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根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)山葡萄VaCBF3基因轉(zhuǎn)化歐美楊111的研究

2019-08-30 07:07馮連榮矯麗曼王占斌趙繼梅宋立志梁德軍
關(guān)鍵詞:共培養(yǎng)歐美菌液

馮連榮 矯麗曼 王占斌 趙繼梅 尹 杰 宋立志 梁德軍

( 1. 遼寧省楊樹(shù)研究所,遼寧 營(yíng)口 115213;2. 東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,黑龍江 哈爾濱 150040)

楊樹(shù)是遼寧省平原地區(qū)的主要造林樹(shù)種[1],近年來(lái)受異常氣候(極端干旱、寒潮等)影響,遼寧楊樹(shù)接連發(fā)生大面積災(zāi)害,其中2006年、2009年、2013年楊樹(shù)災(zāi)害發(fā)生規(guī)模較大,損失嚴(yán)重,一些含有南方型美洲黑楊基因的楊樹(shù)品種受災(zāi)較重,其中歐美楊107(Populus×euramericana cv.‘ Neva’)、 歐 美 楊 108( P.×euramericana cv.‘Guariento’)幾乎全軍覆沒(méi)[2]。除氣候因素外,樹(shù)種抗逆性差是楊樹(shù)發(fā)生災(zāi)害的主要內(nèi)在因素,所以培育耐低溫楊樹(shù)品種、提高楊樹(shù)抗寒性是楊樹(shù)生產(chǎn)迫切需求。目前楊樹(shù)抗寒育種主要依靠人工雜交和天然雜種選育,不僅周期長(zhǎng)而且對(duì)提高植物抗寒性的作用不大。

近年來(lái),大量的抗逆基因被分離,作為林木基因工程研究的模式植物[3],楊樹(shù)轉(zhuǎn)抗逆基因研究取得了重大進(jìn)展,但關(guān)于抗寒方面的研究仍處于探索階段,開(kāi)展了一些導(dǎo)入單一的功能基因如擬南芥(Arabidopsis thaliana)Fe-SOD基因[4]、胡蘿卜(Daucus carota)抗凍蛋白基因[5]、毛白楊(P. tomentosa)油酸去飽和酶基因FAD基因[6]和轉(zhuǎn)錄因子基因如擬南芥CBF1(CRT/DRE binding factor) 基 因[7]、 銀 腺 楊 MBF1(multiprotein bridging factor)基因[8]的研究,這些研究均獲得了陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株,并在一定程度上提高了轉(zhuǎn)基因植株的抗寒性。CBF(CRT/DRE binding factor)轉(zhuǎn)錄因子是一類(lèi)受低溫誘導(dǎo)的反式作用因子[9],屬于AP2/ERF家族,可以與COR(cold-regulated)基因啟動(dòng)子中的CRT/DRE(C-repeat/dehydration responsive element)等順式作用元件特異性結(jié)合[10],激活低溫和脫水響應(yīng)基因的表達(dá),促進(jìn)脯氨酸、可溶性糖類(lèi)等物質(zhì)的積累[11],從而提高植物的抗寒性。目前已經(jīng)在陸地棉(Gossypium hirsutum)[12]、哈密大棗(Zizyphus jujuba)[13]、番茄(Lycopersicon esculentum)[14]、黃瓜(Chcumis satires)[15]、 茄 子 ( Solanum melongena)[16]、 苜蓿(Medicago sativa)[17]等植物中得到了應(yīng)用。CBF轉(zhuǎn)錄因子基因在楊樹(shù)轉(zhuǎn)化上的報(bào)道還比較少,目前僅可見(jiàn)毛果楊CBF/DREB1基因家族生物信息分析[18]、胡楊CBF基因家族的鑒定及表達(dá)特性分析[19]及大青楊PuCBF轉(zhuǎn)化煙草[20]等方面的少數(shù)報(bào)道。筆者利用RT-PCR方法克隆得到山葡萄(Vitis amurensis)CBF3(VaCBF3)基因[21]并分別構(gòu)建了由組成型啟動(dòng)子CaMV 35S啟動(dòng)子和擬南芥rd29A基因啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的植物表達(dá)載體[22],確定了轉(zhuǎn)化過(guò)程中抗生素使用濃度[23]。本研究通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤(pán)法建立了歐美楊111(P. euramericana ‘Bellotto’)高效遺傳轉(zhuǎn)化體系,旨在為歐美楊111號(hào)抗寒育種及應(yīng)用提供參考及擴(kuò)繁材料。

