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基于PHP的玉米育種信息管理平臺(tái)研建

2019-09-24 06:03姚芷馨蘇杰張隅希徐軻李健
電腦知識(shí)與技術(shù) 2019年21期
關(guān)鍵詞:雜種優(yōu)勢(shì)管理員信息管理

姚芷馨 蘇杰 張隅希 徐軻 李健

摘要:在當(dāng)前時(shí)代背景下,育種的過(guò)程依然非常復(fù)雜,需要考慮諸多因素,比如遺傳因素,環(huán)境因素,育種家的個(gè)人學(xué)識(shí),和選種技巧以及社會(huì)環(huán)境等等過(guò)程。如果單靠個(gè)人的經(jīng)驗(yàn)和學(xué)識(shí)去從事育種開(kāi)發(fā)的工作,需要長(zhǎng)時(shí)間的積累才能獲得一定的進(jìn)展,現(xiàn)代計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,互聯(lián)網(wǎng)的使用以及作物育種科學(xué)的持續(xù)發(fā)展,為數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、處理、計(jì)算奠定了基礎(chǔ),為育種家提供了強(qiáng)大的信息技術(shù)支持。

該信息管理平臺(tái)利用PHP和MySQL編程實(shí)現(xiàn)種子的信息管理,考種的信息管理和有關(guān)玉米的文獻(xiàn)查閱為主要板塊分析玉米的性狀信息并且對(duì)其進(jìn)行了有效的管理和分類(lèi),該平臺(tái)對(duì)玉米的信息管理實(shí)現(xiàn)了高效率的信息整理和對(duì)其性狀進(jìn)行研究管理,提高了玉米育種的效率,這是一種新型的數(shù)據(jù)化育種,其管理的高效率和方便性都優(yōu)于之前的Excel記錄信息的管理,是具有綜合分析功能的玉米育種信息管理平臺(tái)。

關(guān)鍵詞:玉米育種分析;結(jié)構(gòu)化設(shè)計(jì);ThinkPHP(3.2.3)框架;MVC模式

中圖分類(lèi)號(hào):TP311? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A

文章編號(hào):1009-3044(2019)21-0102-02

開(kāi)放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID):

1 玉米育種信息管理系統(tǒng)研究狀況

2002年5月,中國(guó)珠海舉行了高校數(shù)字校園建設(shè)的國(guó)家重點(diǎn)建設(shè)會(huì)議,全國(guó)將近有40多所高等院校參加此會(huì)[6]。會(huì)議最終宣布,北京大學(xué),清華大學(xué),中山大學(xué),浙江大學(xué)等實(shí)現(xiàn)推動(dòng)效益的教學(xué)單位作為召集人,將數(shù)字化校園的建設(shè)推向一個(gè)新的高潮,繼而在全國(guó)范圍內(nèi)陸續(xù)召開(kāi)了相關(guān)領(lǐng)域的大型研討會(huì),商討該如何強(qiáng)而有力地推動(dòng)信息技術(shù)在玉米育種管理中的實(shí)踐引用,讓其發(fā)揮更具便利的作用,以促使對(duì)數(shù)字化校園建設(shè)進(jìn)行更深層次的研究,從而提高對(duì)玉米相關(guān)信息的管理水平和工作效率[7]。

2 開(kāi)發(fā)環(huán)境介紹

本設(shè)計(jì)采用的是ThinkPHP(3.2.3)框架和B/S架構(gòu),系統(tǒng)使用PHP作為主要開(kāi)發(fā)語(yǔ)言,后臺(tái)頁(yè)面采用layui框架進(jìn)行前端開(kāi)發(fā),Apache作為本地服務(wù)器,使用MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)用來(lái)存放系統(tǒng)數(shù)據(jù)。

MySQL 數(shù)據(jù)庫(kù)的特點(diǎn)如下:

