彭曉蕊,李 歡,何麗潔,張 鵬※
(1.西安醫(yī)學(xué)院,西安 710021; 2.陜西省第二人民醫(yī)院腎內(nèi)科,西安 710005; 3.第四軍醫(yī)大學(xué)西京醫(yī)院腎內(nèi)科,西安 710032)
長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一類長度>200 nt的RNA分子,它不編碼蛋白質(zhì),但可通過染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄水平以及轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達,與人類多種疾病的發(fā)生關(guān)系密切[1]。肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)又稱核富集常染色體轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2,是廣泛表達于人類組織的lncRNA,它主要通過轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平參與基因表達調(diào)控[2]。MALAT1起初因在許多腫瘤中呈高度表達而被廣泛研究,后來越來越多的學(xué)者發(fā)現(xiàn)MALAT1對眾多腫瘤細胞的增殖、侵襲及轉(zhuǎn)移起促進作用[3-5]。但隨著研究的深入,近幾年發(fā)現(xiàn),MALAT1亦具有細胞周期調(diào)控、免疫調(diào)控、炎癥調(diào)控及代謝調(diào)節(jié)等作用[6-8]。免疫炎癥與慢性腎臟病的發(fā)展密不可分,而腎臟纖維化是大部分慢性腎臟病最終的共同通路,因此,研究MALAT1在腎臟纖維化中的作用及機制顯得尤為重要。現(xiàn)就MALAT1與腎臟纖維化上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相關(guān)分子之間的作用予以綜述,以期為腎臟纖維化防治提供新的見解和思路。
1.1MALAT1的結(jié)構(gòu)和功能 MALAT1定位于人染色體11q13,轉(zhuǎn)錄本序列長約8 700 nt,主要位于細胞核核小體核斑區(qū),屬于基因間轉(zhuǎn)錄本,在哺乳動物進化中高度保守,種屬間具有高度同源性,在正常人體組織中的表達具有器官差異性[2]。成熟的MALAT1缺乏polyA尾,其3′端通過RNase P識別和切割tRNA樣結(jié)構(gòu)而產(chǎn)生,并受一個高度保守的三螺旋結(jié)構(gòu),即核表達元件的保護,使MALAT1不受3′-5′外切酶的剪接,從而有望成為疾病的治療靶點[9-10];MALAT1的3′端還加工產(chǎn)生一種廣泛表達于人類組織的RNA聚合酶 Ⅱ 轉(zhuǎn)錄本MALAT1相關(guān)小細胞質(zhì)RNA,它定位于細胞質(zhì)并參與免疫調(diào)節(jié)[7,11]。MALAT1最早于2003年被發(fā)現(xiàn)在非小細胞肺癌中高度表達,并與患者的生存、預(yù)后密切相關(guān)[2]。此后,又有研究發(fā)現(xiàn),MALAT1在膀胱癌、結(jié)腸癌、胃癌、鼻咽癌、骨肉瘤、胰腺癌等腫瘤中也高度表達,并促進腫瘤細胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移[3-5,12-14]。雖然大量研究表明MALAT1具有癌基因的作用,但也有研究發(fā)現(xiàn),MALAT1在結(jié)腸癌、乳腺癌、膠質(zhì)瘤等腫瘤中能抑制腫瘤細胞生長、轉(zhuǎn)移[15-16],如,MALAT1通過負(fù)向調(diào)控前轉(zhuǎn)移性轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄增強子相關(guān)結(jié)構(gòu)域(TEAD)的靶基因整合素β4和血管內(nèi)皮生長因子A,抑制TEAD的轉(zhuǎn)錄,來抑制乳腺癌細胞的運動及侵襲[17]。