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施氮對(duì)黃土高原旱地小麥根際AMF群落結(jié)構(gòu)的影響

2019-06-01 02:23吳紅紅張凱曄賈小云高志強(qiáng)賀立恒
山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年5期
關(guān)鍵詞:施氮根際球囊

郝 杰 ,楊 茜,吳紅紅,張凱曄,賈小云,高志強(qiáng),賀立恒

(山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山西 太谷 030801)

小麥?zhǔn)鞘澜缟戏N植最廣泛的糧食作物,可以適應(yīng)各種環(huán)境條件[1-2],它為世界上大多數(shù)人口提供了蛋白質(zhì)、能量以及礦物質(zhì)營(yíng)養(yǎng)。提高小麥的產(chǎn)量與品質(zhì)是小麥生產(chǎn)的主要目標(biāo)。施氮是提高小麥產(chǎn)量與蛋白質(zhì)含量最有效的方法,也是最直接且快速提高小麥經(jīng)濟(jì)效益的措施[3]。因此,氮肥的有效利用在農(nóng)藝、經(jīng)濟(jì)、環(huán)境方面起著至關(guān)重要的作用[4-5]。

人們常用增加氮肥的施用量來增加小麥產(chǎn)量。預(yù)計(jì)到2050年,世界人口將會(huì)增加到90 億,如果按現(xiàn)在的栽培措施,當(dāng)?shù)实氖┯昧繛樵瓉淼? 倍以上時(shí),才能滿足世界人口對(duì)糧食增產(chǎn)的需求[6-8]。然而小麥產(chǎn)量的增加與氮肥施用量并沒有呈現(xiàn)出線性關(guān)系,在過去40 a 里,當(dāng)?shù)适褂昧繛樵瓉淼? 倍以上時(shí),而糧食產(chǎn)量?jī)H為原來的3 倍[9-10]。氮肥增施的報(bào)酬遞減規(guī)律揭示出氮肥使用量的大幅度增加對(duì)全球可持續(xù)的糧食產(chǎn)量的提高作用逐漸降低,且過量施氮造成的氮肥流失正加劇全球生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)的氮污染,這已經(jīng)成為威脅環(huán)境安全的重要因素之一,并導(dǎo)致生物多樣性的減少與氣候的變化[11]。前人利用15N 同位素示蹤法進(jìn)行田間小區(qū)試驗(yàn),結(jié)果表明,我國(guó)旱地大田中氮素?fù)p失達(dá)20%以上[12]。

在前人的研究中,關(guān)于AMF(叢枝菌根菌)在提高其他植物氮素利用率方面已有研究報(bào)道。在大田條件下,小麥根系與AMF 也能夠自然形成共生體系。祝英[13]通過盆栽大田試驗(yàn)對(duì)小麥接種光壁無梗囊霉(Acaulospora laevis)、根內(nèi)球囊霉(Glomus intraradices)和單孢球囊霉(Glomus monosporum)3 種AMF 真菌,均能顯著提高六倍體春小麥籽粒產(chǎn)量,改善產(chǎn)量構(gòu)成因素,增加繁殖分配,改善R-V(繁殖與營(yíng)養(yǎng)分配)指數(shù),并顯著提高收獲指數(shù)。馬放等[14]研究表明,在大田條件下,人工添加AMF 菌劑可顯著提高AMF 對(duì)小麥的侵染率,同時(shí),小麥株高與地上部生物量分別提高14.08%,24.05%。AMF 對(duì)宿主植物氮吸收的影響不但與菌根真菌自身的種類、根際伴生菌的種類和數(shù)量有關(guān),也與外界氮源有關(guān)。朱晨[15]研究表明,不同施肥制度對(duì)土壤中菌根真菌多樣性存在影響,然而不同作物不同土壤中驅(qū)動(dòng)菌根真菌群落變化的主要因子卻有差異。但是隨著氮素投入增加,AMF 的多樣性均下降。李晉榮等[16]研究不同施氮水平下AMF 真菌群落對(duì)三葉草生長(zhǎng)的影響,結(jié)果表明,菌根真菌的侵染率隨施氮水平的增高而降低,在高氮水平下,AMF 對(duì)植物營(yíng)養(yǎng)的貢獻(xiàn)率幾乎為零,反而會(huì)抑制三葉草的生長(zhǎng)。

