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影像組學(xué)的臨床應(yīng)用與進(jìn)展

2019-02-11 20:24尹芳艷李小雪
實用醫(yī)院臨床雜志 2019年1期
關(guān)鍵詞:組學(xué)紋理預(yù)測

黃 冠,蒲 紅△,尹芳艷,李小雪,朱 浩

(1.電子科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院,四川 成都 610072;2.四川省醫(yī)學(xué)科學(xué)院·四川省人民醫(yī)院放射科,四川 成都 610072;3.四川省都江堰市醫(yī)療中心放射科,四川 成都 610072)

隨著醫(yī)療信息現(xiàn)代化建設(shè)的快速發(fā)展,醫(yī)療數(shù)據(jù)呈指數(shù)增長,各種圖像分析、模式識別工具也快速增加,因此促進(jìn)了影像組學(xué)提出與發(fā)展。影像組學(xué)這一概念,最開始由Lambin[1]提出,是指通過先進(jìn)的計算機(jī)技術(shù),把醫(yī)學(xué)圖像轉(zhuǎn)化為可量化的數(shù)據(jù),并隨后結(jié)合臨床和病理分析這些數(shù)據(jù),最后將所得結(jié)果用于指導(dǎo)臨床。影像組學(xué)提取圖像的一階、二階、高階統(tǒng)計特征和紋理特征,分析紋理特征背后所代表的臨床的意義,與傳統(tǒng)的基于疾病形態(tài)結(jié)構(gòu)變化的影像研究形成鮮明對比。本文主要基于影像組學(xué)的工作流程及臨床應(yīng)用綜述其研究進(jìn)展。

1 影像組學(xué)工作流程

影像組學(xué)的工作流程主要包括以下4個步驟[2]:①圖像的獲?。河跋窠M學(xué)的圖像大多來源于電子計算機(jī)斷層掃描(computed tomography,CT)、磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)、正電子發(fā)射型計算機(jī)斷層顯像(positron emission computed tomography,PET-CT)和超聲,其中CT圖像因其格式標(biāo)準(zhǔn),容易獲取,因此在研究中最常采用。②圖像分割:圖像分割主要有三種方式,即手動、自動、半自動,其中手動分割是金標(biāo)準(zhǔn)。③特征提取:提取的影像學(xué)特征主要包括三類,形態(tài)學(xué)特征、統(tǒng)計學(xué)特征和紋理特征,通過特定的軟件如MATLAB、MAZDA、A.K等,也可通過研究人員自己編程提取圖像特征。④模型建立:通過篩選特征后,結(jié)合臨床數(shù)據(jù)建立診斷、鑒別診斷、療效評價、生存分析等模型,以用于指導(dǎo)臨床決策。

2 影像組學(xué)的臨床應(yīng)用

在過去十年中,關(guān)于“影像組學(xué)”的研究明顯增加,尤其是最近兩年,每年的文章呈倍數(shù)增長。影像組學(xué)多用于實體腫瘤的研究,在描述腫瘤的生物學(xué)特征、腫瘤的診斷、療效的監(jiān)測及預(yù)后取得了一些初步成果。雖然將這些成果應(yīng)用于臨床還有很長一段路要走,但在人工智能迅速發(fā)展的今天其應(yīng)用前景具有很大潛力。