針對MALAT1這一爭議作用,有學(xué)者提出,MALAT1的作用取決于腫瘤類型和實驗?zāi)P拖到y(tǒng),實驗中MALAT1的失活策略不同則相應(yīng)的表型不同甚至相反,因此MALAT1在腫瘤中的功能和作用機制不同[18],這表明無論是基因缺失、插入失活還是RNAi等處理都應(yīng)該排除不同實驗方法對MALAT1產(chǎn)生的特異性影響。MALAT1不僅對腫瘤的發(fā)生發(fā)展起重要作用,還在一定程度上可以作為腫瘤診斷的標(biāo)志物或預(yù)后指標(biāo),但并非特異性指標(biāo)[19]。此外,MALAT1也可在正常軟骨組織中高度表達,并起到調(diào)控細胞增殖的作用[20],在心血管系統(tǒng)中可促進內(nèi)皮細胞增殖和血管化[21],還可作為重要的細胞代謝調(diào)節(jié)因子,參與脂質(zhì)、蛋白質(zhì)代謝[6]。
除了在腫瘤方面研究廣泛外,MALAT1還與免疫、炎癥密切相關(guān)。Gast等[7,22]在心血管的研究中發(fā)現(xiàn),MALAT1相關(guān)小細胞質(zhì)RNA系統(tǒng)對先天性免疫系統(tǒng)具有重要的調(diào)節(jié)功能,它可以通過抑制巨噬細胞的吞噬作用對免疫和炎癥反應(yīng)起抑制作用,該團隊在MALAT1缺陷型ApoE-/-小鼠中觀察到干擾素1、腫瘤壞死因子和白細胞介素-6的水平顯著增加,并通過實驗發(fā)現(xiàn)MALAT1相關(guān)小細胞質(zhì)RNA消融會強烈影響腫瘤壞死因子和白細胞介素-6等炎癥介質(zhì)的表達。在風(fēng)濕免疫研究中發(fā)現(xiàn),MALAT1能通過抑制磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B通路的激活,促進類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎中成纖維細胞樣滑膜細胞凋亡,從而限制自身免疫反應(yīng)[23]。在小鼠腦卒中模型中發(fā)現(xiàn),MALAT1高表達并通過抑制炎癥反應(yīng)實現(xiàn)對腦缺血損傷的保護作用[24]。雖然MALAT1在這些疾病中具有顯著的炎癥控制作用,但也有學(xué)者提出假設(shè):LncRNA MALAT1可通過在心肌缺血再灌注損傷中靶向微RNA(microRNA,miRNA)-26b加劇炎癥反應(yīng)[25]。因此,目前仍不能將MALAT1籠統(tǒng)概括為炎性抑制因子。但有學(xué)者發(fā)現(xiàn),lncRNA MALAT1是一種新型免疫耐受調(diào)節(jié)因子[26]。大部分腎臟病是免疫介導(dǎo)的炎癥反應(yīng)為始發(fā)因素的疾病,回顧文獻發(fā)現(xiàn),MALAT1在體內(nèi)、外急性腎損傷模型中表達均顯著上調(diào),并可能通過核因子κB通路抑制缺氧誘導(dǎo)的炎癥反應(yīng)[27];而在糖尿病腎臟組織中表達顯著上調(diào)并與調(diào)節(jié)炎性基因(如血清淀粉樣蛋白A3、腫瘤壞死因子和白細胞介素-6)的表達同步;此外,MALAT1在糖尿病足細胞損傷和蛋白尿發(fā)生過程中起著促進作用[21,28],表明MALAT1在腎臟疾病中抑制或促進炎癥反應(yīng)均有可能。
1.2MALAT1的作用機制
1.2.1MALAT1參與選擇性剪接調(diào)控 這是最早發(fā)現(xiàn)的MALAT1經(jīng)典作用機制之一。MALAT1通過與新生的前信使RNA相互作用,定位于活躍的剪接基因的染色質(zhì),并對定位于該染色質(zhì)位點的其他蛋白質(zhì)進行招募和修飾而影響RNA的加工[29]。例如,MALAT1參與調(diào)控內(nèi)源性前信使RNA選擇性剪接,并通過調(diào)節(jié)絲氨酸/精氨酸蛋白磷酸化水平調(diào)節(jié)絲氨酸/精氨酸在核斑點的分布來調(diào)控基因表達[30]。MALAT1的選擇性剪接調(diào)控與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān),例如,MALAT1通過促進選擇性RNA加工及EMT相關(guān)基因的差異性表達,而促進卵巢癌的前轉(zhuǎn)移表型[31]。
