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慢性乙型肝炎患者HBV基因分型和耐藥突變的分析

2019-12-16 01:06:42李雯賴啟南張志成李煒陳勇平肖影群
實驗與檢驗醫(yī)學(xué) 2019年6期
關(guān)鍵詞:乙型肝炎分型基因型

李雯 ,賴啟南 ,張志成 *,李煒 ,陳勇平 ,肖影群

(1.南昌市第九醫(yī)院,江西 南昌 330002;2.寧都縣人民醫(yī)院,江西 寧都 342800;3.宜黃縣人民醫(yī)院,江西 宜黃 344400)

全球估計有2.4億人感染乙型肝炎病毒,這些感染者患肝硬化和肝細(xì)胞癌(HCC)的風(fēng)險明顯增加[1]。據(jù)統(tǒng)計,目前我國有慢性HBV感染者約9300萬人,慢性HBV感染可引起慢性乙型肝炎、肝硬化、肝衰竭和肝細(xì)胞癌[2],我國肝硬化和HCC患者中,分別有60%和80%的比例是由HBV感染引起的[3]。因此,HBV感染已成為我國嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題之一,長期威脅著我國人民的健康,同時造成嚴(yán)重的經(jīng)濟負(fù)擔(dān)。

目前,臨床上應(yīng)用于抗HBV治療的主要藥物是核苷(酸)類似物(nucleoside analogues,NAs),我國主要使用的抗HBV治療的NAs為拉米夫定(LAM)、阿德福韋酯(ADV)、替比夫定(LdT)、恩替卡韋(ETV)與替諾福韋酯(TDF)。NAs因抗病毒作用強、口服方便、不良反應(yīng)小、價格相對易接受等優(yōu)點在臨床上應(yīng)用廣泛[4],但是NAs的治療缺點是停藥難,需長期用藥,隨著NAs的廣泛和長期應(yīng)用,在治療的過程中患者很容易發(fā)生HBV耐藥突變[5]。因此,及時了解患者的耐藥情況,可以更好的指導(dǎo)臨床用藥,幫助患者制定最佳的抗病毒治療方案。

本文通過回顧性分析江西地區(qū)542例慢性乙肝患者的HBV基因分型和耐藥相關(guān)位點突變的情況,為臨床制定抗病毒治療方案提供參考依據(jù),幫助降低疾病進(jìn)展風(fēng)險。

1 資料與方法

1.1 一般資料 納入2017年7月-2019年6月在我院進(jìn)行HBV耐藥檢測和基因分析的542例慢性乙肝患者,其中男459例,女83例;年齡23~78歲,中位數(shù)年齡51歲。所有患者診斷均符合中華醫(yī)學(xué)會肝病學(xué)分會、中華醫(yī)學(xué)會感染病學(xué)分會2015年修訂的《慢性乙型肝炎防治指南》標(biāo)準(zhǔn)[4],并且均排除有HIV,HAV,HCV,HDV共同感染以及免疫功能不全者。

1.2 儀器與試劑 病毒核酸提取純化試劑盒,乙型肝炎病毒分型及耐藥突變基因檢測試劑盒,PCR擴增儀(ABI 7500),PCR分子恒溫雜交儀(深圳亞能 YN-H16)。

1.3 方法

1.3.1 HBV DNA的提取 收集患者空腹靜脈血5 ml,常溫放置30 min,離心后取血清,-20℃保存?zhèn)溆谩?.5ml離心管中先后加入HBV DNA提取液I和樣品(待檢血清或陰/陽質(zhì)控品)各200uμl,振蕩混勻,13000r/min離心 5min, 棄上清,加入 50μl HBV DNA提取液II,混合均勻至沉淀完全溶解,低速離心數(shù)秒后,100℃干浴或沸水浴 10min;2000r/min離心數(shù)秒,加入5μl三氯甲烷,振蕩混勻,13000r/min離心5min;取上清3μl作為PCR反應(yīng)模板。

1.3.2 PCR擴增 取出PCR反應(yīng)管稍事離心,并在管蓋上做好標(biāo)記,加入3μl已提取的待測樣本DNA,陰性質(zhì)控及陽性質(zhì)控同樣處理。反應(yīng)程序:50℃ 2min;95℃10min;94℃ 60s,68℃ 90s,30 個循環(huán) ;94℃ 30s,54℃30s,72℃ 30s,30 個 循 環(huán) ;72℃5min。

