李詩卉,吳迪,周銥然,劉棟,蘇昌亮,朱文杰,姚義好,黃超,方紀(jì)成,朱文珍
腫瘤突變負(fù)荷(tumor mutational burden,TMB)或超突變增加是癌細(xì)胞中DNA突變的過度積累。超突變的膠質(zhì)瘤大多數(shù)對烷基化治療具有抵抗性。Hassan等對101例原發(fā)性膠質(zhì)瘤患者(77非超突變:<30個突變;24個超突變:≥30個突變或<30個MMR基因或POLE / POLD基因突變)術(shù)前的常規(guī)MR圖像(FLAIR和T1增強(qiáng))提取一階直方圖和灰度共生矩陣特征。LASSO正則化(alpha=1)使用所有4880特征進(jìn)行特征選擇并且40個最突出的特征被用于邏輯回歸建模。ROC分析顯示符合率為94%、敏感度為75%、特異度為100%。表明MRI放射學(xué)表型可預(yù)測原發(fā)性和復(fù)發(fā)性膠質(zhì)瘤中TMB的增加,放射組學(xué)生物標(biāo)志物可用于指導(dǎo)臨床免疫療法試驗患者選擇和治療。
Su等將220名膠質(zhì)瘤患者的傳統(tǒng)解剖、擴(kuò)散和灌注加權(quán)包括10種對比度的圖像配準(zhǔn)到T2FLAIR圖像上,提取出431個影像組學(xué)特征。采用偏相關(guān)分析探究影像組學(xué)特征與病理生物標(biāo)記之間的相關(guān)性,并采用0.632+Bootstrap方法建立多變量預(yù)測模型。在單變量分析中,與腫瘤級別相關(guān)性最好的為T1增強(qiáng)(R=0.557);與Ki-67相關(guān)性最好的是ADC(R=0.395)。在多變量分析中,所有影像組學(xué)特征的組合在預(yù)測膠質(zhì)瘤亞型和預(yù)測增殖中具有最高的曲線下面積(AUC)。區(qū)分低/高級別膠質(zhì)瘤的AUC為0.911,區(qū)分Ⅱ/Ⅲ級為0.896,Ⅱ/Ⅳ級為0.997,Ⅲ/Ⅳ級為0.881。在反映增殖水平時,整合多對比度建立的預(yù)測模型的AUC為0.936。多模態(tài)MRI影像組學(xué)能提供互補(bǔ)的信息,結(jié)合多模態(tài)影像組學(xué)能有效的預(yù)測膠質(zhì)瘤的級別和Ki-67水平,有利于患者的精準(zhǔn)診療。
獲取85例腦膜瘤患者(低級別61例,高級別24例)T1增強(qiáng)、ADC及FA圖的腫瘤全體積參數(shù),將紋理及形態(tài)特征與腫瘤分級和病理分型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。訓(xùn)練支持向量機(jī)(support vector machine,SVM)以獲得腦膜瘤的分級診斷模型,并通過外部驗證集(低級別27例,高級別10例)驗證模型效能。研究發(fā)現(xiàn)多個形態(tài)及紋理參數(shù)與腦膜瘤的分級密切相關(guān),在訓(xùn)練集中分類器的AUC為0.905,在驗證集中為0.878。多個紋理參數(shù)在鑒別纖維型及非纖維型腦膜瘤方面均具有顯著性。T1增強(qiáng)、ADC圖及FA圖的紋理及形態(tài)特征分析在區(qū)分腦膜瘤等級方面具有輔助的診斷價值,有助于臨床治療方案選擇。
獲取198例AD病例和148例健康對照組(HC組)的高清3D T1圖像。其中148例AD和100例HC為訓(xùn)練集,50例AD和50例HC為測試集。采用稀疏主成分分析法(sparse principal component analysis, SPCA),根據(jù)AAL模板提取32個腦ROI的稀疏主成分(SPCs),得到區(qū)間相關(guān)矩陣的32個 ROI的Yi值及16個特征性的與海馬具有高度相關(guān)性的ROI(r>0.3)。作為SVM的特征變量,Yi和17個ROIs(包含上面16個ROIs加海馬)的灰質(zhì)體積的分類符合率分別為0.84和0.82。海馬Yi值與海馬體積具有高度的相關(guān)性(r=0.963)。Yi與MMSE評分的相關(guān)性(r=0.586)遠(yuǎn)大于體積(r=0.393)。通過SPCA聯(lián)合區(qū)間相關(guān)矩陣法對AD病例結(jié)構(gòu)MR圖像數(shù)據(jù)的分析,具有較高的診斷符合率。特征參數(shù)值Yi具有比AD患者海馬體積更高的診斷符合率。