1 材料與方法

1.1 材料來(lái)源

1.1.1 受體材料

歐美楊111 當(dāng)年生枝條采自遼寧省楊樹(shù)研究所基因庫(kù),經(jīng)室內(nèi)消毒、外植體接種獲得無(wú)菌組培苗。組培苗培養(yǎng)于(25±1)℃條件下培養(yǎng),光周期12 h/d,光照強(qiáng)度2 000~2 500 lx。

1.1.2 菌株和質(zhì)粒

工程菌為根癌農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumiefaciens)LBA4404,攜帶有擬南芥rd29A基因啟動(dòng)子調(diào)控的VaCBF3基因植物表達(dá)載體質(zhì)粒。質(zhì)粒大小約為11.9 kb,其上攜帶卡那霉素抗性標(biāo)記基因,見(jiàn)圖1。

圖 1 質(zhì)粒圖譜Fig. 1 The plasmid profile

1.1.3 培養(yǎng)基

遺傳轉(zhuǎn)化用培養(yǎng)基:

Ⅰ歐美楊111葉片分化培養(yǎng)基:MS+6-BA 0.5 mg/L+NAA 0.5 mg/L;

Ⅱ歐美楊111莖段生根培養(yǎng)基:1/2MS+IBA 0.4 mg/L;

Ⅲ脫菌分化培養(yǎng)基:MS+6-BA 0.5 mg/L+NAA 0.5 mg/L+Kan 10 mg/L;

Ⅳ選擇生根培養(yǎng)基:1/2MS+IBA0.4 mg/L+Kan 20 mg/L+Cef 50 mg/L;

每升培養(yǎng)基中加蔗糖20 g,瓊脂6 g,用1 mol/L NaOH調(diào)節(jié)pH至6.0~6.5,121 ℃ 0.1 MPa滅菌20 min備用。

LB液體培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,NaCl 10 g/L,用5 mol/L NaOH調(diào)pH至7.0,121 ℃ 0.1 MPa滅菌20 min備用。

1.1.4 酶及生化試劑

Taq DNA Polymerase購(gòu)自Thermo公司;TIANGEN DNAsecure新型植物基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自北京天根生化科技有限公司;卡那霉素購(gòu)自Sigma公司;其他生化試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。

引物序列為:

RD1 為:5′-GCAAGCTTA ACGCATGATTTGATGGAGGA-3′;

RD2 為:5′-GCTCTAGACTTTCCAATAGAAGTAATC-3′

C1 為:5′-GCGGATCTAGAATGGAATCGGAGCGT-3′;

C2 為:5′-GGCGGTACCTCAAGCTATGCATCCAAC-3′。

RD1/RD2擴(kuò)增擬南芥rd29A基因啟動(dòng)子,片段長(zhǎng)度945 bp;C1/C2擴(kuò)增山葡萄CBF3(VaCBF3)基因,片段長(zhǎng)度854 bp;RD1/C2擴(kuò)增rd29A基因啟動(dòng)子+VaCBF3基因,片段長(zhǎng)度1 799 bp。