1.2.2MALAT1參與細胞周期調(diào)控 MALAT1可以通過調(diào)節(jié)G1/S期和有絲分裂期調(diào)控基因表達,通過調(diào)節(jié)細胞周期調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子或前信使RNA的表達促進細胞增殖,例如,MALAT1通過調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子B-MYB的表達調(diào)節(jié)有絲分裂[8]。此外,MALAT1可通過參與信號通路調(diào)控細胞周期,例如,MALAT1可能通過調(diào)節(jié)參與細胞周期調(diào)控的共濟失調(diào)毛細血管擴張突變-節(jié)點激酶2通路去磷酸化促進食管鱗癌的生長,解除G2/M期阻滯并抑制細胞凋亡[32]。
1.2.3MALAT1參與表觀遺傳調(diào)控 MALAT1可以作為細胞生長基因的表觀遺傳調(diào)節(jié)因子。MALAT1通過抑制p53的激活降低了p53乙?;?,降低p53下游靶基因的轉(zhuǎn)錄,促進細胞增殖并抑制細胞凋亡[33]。MALAT1與非甲基化的多梳2蛋白相互作用,并推動其與細胞周期相關(guān)基因從多梳體到核斑點的易位,去甲基化的多梳2蛋白與MALAT1相互作用,促進類泛素蛋白修飾活化而激活細胞周期基因[34]。此外,MALAT1的3′端三螺旋可以被甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白16結(jié)合,增強MALAT1的致癌活性[35]。
1.2.4MALAT1參與EMT調(diào)控 有研究表明,MALAT1是轉(zhuǎn)化生長因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)誘導(dǎo)EMT的重要介導(dǎo)因子,而TGF-β通過誘導(dǎo)EMT促進腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移,因此,靶向抑制MALAT1可抑制TGF-β誘導(dǎo)的腫瘤遷移和侵襲特性[3]。類似的,MALAT1在參與TGF-β1誘導(dǎo)的人視網(wǎng)膜色素上皮細胞中顯著增加,并對細胞的EMT、增殖、遷移起重要作用[36]。此外,MALAT1還可通過參與相關(guān)信號通路軸參與EMT的調(diào)控,如,Yes相關(guān)蛋白1-MALAT1-miR-126-5p軸可以調(diào)控結(jié)直腸癌中的EMT[12]。
1.2.5MALAT1作為競爭性內(nèi)源RNA發(fā)揮作用 近年來越來越多的研究發(fā)現(xiàn),lncRNA可通過海綿效應(yīng)抑制miRNA的表達,即像海綿特異性吸附miRNA,競爭性抑制miRNA與自身靶基因結(jié)合,例如,MALAT1海綿miR-211并可能上調(diào)植物同源結(jié)構(gòu)域指蛋白19表達,從而促進卵巢癌進展[37];MALAT1通過海綿miR-200a-3p上調(diào)程序性細胞死亡4來調(diào)節(jié)缺氧誘導(dǎo)的心肌細胞的增殖、細胞周期進程和凋亡[38];MALAT1通過海綿miR-106b-5p增強微管運動來促進大腸癌的侵襲及轉(zhuǎn)移[39]。
MALAT1在腎臟領(lǐng)域具有重要作用。慢性腎臟病影響著全世界多達10%~15%的人口[40],而腎臟纖維化是許多慢性腎臟病最終的共同病理表現(xiàn),主要表現(xiàn)為腎小球硬化、腎小管萎縮和腎間質(zhì)纖維化,并以內(nèi)皮細胞損傷、持續(xù)炎癥刺激、肌成纖維細胞的激活與增殖、細胞外基質(zhì)沉積和實質(zhì)細胞丟失為特征[41]。其中,受損的內(nèi)皮細胞可通過釋放具有促纖維化作用的TGF-β等多種細胞因子進行修復(fù),這些細胞因子的過度釋放會促進間質(zhì)細胞(如肌成纖維細胞)過度活化和異常細胞外基質(zhì)轉(zhuǎn)分化(以EMT為代表),使大量膠原纖維沉積在細胞間質(zhì)[42]。由此認(rèn)為,在腎臟纖維化中異常肌成纖維細胞活化是核心,EMT是關(guān)鍵。而血管周圍膠質(zhì)瘤相關(guān)GLI1(gene glioma-associated oncogene homologue 1)細胞是肌成纖維細胞的主要來源[43],有學(xué)者在胃成纖維細胞瘤病例中證實了MALAT1-GLI1融合基因的存在[44]。在腎臟纖維化中是否也具有MALAT1-GLI1融合基因還有待進一步驗證。目前關(guān)于EMT的研究較多,主要為一些促纖維化生長因子參與促進EMT。