1.3.3 雜交 取15ml離心管,放入HBV基因分型及耐藥突變檢測膜條,然后加入5ml左右的A液,再加入25μlPCR擴增產(chǎn)物,100℃沸水浴中加熱10min,取出離心管,放入雜交箱47℃雜交90min。

1.3.4 洗膜和顯色 將雜交好的膜條轉(zhuǎn)移至裝有40ml B液(47℃預(yù)先預(yù)熱好)的50ml離心管中輕搖15min。然后取出膜條放入孵育液(按A液/POD=2000/1的比例配置),室溫輕搖孵育30min。棄孵育液,用A液室溫?fù)u洗2~3次,每次 5min。再用C液室溫洗膜2min。再將膜條浸泡于顯色液(10張膜體系:19mlC 液+1mlTMB+2μl30%H2O2)中避光顯色10-15min,并用純水終止顯色反應(yīng)。

1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 21.0統(tǒng)計軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,計數(shù)資料組間比較采用χ2檢驗,以 P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義;計數(shù)資料以n(%)表示。

2 結(jié)果

2.1 結(jié)果判讀 乙型肝炎病毒患者的血清經(jīng)過HBV DNA的提取,PCR擴增以及與膜條的雜交、顯色等過程后,可通過膜條各陣列的顯色情況(藍(lán)色斑點)直接判讀HBV的耐藥情況及其基因型,見圖1。當(dāng)膜條各陣列只有CC位點顯色而其他位點不顯色,則表明被檢樣本中的HBV病毒量低于本試劑的最低檢測下限或者樣本中不存在HBV。

2.2 HBV基因分型 經(jīng)分型鑒定顯示,542例CHB中共檢出B、C、BC、BD及其他型等五種基因型,主要基因型為B型和C型,其中B基因型比例最大(83.0%,450/542),C 基因型次之(12.6%,68/542)。 此外,542例樣本中共檢測到耐藥突變184例,耐藥檢出率為33.9%(184/542),并且耐藥突變中以B、C 2種基因型為主體,其中B基因型151例,耐藥檢出率為33.6%(151/450),C基因型22例,耐藥檢出率為 32.4%(22/68),B、C基因型在耐藥檢出率方面無統(tǒng)計學(xué)差異(P>0.05)。具體情況見表1。

圖1 HBV耐藥測定及基因分型膜條示意圖

表1 HBV基因分型結(jié)果

2.3 NAs藥物的耐藥情況 542例樣本中共檢測到耐藥突變184例,耐藥檢出率為33.9%(184/542);其中,出現(xiàn)突變的184例樣本中LAM耐藥例數(shù)為152(82.6%),LdT 耐藥例數(shù)為 151(82.1%),ADV 耐藥例數(shù)為 50(27.2%),ETV耐藥例數(shù)為 27(14.6%),并且有 152(82.6%)例出現(xiàn)了多種藥物耐藥的情況。見表2。

2.4 HBV耐藥突變位點分析 在184例發(fā)生耐藥突變的樣本中,共發(fā)現(xiàn)了20種不同的耐藥突變模式,其中發(fā)生單個位點突變111例(60.3%),發(fā)生多個位點突變73例(39.7%);單個位點以 rt204 I/V位點的突變檢出率最高(33.7%,62/184),多個位點以rt204 I/V+rt180 M的突變檢出率最高(22.3%,41/184)。見表3。對總的突變檢出率進(jìn)行分析顯示,突變檢出率最高的位點為 rt204 I/V(70.7%,130/184),其次為 rt180 M(34.8%,64/184),再次為 rt236 T(19.6%,36/184)。 見表 4。

表2 HBV耐藥株分布情況[n(%)]

3 討論

隨著核苷酸類抗病毒藥物的普及和用藥時間延長,HBV耐藥株帶來的問題已經(jīng)嚴(yán)重?fù)p害了CHB的健康,因此及時高效的檢測出患者在治療過程中是否出現(xiàn)了耐藥顯得尤為重要。檢測乙肝耐藥突變的方法有限制性片段長度多態(tài)性法、多溫度單鏈構(gòu)象多態(tài)性法、直接測序法和克隆測序法、線性探針分析法、基因芯片技術(shù)和核酸質(zhì)譜檢測技術(shù)等,其中基因芯片技術(shù)和Sanger測序法是目前運用最為廣泛的兩種技術(shù)[6]。

表3 HBV耐藥位點分布情況[n(%)]

表4 HBV耐藥位點分布情況[n(%)]