1.2 實(shí)驗(yàn)方法

1.2.1 農(nóng)桿菌介導(dǎo)目的基因遺傳轉(zhuǎn)化及抗性植株的獲得

以歐美楊111無(wú)菌組培苗葉片為外植體,采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法[24]轉(zhuǎn)化山葡萄VaCBF3基因。選擇完全展開(kāi)、深綠色的葉片,用手術(shù)剪刀剪2~3下,剪斷主脈,葉面朝上接種至培養(yǎng)基Ⅰ上進(jìn)行預(yù)培養(yǎng)。于超凈工作臺(tái)上,將工程菌菌液(OD600≈0.5)轉(zhuǎn)入至50 mL離心管中,3 000 r/min,4 ℃離心5 min,去除上清液,將收集到的菌液用LB液體培養(yǎng)基稀釋至終濃度為OD600≈0.5,然后將預(yù)培養(yǎng)的葉片放入到稀釋好的菌液中,侵染2~10 min,侵染期間不停的搖動(dòng),使菌液與葉片充分接觸。侵染過(guò)的葉片取出后置于無(wú)菌干燥的濾紙上,吸附葉片其表面的殘余菌液,然后接種到培養(yǎng)基Ⅰ上,25 ℃黑暗條件下共培養(yǎng),當(dāng)葉片邊緣隱約可見(jiàn)菌斑時(shí),共培養(yǎng)結(jié)束。將經(jīng)過(guò)共培養(yǎng)的外植體轉(zhuǎn)移到加有選擇壓的脫菌分化培養(yǎng)基Ⅲ上,25 ℃條件下進(jìn)行選擇培養(yǎng)。如果獲得抗性不定芽,將抗性芽剪下繼代擴(kuò)繁培養(yǎng)。選擇培養(yǎng)3~4周后,將抗性芽轉(zhuǎn)入相應(yīng)的附加選擇壓的分化培養(yǎng)基中令其生長(zhǎng)或誘導(dǎo)分化。將獲得的長(zhǎng)至2~3 cm的抗性芽切下,接種到選擇生根培養(yǎng)基Ⅳ中,進(jìn)行生根篩選,培養(yǎng)條件同上,2周后可長(zhǎng)出不定根。

1.2.2 不同因素對(duì)歐美楊111轉(zhuǎn)化的影響

采用單因素實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),研究預(yù)培養(yǎng)時(shí)間、菌液濃度、侵染時(shí)間、共培養(yǎng)時(shí)間對(duì)轉(zhuǎn)化的影響。轉(zhuǎn)化基本條件為:外植體預(yù)培養(yǎng)時(shí)間為3 d,菌液濃度為OD600=0.2,侵染時(shí)間為4 min,共培養(yǎng)時(shí)間為3 d。以轉(zhuǎn)化基本條件為基礎(chǔ),預(yù)培養(yǎng)時(shí)間設(shè)置為:1、2、3、4、5 d;菌液濃度為:0.1、0.2、0.3、0.4、0.5;侵染時(shí)間:2、4、6、8、10 min;共培養(yǎng)時(shí)間:1、2、3、4、5 d。每個(gè)處理侵染葉片20~31個(gè),3次重復(fù),使用Excel、DPS 15.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行整理分析。

1.2.3 抗性植株分子檢測(cè)

采用天根快捷型植物DNA提取試劑盒提取抗性植株和對(duì)照植株葉片總DNA,操作步驟按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,DNA于-20 ℃下儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

以提取的總DNA為模板,未轉(zhuǎn)化對(duì)照植株DNA為陰性對(duì)照,質(zhì)粒DNA為陽(yáng)性對(duì)照,RD1/RD2和C1/C2及RD1/C2為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系(25 μL):10×PCR Buffer 2.5 μL、dNTP(2.5 mmol/L) 2.0 μL、上游引物(10 μmol/L)0.5 μL、下游引物(10 μmol/L)0.5 μL、模板 1.0 μL、Taq 酶 0.25 μL、ddH2O 加 至 25 μL。 反 應(yīng) 條 件為:94 ℃ 預(yù)變性 5 min,94 ℃ 變性 30 s,53 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,72 ℃延伸10 min,反應(yīng)30個(gè)循環(huán),4 ℃終止反應(yīng)。反應(yīng)結(jié)束后,取6 μL反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同因素對(duì)歐美楊111轉(zhuǎn)化的影響