早期關(guān)于AMF 在宿主植物吸收養(yǎng)分方面的研究較多,但并沒有針對(duì)黃土高原特殊立地條件的研究報(bào)道,再加上研究方法的局限性,很大程度上限制了人們對(duì)黃土高原旱地土壤中AMF 群落結(jié)構(gòu)的清晰認(rèn)識(shí),阻礙了AMF 共生體在旱地小麥生產(chǎn)中的挖掘應(yīng)用潛力。不同施氮水平以及耕作措施對(duì)黃土高原AMF 菌群結(jié)構(gòu)的影響作用尚未見報(bào)道。

本研究根據(jù)黃土高原這一特殊立地條件并結(jié)合主要糧食作物小麥,采用高通量測(cè)序技術(shù),探索不同施氮條件下AMF 群落結(jié)構(gòu)變化,為建立黃土高原旱地小麥基于菌根群落結(jié)構(gòu)優(yōu)化下的氮素高效利用的可持續(xù)高產(chǎn)高效栽培技術(shù)體系提供依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)地概況

試驗(yàn)區(qū)位于山西晉南旱作麥區(qū)試驗(yàn)基地,屬典型暖溫帶大陸氣候,四季分明,年平均氣溫12.6 ℃,年降雨量 500 mm 左右,7,8,9月降雨量較大,無霜期185 d,主要種植作物為小麥。試驗(yàn)地為夏閑地,黏壤土至粉砂質(zhì)黏壤土,土壤基礎(chǔ)肥力為:有機(jī)質(zhì)8.65 g/kg,全氮 0.74 g/kg,堿解氮 32.93 mg/kg,速效磷2.08 mg/kg。

1.2 試驗(yàn)方法

試驗(yàn)共設(shè)3 個(gè)施氮水平,分別為:N1.0 kg/hm2;N2.90 kg/hm2;N3.180 kg/hm2。采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),重復(fù)3 次,共設(shè)置9 個(gè)小區(qū),小區(qū)面積100 m2,所有處理均基施磷肥(P2O)590 kg/hm2、鉀肥(K2O)90 kg/hm2,所有肥料均播前一次施入土壤。分別在越冬期(11月21日)、拔節(jié)期(3月21日)、開花期(5月6日)、成熟期(6月4日)4 個(gè)時(shí)期采集各施氮水平下0~100 cm 土層根系土樣,分3 個(gè)土層:L1.0~20 cm;L2.20~60 cm;L3.60~100 cm。土樣分別標(biāo)記、裝袋,將采集到的樣品迅速置于4 ℃冰箱保存。

1.3 AMF多樣性測(cè)定

各土層根際土壤及根系A(chǔ)MF 的多樣性測(cè)定與分析,委托華大基因公司采用目前微生物多樣性分析最為先進(jìn)的技術(shù)——宏基因組測(cè)序方法完成。

1.4 土壤DNA提取

使用Power Soil DNA 分離試劑盒(MO BIO Laboratories)從樣品中提取總DNA。DNA 質(zhì)量和數(shù)量通過波長(zhǎng)260 nm/280 nm 和260 nm/230 nm 的比率進(jìn)行評(píng)估。

