冠狀病毒屬的病毒是具囊膜結(jié)構(gòu)的單股正鏈RNA 病毒，可感染人、鼠、豬、貓、犬、禽類等脊椎動物，引起包括哺乳動物和禽在內(nèi)的多種動物呼吸系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、泌尿生殖系統(tǒng)和神經(jīng)系統(tǒng)等不同程度的疾病。近年來多種新型冠狀病毒從不同動物中發(fā)現(xiàn)，并證實了這些新型病毒具備跨物種感染的趨勢，給動物或/和人類造成公共衛(wèi)生安全隱患，因此探究冠狀病毒的起源和進化研究越來越引起人們的重視。

雞傳染性支氣管炎病毒（Infectious Bronchitis virus,IBV）作為冠狀病毒的典型代表，最先是1931 年從雞身上發(fā)現(xiàn)。此后相繼從多種不同物種分離到不同類型的冠狀病毒。目前根據(jù)病毒基因型和血清學特征將現(xiàn)有的冠狀病毒分為α、β、γ、δ亞群冠狀病毒，其中α、β亞群病毒主要從哺乳動物中發(fā)現(xiàn)，γ亞群病毒主要從禽和海洋哺乳動物中發(fā)現(xiàn)，而δ亞群冠狀病毒主要發(fā)現(xiàn)于禽和豬。與IBV 同屬于γ亞群的其它冠狀病毒大多數(shù)從鳥類中分離出來，其中包括雞形目（雞，火雞，鵪鶉，珍珠雞，野雞和孔雀），雁形目（鴨，鵝，水鴨，天鵝和長尾鴨），鴿形目（鴿子），鵜形目（琵鷺），鰹鳥目（鸕鶿），鸻形目（紅腹濱鷸，蠣鷸和黑頭鷗）和雀形目（夜鶯）。在這些冠狀病毒中，造成危害嚴重的病毒主要是傳染性支氣管炎病毒和火雞冠狀病毒（TCoV）。IBV 由于病毒自身的復制酶缺乏校正功能，基因（尤其是與病毒組織嗜性和抗原性密切相關的S 基因）核苷酸序列易于突變、插入或重組，導致近年來病毒在宿主中不斷變異和演化，病毒的基因型和血清型呈現(xiàn)出復雜性和多樣性，并不斷有新的變異株在雞群中發(fā)現(xiàn)，從而導致傳染性支氣管炎疫病的防控形勢日趨嚴峻。

一般認為IBV 只感染各個日齡的雞，并造成不同臟器的病理損傷，不感染除雞以外的其它禽類，但近年來從部分野鳥和水禽中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒與IBV 高度相似，而且根據(jù)TCoV 的基因組研究分析結(jié)果推測TCoV 與IBV 遺傳關系密切，推測這些新出現(xiàn)的禽冠狀病毒很可能由IBV 在不同宿主中適應并進化而成，但一直以來缺乏可信的科學依據(jù)。中國農(nóng)業(yè)科學院哈爾濱獸醫(yī)研究所禽呼吸道病創(chuàng)新團隊近期發(fā)表于《Veterinary Microbiology》的一項研究工作報道了從我國山東和安徽地區(qū)養(yǎng)殖的雉雞群中首次分離獲得兩株雉雞冠狀病毒（分別命名為I0623/17 株和I0710/17 株），經(jīng)系統(tǒng)研究發(fā)現(xiàn)這兩株雉雞冠狀病毒（PhCoV）與IBV 高度相似。該項研究從病毒心態(tài)學、抗原性、血清學反應、病毒主要結(jié)構(gòu)蛋白基因、全基因組結(jié)構(gòu)以及病毒對雞和雉雞不同宿主的致病性等方面闡釋了PhCoV 和IBV 之間存在較近的遺傳關系，發(fā)現(xiàn)PhCoV 的ORF 和推導的氨基酸序列中存在與IBV 相似的點突變，缺失和插入現(xiàn)象，但并未發(fā)現(xiàn)重組現(xiàn)象，PhCoV 基因組中存在多個基因位點的這些替代積累，導致了病毒從雞到雉雞的宿主轉(zhuǎn)移，但并未導致致病性的變化。而與此相反的是，本研究分析了國外分離雉雞冠狀病毒S1基因與IBVS1 基因序列的相關性，發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)外已報到的不同疫情中分離的PhCoV 之間以及與本研究分離雉雞冠狀病毒之間并無顯著的親緣關系，反而與當?shù)亓餍械腎BV 具有遺傳相關性，且存在不同的進化模式和不同的組織嗜性，這一研究結(jié)果以充分的科學依據(jù)有效證實PhCoV 是在特定條件下由IBV通過適應雉雞并在雉雞群中獨立演化而來，揭示出雉雞冠狀病毒的起源和進化。這對于新型冠狀病毒的起源和遺傳演化研究以及相關病原防控理論的研究具有重要的科學指導意義。