2.1影像組學(xué)與腫瘤基因表型及分子標(biāo)記物腫瘤的發(fā)生常與相關(guān)的遺傳物質(zhì)發(fā)生改變有關(guān),這些改變通常會對編碼的蛋白質(zhì)或一些大小分子表達(dá)產(chǎn)物產(chǎn)生不同影響,影像組學(xué)通常認(rèn)為,這些微觀的改變必將引起影像圖像的紋理特征發(fā)生變化。腎細(xì)胞癌是成人腎臟疾病中常見的一種腫瘤疾病,15%的腎細(xì)胞癌發(fā)生被認(rèn)為是和BRCA1相關(guān)蛋白1基因(BAP1)改變有關(guān),并且與腫瘤分級和預(yù)后不良相關(guān)[3]。Ghosh等[3]通過對78例已證實BAP1基因突變陽性的腎細(xì)胞癌患者進(jìn)行研究,評估圖像紋理特征與基因突變的相關(guān)性,結(jié)果表明,影像組學(xué)的方法對預(yù)測BAP1基因的突變發(fā)現(xiàn)具有很高的敏感性和特異性。Yip等[4]研究非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)與表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突變的關(guān)系,評估了66個放射學(xué)特征,結(jié)果表明,大部分特征(n = 56,85%)能預(yù)測EGFR突變(AUC≥0.61)。在乳腺腫瘤方面,Antunovic等[5]對43例首次診斷為乳腺癌的患者進(jìn)行回顧性研究,采用單因子分子,層次聚類分析和Fisher檢驗,結(jié)果顯示,影像特征與表達(dá)管腔上皮A型(luminal A)-、管腔上皮B型(luminal B)-/HER2-和luminal B+/HER2+的乳腺癌組織之間有顯著關(guān)系。Li等[6]研究乳腺磁共振成像特征與MammaPrint,Oncotype DX和PAM50多基因檢測之間的關(guān)系,以影像組學(xué)乳腺癌復(fù)發(fā)風(fēng)險中的作用,結(jié)果顯示了良好的預(yù)測能力。Panth等[7]在NMRI-nu小鼠注射HCT116多西四環(huán)素,誘導(dǎo)GADD34細(xì)胞在側(cè)腹生長為異種移植物,分別在40 kVp和80 kVp不同的CT成像條件得到的圖像上進(jìn)行影像組學(xué)分析,表明基因誘導(dǎo)的GADD34過表達(dá)的分子特征能轉(zhuǎn)化為具體的影像組學(xué)特征。

在分子標(biāo)記物方面。腫瘤血管是腫瘤生長,增殖,轉(zhuǎn)移以及預(yù)后的必要條件,Yin等[8]發(fā)現(xiàn),腎透明細(xì)胞癌放射學(xué)特征與腫瘤微血管密度和VEGF之間有顯著相關(guān)性。腫瘤的代謝體積(metabolic tumor volumes,MTVs)通常與N-乙酰天冬氨酸(n-acetyl aspartate,NAA)和膽堿(choline,Cho)的異常水平相關(guān),Lopez等[9]提取17個多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者5類共816個MRI紋理特征,去除冗余特征后,采用相關(guān)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)腫瘤代謝體積與NAA水平密切相關(guān),然而與Cho相關(guān)的成像特征較少。Zhu等[10]發(fā)現(xiàn)乳腺癌的MRI圖像特征與DNA突變,miRNA表達(dá),蛋白表達(dá),基因通路表達(dá)和拷貝數(shù)變異等相關(guān)。

2.2影像組學(xué)與疾病的診斷、鑒別診斷及病理分型

從20世紀(jì)80年代開始,計算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)就被用來幫助影像科醫(yī)生檢測病變及診斷疾病,隨著影像組學(xué)的提出和發(fā)展,高通量數(shù)據(jù)的挖掘分析必將更進(jìn)一步提高影像診斷準(zhǔn)確性。Tsujikawa等[11]通過對83例不同亞型宮頸癌18F-FDG PET/CT圖像特征進(jìn)行分析,提取18個PET特征經(jīng)過分類建模以后,結(jié)果顯示灰度共生矩陣中相關(guān)性能很好區(qū)分鱗狀細(xì)胞癌和非鱗狀細(xì)胞癌。Huang等[12]通過比較影像組學(xué)的方法和人工方法對肺部小結(jié)節(jié)的檢測,表明影像組學(xué)的方法能明顯降低肺癌篩查小結(jié)節(jié)的假陽性率,對早期肺癌檢測受試者工作特征曲線下的面積(the Area Under the Receiver Operating Characteristic Curve,AUC)達(dá)到91%,人工為88%。Parekh等[13]也提取多參數(shù)MRI圖像特征,對乳腺結(jié)節(jié)進(jìn)行良惡性檢測。van den Burg等[14]利用影像組學(xué)方法分析24例梅尼埃病患者和29例特發(fā)性不對稱感音神經(jīng)性聽力損失患者內(nèi)耳迷路高分辨率T2加權(quán)MRI圖像特征,兩組紋理分析差異具有統(tǒng)計學(xué)意義,初步探索了利用影像組學(xué)方法對梅尼埃病診斷的可行性。Khalvati等[15]表示基于放射組學(xué)方法,通過利用多參數(shù)MRI成像數(shù)據(jù)能實現(xiàn)早期前列腺癌的自動檢測。Ma等[16]回顧性分析40例Borrmann IV型胃癌患者和30例原發(fā)性胃淋巴瘤患者門靜脈期CT圖像485個影像組學(xué)特征,結(jié)果顯示放射組學(xué)特征區(qū)分Borrmann IV型胃癌和原發(fā)性胃淋巴瘤具有很高準(zhǔn)確性。自閉癥是一類神經(jīng)功能異常的疾病,然而在常規(guī)頭部影像圖像上很難發(fā)現(xiàn)異常,Chaddad等[17]通過分析不同年齡段自閉癥患者磁共振T1圖像,采用支持向量機(jī)和隨機(jī)森林法對影像特征分類后,結(jié)果顯示來自海馬的特征有作為自閉癥診斷的生物學(xué)標(biāo)志潛力。