1.5 文庫(kù)建庫(kù)及高通量測(cè)序

提取小麥根系土壤樣品總DNA 后,根據(jù)保守區(qū)設(shè)計(jì)引物并采用18s 定制引物,前引物序列AAGCTCGTAGTTGAATTTCG,后引物序列為CCCA ACTATCCCTATTAATCAT[17-19],在末端加上測(cè)序接頭后進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。擴(kuò)增步驟為:根據(jù)樣品的實(shí)際擴(kuò)增情況將樣品統(tǒng)一稀釋到20 ng/μL,不足的直接使用原液。擴(kuò)增體系(25 μL):5×反應(yīng)緩沖液 5 μL,5×GC 緩沖液 5 μL,dNTP 原料(2.5 mmol/L)2 μL,前引物(10 μmol/L)1 μL,后引物(10 μmol/L)1 μL,DNA 模板 2 μL,ddH2O 8.75 μL,Q5 DNA 聚合酶0.25 μL。 擴(kuò)增參數(shù)為:預(yù)變性 98 ℃ 2 min,變性 98 ℃15 s,退火 55 ℃ 30 s,延伸 72 ℃ 30 s,25~30 個(gè)循環(huán),終延伸72 ℃5 min,10 ℃保存。擴(kuò)增后對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行純化定量和均一化形成測(cè)序文庫(kù),建好的文庫(kù)先進(jìn)行質(zhì)檢,質(zhì)檢合格的文庫(kù)用Illumina HiSeq 2500進(jìn)行測(cè)序。

1.6 生物信息學(xué)分析

根據(jù)雙端測(cè)序序列(PE reads) 之間的重疊(Overlap)關(guān)系,將Hiseq 測(cè)序得到的雙端序列數(shù)據(jù)拼接(Merge)成一條序列 Tags,同時(shí)對(duì)序列(Reads)的質(zhì)量和Merge 的效果進(jìn)行質(zhì)控過濾。通過統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)處理各階段樣品序列數(shù)目,評(píng)估數(shù)據(jù)質(zhì)量。主要通過統(tǒng)計(jì)各階段的序列數(shù)、序列長(zhǎng)度、GC 含量、Q20和Q30 質(zhì)量值、有效值(Effective)等參數(shù)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行評(píng)估。在0.97 的相似度水平下,得到了每個(gè)樣品的OTU 個(gè)數(shù),然后根據(jù)樣品中共有及特有的OTU數(shù)目繪制Venn 圖,直觀地表現(xiàn)出樣品間的相似度。根據(jù)軟件平臺(tái)進(jìn)行物種注釋及分類學(xué)分析。使用Mothur(version v.1.30)軟件,對(duì)樣品 Alpha 多樣性指數(shù)進(jìn)行評(píng)估,以及對(duì)樣品采用距離算法得到樣品間的距離矩陣,通過R 語言工具進(jìn)行Beta 多樣性分析來衡量樣品在時(shí)間、空間尺度上的物種組成變化,主要包括非度量多維標(biāo)定法(NMDS)分析、非加權(quán)組平均法(UPGMA)分析、組間物種差異熱圖等。

2 結(jié)果與分析

2.1 稀釋性曲線分析

稀釋性曲線(Rarefaction Curve)是從樣本中隨機(jī)抽取一定數(shù)量的序列,統(tǒng)計(jì)這些序列所代表的物種數(shù)目,并以序列數(shù)與物種數(shù)來構(gòu)建曲線,用于驗(yàn)證測(cè)序數(shù)據(jù)量是否足以反映樣品中的物種多樣性,并間接反映樣品中物種的豐富程度。

由圖1可知,AMF 真菌樣品的稀釋曲線趨于平坦,不會(huì)隨測(cè)序量增加而增長(zhǎng),已涵蓋絕大多數(shù)的AMF 物種信息。

2.2 不同施氮處理下物種OTU多樣性比較分析

從圖2可以看出,N1,N2,N3處理下共有 OTU個(gè)數(shù)為 125 個(gè),沒有特有的 OTU,表明在 N1,N2,N3這3 種施氮水平下小麥根際土壤中AMF 群落組成相似度較高。