2.1.1 預(yù)培養(yǎng)時(shí)間

預(yù)培養(yǎng)時(shí)間對(duì)歐美楊111葉片分化和轉(zhuǎn)化的影響,結(jié)果見(jiàn)圖2a:隨著預(yù)培養(yǎng)時(shí)間的增加,抗性芽率逐漸提高,預(yù)培養(yǎng)1 d時(shí)抗性芽率為0,可能是由于葉片的傷口還未來(lái)得及修復(fù),農(nóng)桿菌的毒害作用使葉片從傷口處迅速褐化死亡。當(dāng)預(yù)培養(yǎng)時(shí)間為3 d時(shí),抗性芽率達(dá)到最高12.34%,隨后呈現(xiàn)下降趨勢(shì)。原因可能是隨著預(yù)培養(yǎng)時(shí)間的延長(zhǎng),葉片邊緣細(xì)胞已經(jīng)出現(xiàn)芽的分化,葉片切口快要愈合,創(chuàng)傷產(chǎn)生的酚類(lèi)等vir基因誘導(dǎo)物減少,不利于農(nóng)桿菌從傷口侵入,降低轉(zhuǎn)化率。因此,在進(jìn)行歐美楊111遺傳轉(zhuǎn)化時(shí),預(yù)培養(yǎng)時(shí)間以3 d為宜。

2.1.2 菌液濃度

農(nóng)桿菌的濃度和侵染時(shí)間直接影響T-DNA向植物細(xì)胞的轉(zhuǎn)移幾率[23]。農(nóng)桿菌一般菌液濃度范圍是OD600=0.1~0.5。本研究將菌液濃度分別稀釋至0.1、0.2、0.3、0.4和0.5,結(jié)果見(jiàn)圖2b:隨著菌液濃度的增加,歐美楊111葉片產(chǎn)生的抗性芽率隨之提高。當(dāng)菌液濃度為0.3~0.4時(shí),抗性率達(dá)到較大值9.68%~11.36%,隨后又轉(zhuǎn)為下降趨勢(shì),菌液濃度過(guò)高,菌體本身易相互凝結(jié),不利于在外植體附著,從而降低轉(zhuǎn)化率,而濃度過(guò)低時(shí)不利于基因的轉(zhuǎn)入。因此,適宜于歐美楊111轉(zhuǎn)化的農(nóng)桿菌菌液濃度為0.3~0.4。

2.1.3 侵染時(shí)間

侵染時(shí)間的長(zhǎng)短對(duì)影響轉(zhuǎn)化效率具有一定的影響。本研究將侵染時(shí)間設(shè)置為2、4、6、8 min和10 min,結(jié)果表明:侵染時(shí)間在2~4 min之間時(shí),歐美楊111葉片抗性芽得率較高,分別達(dá)到12.12%和19.05%,之后隨著侵染時(shí)間的延長(zhǎng),抗性芽率逐漸降低,見(jiàn)圖2c,可能是由于侵染時(shí)間過(guò)長(zhǎng),農(nóng)桿菌過(guò)度繁殖、毒性過(guò)強(qiáng)而使外植體缺氧軟腐。因此,適宜于歐美楊111轉(zhuǎn)化的侵染時(shí)間為2~4 min。

圖 2 不同因素與歐美楊111葉片抗性芽率的關(guān)系Fig. 2 The relationship between different factors and the rate of leaves resistant bud of P. euramericana 'Bellotto'

