何永玲
(桂林醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院檢驗科,廣西 桂林 541001)
系統(tǒng)性紅斑狼瘡(Systematic lupus erythematosus, SLE)是一類病因不明的慢性自身免疫性疾病,主要以抗自身抗體的產(chǎn)生并引起機體多個器官的免疫損傷為特點。疾病活動的進展、并發(fā)感染和心血管疾病是引起SLE患者死亡的主要原因,而按性別和年齡進行標準化后,SLE患者的標準化死亡率是普通人群的2.6倍[1]。近20多年來,流行病學(xué)的調(diào)查資料顯示SLE發(fā)病率和死亡率在歐洲地區(qū)的丹麥、法國和英國雖有下降的趨勢,但在中/美洲和亞洲某些國家包括我國一些地區(qū)卻呈現(xiàn)上升的趨勢[2-5]。因此,開展SLE的病因?qū)W研究,深入了解SLE的發(fā)生發(fā)展,對SLE早期有效防治具有極其重要的意義。筆者就miR-181基因簇在系統(tǒng)性紅斑狼瘡疾病中的研究進展做一系統(tǒng)綜述。
1993年,Lee等[6]通過對秀麗隱桿線蟲(caenorhabditis elegans, C.elegans) 的lin-4基因研究發(fā)現(xiàn)了首個miRNA分子。lin-4基因表達的終產(chǎn)物不是蛋白質(zhì),而是生成長約22個核苷酸序列的小RNA分子,該分子可以和C.elegans的異時基因lin-14基因mRNA的3’UTR結(jié)合,導(dǎo)致lin-14蛋白合成減少。2000年,科學(xué)家通過對C.elegans的研究發(fā)現(xiàn)了第二miRNA,即let-7。Let-7可轉(zhuǎn)錄最終生成長度為21個核苷酸的RNA,該RNA可通過堿基互補配對與線蟲的lin-14,lin-28,lin-41,lin-42和daf-12等異時基因的3’UTR結(jié)合,從而調(diào)控這些基因的表達[7]。此后,新的miRNA分子在不同物種中陸續(xù)地被科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)。目前被發(fā)現(xiàn)的miRNA已達數(shù)千種,而人體中被發(fā)現(xiàn)的約含3479種。miRNA的發(fā)現(xiàn)為開啟基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控領(lǐng)域奠定了堅實的基礎(chǔ)。
miRNA的形成是經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、加工、成熟的過程,并伴有多種酶的參與[8]。首先,miRNA基因在RNA聚合酶Ⅱ的作用轉(zhuǎn)錄生成長度約1 kb,且含有2個環(huán)狀結(jié)構(gòu)的初級產(chǎn)物pri-miRNA[9-10]。在輔助因子DGCR8(diGeorge syndrome critical region gene 8, DGCR8)的幫助下,pri-miRNA被Drosha識別并剪切掉其莖環(huán)狀結(jié)構(gòu),生成長度約70個核苷酸的前體pre-miRNA,莖環(huán)狀結(jié)構(gòu)之外的部分大多在細胞核內(nèi)被降解[11]。隨后,轉(zhuǎn)運蛋白Exportin 5通過與pre-miRNA環(huán)狀結(jié)構(gòu)的識別和結(jié)合,從而使細胞核內(nèi)的pre-miRNA轉(zhuǎn)運到細胞質(zhì)[12]。RNaseⅢ酶Dicer對細胞質(zhì)中的pre-miRNA進行切割最終生成長約22個核苷酸的雙鏈RNA[13-14]。Argonaute蛋白與該雙鏈RNA解旋后的其中一條單鏈RNA相結(jié)合形成基因沉默復(fù)合物RISC(RNA-induced silencing complex, RISC),又稱為miRNPs,該復(fù)合物可以與靶基因mRNA的3’UTR區(qū)發(fā)生特異性結(jié)合,從而導(dǎo)致靶mRNA發(fā)生降解或翻譯抑制[15]。
miRNA基因多數(shù)位于蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū),也可位于長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA)的內(nèi)含子區(qū)內(nèi),有部分miRNA基因與lncRNA基因的外顯子區(qū)重疊,有些甚至同時來自基因的內(nèi)含子和外顯子[16]。miRNA基因存在的形式可以為單拷貝或者成簇聚集的基因簇,可通過一個共同的啟動子轉(zhuǎn)錄生成多順反子,再經(jīng)過加工生成多個獨立的成熟miRNA分子?;虼氐母鱾€成員在功能上具有疊加效應(yīng)的特點,對某些生物活動起到相互協(xié)調(diào)的作用,以確保生命活動的有序進行[17]。目前已有大量的miRNA基因簇被發(fā)現(xiàn),而miR-17-92基因簇是目前被研究得最多的基因簇。