N1處理下,L1土層含有 123 個(gè) OTU,L2土層含有 122 個(gè) OUT,L1與 L2土層共有的 OTU 為 121 個(gè),L1與 L3土層共有的 OUT 為 122 個(gè),L2與 L3土層共有的 OUT 為 122 個(gè),說明 L1與 L2土壤中 AMF 群落組成相似度低于L1與L3,L2與L3之間的相似度。

N2處理下,L1與 L2土層共有的 OTU 為 119 個(gè),L1與 L3土層共有的 OTU 為 119 個(gè),L2與 L3土層共有的 OTU 為 121 個(gè),說明 L2與 L3土壤中 AMF 群落組成相似度較高。

N3處理下,L1與 L2土層共有的 OTU 為 120 個(gè),L1與 L3土層共有的 OUT 為 123 個(gè),L2與 L3土層共有的 OUT 為 119 個(gè),說明 L1與 L3土壤中 AMF 群落組成相似度較高,L1與 L2次之,L2與 L3最低。

2.3 不同施氮處理下AMF多樣性分布

物種組成分布柱狀圖可反映小麥不同生育時(shí)期根際A MF 不同分類學(xué)水平上的群落結(jié)構(gòu)。圖3~7 分別展示綱水平、目水平、科水平、屬水平、種水平的群落結(jié)構(gòu)和分類比較結(jié)果。從圖3~7 可以看出,黃土高原旱地小麥在不同生育期不同土層的根際土壤中AMF 物種包括球囊菌門(Glomeromycota)3 綱、4 目、5 科、5 屬、29 種,其中,類球囊屬(Paraglomus)、球囊霉屬(Glomus)、近明球囊霉屬(Claroideoglomus)為優(yōu)勢(shì)屬,sp._VTX00308 與 _sp._VTX00193 為優(yōu)勢(shì)種。

從圖3可以看出,施氮對(duì)土壤中AMF 群落結(jié)構(gòu)影響較大,其中發(fā)生主要變化的是球囊菌綱(Glomeromycetes)與類球囊菌綱(Paraglomeromycetes),二者約占總菌群的95%以上。N1處理下,L2土層類球囊菌綱(Paraglomeromycetes)較高,相對(duì)豐度占總菌群的70%左右;N2處理下,球囊菌綱(Glomeromycetes)較低,相對(duì)豐度占總菌群的30%左右;N3 處理下,隨著土層深度增加,球囊菌綱(Glomeromycetes)呈逐漸降低,而類球囊菌綱(Paraglomeromycetes)呈逐漸增加。

從圖4可以看出,AMF 在目分類水平下,發(fā)生主要變化的為類球囊菌目(Paraglomerales)與球囊霉目(Glomerales),相對(duì)豐度占到總菌群的95%以上,其變化趨勢(shì)與其各自對(duì)應(yīng)的綱水平變化相似。

從圖5可以看出,N1處理下,L3土層相比于其他2 個(gè)土層球囊霉科(Glomeraceae)較高,占總菌群的15%左右,而類球囊霉科(Paraglomeraceae)在L2土層中分布較多,相對(duì)豐度占總菌群的70%左右;N2處理下,L2土層相比于其他2 個(gè)土層球囊霉科(Glomeraceae)較高,相對(duì)豐度占總菌群的25%左右,而類球囊霉科(Paraglomeraceae)在L3土層中分布較多,相對(duì)豐度占總菌群的70%左右;N3處理下,隨著土層深度增加,類球囊霉科(Paraglomeraceae)逐漸降低,而類球囊菌綱(Paraglomeromycetes)逐漸增加,相對(duì)豐度占總菌群的45%左右。

由圖6可知,AMF 在屬分類水平下,不同處理下發(fā)生主要變化的是類球囊屬(Paraglomus)、球囊霉屬(Glomus)、近明球囊霉屬(Claroideoglomus),其變化趨勢(shì)與科水平上的變化趨勢(shì)相似。