2.1MALAT1可能通過TGF-β/Smad介導(dǎo)的表觀遺傳促進腎臟纖維化 TGF-β是肌成纖維細胞分化的主要調(diào)控因子[43],具有免疫抑制、炎癥調(diào)節(jié)、促進或抑制腫瘤以及切口愈合等作用,是導(dǎo)致大多慢性腎臟病纖維化的因素,主要通過激活經(jīng)典和非經(jīng)典的Smad信號通路誘導(dǎo)腎纖維化[45]。TGF-β的亞型TGF-β1起主要作用,但TGF-β的效應(yīng)蛋白Smad具有競爭性促纖維化和抗纖維化作用,Smad可通過與基因啟動子結(jié)合、誘導(dǎo)lncRNA的轉(zhuǎn)錄以及表觀遺傳修飾來誘導(dǎo)α-平滑肌肌動蛋白、Ⅰ型膠原和金屬蛋白酶組織抑制因子等促纖維分子的轉(zhuǎn)錄,誘導(dǎo)成纖維細胞活化基質(zhì)沉積[46]?;仡櫸墨I發(fā)現(xiàn),MALAT1間接與Smad依賴的EMT相關(guān)聯(lián),miR-145是由Smad介導(dǎo)EMT的腫瘤抑制劑,MALAT1可在內(nèi)皮祖細胞中通過抑制miR-145促進TGF-β1所致的EMT[47]。有研究發(fā)現(xiàn),TGF-βR2/Smad 2(3)/MALAT1/MARCH(membrane-associated RING-CH-type finger)7/自噬相關(guān)蛋白7反饋環(huán)介導(dǎo)卵巢癌自噬、遷移和侵襲[48],雖具體機制尚未闡明,但提示MALAT1可能作為TGF-β的下游分子參與腫瘤細胞遷移。MALAT1是否參與TGF-β/Smad的表觀遺傳調(diào)控目前尚無明確記載,但有研究明確提出,MALAT1是TGF-β誘導(dǎo)EMT的重要介質(zhì),若靶向抑制MALAT1可抑制TGF-β誘導(dǎo)的膀胱癌細胞的遷移和侵襲性[3];類似的,MALAT1在人視網(wǎng)膜色素上皮細胞中可被TGF-β上調(diào),且剔除MALAT1會抑制TGF-β誘導(dǎo)的EMT及上皮細胞遷移和增殖過程[36]。以上研究表明,MALAT1可能通過與TGF-β直接或間接作用促進EMT,從而促進腎臟纖維化。
2.2MALAT1可能作為競爭性內(nèi)源RNA參與調(diào)節(jié)Snail1(encoding snail family zinc finger 1)促進腎臟纖維化 Snail1是EMT的強效誘導(dǎo)劑,可促進小鼠腎纖維化[49]。在一項有關(guān)肺纖維化的研究中發(fā)現(xiàn),miR-503通過磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B/哺乳動物雷帕霉素靶蛋白/Snail信號通路參與EMT,MALAT1可作為分子海綿,直接與miR-503結(jié)合并競爭性降低miR-503的表達而促進EMT[50]。類似的,MALAT1作為競爭性內(nèi)源RNA在肝臟纖維化中通過miR-101b調(diào)節(jié)C3肉毒桿菌底物1的表達,影響原代肝星狀細胞的增殖、細胞周期和活化[51]。MALAT1通過海綿狀miR-22促進黑素瘤細胞的增殖、侵襲和遷移,MALAT1可通過作為miR-22的競爭性內(nèi)源RNA來調(diào)節(jié)Snail[52]。在腎臟纖維化中,MALAT1是否也能通過與相應(yīng)的miRNA作用來調(diào)節(jié)Snail,促進EMT或影響肌成纖維細胞的活化和增殖,該假設(shè)雖未被驗證,但通過構(gòu)建小鼠單側(cè)輸尿管梗阻模型發(fā)現(xiàn),MALAT1在缺氧誘導(dǎo)的腎小管上皮細胞中表達上調(diào),并可通過負(fù)向調(diào)控miR-100-3p,進而促進Ⅳ型膠原蛋白α1表達,促進腎小管上皮細胞EMT,從而促進腎病小鼠腎臟纖維化[53]。這充分說明了MALAT1對腎臟纖維化起促進作用,雖然具體分子機制尚未闡明,但根據(jù)MALAT1可作為競爭性內(nèi)源RNA的作用機制推測,MALAT1可能競爭性拮抗miR-100-3p,在轉(zhuǎn)錄后水平抑制miR-100-3p或下游蛋白的功能,從而促進腎臟纖維化。