2.1.4 共培養(yǎng)時(shí)間

農(nóng)桿菌與受傷部位共存16 h后才能誘發(fā)受體材料產(chǎn)生腫瘤,完成T-DNA完成轉(zhuǎn)移和整合[24]。因此,對(duì)歐美楊111的遺傳轉(zhuǎn)化共培養(yǎng)時(shí)間必須長(zhǎng)于16 h。本研究將預(yù)培養(yǎng)時(shí)間設(shè)置為1、2、3、4、5 d,分析共培養(yǎng)時(shí)間對(duì)歐美楊111轉(zhuǎn)化的影響,結(jié)果見(jiàn)圖2d:隨著共培養(yǎng)時(shí)間的延長(zhǎng),抗性芽率增加,當(dāng)共培養(yǎng)時(shí)間為3 d時(shí),抗性芽率達(dá)到最大值5.26%,隨后抗性芽率降低,共培養(yǎng)時(shí)間為5 d時(shí),抗性芽率更是降低為0。共培養(yǎng)時(shí)間過(guò)長(zhǎng)時(shí),長(zhǎng)時(shí)間黑暗培養(yǎng)導(dǎo)致產(chǎn)生白化芽,白化芽轉(zhuǎn)入到選擇性培養(yǎng)基后,葉片和芽很快死亡,無(wú)法獲得抗性芽。因此,對(duì)于歐美楊111葉片的遺傳轉(zhuǎn)化,共培養(yǎng)時(shí)間在3 d時(shí)比較合適。

2.2 抗性植株的分子檢測(cè)

2.2.1 抗性植株總DNA提取

提取 66株抗性植株的DNA,DNA取5 μL DNA溶液混合1 μL上樣緩沖液加入到凝膠點(diǎn)樣孔,在約5 V/cm電場(chǎng)中電泳,使用凝膠成像系統(tǒng)觀察、拍照,1~21號(hào)抗性植株DNA電泳結(jié)果見(jiàn)圖3:電泳結(jié)果顯示提取的歐美楊111總DNA質(zhì)量較好,條帶清晰,雜質(zhì)較少,雖有DNA降解,但也可以作為PCR反應(yīng)的模板。

圖 3 歐美楊111 DNA電泳Fig. 3 The DNA electrophoretogram of P. euramericana 'Bellotto'

2.2.2 抗性植株的PCR檢測(cè)

歐美楊111抗性植株葉片總DNA經(jīng)RD1/RD2、C1/C2和RD1/C2 3對(duì)引物進(jìn)行PCR測(cè),其中有4株陽(yáng)性植株(圖4)分別擴(kuò)增出目的條帶,片段大小分別約為:950、850 bp和1 800 bp。其中的1號(hào)、2號(hào)植株P(guān)CR產(chǎn)物檢測(cè)見(jiàn)圖5,并對(duì)1號(hào),2號(hào)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行了測(cè)序,測(cè)序結(jié)果經(jīng)過(guò)BLAST比對(duì),與目的基因片段進(jìn)行序列比對(duì)(表1),片段一致性達(dá)到了99%~100%,可以初步判斷目的基因片段導(dǎo)入到受體材料中。

圖 4 轉(zhuǎn)VaCBF3基因歐美楊111抗性芽及陽(yáng)性植株Fig. 4 The resistant buds and positive plants of P. euramericana 'Bellotto' with transforming VaCBF3 gene

圖 5 PCR產(chǎn)物檢測(cè)Fig. 5 Detection of PCR products

表 1 轉(zhuǎn)基因1、2號(hào)植株P(guān)CR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果Table 1 The sequencing results of PCR products in transgenic plants 1 and 2

