豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)是引起豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)的病原,該病毒分為兩個基因型(基因1 型和2 型)。基于ORF5 基因的遺傳演化分析顯示,基因2 型PRRSV 被劃分為9 個系,目前,在中國存在5 個系,包括1、3、5、8 和9 系。1系PRRSV 進(jìn)一步劃分為9 個亞系,包括1.1~1.9。2012 年,1 系PRRSV(NADC30-like PRRSV,1.8 亞系)在我國出現(xiàn),到2016 年,NADC30-like PRRSV 已經(jīng)在我國多個地方取代高致病性PRRSV(HP-PRRSV)成為主要的流行株。2017 年,我國遼寧省出現(xiàn)了NADC34-like PRRSV,屬于1 系中的1.5 亞系。隨后,福建省和黑龍江省相繼報道了NADC34-like PRRSV。那么,NADC34-like PRRSV 在我國的流行情況是怎樣的?未來對我國養(yǎng)豬業(yè)的危害有多大?這些都是當(dāng)前急需要解決的問題。
近期發(fā)表于《Transboundary and Emerging Diseases》上的一項研究,對2018 年~2019 年來自我國16個省、市和自治區(qū)的650 份疑似樣品進(jìn)行PRRSV 的檢測和基因組序列測定。結(jié)果顯示,PRRSV的檢出率為41.85%(272/650),其中NADC30-like PRRSVs 的陽性檢出率為54.41%(148/272),JXA1-like/CH-1a-like PRRSVs 的陽性檢出率為30.51%(83/272),QYYZlike PRRSVs 的陽性檢出率為7.35%(20/272),VR2332-like PRRSVs 的陽性檢出率為5.51%(15/272)。共檢測到6 株NADC34-like PRRSV,檢出率為2.21%(6/272),檢出NADC34-like PRRSV 的豬場均存在約10%~20%的流產(chǎn)率。氨基酸序列比對顯示,NADC34-like PRRSV 的NSP2 蛋白上均存在100 個氨基酸的連續(xù)缺失。遺傳演化分析顯示,它們均屬于1.5 亞系,而且我國的NADC34-like PRRSV 分為2 個群。重組分析結(jié)果表明,5/8 株NADC34-like PRRSV 為重組病毒,主要母本株均為IA/2014/NADC34,次要母本株為NADC30 或ISU30,重組的位置主要位于非結(jié)構(gòu)蛋白NSP1~NSP2 和結(jié)構(gòu)蛋白GP4~GP5。此外,即使在非洲豬瘟暴發(fā)的背景下,與2017 年相比,NADC34-like PRRSV 的檢出數(shù)量和檢出省份仍在持續(xù)增加,預(yù)示這類新病毒有逐步流行的可能。
該研究從是否形成獨立分支、在美國的流行情況、NSP2 是否各自形成一致的缺失模式、病毒起源、早期病毒的重組模式、全基因組序列同源性、分離地點及流行情況、早期病毒是否和本地病毒發(fā)生重組、以及出現(xiàn)時的背景等方面,對NADC34-like PRRSV 和NADC30-like PRRSV 進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)NADC34-like PRRSV 與NADC30-like PRRSV 相似,具有成為流行株的可能性。隨著非洲豬瘟得到有效控制,生豬養(yǎng)殖量逐漸恢復(fù),NADC34-like PRRSV 很有可能和本地病毒發(fā)生重組,而這類重組病毒極有可能像NADC30-like PRRSV 一樣,出現(xiàn)大范圍流行。
該論文詳細(xì)研究了NADC34-like PRRSV 在我國的流行情況、基因組分子特征、重組特征以及未來NADC34-like PRRSV 在我國的流行趨勢,為我國NADC34-like PRRSV 的監(jiān)測和疫病防控提供了重要參考。