本研究采用PCR-反向點雜交基因芯片技術(shù)對來自江西地區(qū)542例CHB的基因型及其耐藥突變情況進(jìn)行檢測?;蚍中偷慕Y(jié)果顯示江西地區(qū)HBV 分型主要以 B(83.0%)、C(12.6%)基因型為主,檢測結(jié)果符合南方以B基因為主的結(jié)論,并且與本地區(qū)其他研究結(jié)果相吻合[7,8];其中,B基因型的耐藥檢出率為33.6%(151/450),C基因型的耐藥檢出率為 32.4%(22/68);但是,B、C 基因型在耐藥檢出率方面差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。此外,本研究還檢測到BC混合型13例,BD混合型8例以及其他型3例,同時本研究發(fā)現(xiàn)混合型發(fā)生耐藥的概率明顯高于其他基因型,但是因為混合型基因型的樣本量比較少,所以混合基因型是否與耐藥突變存在關(guān)系還需進(jìn)一步擴大樣本量證實。

目前,臨床上用于抗乙型肝炎病毒的NAs主要是拉米夫定、替比夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋和替諾福韋酯等幾種藥物,CHB患者在使用替諾福韋酯抗病毒治療時病毒學(xué)應(yīng)答率良好,8年隨訪研究暫未發(fā)現(xiàn)TDF相關(guān)耐藥[9]。故而,本研究主要是針對前4中NAs藥物進(jìn)行突變位點的檢測,檢測的拉米夫定突變位點為rt204 I/V+rt180 M、rt204 I/V、rt181 V/T和rt207 I,替比夫定突變位點為rt20 4 I/V+rt180 M、rt204 I和 rt181 V/T,阿德福韋酯突變位點為rt181 V/T和rt236 I,恩替卡韋突變位點為rt204 I/V+rt180 M或rt204 I/V加rt184 I/S/A/F/L、rt250 I/L/V、rt202 G/I任意位點。

本文結(jié)果顯示542例樣本中有184例發(fā)生了不同程度的耐藥位點突變,突變檢出率為33.9%,該結(jié)果與滕菁等[10](161/433,37.2%)和郭耿龍等[11](67/182,36.8%)的研究結(jié)果相符;但是低于馬軍等[12](1193/2765,43.15%)和韓宇等[13](46.87%,75/160)的研究結(jié)果;此外本研究結(jié)果又顯著高于李少燕等[14](30/255,11.8%)和許桂丹等[15](63/869,7.25%)的結(jié)果。究其原因,可能與耐藥基因屏障、突變對病毒適應(yīng)力的影響、患者用藥的規(guī)范性和用藥史、地域不同等多種因素相關(guān)。

突變位點結(jié)果分析顯示,共發(fā)現(xiàn)了20種不同的耐藥突變模式,以 rt204 I/V(33.7%,62/184)單一位點突變和rt204 I/V+rt180 M(22.3%,41/184)聯(lián)合位點突變?yōu)橹?,這兩個突變均提示LAM和LdT聯(lián)合耐藥。有48(26.1%,48/184)例患者在rt236 T和rt181 V/T位點發(fā)生了突變,其中31例是rt236 T突變,該位點突變提示ADV耐藥,13例患者是rt181 V/T突變,4例是rt236 T+rt181 V/T聯(lián)合突變,該17例患者提示發(fā)生了LAM、LdT和ADV聯(lián)合多重耐藥。ETV是高耐藥基因屏障藥物,除了預(yù)先存在的rt204 I/V+rt180 M或rt204 I/V耐藥位點,還需要同時出現(xiàn)rt184 I/S/A/F/L、rt250 I/L/V和rt202 G/I任意位點突變[1],本研究中ETV相關(guān)的rt184、rt2 50、rt202三個位點發(fā)生突變的患者為37例,其中3例患者為rt184單一位點突變,5例為rt250單一位點突變、2例為rt202單一位點突變,其余27(14.6%,27/184)例患者均為rt204 I/V+rt180 M或rt204 I/V突變模式的基礎(chǔ)上分別發(fā)生rt184、rt250、rt202任意位點的多重耐藥突變,因此,LAM耐藥的患者換用或加用 ETV治療時需定期監(jiān)測療效,以防發(fā)生聯(lián)合多重耐藥。

本研究大樣本回顧性分析江西地區(qū)慢性乙型肝炎患者HBV基因分型與耐藥突變。提示江西地區(qū)NAs耐藥檢出率相對較高,且耐藥突變模式復(fù)雜多樣,有待深入研究,對患者在抗病毒治療過程中定期進(jìn)行NAs耐藥檢測對制定用藥方案、提高抗HBV療效以及預(yù)防耐藥株的產(chǎn)生也具有重要的臨床價值。

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