宋建坤 ,蒯仂 ,李秀麗 ,茹意 ,羅楹 ,周蜜 ,李欣 ,李斌
(1.上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬岳陽(yáng)中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院,上海200437;2.同濟(jì)大學(xué)附屬第十人民醫(yī)院,上海200072)
腺嘌呤在N6位的甲基化即N6-甲基腺苷(m6A)是一種豐富的RNA修飾,有高度保守性,廣泛存在于大多數(shù)真核生物物種(從酵母、植物、果蠅到哺乳動(dòng)物)以及病毒mRNA中,在轉(zhuǎn)錄后mRNA的處理和代謝中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用[1]。m6A修飾過(guò)程由3種通常稱(chēng)為“作者”(腺苷甲基轉(zhuǎn)移酶)、“擦除器”(去甲基化酶)和“閱讀器”(m6A結(jié)合蛋白)的蛋白質(zhì)調(diào)控。m6A修飾作為表位轉(zhuǎn)錄標(biāo)記,幾乎可以調(diào)節(jié)RNA轉(zhuǎn)錄本代謝的所有方面,包括剪接、穩(wěn)定性、結(jié)構(gòu)、翻譯和輸出[2]。
銀屑病是一種以T淋巴細(xì)胞為主的炎性細(xì)胞浸潤(rùn)的慢性炎癥性皮膚疾病,以角質(zhì)形成細(xì)胞過(guò)度增生為特征。結(jié)合m6A修飾在基因表達(dá)調(diào)控和免疫應(yīng)答中的作用,本文對(duì)m6A修飾和銀屑病發(fā)病機(jī)制之間的聯(lián)系進(jìn)行綜述研究。
銀屑病是一種以T淋巴細(xì)胞為主的炎性細(xì)胞浸潤(rùn)的慢性炎癥性皮膚疾病。最近Li等[3]研究表明RNA甲基化酶METTL3缺失的幼稚T細(xì)胞Th2細(xì)胞增多,而Th1和Th17細(xì)胞減少。此外,在淋巴減數(shù)過(guò)繼轉(zhuǎn)移模型中,缺乏METTL3的幼稚T細(xì)胞無(wú)法進(jìn)行穩(wěn)態(tài)擴(kuò)增并保持幼稚狀態(tài)。該研究首次闡明了m6A介導(dǎo)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄物降解在控制T細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和IL-7誘導(dǎo)的分化中發(fā)揮作用。后續(xù)研究中,Tong等[4]發(fā)現(xiàn)調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg)特異性缺失m6A甲基化轉(zhuǎn)移酶METTL3的小鼠,在斷奶后會(huì)出現(xiàn)淋巴結(jié)腫大、脾臟腫大、毛發(fā)脫落等嚴(yán)重的自身免疫性疾病,表明m6A mRNA甲基化修飾對(duì)Treg細(xì)胞發(fā)揮抑制性功能至關(guān)重要。
Treg細(xì)胞是效應(yīng)T細(xì)胞的一個(gè)重要亞群。銀屑病病理特征之一為T(mén)h1/Th2軸活化及Th17/Treg平衡異常征[5]。在銀屑病患者的皮損處,Treg細(xì)胞功能受損導(dǎo)致Th1和Th17過(guò)度活化,引起銀屑病炎癥。Yun等[6]發(fā)現(xiàn),進(jìn)展期銀屑病患者的皮損中能發(fā)現(xiàn)Foxp3+Treg細(xì)胞數(shù)目降低,提示銀屑病的加重可能與銀屑病皮損處的Foxp3+Treg細(xì)胞數(shù)目減少有關(guān)。基于m6A作為免疫細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和功能的關(guān)鍵調(diào)控因子,及其mRNA甲基化修飾對(duì)Treg細(xì)胞發(fā)揮抑制性功能,筆者推測(cè)其可能通過(guò)維持Treg細(xì)胞的抑制性功能,使Th17/Treg細(xì)胞處于平衡狀態(tài),從而起到緩解銀屑病的作用。
