尹曉剛
(浙江工業(yè)大學(xué),浙江 杭州 310014)
端粒是染色體的保護(hù)性末端,存在于真核細(xì)胞染色體之中,與端粒結(jié)合蛋白一起構(gòu)成了染色體“帽子”結(jié)構(gòu)[1-2],起著保持染色體完整,控制細(xì)胞有絲分裂的作用[3-4]。端粒的功能異常會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞有絲分裂的異常,從而使增殖活性降低,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,是抗腫瘤靶點(diǎn)研究的重要內(nèi)容。一系列證據(jù)表明腫瘤細(xì)胞中的端粒能夠以自身為模板,通過(guò)活化的端粒酶進(jìn)行自我復(fù)制、延長(zhǎng),是導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞永生化的主要因素[5]。
端粒是由端粒DNA與端粒復(fù)合蛋白相結(jié)合的復(fù)合結(jié)構(gòu),端粒復(fù)合蛋白(shelterin)在端粒長(zhǎng)度調(diào)控和保護(hù)端粒的DNA損傷反應(yīng)中起著至關(guān)重要的作用。端粒復(fù)合蛋白由六種蛋白組成,分別為端粒重復(fù)序列綁定因子TRF1、TRF2,TRF1相互作用蛋白TIN2,端粒保護(hù)蛋白POT1,TIN2與POT1連接蛋白TPP1,以及受體活化蛋白R(shí)AP1[6]。其中對(duì)POT1的大量研究中發(fā)現(xiàn):POT1的表達(dá)與端粒結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定、端粒懸突G-四鏈體的形成息息相關(guān)[7-8]。端粒保護(hù)蛋白POT1是一種高度保守的蛋白,由N端懸突結(jié)合結(jié)構(gòu)域與C端蛋白結(jié)合結(jié)構(gòu)域組成,分別結(jié)合端粒末端G-Overhang(端粒3’端懸突結(jié)構(gòu))與端粒蛋白TPP1,具有維持端粒結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,限制G-Overhang長(zhǎng)度等作用。POT1最為重要的作用是能夠誘導(dǎo)G-Overhang反向折回端粒DNA雙鏈結(jié)構(gòu),將雙鏈其中一段自身鏈置換出來(lái),互補(bǔ)鏈進(jìn)行配對(duì),形成端粒結(jié)構(gòu)中獨(dú)有的D-Loop(Displacement Loop)與 T-Loop(Telomere Loop),將活性的端粒末端DNA隱藏,從而維持端粒結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。POT1蛋白的缺失或低表達(dá)對(duì)于維持端粒結(jié)構(gòu)穩(wěn)定、染色體遺傳穩(wěn)定性乃至細(xì)胞產(chǎn)生重大的影響(Figure 1)。
Figure1 The structure of the ternal of telomere
存在于端粒末端的蛋白POT1是形成末端結(jié)構(gòu)D-LOOP與T-LOOP的關(guān)鍵蛋白,POT1蛋白的缺失將導(dǎo)致D-LOOP與T-LOOP之上的鍵合強(qiáng)度降低,使該結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,重新轉(zhuǎn)變?yōu)樽杂蓡捂溄Y(jié)構(gòu),使得通過(guò)形成D-LOOP與T-LOOP結(jié)構(gòu)被隱藏起來(lái)的端粒3’端懸突結(jié)構(gòu)重新暴露(端?!懊撁薄保瑢?dǎo)致端粒結(jié)構(gòu)發(fā)生破壞。