Diao等選用ANDI數(shù)據(jù)庫中88例AD患者的3D T1MPRAGE圖像,并選取142例正常對照。用FreeSurfer軟件對皮層、皮層下及海馬進(jìn)行分割,然后將數(shù)據(jù)導(dǎo)入SVM、隨機(jī)森林(Random forest,RF)及樸素貝葉斯三種不同機(jī)器學(xué)習(xí)算法進(jìn)行訓(xùn)練。每個病例均生成163個腦結(jié)構(gòu)特征,包含70個皮質(zhì)厚度特征,68個腦體積特征,10個腦室體積特征,15個海馬亞區(qū)特征。在AD的分類鑒別中,RF法具有最好的診斷符合率(95.7%)、敏感度(83.3%)、陽性預(yù)測值(PPV,100%)、特異度(100%)及陰性預(yù)測值(NPV,94.4%)。而SVM法及樸素貝葉斯算法具有較差的效能。相對于SVM及樸素貝葉斯算法,RF法具有更高的診斷價值。此外,機(jī)器學(xué)習(xí)在預(yù)測診斷AD中具有重要價值,可對更薄的皮層厚度及更小的海馬亞區(qū)進(jìn)行鑒別診斷。
Lee等使用169名標(biāo)注了骨折及顱內(nèi)出血(intracranial hemorrhage,ICH)區(qū)域的患者數(shù)據(jù)對1785名健康受試者和2661例骨折或(及)ICH患者的CT圖像進(jìn)行弱監(jiān)督訓(xùn)練,并對卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutional neural networks,CNN)模型進(jìn)行微調(diào)?;赩GGNet-16設(shè)計三維CNN架構(gòu),在預(yù)測層之前進(jìn)行全局平均化,以提取類激活映射。該研究建立的模型在檢測出血的符合率為87.7%、敏感度為87.7%、特異度為87.6%、PPV為91.5%、NPV為82.5%;骨折檢測的符合率為80.5%、敏感度為69.5%、特異度為87.8%、PPV為79.0%、NPV為81.3%。這種基于深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)的腦外傷急診患者全自動檢測系統(tǒng)有助于放射科和急診科的醫(yī)生減少診斷時間和人為錯誤。
Farris等利用內(nèi)部編寫的MATLAB腳本手動分割I(lǐng)CH病灶,用60個帶注釋的ICH病例訓(xùn)練深度殘差卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(DRCNN),并用5個ICH病例進(jìn)行驗證。然后用訓(xùn)練后的DRCNN對30例ICH病例(其中許多病例包括不同類型的出血,共56次出血)和46例正常頭部CT病例進(jìn)行測試也獲得了較好的結(jié)果。高閾值的DRCNN正確檢測到70%(39/56)ICH,包括0%(0/1)硬膜外出血(epidural hemorrhage,EDH),60%(6/10)硬膜下出血(subdural hemorrhage,SDH),50%(6/12)蛛網(wǎng)膜下腔出血(subarachnoid hemorrhage,SAH),81%(17/21)腦實質(zhì)出血(intraparenchymal hemorrhage,IPH)和83%(10/12)腦室內(nèi)出血(intraventricular hemorrhage,IVH)。低閾值的DRCNN正確檢測到89%(50/56)ICH,包括100%(1/1)EDH,80%(8/10)SDH,83%(10/12)SAH,90%(19/21)IPH和100%(12/12)IVH。這種自動檢測的方法有可能在臨床上有助于對顱內(nèi)出血進(jìn)行分類。