由圖7可知,在種水平上,AMF 群落結(jié)構(gòu)受不同施氮量的影響,其變化比較明顯,含量較為豐富的優(yōu)勢(shì)菌種為sp._VTX00308 與_sp._VTX00193,二者總量占到總菌群的65%以上。

2.4 不同施氮處理Alpha多樣性指數(shù)分析

使用 Mothur(version v.1.30)軟件,對(duì)不同施氮量各土層樣品進(jìn)行聚類后的樣品復(fù)雜性分析。衡量9 個(gè)樣品的物種豐度(richness)及物種多樣性(diveristy)有4個(gè)指標(biāo):Shannon,Simpson,Ace,Chao1。Chao1 和Ace 指數(shù)衡量物種豐度即物種數(shù)量的多少,Shannon 和Simpson 指數(shù)用于衡量物種多樣性。

由表1可知,N2處理下,相比于對(duì)照(N1)與高氮(N3)處理,各土層的 Shannon 指數(shù)最大,Simpson指數(shù)最小,根際土壤AMF 多樣性最高,這表明適宜的施氮量會(huì)提高土壤中AMF 多樣性。

表1 不同施氮量各土層Alpha 多樣性指數(shù)分析

N1處理下,L3土層的 Shannon 指數(shù)最大,Simpson 指數(shù)最小,這表明在L3土層根際土壤AMF 多樣性較高,且L3土層的Chao1 和Ace 指數(shù)最大,其豐度也較高。

N2處理下,在L2土層的Shannon 指數(shù)最大,Simpson 指數(shù)最小,這表明在L2土層根際AMF 多樣性較高;Chao1 和Ace 指數(shù)在L3土層均最大,根際土壤AMF 豐度較高。

N3處理下,Shannon 指數(shù)隨著土層的加深逐漸增大,Simpson 指數(shù)隨著土層的加深而逐漸減小,這表明隨著土層的加深,小麥根際AMF 多樣性呈逐漸增加的趨勢(shì);Chao1 和Ace 指數(shù)在L1土層最大,在L2土層最低,這表明L1土層根際土壤AMF 豐度較高,L2土層根際土壤AMF 豐度較低。

2.5 不同施氮處理Beta多樣性分析

圖8是對(duì)樣品聚類分析后的樣品熱圖,樣品熱圖是基于距離算法得到樣品間的距離矩陣,通過R語言工具繪制樣品熱圖,可根據(jù)顏色梯度的變化直觀看出兩兩樣品間的差異性。從圖8可以看出,N2L1與 N2L2,N2L3與 N1L2,N3L1與 N1L1這3組樣品中AMF 菌群的相似度較高,N3L2與各樣品的AMF 菌群的差異性較大。

UPGMA 聚類樹與柱狀圖結(jié)合繪圖是將聚類樹與豐度柱狀圖結(jié)合起來展示的一種分析手段。圖中左側(cè)為樣品聚類樹(同UPGMA),用以判斷各樣品間物種組成的相似性;圖右側(cè)為各樣品屬水平的豐度柱狀圖,用以判斷各樣品間物種豐度的相似性。

由圖9可知,N2L1 與 N3L2,N3L3與 N1L3,N3L1與N1L1這3 種處理組合下,樣品的相似度較高,3 種處理下,樣品中優(yōu)勢(shì)菌群為類球囊屬(Paraglomus)、球囊霉屬(Glomus)、近明球囊霉屬(Claroideoglomus),N2L2與其他各樣品差異較大,N2L2樣品中球囊霉屬(Glomus)相對(duì)豐度最高。