細(xì)胞的遺傳增殖是一個(gè)相對(duì)保守且穩(wěn)定的過(guò)程,其中端粒的存在作用巨大,是細(xì)胞染色體的保護(hù)者。當(dāng)POT1的缺失導(dǎo)致端粒結(jié)構(gòu)發(fā)生“脫帽”時(shí),由于G-overhang的暴露,使得細(xì)胞中的染色體容易發(fā)生自重復(fù)與四倍體現(xiàn)象,發(fā)生遺傳紊亂。
端粒是細(xì)胞染色體中的重要結(jié)構(gòu)部分,端粒的存在在很大程度上調(diào)控了細(xì)胞的增殖、凋亡、有絲分裂等必要生命活動(dòng),端粒的結(jié)構(gòu)變化將對(duì)細(xì)胞的生命活動(dòng)產(chǎn)生巨大的影響。
在Churikov D等人關(guān)于POT1生物學(xué)功能的研究中[9],他們通過(guò)構(gòu)建雌激素受體(ER)-POT1蛋白的復(fù)合突變株細(xì)胞與野生型細(xì)胞的對(duì)照中發(fā)現(xiàn),在它莫西芬的作用下,兩組細(xì)胞無(wú)表現(xiàn)出明顯的區(qū)別。而有趣的是,當(dāng)不受藥物它莫西芬干預(yù)時(shí),野生型細(xì)胞能夠保持正常生長(zhǎng),而突變株在前24 h細(xì)胞數(shù)量幾乎無(wú)明顯變化,而48 h后出現(xiàn)細(xì)胞減少的趨勢(shì),直到無(wú)干預(yù)后第三天細(xì)胞全部死亡。說(shuō)明當(dāng)雌激素受體不受到藥物抑制時(shí),能夠正常表達(dá),與POT1蛋白結(jié)合,導(dǎo)致POT1功能異常。在進(jìn)一步探究其作用機(jī)制的研究中,他們嘗試在24 h不干預(yù)它莫西芬后,開始加入藥物,發(fā)現(xiàn)并不能逆轉(zhuǎn)之前的作用損傷,且對(duì)ER蛋白與POT1蛋白進(jìn)行熒光染色發(fā)現(xiàn),兩者在突變株細(xì)胞中表達(dá)均明顯下降。說(shuō)明當(dāng)POT1下調(diào)表達(dá)時(shí),導(dǎo)致的端粒結(jié)構(gòu)發(fā)生不穩(wěn)定的過(guò)程是不可逆的。
在Kenkichi M等人對(duì)于端粒的研究中也發(fā)現(xiàn),當(dāng)端粒末端結(jié)構(gòu)G-Overhang以自由單鏈形態(tài)暴露出來(lái)時(shí),細(xì)胞自身將進(jìn)入DNA損傷狀態(tài),大量上調(diào)γ-H2AX蛋白表達(dá),致使細(xì)胞發(fā)生凋亡[10-11]。由于POT1的缺失,使得端粒的結(jié)構(gòu)被破壞而導(dǎo)致的DNA損傷狀態(tài)被稱為端粒的持續(xù)性損傷,且這個(gè)過(guò)程是不可逆的。端粒的持續(xù)性損傷導(dǎo)致細(xì)胞的有絲分裂無(wú)法從G2期過(guò)渡至M期,使得細(xì)胞周期停滯于G2期,在所有對(duì)POT1蛋白的研究中發(fā)現(xiàn),構(gòu)建的POT1缺失的突變株細(xì)胞均出現(xiàn)G2-Arrest狀態(tài)[9]。
POT1蛋白對(duì)端粒結(jié)構(gòu)的完整性與穩(wěn)定性具有至關(guān)重要的作用,并且由于其不可逆的特性,從POT1蛋白表達(dá)水平研究靶向端粒結(jié)構(gòu)的抗腫瘤小分子化合物是行之有效的途徑[12-14]。
端粒抑素(Telomestatin)是一種天然存在于人體中的小分子(Figure 2),Dennis Gomez 等人[15]發(fā)現(xiàn)該化合物是一種有效的G-四鏈體的配體,且能靶向結(jié)合于端粒3’端懸突結(jié)構(gòu),導(dǎo)致其結(jié)構(gòu)的退化。后續(xù)的研究發(fā)現(xiàn),這樣的結(jié)構(gòu)變化導(dǎo)致了POT1蛋白無(wú)法與端粒DNA相結(jié)合,是誘導(dǎo)細(xì)胞有絲分裂異常與凋亡的主要因素。
Figure2 The structure of telomestatin.