在69~367 mAs之間的幾個劑量水平對Catphan體模重復(fù)掃描,并在40~400 mAs范圍內(nèi)對定制的頭部模型重復(fù)掃描。使用光子計數(shù)探測器在臺式CT系統(tǒng)上獲得兩個模型的原始CT數(shù)據(jù)。通過對所有重復(fù)掃描中的最高劑量水平的對數(shù)前投影求平均,然后進(jìn)行濾波反投影(filter back projection,FBP)重建獲得每個體模的參考圖像。對于每個劑量水平和重建方法[FBP,傳統(tǒng)基于模型的迭代重建(Model based iterative reconstruction, MBIR),優(yōu)化的MBIR],通過從每個重復(fù)掃描的重建后的平均值中減去參考圖像來計算偏倚圖像。優(yōu)化的MBIR方法消除了Catphan體模中每個對比度和劑量水平的偏差并且在更復(fù)雜的頭部模型中顯示出可減少整個FOV的偏差。該方法通過修改數(shù)據(jù)加權(quán)方案來維持不同劑量水平的不同對比度的CT值的準(zhǔn)確性。
獲取低計數(shù)PET和欠采樣MR可以縮短PET/MR掃描時間,但是,這也可能導(dǎo)致PET圖像噪聲增加和MR圖像產(chǎn)生偽影。Xu等開發(fā)了一個完全卷積編碼器--解碼器網(wǎng)絡(luò),采用跳過連接和殘差學(xué)習(xí)策略來恢復(fù)高分辨率。對該模型用40名患者進(jìn)行訓(xùn)練,并對其他10名患者進(jìn)行了評估。與低計數(shù)PET/欠采樣MR相比,所提出的聯(lián)合模型的峰值信噪比和結(jié)構(gòu)相似性指數(shù)均有所改善,分別為0.97/0.15 dB、0.006/0.0012。深度學(xué)習(xí)方法可以從低質(zhì)量的對應(yīng)圖像重建高質(zhì)量的PET/MR圖像,從而縮短PET/MR的掃描時間。
Zhang等開發(fā)了基于深度學(xué)習(xí)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型--多通道生成對抗網(wǎng)絡(luò),用于處理原始多通道MRI數(shù)據(jù)。多通道生成對抗網(wǎng)絡(luò)具有兩個子網(wǎng)絡(luò):一個學(xué)習(xí)欠采樣和完全采樣數(shù)據(jù)之間關(guān)系的生成網(wǎng)絡(luò);一個可以證明生成的數(shù)據(jù)是否真實的鑒別網(wǎng)絡(luò)。整個模型由與MRI掃描儀上的射頻通道相同數(shù)量的基本網(wǎng)絡(luò)單元組成,用于并行MRI重建。訓(xùn)練過程使用隨機(jī)梯度下降和反向傳播算法,多通道發(fā)生器網(wǎng)絡(luò)經(jīng)過訓(xùn)練后用于圖像重建。經(jīng)訓(xùn)練的模型可在不校準(zhǔn)的情況下從欠采樣數(shù)據(jù)重建高質(zhì)量圖像,從而提供比傳統(tǒng)并行MRI更快的成像速度,縮短臨床MRI檢查程序,提高臨床MRI效能。