在病理分型方面,Yuan等[18]比較傳統(tǒng)體積分析法和影像組學(xué)法對肺腺癌的分型的準(zhǔn)確性,結(jié)果顯示,從浸潤性腺癌中分離出原位腺癌和微浸潤性腺癌,影像組學(xué)方法表現(xiàn)出更好的診斷準(zhǔn)確性,AUC達(dá)到80.5%,而傳統(tǒng)體積分析法只有69.5%。Hwan-ho Cho等[19]從磁共振T1、T2、FLAIR及T1增強(qiáng)圖像上提取腦膠質(zhì)瘤的直方圖、形狀和灰度共生矩陣影像組學(xué)特征量化膠質(zhì)瘤病理分級,結(jié)果顯示AUC達(dá)到88%,準(zhǔn)確率89%,靈敏度88%,特異性90%。Wu等[20]利用單因素分析和多因素分析預(yù)測肺癌組織學(xué)亞型(腺癌和鱗癌),從350例患者CT圖像中提取440個放射組學(xué)特征,結(jié)果表明放射學(xué)特征與肺腫瘤組織學(xué)分型顯著相關(guān),AUC達(dá)到72%,顯示了放射組學(xué)在組織分型上的巨大潛力。Bae等[21]從80例患者肺腺癌中提取術(shù)前CT和PET圖像特征,采用影像組學(xué)方法對腫瘤結(jié)節(jié)進(jìn)行分級,表明來自影像的部分特征可以幫助預(yù)測肺腺癌的病理侵襲性。Zhang等[22]采集61例膀胱癌患者擴(kuò)散加權(quán)成像(Diffusion Weighted Imaging,DWI)和相應(yīng)的從表觀擴(kuò)散系數(shù)(Apparent Diffusion Coefficient,ADC)數(shù)據(jù),每個感興趣區(qū)體積內(nèi)提取102個特征,篩選出47個特征,采用支持向量機(jī)進(jìn)行膀胱腫瘤分級,結(jié)果顯示DWI和ADC圖像的紋理特征,特別是ADC圖的灰度共生矩陣特征,可以反映低級別和高級別膀胱癌的差異。