端粒抑素作用機(jī)制的發(fā)現(xiàn),推動(dòng)了小分子化合物抗腫瘤的新發(fā)展。研究發(fā)現(xiàn),通過(guò)靶向作用腫瘤細(xì)胞中關(guān)鍵性序列與蛋白,誘導(dǎo)其構(gòu)象變化,能夠引發(fā)機(jī)體強(qiáng)烈應(yīng)激反應(yīng),從而實(shí)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞的增殖抑制與凋亡。該類機(jī)制的發(fā)現(xiàn),使抗腫瘤的研究不再局限于免疫應(yīng)答與基因手段,大大推動(dòng)了抗腫瘤研究的進(jìn)展。
20世紀(jì)末,對(duì)于聚酰胺的研究熱潮以及G-四鏈體形成機(jī)制的研究日漸成熟,使得小分子抗腫瘤化合物突破傳統(tǒng)的放療、化療以及免疫治療的壟斷,開拓了一片嶄新的抗腫瘤研究領(lǐng)域。以下重點(diǎn)介紹以小分子化合物誘導(dǎo)G-四鏈體的形成,表現(xiàn)高活性抗腫瘤活性。
在對(duì)腫瘤發(fā)病的機(jī)制研究中,發(fā)現(xiàn)這是一個(gè)復(fù)雜的病變過(guò)程,無(wú)明確的病變起因。對(duì)于各腫瘤細(xì)胞的普遍研究中,發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞之所以能夠?qū)崿F(xiàn)永生化,主要是由于在胞內(nèi)高活性的端粒酶的作用下,以其自身為模板,使端粒得以延伸,導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞能夠無(wú)限分裂,所以設(shè)計(jì)靶向作用于端粒與端粒酶的小分子化合物,能夠?qū)崿F(xiàn)良好的選擇性。
2.2.1 以端粒末端及POT1蛋白為靶點(diǎn)的G-四鏈體構(gòu)建作用機(jī)制
端粒3’懸突是一段富含鳥嘌呤的序列,在正電荷離子中心的共同作用下,具有共軛大平面結(jié)構(gòu)的小分子化合物能夠嵌插進(jìn)入端粒末端中首尾通過(guò)氫鍵相連的鳥嘌呤構(gòu)成的G-四分體之中,通過(guò)π-π堆積作用,誘導(dǎo)G-四鏈體的形成(Figure 1)?,F(xiàn)今,已有報(bào)導(dǎo)證實(shí)二萘嵌苯、2,7-二取代氨基芴酮、吖啶、乙啡啶衍生物、二取代三嗪,以及最新發(fā)現(xiàn)的雙角鯊衍生物等具有共軛大平面結(jié)構(gòu)的小分子能夠成功誘導(dǎo)端粒DNA形成G-四鏈體。
端粒末端DNA在小分子化合物的作用下,被誘導(dǎo)形成特殊二級(jí)結(jié)構(gòu)-G-四鏈體,使端粒末端T-環(huán)結(jié)構(gòu)與D-環(huán)結(jié)構(gòu)受到破壞,將被隱藏的端粒懸突序列重新暴露,使得端粒末端雙鏈結(jié)構(gòu)破壞致使細(xì)胞出現(xiàn)端粒持續(xù)性損傷。端粒持續(xù)性損傷是導(dǎo)致細(xì)胞有絲分裂周期出現(xiàn)G2-Arrest,誘導(dǎo)細(xì)胞自身凋亡的原因之一,所以以端粒末端為靶點(diǎn)設(shè)計(jì)能夠誘導(dǎo)其形成G-四鏈體的小分子化合物實(shí)現(xiàn)高活性抑制腫瘤增殖是一個(gè)行之有效的潛在方法。
Figure3 The structure of compound benzothioxanthene derivatives S1-S6
