世界范圍分布的病原真菌,寄主范圍廣,其中B.cinerea可以侵染586 屬1 400 種植物,其他種的寄主范圍較窄[13];B. fabae主要侵染蠶豆,也能侵染幾種其他的豆科植物[14],暫未見到從月季上分離到B.fabae的報(bào)道。本研究從月季切花上分離得到1株B.fabae菌株,這是從月季上分離到B.fabae的首次報(bào)道。

葡萄孢屬真菌屬內(nèi)包含的種比較多,現(xiàn)在國際上廣泛認(rèn)可的是Henneber(t1973)分類系統(tǒng),該系統(tǒng)將葡萄孢屬真菌歸納為23 個(gè)種。病原菌的傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)鑒定主要依據(jù)形態(tài)特征和其對(duì)寄主的專性化,但是形態(tài)特征容易因環(huán)境的改變而變化,有些葡萄孢菌寄主范圍比較廣泛,并且屬內(nèi)種與種之間的特征比較相似[15],單靠傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)的方法很難準(zhǔn)確鑒定引起月季灰霉病的病原菌。本研究通過傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)手段鑒定出的B.fabae病菌在菌絲形態(tài)、孢子形態(tài)及菌落特征上與B.cinerea沒有顯著差異,充分證實(shí)了分子輔助鑒定的必要性。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,分子生物學(xué)鑒定方法結(jié)合傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法能更加準(zhǔn)確地鑒定病原菌。ITS區(qū)域已被廣泛地應(yīng)用于真菌種類的鑒別,但因其序列較短且在種內(nèi)不同菌株間高度保守,提供的信息量較少,所以并不能很好地區(qū)分菌株之間的親緣關(guān)系[12,15-16]。STAATS等通過對(duì)葡萄孢屬真菌的功能基因RPB2、HSP60和G3PDH進(jìn)行序列分析發(fā)現(xiàn),這些基因存在足夠的變異,能夠鑒定形態(tài)學(xué)上無法區(qū)分的葡萄孢屬的23個(gè)種,證實(shí)葡萄孢屬中的23個(gè)種在基因水平上是獨(dú)立的[11]。筆者在初期分析數(shù)據(jù)時(shí)曾單獨(dú)采用ITS序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示,供試菌株與葡萄孢屬的3 個(gè)種B.cinerea、B.fabae和B.pelargonii聚為一支,其他幾個(gè)種也不能被明顯區(qū)分開。因此,本研究采用ITS和RPB2基因聯(lián)合分析的方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示:87 個(gè)菌株與B.cinerea聚到單一的進(jìn)化分支中,支持率達(dá)到76%;1 個(gè)菌株與B.fabae聚到一個(gè)分支上,支持率為85%;葡萄孢屬的其他種也都位于不同的分支上,能夠顯著區(qū)分葡萄孢屬的不同種。由此表明,采用保守的ITS序列聯(lián)合特定的功能基因序列分析能更準(zhǔn)確有效地鑒定月季灰霉病病原菌。

圖5 云南地區(qū)月季灰霉病病原分離物的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.5 Phylogenetic tree of gray mold pathogens isolated from roses in Yunnan area

本研究分離到的124株菌株中,經(jīng)培養(yǎng)觀察,只有1株產(chǎn)生黃色菌核,并且持續(xù)培養(yǎng)1個(gè)月后,菌核已萌發(fā)產(chǎn)生分生孢子但仍未變色,這與李娜[8]報(bào)道的黃色系菌株相符,這也是從月季上發(fā)現(xiàn)黃色灰葡萄孢菌菌核的首次報(bào)道?;移咸焰呔谏耸怯珊谏丶坌纬傻?,ZHOU 等[17]對(duì)番茄和草莓上分離到的黃色菌核研究表明,B.cinerea菌核的黑色素形成與環(huán)境適應(yīng)性密切相關(guān)。本研究從侵染月季的灰霉病病原菌中分離獲得的B.cinerea黃色菌核菌株,為進(jìn)一步研究B.cinerea的菌核顏色與環(huán)境適應(yīng)性的關(guān)聯(lián),以及B.cinerea對(duì)環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制提供了材料。

本研究用于構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的88 個(gè)菌株中有87 株是B.cinerea,只有1 株是B.fabae,可見引起云南月季切花灰霉病的病原菌主要是B.cinerea。然而,B. cinerea在PDA 培養(yǎng)基上的形態(tài)特征表現(xiàn)出豐富的多樣性,這與國內(nèi)外學(xué)者的研究一致[1,18-20],可以分為菌絲型、孢子型和菌核型3 種類型[1],所占比例分別是39%、28%和33%,沒有明顯的優(yōu)勢(shì)類型。張靜[1]、李娜[8]、吳小瑤[20]、黃燕等[21]分別在研究湖北灰葡萄孢菌、湖北保護(hù)地番茄和草莓在葡萄孢菌、廣州園藝作物灰葡萄孢菌株、灰葡萄孢蠶豆分離物的多樣性時(shí)發(fā)現(xiàn),供試菌株可分為菌絲型、孢子型和菌核型,其中菌核型占絕大多數(shù)。本研究結(jié)果與他們的研究結(jié)果不同,造成這種差異的原因可能與菌株的寄主有關(guān)。上述幾位研究者獲得的灰霉菌菌株分別是從蠶豆、番茄、草莓等不同科屬的植物上分離得到的,而本研究的供試菌株都是從切花月季上分離得到的,具體原因有待進(jìn)一步研究。

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