(1)綜合統(tǒng)一。

(2)面向集合的操作方式

(3)語(yǔ)言簡(jiǎn)潔,易學(xué)易用。

(4)多用戶、多線程。

(5)客戶機(jī)/服務(wù)器結(jié)構(gòu)。

(6)支持SQL語(yǔ)言。

3 玉米育種方法測(cè)算分析

3.1 玉米不完全雙列雜交多性狀綜合雜種優(yōu)勢(shì)測(cè)定方法

作物育種中的雜交育種目前也是玉米生產(chǎn)常常采用的方法,為了得到性狀更加優(yōu)良的子代,需要進(jìn)行科學(xué)的方法進(jìn)行相應(yīng)的雜交實(shí)驗(yàn)來(lái)預(yù)估雜種的優(yōu)勢(shì)。對(duì)于玉米的不完全雙列雜交實(shí)驗(yàn),能夠?qū)涡誀畹碾s種優(yōu)勢(shì)得到估測(cè)結(jié)果。但是玉米的生產(chǎn)指標(biāo)由多個(gè)性狀組成,每個(gè)性狀對(duì)玉米的經(jīng)濟(jì)價(jià)值影響各不相同,如果只對(duì)一種性狀的分析來(lái)評(píng)價(jià)一組在雜交組合的好壞是不夠全面的。并且性狀之間會(huì)互相影響,而且表現(xiàn)型的性狀還包含了環(huán)境因素的影響,本文使用了統(tǒng)計(jì)分析中的主成分分析的相應(yīng)原理,提出了測(cè)定玉米不完全雙列雜交多性狀綜合雜種優(yōu)勢(shì)的方法,簡(jiǎn)稱主成分法。這種方法的基本思路就是先將多個(gè)目標(biāo)性狀進(jìn)行方差分析,取數(shù)量為p,根據(jù)顯著遺傳性狀差異來(lái)選出目標(biāo)性狀q個(gè),將選出的目標(biāo)性狀的觀測(cè)值乘以自身的相對(duì)重要權(quán),然后進(jìn)行主成分分析,選取前L個(gè)主成分,使其累計(jì)貢獻(xiàn)率大于85%,得到各主成分的雜種性狀優(yōu)勢(shì)之和為多性狀綜合雜種優(yōu)勢(shì)的估計(jì)值。此方法的優(yōu)點(diǎn)在于既考慮了各性狀的相對(duì)重要性, 又可以消除性狀間的相關(guān)影響和因環(huán)境因素的影響, 得到的綜合雜種優(yōu)勢(shì)的估計(jì)值比較合理[9]。

3.2 對(duì)乘以相對(duì)重要權(quán)的 q 個(gè)目標(biāo)性狀進(jìn)行主成分分析[2-5]

對(duì)這q 個(gè)目標(biāo)性狀進(jìn)行方差分析與協(xié)方差分析記作[yijk=wjxijk], 則對(duì) j 性狀進(jìn)行方差分析時(shí) ,數(shù)學(xué)模型為:

其中:[yijk]為乘以相對(duì)重要權(quán)后的第j性狀第i品種(系)的第k區(qū)組觀測(cè)值;[μj]為乘以相對(duì)重要權(quán)后的第j性狀的總平均數(shù);[gij]為乘以相對(duì)重要權(quán)后的第j性狀第i品種(系)的基因型效應(yīng);[eijk]為乘以相對(duì)重要權(quán)后的隨機(jī)誤差,相互獨(dú)立,且都服從 N(0 ,[σ2ei])。

4 服務(wù)器端功能

4.1 管理功能

(1)系統(tǒng)管理員功能:該系統(tǒng)對(duì)管理員的基本信息進(jìn)行管理。它包括添加管理員信息,編制管理員信息,刪除管理員信息。本平臺(tái)對(duì)用戶權(quán)限進(jìn)行了設(shè)置,分為以下三大類(lèi):