ncRNA是指不能翻譯為蛋白的功能性RNA分子,過(guò)去一直被視為基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的“垃圾序列”,現(xiàn)在被證實(shí)廣泛參與細(xì)胞生命活動(dòng)和許多人類(lèi)疾病過(guò)程,并在表觀遺傳水平、轉(zhuǎn)錄水平及轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮重要調(diào)控功能。在ncRNA中,m6A修飾在轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性和功能中發(fā)揮作用。銀屑病中大量差異表達(dá)的ncRNA分子在基因水平發(fā)揮了重要的調(diào)控作用。因此,m6A甲基化可能在ncRNA中促進(jìn)轉(zhuǎn)錄本的降解,從而影響銀屑病的進(jìn)程。
2.1 微小核糖核酸(miRNA) miRNA是一類(lèi)成熟產(chǎn)物長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸的非編碼小RNA,被認(rèn)為是疾病數(shù)量的基因和生物標(biāo)志物的關(guān)鍵調(diào)控因子。自然發(fā)生的miRNA作為細(xì)胞分化、增殖和生存的重要調(diào)節(jié)因子,其異常和改變的miRNA表達(dá)參與調(diào)控細(xì)胞分化增殖及信號(hào)傳導(dǎo)等多途徑,與銀屑病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[7-8]。銀屑病是一種以T淋巴細(xì)胞介導(dǎo)的、以表皮增生、角質(zhì)形成細(xì)胞過(guò)度增殖為特征的自身免疫性疾病。miRNA在銀屑病中發(fā)揮關(guān)鍵作用,包括調(diào)節(jié)角質(zhì)形成細(xì)胞的增殖、細(xì)胞因子和趨化因子的產(chǎn)生,以及介導(dǎo)銀屑病的免疫功能障礙。在銀屑病中異常表達(dá)的miRNA主要有miR-125b、miR-31、miR-203、miR-21、miR-146a/b 等。
Chen等[9]發(fā)現(xiàn),通過(guò)調(diào)節(jié)miRNA生物發(fā)生酶切子或miRNA的表達(dá),可以改變單個(gè)mRNA上的整個(gè)細(xì)胞m6A豐度和m6A,證實(shí)了miRNA通過(guò)介導(dǎo)METTL3與mRNA的結(jié)合,參與調(diào)控小鼠和人類(lèi)細(xì)胞中m6A的形成。此外,METTL3的缺失導(dǎo)致多種細(xì)胞類(lèi)型中成熟miRNA的整體減少,而酶活性較高的METTL3的過(guò)表達(dá)足以顯著上調(diào)成熟miRNA的表達(dá)[10]。Zhou等[11]發(fā)現(xiàn)m6Afreq基因在胚胎發(fā)育、有絲分裂細(xì)胞周期、生長(zhǎng)和凋亡信號(hào)通路等方面顯著富集,而miRNA也與細(xì)胞的增殖與凋亡有關(guān)。miRNA的異常表達(dá)在銀屑病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。Xu等[12]認(rèn)為miR-125b在介導(dǎo)銀屑病角質(zhì)形成細(xì)胞分化和增殖的同時(shí),通過(guò)抑制成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體(FGFR)2,下調(diào)和過(guò)表達(dá)抑制角質(zhì)形成細(xì)胞的增殖和促進(jìn)分化。銀屑病表皮細(xì)胞因子高表達(dá)的轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子(TGF)-β1可以在角質(zhì)形成細(xì)胞中上調(diào)miR-31的表達(dá),從而激活內(nèi)皮細(xì)胞,吸引白細(xì)胞聚集,抑制炎性介質(zhì)的產(chǎn)生[13]。據(jù)此,筆者推測(cè)m6A修飾過(guò)程中的腺苷甲基轉(zhuǎn)移酶的過(guò)表達(dá)可能通過(guò)上調(diào)miRNA表達(dá),從而抑制角質(zhì)形成細(xì)胞的異常分化以及細(xì)胞因子和趨化因子的產(chǎn)生,緩解銀屑病的發(fā)生。