3 結(jié)論與討論

根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng),是當(dāng)今楊樹(shù)遺傳轉(zhuǎn)化的主要方法[25]。轉(zhuǎn)化成功與否受楊樹(shù)基因型、外植體類(lèi)型、培養(yǎng)條件、抗生素等因素影響。建立高效的遺傳轉(zhuǎn)化體系,是提高轉(zhuǎn)化效率的重要環(huán)節(jié),除了確定受體材料對(duì)抗生素的敏感性,還需要篩選轉(zhuǎn)化過(guò)程中適宜的預(yù)培養(yǎng)時(shí)間、菌液濃度、侵染時(shí)間和共培養(yǎng)時(shí)間等。甄成[26]研究毛果楊(P. trichocarpa)莖段最佳侵染條件為菌液濃度OD600=0.4,侵染時(shí)間為20 min,共培養(yǎng)時(shí)間為2 d,在侵染及共培養(yǎng)過(guò)程中添加80 μmol/L的乙酰丁香酮,轉(zhuǎn)化率為26.7%。朱偉康[27]確定轉(zhuǎn)Bt基因歐洲黑楊(P. nigra)遺傳轉(zhuǎn)化最佳條件為:菌液濃度OD600=0.3,侵染時(shí)間10 min,共培養(yǎng)時(shí)間2 d,轉(zhuǎn)化率為18.0%。趙芳方[28]確定毛白楊(P. tomentosa)最佳遺傳轉(zhuǎn)化體系為菌液濃度OD600=1.0,侵染時(shí)間為9 min,共培養(yǎng)時(shí)間為25 h。孫偉博等[29]采用正交實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)研究‘南林895楊’(P. delotides×P. euramericana cv. ‘Nanlin895’)合適的遺傳轉(zhuǎn)化體系為:預(yù)培養(yǎng)3 d,菌液濃度OD600=0.8,侵染8 min,共培養(yǎng)3 d。本研究采用單因素實(shí)驗(yàn)篩選出歐美楊111遺傳轉(zhuǎn)化過(guò)程中適宜的預(yù)培養(yǎng)時(shí)間為3 d,適宜菌液濃度為OD600≈0.3~0.4之間,適宜侵染時(shí)間為2~4 min,適宜共培養(yǎng)時(shí)間為3 d,轉(zhuǎn)化效率為5.26%~19.05%。但本研究只是采用單因素梯度實(shí)驗(yàn)方法來(lái)探索預(yù)培養(yǎng)時(shí)間等影響轉(zhuǎn)化效率的4個(gè)關(guān)鍵因素的最佳水平,不能確定各因素間的交互作用,還有待于進(jìn)一步的優(yōu)化。另外提高轉(zhuǎn)化效率的另一種有效手段是在農(nóng)桿菌培養(yǎng)、農(nóng)桿菌和外植體共培養(yǎng)的培養(yǎng)基中添加vir基因誘導(dǎo)物,如乙酰丁香酮、羥基乙酰丁香酮等[21],其中以乙酰丁香酮效果最佳,使用較為廣泛,使用濃度一般為20~200 μmol/L[20],有待于在下一步優(yōu)化過(guò)程中進(jìn)行嘗試。

本研究利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將山葡萄VaCBF3基因?qū)氲綒W美楊111中,獲得4株抗性植株,初步證明VaCBF3基因已經(jīng)整合到歐美楊111基因組中。下一步需要進(jìn)一步在RNA水平、蛋白水平進(jìn)行分子檢測(cè),并進(jìn)一步驗(yàn)證VaCBF3的表達(dá)水平、表達(dá)穩(wěn)定性,同時(shí)通過(guò)測(cè)試電導(dǎo)率、丙二醛、可溶性糖等抗寒生理指標(biāo),在生理上明確VaCBF3基因?qū)μ岣邨顦?shù)抗寒性的作用。CBF轉(zhuǎn)錄因子是一個(gè)冷適應(yīng)過(guò)程中的關(guān)鍵性調(diào)控因子,CBF的發(fā)現(xiàn)為基因工程改良植物耐逆性提供了一種全新的技術(shù)途徑。在南方植物北移,換季節(jié)種植等基因改良品種方面具有重要應(yīng)用價(jià)值。

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