2.3影像組學(xué)與療效監(jiān)測和臨床決策影像組學(xué)基于其大通量的數(shù)據(jù)特征,能早期發(fā)現(xiàn)治療過程中基于病情變化而改變的紋理特征,在監(jiān)測療效的同時機(jī)動地優(yōu)化治療方案。Zhang等[23]研究磁共振成像的放射學(xué)特征對于預(yù)測晚期鼻咽癌(nasopharynx cancer,NPC)患者進(jìn)展的潛力,從118例晚期鼻咽癌患者中提取970個初始特征,采用LASSO降維以后,選擇11個個特征進(jìn)一步分析,結(jié)果確定了8個特征與晚期鼻咽癌的進(jìn)展顯著相關(guān),對晚期鼻咽癌的預(yù)治療方案選擇有重要意義。Zhou等[24]收集215例肝細(xì)胞癌患者術(shù)前動脈期和門脈期圖像,從300個候選特征中選擇了21個特征來構(gòu)建一個預(yù)測肝細(xì)胞癌早期復(fù)發(fā)的模型,比較臨床分析方法,顯示影像組學(xué)能較準(zhǔn)確預(yù)測肝細(xì)胞癌早期復(fù)發(fā),AUC為83%,而臨床分析方法AUC為78%。Mattonen等[25]比較影像組學(xué)和影像醫(yī)師對早期肺癌患者接受立體定向消融放療(stereotactic ablative radiation therapy,SABR)后局部復(fù)發(fā)的判斷情況,結(jié)果表明,放射組學(xué)對監(jiān)測與局部復(fù)發(fā)有關(guān)的早期變化準(zhǔn)確率明顯高于醫(yī)師組,這將有助于臨床醫(yī)師早期制定對SABR放療后局部復(fù)發(fā)患者治療方案。Coroller等[26]研究基于腫瘤新輔助放化療前后CT紋理特征分析,預(yù)測晚期非小細(xì)胞肺癌治療后反應(yīng),7個特征可預(yù)測治療后病變總殘余(AUC> 0.6,P< 0.05),1個特征可用于預(yù)測臨床完全緩解(AUC = 0.63,p值= 0.01)。肺癌患者在接受立體定向消融放療后很容易出現(xiàn)放射性肺損傷,在隨訪中很難與腫瘤復(fù)發(fā)相區(qū)分,Cunliffe等[27]回顧性分析106例接受食管癌放療患者胸部CT影像數(shù)據(jù)對放射性肺炎識別能力,結(jié)果顯示,CT特征的變化和放射性肺炎發(fā)生有密切關(guān)系。Mattonen[25]和Anthony[28]等也同樣運(yùn)用影像組學(xué)的方法成功預(yù)測腫瘤患者放療后放射性肺炎發(fā)生。Folkert等[29]回顧性研究174例III-IV期口咽癌患者治療前后18-FDG-PET掃描圖像,預(yù)測腫瘤局部消退和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。Vallières等[30]聯(lián)合運(yùn)用FDG-PET和MR圖像,提取六種不同類型的紋理特征評估51例軟組織肉瘤患者肺轉(zhuǎn)移風(fēng)險,單因素分析顯示各向同性體素大小對預(yù)測結(jié)果影響最大,在多因素分析中,融合PET和MR圖像提取的紋理特征在肺轉(zhuǎn)移預(yù)估方面顯著優(yōu)于某一種掃描圖像的紋理特征。Zhou等[31]從348例肺癌患者術(shù)前CT圖像中提取485個放射學(xué)特征,降維后選擇4個放射學(xué)特征和3個臨床特征,使用支持向量機(jī)來評估每個特征的預(yù)測能力,AUC可大于89%,表示治療前CT圖像的放射學(xué)特征可作為遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的預(yù)測因子。頭頸癌放療患者經(jīng)常會出現(xiàn)長期口干和/或腮腺萎縮,如果在治療的早期階段能及時預(yù)測癥狀的發(fā)生,則可以對有風(fēng)險的患者調(diào)整相適應(yīng)性的治療計劃,Pota等[32]使用影像組學(xué)的方法,提取頭頸癌放療患者治療早期和治療中期CT圖像特征,結(jié)果表示基于影像組學(xué)的特征可以作為放療后長期口干和/或腮腺萎縮的預(yù)測因子。