2.2 長(zhǎng)鏈非偏碼RNA(lncRNA) lncRNA其長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸,不編碼蛋白質(zhì),主要位于細(xì)胞核內(nèi)。在銀屑病中表達(dá)失衡的lncRNA主要有壓力應(yīng)激誘導(dǎo)的銀屑病易感性相關(guān)RNA基因(PRINS)、lncRNA-MSX2P1 等。Patil等[14]發(fā)現(xiàn)lncRNA X非活性特異性轉(zhuǎn)錄物(XIST)和細(xì)胞mRNA中m6A的形成是由RNA結(jié)合基序蛋白(RBM)15及其旁體RBM15b介導(dǎo)的,后者結(jié)合m6A甲基化復(fù)合物并將其招募到RNA中的特定位點(diǎn),這導(dǎo)致相鄰m6A共有基序中腺苷核苷酸的甲基化。m6A的結(jié)合蛋白之一,YTHDC1,優(yōu)先結(jié)合XIST上的m6A標(biāo)記物,是XIST賦予人類(lèi)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄沉默的必要條件。
Ahn等[15]通過(guò)對(duì)銀屑病患者治療前后和健康對(duì)照者的皮膚樣本進(jìn)行RNA序列分析,利用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA),發(fā)現(xiàn)50%以上的共表達(dá)基因是lncRNA。Qiao等[16]發(fā)現(xiàn)lncRNA-MSX2P1通過(guò)抑制miR-6731-5p和激活S100鈣結(jié)合蛋白A7(S100A7,銀屑素),促進(jìn)白細(xì)胞介素(IL)-22刺激的角質(zhì)形成細(xì)胞增殖,從而促進(jìn)銀屑病的發(fā)生,這說(shuō)明lncRNA在調(diào)節(jié)銀屑病發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。因此,m6A可能通過(guò)與lncRNA的XIST結(jié)合,使轉(zhuǎn)錄沉默,緩解銀屑病的發(fā)生。
2.3 環(huán)狀RNA(circRNA) circRNA由選擇性剪接產(chǎn)生,代表一類(lèi)特殊的ncRNA分子。circRNA在真核細(xì)胞細(xì)胞質(zhì)中含量豐富,有組織、行為和疾病特異性,其可以調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄或剪接,并與RNA結(jié)合蛋白相互作用[17]。最近,Zhou等[18]通過(guò)對(duì)m6A位點(diǎn)的全基因組定位,發(fā)現(xiàn)了circRNA中廣泛存在的m6A修飾,結(jié)果表明,circRNA中的m6As與mRNA中的m6A蛋白復(fù)合物有相同的“作者”和“閱讀器”蛋白復(fù)合物,而circRNA中的許多m6A位點(diǎn)與mRNA中的m6A位點(diǎn)存在顯著差異。Qiao等[19]首次使用微陣列對(duì)銀屑病中circRNA表達(dá)譜進(jìn)行了研究,結(jié)果銀屑病病灶hsa_circ_0061012顯著上調(diào),提示hsa_circ_0061012可能是銀屑病的候選生物標(biāo)志物。因此,m6A可能通過(guò)對(duì)circRNA的調(diào)控,直接或間接影響銀屑病。
m6A主要在Janus激酶-信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子(JAK/STAT)通路和Notch通路中發(fā)揮作用,而這2種通路在銀屑病的發(fā)病機(jī)制中也被證實(shí)有重要的作用,現(xiàn)作如下綜述。