2.2.2 共軛大平面化合物誘導(dǎo)G-四鏈體形成機(jī)制
在本課題組先前已經(jīng)報(bào)道的研究中[16],已經(jīng)證實(shí)苯并硫雜蒽類衍生物(Figure 3)能夠在細(xì)胞外誘導(dǎo)端粒G-四鏈體的形成,并能有效抑制腫瘤細(xì)胞增殖,具有良好的抗腫瘤活性。為探究該類化合物誘導(dǎo)端粒DNA形成G-四鏈體的機(jī)制,用Discovery Studio軟件進(jìn)行計(jì)算機(jī)分子模擬,以抗腫瘤活性最好的三號(hào)化合物(S3)為研究對(duì)象,對(duì)PDB庫(kù)中的端粒DNA晶體進(jìn)行結(jié)合模擬。
從結(jié)果發(fā)現(xiàn)(Figure 4),具有共軛結(jié)構(gòu)的苯并硫雜蒽母環(huán)與同為共軛平面的鳥嘌呤與腺嘌呤存在更好的親和力,易嵌插進(jìn)入腺嘌呤與G-四分體之間的空間,以化合物:DNA=4∶1,2∶1 的比例為主。小分子配體通過(guò)與富G之間以π-π堆積作用力為主,氫鍵為輔相結(jié)合,結(jié)合于腺嘌呤與鳥嘌呤之上,誘導(dǎo)端粒DNA向空間結(jié)構(gòu)更緊湊進(jìn)行,最終形成特殊二級(jí)結(jié)構(gòu)-G-四鏈體。另一方面,化合物中柔性更好的側(cè)鏈通過(guò)空間折疊,嵌入溝槽結(jié)構(gòu)中,通過(guò)其上電負(fù)性較強(qiáng)的氮原子與溝槽周邊堿基形成氫鍵,使整個(gè)結(jié)構(gòu)更為牢固、緊湊。
Figure4 The formation of G-quadruplex by computer molecular simulation.
研究表明,在不含正電荷中心K+共同作用時(shí),具有共軛大平面結(jié)構(gòu)的苯并硫雜蒽類衍生物可以輕易地嵌插進(jìn)入端粒DNA堿基與堿基之間(以腺嘌呤與鳥嘌呤、胸腺嘧啶與鳥嘌呤之間的空間為主),G-四鏈體溝槽之間,通過(guò)化合物:核酸=4∶1作用比例,強(qiáng)有力地誘導(dǎo)并穩(wěn)定G-四鏈體的形成(Figure 4A)。對(duì)含有正電荷中心與化合物共同作用,與同一個(gè)DNA晶體進(jìn)行結(jié)合模擬發(fā)現(xiàn),結(jié)果整個(gè)DNA構(gòu)型發(fā)生了有趣的變化,所有相鄰堿基之間的空間縮小,整個(gè)DNA表現(xiàn)出更緊湊的構(gòu)型。此時(shí)在正電荷中心K+作用下,化合物與DNA更多以2∶1比例相結(jié)合,苯并硫雜蒽化合物π電子受到中心K+牽引,嵌入更加完全,使整個(gè)G-四鏈體結(jié)構(gòu)展現(xiàn)更穩(wěn)定構(gòu)象(Figure 4B)。
對(duì)POT1蛋白的研究已較為完善,但卻未能有以其為靶點(diǎn)的高效抗腫瘤藥物的上市。POT1蛋白的存在與端粒末端的穩(wěn)定息息相關(guān),對(duì)兩者的相關(guān)研究中,以端粒酶抑制劑為主的抗腫瘤藥物占大多數(shù)。由于在之前的研究中,對(duì)于以POT1蛋白的治療未能夠跳脫出基因手段,導(dǎo)致了其局限性及進(jìn)入臨床的困難。新技術(shù)的出現(xiàn)固然是抗腫瘤研究中的重要部分,但新思路的形成也同樣重要。研究已久的靶點(diǎn)形成的新作用機(jī)制,希望能夠一定意義上推動(dòng)抗腫瘤研究的發(fā)展。