2.4影像組學(xué)與疾病預(yù)后一種疾病除了其病因、病理、臨床表現(xiàn)、治療方案等之外,疾病的近期和遠(yuǎn)期恢復(fù)或進(jìn)展的程度也很重要。同一種疾病,由于患者的年齡、體質(zhì)、合并的疾病、接受治療的早晚等諸多因素不同,即使接受了同樣的治療,預(yù)后也有很大的差異,而影像組學(xué)認(rèn)為影響疾病的各種預(yù)后因素能通過圖像紋理特征表現(xiàn)出來。Shen等[33]比較非小細(xì)胞肺癌CT圖像的二維和三維放射學(xué)數(shù)據(jù)差異,從588例非小細(xì)胞癌患者中選擇1014個影像學(xué)特征(507個2D特征和507個3D特征),分別建立2D和3D特征COX回歸模型,發(fā)現(xiàn)二維和三維CT特征對非小細(xì)胞肺癌預(yù)后均有一定的預(yù)測作用,但二維特征實驗中表現(xiàn)更好。Huang等[34]表示影像組學(xué)不僅能預(yù)測非小細(xì)胞肺癌(I-II期)患者無病生存率,且對于疾病的分期準(zhǔn)確性高于傳統(tǒng)分期系統(tǒng)。Bogowicz等[35]研究基于CT定量圖像特征和放療后頭頸部磷狀細(xì)胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)局部控制情況、人乳頭狀瘤病毒(human papillomavirus,HPV)水平關(guān)系,建立COX回歸模型,發(fā)現(xiàn)HNSCC密度不均一性與放化療后的局部控制和HPV狀態(tài)有關(guān)(CI等于0.75,AUC等于0.85)。Bogowicz等[36]的另一個實驗比較基于CT數(shù)據(jù)和18F-FDG PET數(shù)據(jù)使用影像組學(xué)的方法對HNSCC放化療預(yù)后的預(yù)測能力,從121例HNSCC患者原發(fā)腫瘤區(qū)域提取增強(qiáng)CT和18F-FDG PET圖像影像學(xué)特征,使用主成分分析法去除冗余特征,建立多變量Cox回歸分類模型,表示兩種數(shù)據(jù)都能對預(yù)后做出相對準(zhǔn)確預(yù)測,但CT圖像特征高估了預(yù)后不良組中的腫瘤局部控制情況(預(yù)測值為68%,實際值為56%)。Ouyang等[37]提取MRI特征預(yù)測晚期頭頸癌預(yù)后,認(rèn)為影像組學(xué)特征是一種有效的非侵入性的預(yù)后生物學(xué)標(biāo)志。同樣Ou等[38]也用影像組學(xué)方法預(yù)測了HNSCC患者總體生存率以及無進(jìn)展生存期。Paul等[39]采用隨機(jī)森林遺傳算法提取65名晚期食管癌放化療前PET圖像數(shù)據(jù),預(yù)測治療反應(yīng)及3年存活率。Gnep等[40]研究MRI圖像紋理特征與前列腺癌放療后復(fù)發(fā)之間的關(guān)系,從T2加權(quán)和ADC圖像中提取了140個圖像特征,包括一階統(tǒng)計學(xué)特征、梯度特征、二階紋理特征,建立Cox回歸分析模型和采用隨機(jī)生存森林法來評估MRI特征與治療后復(fù)發(fā)之間的關(guān)系,并評估Gleason評分與MRI特征之間的相關(guān)性,結(jié)果顯示,T2加權(quán)的Haralick特征與前列腺癌放療后的復(fù)發(fā)密切相關(guān)。

3 總結(jié)

影像組學(xué)有很大的臨床應(yīng)用潛力,能夠充分挖掘和分析不同疾病特異性影像特征,給臨床提供量化和監(jiān)測疾病的非侵入性工具,提高疾病的早期診斷準(zhǔn)確性,實現(xiàn)早期干預(yù)、提高患者生存質(zhì)量。其大部分的工作流程都是在電腦上完成的,成本低廉,易于被患者接受,且能實現(xiàn)對患者圖像個體化分析。影像組學(xué)的發(fā)展才短短數(shù)十年,已取得非常可觀的成果,然而其分析技術(shù)主要依賴于計算機(jī)的發(fā)展,每一步工作流程中都存在著或大或小的不足,因此,影像組學(xué)應(yīng)用于臨床還面臨著巨大的挑戰(zhàn)。但這些并不能否認(rèn)影像組學(xué)成為更好的臨床決策工具的潛質(zhì),其快速、低成本、可重復(fù)及非侵入性等優(yōu)點(diǎn)必將對影像學(xué)和臨床的發(fā)展產(chǎn)生巨大革新。

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