3.1 JAK/STAT通路 JAK/STAT信號(hào)通路在調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答、干細(xì)胞調(diào)控和確定不同生物體的細(xì)胞特性方面起著至關(guān)重要的作用。JAK/STAT信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)開(kāi)始于JAK的激活,通過(guò)將生長(zhǎng)因子、干擾素(IFN)或IL等配體結(jié)合到特定的跨膜受體,JAK磷酸化相應(yīng)的STAT,活化的STAT將信號(hào)由細(xì)胞膜傳至細(xì)胞核,從而發(fā)揮多種生物學(xué)效應(yīng)[20]。最新研究發(fā)現(xiàn),m6A甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3通過(guò)介導(dǎo)JAK2/STAT3信號(hào)通路,通過(guò)YTHDF1/YTHDF2依賴(lài)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,在調(diào)節(jié)多能干細(xì)胞的多能性方面發(fā)揮重要作用[21]。細(xì)胞因子信號(hào)傳導(dǎo)抑制因子(SOCS)蛋白是JAK/STAT信號(hào)通路的關(guān)鍵生理抑制劑,在T細(xì)胞增殖和分化中起重要作用。Madonna等[22]發(fā)現(xiàn)SOCS1與SOCS3在銀屑病角質(zhì)形成細(xì)胞中大量表達(dá),其與銀屑病皮損區(qū)強(qiáng)烈的不良反應(yīng)密切相關(guān)。Galluzzo等[23]研究表明,托法替尼在JAK蛋白的ATP結(jié)合位點(diǎn)可以起到可逆、競(jìng)爭(zhēng)性的ATP抑制劑的作用,決定其失活,從而阻止下游的STAT蛋白激活,使STAT蛋白不能上調(diào)銀屑病相關(guān)的促炎基因,從而阻斷銀屑病進(jìn)程。m6A通過(guò)對(duì)SOCS靶向降解,在JAK/STAT信號(hào)通路中發(fā)揮重要作用,以控制T細(xì)胞的穩(wěn)態(tài),緩解銀屑病的發(fā)生。
3.2 Notch通路 Notch通路在決定細(xì)胞增殖和分化以及免疫細(xì)胞的發(fā)育和功能中起著重要作用[24]。Lv等[25]利用Cre/LoxP系統(tǒng)生成內(nèi)皮特異性的METTL3敲除小鼠,確定了METTL3介導(dǎo)的m6A修飾在Notch信號(hào)活性中發(fā)揮重要調(diào)控作用,在小鼠最終造血中起到不可或缺的作用。Skarmoutsou等[26]研究表明Notch通路對(duì)表皮細(xì)胞的正常維持和更新至關(guān)重要,而其失調(diào)可能與銀屑病皮膚表型有關(guān)。Abdou等[27]發(fā)現(xiàn)銀屑病皮膚中的Notch1表達(dá)上調(diào)。因此,m6A可能通過(guò)調(diào)控Notch信號(hào)活性,維持上皮穩(wěn)態(tài),調(diào)節(jié)炎性反應(yīng)發(fā)生,減緩銀屑病的進(jìn)程。
m6A作為免疫細(xì)胞穩(wěn)態(tài)和功能的關(guān)鍵調(diào)控因子,發(fā)揮維持Treg細(xì)胞的抑制性功能。信號(hào)傳導(dǎo)方面主要在JAK/STAT信號(hào)通路、Notch信號(hào)通路發(fā)揮功能,通過(guò)對(duì)SOCS靶向降解,控制T細(xì)胞的穩(wěn)態(tài),抑制炎性反應(yīng)的發(fā)生。同時(shí),m6A甲基化在非編碼RNA中促進(jìn)轉(zhuǎn)錄本的降解,可能在基因水平上緩解銀屑病的進(jìn)程。然而目前尚缺乏臨床實(shí)驗(yàn)、體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)直接闡明m6A與銀屑病發(fā)病的關(guān)聯(lián)與相關(guān)功能研究,今后針對(duì)性地進(jìn)行銀屑病中m6A修飾的研究,將補(bǔ)充研究者對(duì)銀屑病的認(rèn)識(shí)。