microRNA(miRNA)是近年來人類又一重大發(fā)現(xiàn)的單鏈非編碼小RNA分子,長約19-25 個核酸,進化上高度保守,約占人類基因組的1%。miRNA可特異性識別并以堿基互補配對的方式與靶基因的mRNA 3’非翻譯(3’untranslational region,3’ UTR)結(jié)合,引起mRNA的降解或翻譯抑制,從而對轉(zhuǎn)錄后水平的靶基因mRNA表達進行調(diào)控。研究證實miRNA參與了細胞的增殖、分化、發(fā)育和代謝等多種生物學(xué)行為,是目前國內(nèi)外研究的熱點之一[18]。人類miR-181家族成員位于3條獨立的染色體上,miR-181a/b-1位于1號染色體上;miR-181a/b-2位于9號染色體上;miR-181c/d則位于19號染色體上。miR-181家族成員包括了miR-181a、miR-181b、miR-181c和miR-181d,其中miR-181a有miR-181a-1和miR-181a-2兩個亞型編碼,miR-181b有型編碼。人類miR-181家族成員包括了 miR-181a、miR-181b、miR-181c和miR-181d,其中miR-181a有miR-181a-1和miR-181a-2兩個亞型編碼,miR-181b有miR-181b-1和miR-181b-2兩個亞型編碼,miR-181家族成員位于3條獨立的染色體上,miR-181a/b-1位于1號染色體上;miR-181a/b-2位于9號染色體上;miR-181c/d則位于19號染色體上。
很多前瞻性文獻已報道了miR-181家族成員可能與心血管疾病、多種腫瘤、病毒感染及自身免疫性疾病等的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[19-22]。但截止目前,關(guān)于miR-181家族成員(miR-181a、miR-181b、miR-181c和miR-181d)與系統(tǒng)紅斑狼瘡相關(guān)的研究甚少。國外研究學(xué)者Lashine等[23]采用實時熒光定量PCR,在兒童系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者的外周血中發(fā)現(xiàn)miR-181a的表達顯著下調(diào),而PCAF基因的表達明顯上調(diào),他們推測miR-181a可能通過調(diào)控靶蛋白PCAF來影響Hdm2泛素化及P53釋放從而誘導(dǎo)細胞凋亡,更為重要的是miR-181a的表達水平與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的活動性指數(shù)相關(guān)。該結(jié)論表明miR-181a可能與系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。最近Li等[24]研究采用了qRT-PCR檢測miR-181a在系統(tǒng)性紅斑狼瘡中的表達情況,結(jié)果表明,系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者miR-181a的血清水平顯著高于正常健康組,miR-181a的表達水平與系統(tǒng)性紅斑狼瘡活動程度及無進展生存期密切相關(guān),提出miR-181a可能對系統(tǒng)性紅斑狼瘡的診斷和評估具有重要作用。然而,該研究者中系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者miR-181a的表達水平與前者的研究結(jié)果相反,miR-181a在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者中的表達水平到底如何,尚存爭議。最近,國內(nèi)學(xué)者陳明坤等[25]也采用了qRT-PCR法檢測系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者血清中miR-181a的表達水平,并分析其與臨床特征的關(guān)系。