基于MR的衰減校正對PET定量準(zhǔn)確性的影響是PET/MR在腦研究中一個重要的部分。對30名受試者進(jìn)行18F-FDG-PET/CT掃描,然后在GE Signa PET/MR上接受掃描。每個患者42 s的零回波時間(zero-echo-time,ZTE)序列來產(chǎn)生兩種衰減圖:一種基于標(biāo)準(zhǔn)ZTE分割的方法;另一種是該方法的優(yōu)化。 CT數(shù)據(jù)作為金標(biāo)準(zhǔn)。重建的PET圖像使用標(biāo)準(zhǔn)化的腦圖譜模版在68個興趣區(qū)進(jìn)行定量測量?;趦?yōu)化模板的ZTE衰減校正的PET偏差與常規(guī)ZTE衰減校正偏差具有顯著差異。表明預(yù)先對ZTE數(shù)據(jù)和解剖模板進(jìn)行配準(zhǔn)在臨床實踐中是可行的,并且可以用于改善基于分割的衰減校正的性能。
Zhang等在325 ps DPC PET/CT(Philips Vereos)上對9例乳腺癌腦轉(zhuǎn)移患者進(jìn)行18次低劑量[(3.1±0.2) mCi]腦FDG-PET掃描(0~75 min),以評估化療前后患者的神經(jīng)代謝變化。采用三維有序子集最大期望值法(3D-OSEM)進(jìn)行5組PET重建(10,5,2,1和0.5 min)。使用MIM Software和Brain Atlas Mapping創(chuàng)建的90個神經(jīng)解剖區(qū)域來進(jìn)行配準(zhǔn)和標(biāo)準(zhǔn)化。計算標(biāo)準(zhǔn)攝取值(SUV)和Z-Score。TOF-PET比非TOF-PET的表現(xiàn)出更好的圖像質(zhì)量和更好的細(xì)節(jié)。當(dāng)掃描時間從10 min減少到1 min時,Z-score在TOF-PET中具有穩(wěn)健性(變化≤10%)。與目前的標(biāo)準(zhǔn)的FDG腦PET成像(10~13 mCi,10 min)相比,這種低劑量(3 mCi)腦PET掃描顯示出比非TOF更好的適應(yīng)性,當(dāng)掃描時間和劑量減少時可以獲得更好的掃描圖像質(zhì)量,通過卓越的TOF能力實現(xiàn)了更精確的大腦PET成像。
為了探究ICH后鐵沉積與血腫周圍水腫的關(guān)系,對模擬自發(fā)性ICH的SD大鼠和正常大鼠在7.0T動物MRI上進(jìn)行T2WI,DTI和T2*-mapping成像。DTI和T2*-mapping的掃描時間點(diǎn)是第1,3和7天。使用在ICH后3~6 h掃描的T2WI圖像來測量初始血腫。在ICH后1,3和7 d,ICH組同側(cè)的T2*值均顯著低于正常對照組,對側(cè)和正常組之間T2*值無顯著差異。在ICH后1 d,T2*異常體積與平均彌散度(mean diffusivity,MD)異常體積呈正相關(guān)(r=0.92)。表明DTI和T2*-mapping不僅可以用于診斷ICH后血腫和血腫周圍區(qū)域水腫和鐵超負(fù)荷沉積,還可以用于探究鐵沉積與血腫周圍水腫的關(guān)系。
另一方面,為了評估ICH后對皮質(zhì)脊髓束的影響,對ICH大鼠在第1,3,7,14,21和28天,于7.0T MRI上行DTI掃描。mNSS用于評估大鼠的神經(jīng)功能。ICH組同側(cè)腦干的FA值顯著低于正常對照(1,3,7,14和21 d);ICH組1 d的同側(cè)腦干的MD值明顯高于對照組,28 d明顯低于對照組;ICH組中7 d和28 d的同側(cè)腦干的軸向彌散度(axial diffusivity,AD)顯著低于對照組;ICH組1 d和3 d同側(cè)腦干的徑向彌散度(radial diffusivity,RD)高于對照組,28 d低于對照組。 ICH組和和對照組在不同時間點(diǎn)的同側(cè)和對側(cè)錐體束的DTI參數(shù)無顯著差異。ICH組mNSS評分顯著高于對照組,且ICH組中1 d的mNSS評分顯著高于其他時間點(diǎn)。表明DTI有可能動態(tài)地監(jiān)測血腫對皮質(zhì)脊髓束的影響。