2.3扭體(Twist)可能與MALAT1啟動子結(jié)合促進腎臟纖維化 Twist是一種含有轉(zhuǎn)錄因子的基本螺旋環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域[54],在腎臟纖維化中起促進作用。Twist在大多數(shù)惡性腫瘤中高度表達,并與腫瘤的轉(zhuǎn)移相關(guān),同時也是靶基因的轉(zhuǎn)錄激活或抑制因子[55]。Twist 1能顯著促進EMT以及癌細胞的遷移和侵襲,也能抑制E鈣黏蛋白的表達,促進EMT[54]。在一項關(guān)于肝癌的研究中發(fā)現(xiàn),包括Twist在內(nèi)的EMT相關(guān)蛋白在MALAT1缺失中表達顯著下調(diào),而E鈣黏蛋白表達升高[56],提示MALAT1與Twist可能有協(xié)同作用。Sun等[12]發(fā)現(xiàn),在結(jié)腸癌中相關(guān)蛋白1與β聯(lián)蛋白(β-catenin)/T細胞因子4形成復(fù)合物后,與MALAT1的啟動子結(jié)合,可以競爭性抑制miR-126-5p,能促進Twist的表達,即相關(guān)蛋白1誘導(dǎo)MALAT1-miR-126-5p軸促進EMT,從而促進結(jié)直腸癌的轉(zhuǎn)移。由此推測,MALAT1在腎臟中可能通過EMT調(diào)節(jié)因子與MALAT1啟動子結(jié)合,促進EMT誘導(dǎo)劑的表達而促進纖維化。
2.4MALAT1可能參與鋅指E-盒結(jié)合同源異形框(zinc finger E-box-binding homeobox,ZEB)的選擇性剪接促進腎臟纖維化 ZEB轉(zhuǎn)錄因子家族包含獨立基因編碼的兩個成員ZEB 1和ZEB 2,可結(jié)合E盒作為轉(zhuǎn)錄激活或抑制因子發(fā)揮作用,抑制一些上皮連接和極性基因,并激活EMT表型的間充質(zhì)基因[57-58],促進腎臟纖維化。Ying等[59]在轉(zhuǎn)移性膀胱癌組織中發(fā)現(xiàn),下調(diào)MALAT1可使EMT相關(guān)的ZEB 1、ZEB 2水平降低,E-鈣黏蛋白水平升高,MALAT1可通過激活體外Wnt信號通路,促進EMT的表達及后續(xù)細胞轉(zhuǎn)移。這表明MALAT1和ZEB均具有促進EMT的作用,但兩者間的聯(lián)系尚不明確。此外,lncRNAs可參與ZEB基因的致病性剪接[60],而MALAT1是否可以通過參與ZEB基因的選擇性剪接也有待進一步驗證。
2.5MALAT1可能通過β-catenin介導(dǎo)的Wnt信號通路參與腎臟纖維化 β-catenin是Wnt信號通路中的關(guān)鍵介質(zhì),β-catenin的異常表達會促進足細胞功能障礙和蛋白尿,并導(dǎo)致腎纖維化;β-catenin通過與MALAT1啟動子區(qū)域結(jié)合而參與MALAT1的轉(zhuǎn)錄,且MALAT1的剔除能通過下調(diào)絲氨酸/精氨酸剪接因子1和部分逆轉(zhuǎn)高糖引起的β-catenin核積累,從而修復(fù)足細胞損傷[27]。Zhao等[61]發(fā)現(xiàn),MALAT1在子宮內(nèi)膜癌細胞中可作為Wnt/β-catenin的直接轉(zhuǎn)錄靶點,通過原鈣黏蛋白10/Wnt/β-catenin/MALAT1調(diào)控軸促進子宮內(nèi)膜癌的發(fā)展。以上研究表明,MALAT1可通過與β-catenin結(jié)合,相互作用共同參與足細胞損傷,并可能通過Wnt信號通路參與腎臟纖維化進程。
MALAT1主要通過選擇性剪接、調(diào)控細胞周期、表觀遺傳、EMT和作為競爭性內(nèi)源RNA等機制作用于多種疾病,發(fā)揮促進細胞增殖、轉(zhuǎn)移及參與免疫炎性介導(dǎo)的細胞損傷等作用。近年來,MALAT1在腎臟領(lǐng)域的研究方興未艾,而腎臟纖維化是慢性腎臟病發(fā)展為終末期腎病的共同病理。MALAT1可通過與EMT主要促纖維化分子的協(xié)同作用,直接或間接推進腎組織EMT,加速腎臟纖維化發(fā)展。MALAT1在腎臟纖維化中的作用機制重要且復(fù)雜,在未來,還需大量體內(nèi)、外實驗在不同層面進一步研究,早日研制出MALAT1拮抗劑等類似物,有望抑制甚至逆轉(zhuǎn)腎臟纖維化。