3 結(jié)論與討論

AMF 作為一種共生真菌對(duì)小麥根系土壤中氮的固定、分布、形態(tài)結(jié)構(gòu)等都產(chǎn)生了重要影響,施氮處理影響了小麥根際土壤AMF 菌群結(jié)構(gòu),進(jìn)而影響了小麥植株氮素代謝。前人研究表明,農(nóng)田中肥料的使用會(huì)影響AMF 群落結(jié)構(gòu),特別是氮肥的大量投入,改變了AMF 的種群組成[20-21]。土壤肥力包括速效磷、有機(jī)質(zhì)含量等,對(duì)AMF 孢子的數(shù)量有很大影響。土壤pH 值變化會(huì)直接影響AMF 豐度及其多樣性[22]??梢?,通過一定的栽培技術(shù)措施間接地調(diào)節(jié)土壤肥力、水分和pH 值,能優(yōu)化AMF 菌群結(jié)構(gòu)[23]。本試驗(yàn)研究表明,施氮處理會(huì)顯著影響根際AMF 菌群結(jié)構(gòu),且在適量氮肥施用(中氮,N2)處理下,小麥根際土壤AMF 多樣性要高于對(duì)照(N1)與高氮(N3)處理,與前人在其他作物上的研究結(jié)果一致。張貴云等[24]研究表明,不同施氮水平對(duì)小麥AMF 群落結(jié)構(gòu)的形成以及分布具有顯著的影響,但隨氮素投入增多,AMF 多樣性下降。劉洋等[25]研究表明,適量的氮肥與磷、鉀肥的配合施用,相比于不施肥處理顯著增加了土壤中AMF 多樣性,施入一定量的氮肥可顯著增加菌根真菌系統(tǒng)的多樣性。

黃土高原旱地小麥根際土壤AMF 物種組成豐富,不同施氮處理下,小麥根際土壤AMF 菌群結(jié)構(gòu)組成不同。N2L1與 N3L2,N3L3與 N1L3,N3L1與 N1L1等3 種處理組合下,樣品相似度較高,N2L2與其他樣品差異較大,N2L2樣品中球囊霉屬(Glomus)相對(duì)豐度最高。劉佳[26]研究表明,不同施肥處理樣地中根圍土壤孢子數(shù)量在不同土壤深度也有差異。0~30 cm土層孢子數(shù)量明顯多于30 cm 以下土層。郭輝娟等[27]研究表明,檸條根際AMF 菌絲定殖率及孢子密度在0~10 cm 土層達(dá)到最大值。本試驗(yàn)研究表明,對(duì)照(N1)與中氮(N2)處理下,小麥根際 AMF 豐度在L3土層達(dá)到最大值,N3處理下,隨著土層的加深,小麥根際AMF 多樣性呈逐漸增加的趨勢(shì),AMF豐度在L1土層達(dá)到最高,而其多樣性沒有表現(xiàn)出一致性規(guī)律,這可能與土壤中其他理化性狀有關(guān)。

特別提出的是,土壤根際AMF 菌群結(jié)構(gòu)以及其他微生物不僅受施氮等栽培技術(shù)措施的影響,還受自然條件等多方面因素制約,導(dǎo)致根際AMF 多樣性研究呈復(fù)雜化趨勢(shì)。試驗(yàn)在開始設(shè)計(jì)時(shí)考慮不同耕作制度對(duì)黃土高原旱地根際土壤中AMF 影響較大,為便于分析,選擇其中的一種氮肥處理因子對(duì)樣品進(jìn)行分析,忽略了另外一些自然因素對(duì)AMF菌群結(jié)構(gòu)的影響,給試驗(yàn)帶來一定的誤差。為了準(zhǔn)確闡明其他栽培方式對(duì)根際土壤AMF 的分布特征的影響,還需要通過定點(diǎn)試驗(yàn),結(jié)合其他栽培方式及土壤的理化性狀進(jìn)一步探索與研究,為建立基于菌群結(jié)構(gòu)及其功能優(yōu)化基礎(chǔ)上的旱地綠色高效栽培技術(shù)提供理論支撐。

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