1) 育種家:擁有最高權(quán)限,可使用所有功能。

2) 管理者:可以通過(guò)授權(quán)獲得育種家部分權(quán)限和數(shù)據(jù)管理者的所有權(quán)限。

3) 數(shù)據(jù)管理者:只能上傳和修改數(shù)據(jù)。

(2)玉米信息管理功能:管理員可玉米的性狀信息進(jìn)行管理,并且對(duì)其數(shù)據(jù)進(jìn)行了有效的管理和分類(lèi),構(gòu)建了玉米種子信息庫(kù)??梢栽谑謾C(jī)端和電腦端通過(guò)登錄,添加和修改玉米的考種性狀,可以查看玉米的所有基本的信息,并且可以生成一個(gè)可視化的統(tǒng)計(jì)圖來(lái)查看育種情況。實(shí)現(xiàn)了信息管理和分析利用。

4.2 數(shù)據(jù)庫(kù)表設(shè)計(jì)

為了實(shí)現(xiàn)本系統(tǒng)的各項(xiàng)功能,該系統(tǒng)設(shè)計(jì)有一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),庫(kù)名為corn。由于玉米信息極為復(fù)雜,該庫(kù)中設(shè)計(jì)有多個(gè)數(shù)據(jù)表:用戶表、玉米數(shù)據(jù)表等。以下為各表的結(jié)構(gòu)。

(1)admin(管理員表)

用戶(管理員)登錄時(shí),用戶的用戶名和密碼信息將提交到該表,與該表中的數(shù)據(jù)進(jìn)行匹配,驗(yàn)證是否正確。正確則允許用戶登錄,進(jìn)行下一步操作,否則用戶無(wú)法進(jìn)入系統(tǒng)。

(2)玉米信息的一系列表

該表是管理員對(duì)于玉米的性狀、基礎(chǔ)信息、玉米圖片等玉米信息進(jìn)行管理時(shí)需調(diào)用的表,生成新的類(lèi)別,修改、刪除已有的類(lèi)別都是調(diào)用一系列的玉米信息的表。

5.1 系統(tǒng)管理員功能區(qū)的實(shí)現(xiàn)

該功能區(qū)既能添加管理員又能顯示所有管理員。添加管理員模塊中主要是添加新的管理員,在所有管理員模塊中進(jìn)行管理員的修改,刪除,查詢。下圖是系統(tǒng)管理員功能區(qū)中添加管理員模塊界面圖。

該功能區(qū)分為兩個(gè)功能模塊:添加玉米信息和所有玉米信息。添加管理員模塊中主要是添加新的學(xué)生,在所有玉米信息模塊中進(jìn)行管理員的修改,刪除,查詢。

6 結(jié)論

玉米管理信息系統(tǒng)可以規(guī)范的存儲(chǔ)數(shù)據(jù)和方便地使用育種資源的數(shù)據(jù),為育種家提供方便的數(shù)據(jù)計(jì)算,降低了育種成本,在系統(tǒng)上進(jìn)行協(xié)同工作,提高了資源使用效率,減少了時(shí)間浪費(fèi),增加了數(shù)據(jù)精確度,能夠滿足當(dāng)前高校的使用需求。

參考文獻(xiàn):

[1] 馮獻(xiàn)忠,何玉科,區(qū)永祥,等.主要經(jīng)濟(jì)作物分子設(shè)計(jì)育種[J].植物生理學(xué)報(bào),2016(12):1764-1765.

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[3] 李常秀,閆超,玉米葉片病斑數(shù)據(jù)庫(kù)分析與建立[J].黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào),2013,25(2).

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[9] 明道緒,黃玉碧,劉永建.玉米不完全雙列雜交多性狀綜合雜種優(yōu)勢(shì)測(cè)定方法[J].四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2000,18(2).

[10] 劉玉愛(ài).玉米主要數(shù)量性狀遺傳參數(shù)分析[D].內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué),2006.

【通聯(lián)編輯:代影】

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