為了闡明AD與胰島素抵抗之間潛在聯(lián)系,Lowe等將6個月的APP/PS1小鼠(n=6)和野生型(WT)同窩小鼠(n=6)分成兩組,一半喂食高脂肪飲食(HFD),一半喂食常規(guī)飼料4個月。并在開始喂食后1、4個月進(jìn)行胰島素耐量試驗。通過股靜脈推注125I-胰島素,并用SPECT/CT對每只小鼠成像。盡管HFD在WT和APP/PS1小鼠中均引起外周胰島素抵抗,但成像顯示這些小鼠胰島素水平是增加的。與之相反的是,對WT和APP/S1小鼠HFD組進(jìn)行尸檢均觀察到較低的胰島素保留。與WT小鼠相比,APP/PS1小鼠表現(xiàn)出更明顯的外周胰島素抵抗和更低的腦胰島素保留,表明大腦對胰島素的耐受會引發(fā)“三型糖尿病”。胰島素分子成像是闡明AD與胰島素抵抗之間潛在聯(lián)系的一種前沿技術(shù),能夠更好地了解胰島素的大腦動力學(xué)。
PET臨床上用于量化AD患者體內(nèi)的腦淀粉樣蛋白負(fù)荷,但需要使用淀粉樣蛋白特異性放射性示蹤劑,并且不能提供斑塊結(jié)構(gòu)的信息。Dahal等研究了小角度X射線散射(small-angle X-ray scattering,SAXS)成像用于人腦中淀粉樣斑塊的結(jié)構(gòu)表征和無對比劑的淀粉樣蛋白負(fù)荷的量化。使用FBP重建不同淀粉樣蛋白負(fù)荷的腦SAXS-CT圖像。淀粉樣蛋白原纖維顆粒的SAXS測量顯示出強(qiáng)烈的散射。SAXS能夠基于其散射特征檢測不含任何對比劑的淀粉樣斑塊。在具有植入淀粉樣斑塊的人頭部數(shù)字模型上進(jìn)行的SAXS-CT模擬顯示可以實現(xiàn)小至2 mm的斑塊的檢測。該研究結(jié)果顯示了SAXS成像方法對人腦中淀粉樣斑塊成像的潛力,并能在不使用對比劑的情況下量化淀粉樣蛋白負(fù)荷。
腫瘤血管生成和腫瘤代謝物對于腦腫瘤患者的臨床是重要的。盡管沒有對比劑泄漏校正的rCBV是MR動態(tài)磁敏感對比灌注加權(quán)成像(dynamic susceptibility contrast perfusion-weighted imaging,DSC-PWI)中最廣泛使用的成像參數(shù),但據(jù)報道具有對比劑泄漏校正的rCBV在評估腫瘤血液動力學(xué)方面具有更好的準(zhǔn)確性。對65例腦腫瘤患者(包括高級別膠質(zhì)瘤、腦轉(zhuǎn)移瘤和腦淋巴瘤)的85次MR DSC-PWI和FDG-PET圖像進(jìn)行分析。結(jié)果具有對比劑泄漏校正的rCBV(1.65±1.38)高于沒有對比劑泄漏校正的rCBV(1.02±0.876)。具有對比劑泄漏校正的rCBV與FDG-PET-TNR(r=0.618)比沒有對比劑泄漏校正的rCBV(r=0.436)具有更好的相關(guān)性。結(jié)合不同的MR-DSC-PWI和FDG-PET參數(shù)可以提供腫瘤血流動力學(xué)變化和腫瘤代謝異常的綜合信息。
Masthoff等在9.4T小動物MRI上開發(fā)了單幀掃描時間為8 min 12 s的T2*WI梯度回波序列的時移MRI方案。電影由20次重復(fù)的圖像組成。在鐵羧葡胺(Resovist)標(biāo)記的單核細(xì)胞上進(jìn)行體模掃描。對健康和實驗性自身免疫性腦脊髓炎(experimental allergic encephalomyelitis,EAE)小鼠靜脈注射Resovist后24 h進(jìn)行活體掃描。通過從標(biāo)記細(xì)胞的不同位置獲得的合成k空間數(shù)據(jù)來模擬運(yùn)動。模擬顯示可以檢測到移動速度達(dá)到1 μm/s的細(xì)胞。EAE小鼠與正常小鼠相比,觀察到體內(nèi)標(biāo)記的免疫細(xì)胞數(shù)量顯著減少(253±29 vs 31±6);在EAE小鼠中,在癥狀發(fā)作前(45±9)與癥狀發(fā)作后(21±4)也觀察到顯著差異。時移MRI能夠非侵入性地評估免疫細(xì)胞動力學(xué),并且可以用作在臨床癥狀發(fā)作之前檢測或監(jiān)測炎癥反應(yīng)。