研究發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者中miR-181a的相對表達量顯著增高,其表達水平與血沉、C反應(yīng)蛋白和系統(tǒng)性紅斑狼瘡的活動評分呈正相關(guān),提示血清miR-181a可能有助于評估系統(tǒng)性紅斑狼瘡的病情。然而,以上學(xué)者都集中在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者中miR-181a表達情況及其臨床意義的研究。在系統(tǒng)性紅斑狼瘡中動物模型及細胞體外培養(yǎng)中的研究,目前國內(nèi)外尚未見文獻報道。miR-181家族的其他基因在系統(tǒng)性紅斑狼瘡中的表達如何、miR-181家族基因突變與系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)生是否相關(guān)未見文獻報道。故此,迫切需要明確miR-181家族基因與系統(tǒng)性紅斑狼瘡中的關(guān)系,它在系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)生中的表達調(diào)控的分子機制。
單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)主要是指在基因組水平上由于單個核苷酸變異所引起的 DNA 序列多態(tài)性,是人類可遺傳變異中最常見的一種,是個體或者群體之間遺傳差異最主要的表現(xiàn)形式。SNPs 在人類基因組中廣泛存在,占人類基因序列變異大多數(shù)的SNPs 的篩選及其檢測正成為研究者們廣泛關(guān)注的焦點。因此,研究SNP有助于解釋不同群體和個體對疾病,特別是對復(fù)雜疾病的易感性,以及對各種藥物的耐受性和對環(huán)境因子反應(yīng)的表型差異。人類基因計劃組掃描發(fā)現(xiàn),miR-181家族(miR-181a、miR-181b、miR-181c和miR-181d)基因存在多種功能性多態(tài)性位點,由于基因多態(tài)性存在種族、民族和地域間差異,在不同的種族、民族和地域之間,很多疾病的發(fā)病率存在著明顯的不同,雖然環(huán)境、生活習(xí)慣等因素在疾病的發(fā)生過程中起著一定的作用,但不同民族在遺傳背景上的差異是導(dǎo)致疾病易感性不同的一個重要因素。
拷貝數(shù)變異(copy number variant,CNV)是指廣泛存在于人類基因組中的,從1 kb至3 Mb范圍內(nèi)的DNA片段插入、缺失、重復(fù)及其互相組合衍生出的復(fù)雜染色體結(jié)構(gòu)變異,可通過破壞基因的調(diào)節(jié)區(qū)域或者編碼蛋白的活性部分而影響基因的表達,從而引起疾病或疾病表型的多樣性。CNV和SNPs一起成為人類表型變異的兩個重要來源,是近年來研究的重點和熱點。一些基因CNVs在系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)生發(fā)展中可能起著重要的作用。但截止目前,關(guān)于miR-181家族基因CNVs與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的相關(guān)性研究目前國內(nèi)外尚未見報道。miR-181家族基因CNVs在系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)生發(fā)展中是否起作用,目前尚不清楚,有必要深入研究其在系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病中的作用。聯(lián)合使用具有互補性的SNPs和CNV兩個遺傳學(xué)標記,探索miR-181家族基因遺傳變異與系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)生發(fā)展的相關(guān)關(guān)系,有助于揭示缺系統(tǒng)性紅斑狼瘡 miR-181家族基因異常表達的分子機理,并鑒定出新的易感基因,找到系統(tǒng)性紅斑狼瘡診治新的靶點。
miR-181家族基因簇是一個具有豐富生物學(xué)功能的基因簇,可調(diào)控數(shù)十種靶基因蛋白的表達,是人體多個器官、系統(tǒng)發(fā)育的必須分子。雖然目前關(guān)于miR-181家族基因簇與系統(tǒng)性紅斑狼瘡疾病的相關(guān)性研究還處在起步階段,但其在系統(tǒng)性紅斑狼瘡疾病診斷和治療方面展現(xiàn)出的潛在價值是毋庸置疑的。相信隨著研究的不斷深入展開,miR-181基因簇將會有廣闊的應(yīng)用前景。