陳奕馳
(西北工業(yè)大學(xué)附屬中學(xué) 西安 710000)
量子化學(xué)是利用量子力學(xué)研究化學(xué)問題,其核心是精確求解薛定諤方程。在量子力學(xué)中,粒子的狀態(tài)用波函數(shù)(概率分布函數(shù))來描述。為了描述粒子狀態(tài)變化的規(guī)律,需要找出波函數(shù)所滿足的運(yùn)動(dòng)方程,薛定諤方程夠滿足上述要求。
其中第一項(xiàng)表示電子動(dòng)能,第二項(xiàng)是電子互斥勢,第三項(xiàng)是電子與原子核的吸引勢,第四項(xiàng)是原子核之間的互斥勢,第五項(xiàng)是原子核的動(dòng)能項(xiàng)。
上述公式都是采用原子單位,原子單位可以使得各種計(jì)算公式中不需要涉及單位轉(zhuǎn)換,一方面使得代碼簡潔,另一個(gè)方面也可以避免額外的計(jì)算帶來的精度的損失。上述公式中電量的原子單位就是電子所帶電量的絕對值。能量的原子單位是hartree 相當(dāng)于2625.500 kJ/mol。
量子化學(xué)的核心問題是求解分子體系的薛定諤方程,但是由于沒有辦法精確求解,在實(shí)際求解中會用到各種近似,其中最常用的近似是Born-Oppenheimer 近似。[1]考慮到原子核的質(zhì)量是電子質(zhì)量的1780倍。原子核的運(yùn)動(dòng)相對于電子的運(yùn)動(dòng)非常慢,因此,把原子核的運(yùn)動(dòng)認(rèn)為是靜止的。此時(shí),對于公式2中的哈密頓量。原子核的動(dòng)能項(xiàng)為0,原子核之間的相互作用就是常數(shù)了。這樣只要考慮電子的運(yùn)動(dòng),原子核的位置作為參數(shù)處理,能夠減少計(jì)算量,使得關(guān)注點(diǎn)在電子的運(yùn)動(dòng)。除了Born-Oppenheimer近似外,還有有限基組近似。也就是說,我們在描述一個(gè)體系的時(shí)候,需要無數(shù)的基(向量)才能準(zhǔn)確描述,但是如果做泰勒展開的話,我們只保留展開式的前幾項(xiàng),后面的項(xiàng)都忽略,這樣也能極大減少計(jì)算量。
Hartree-Fock方法,又稱為自洽場迭代方法,是量子化學(xué)求解薛定諤方程的基礎(chǔ)方法,其他的方法都是在HF方法的基礎(chǔ)上發(fā)展而來的。我們觀察公式1可以發(fā)現(xiàn)。目前我們只知道H的表達(dá)式,而需要求解能量E,波函數(shù) 。一個(gè)公式中兩個(gè)未知數(shù),而且是等式兩邊都有需要求解的波函數(shù)。自洽場迭代的思想如下。首先,對波函數(shù) 進(jìn)行一個(gè)猜測,這樣,公式的左邊H和波函數(shù)都已知了,此時(shí)我們把波函數(shù)記為,通過薛定諤方程,我們可以求出公式右邊的E和波函數(shù)。我們把此次求得的結(jié)果記為E1和,然后我們把帶入到公式的左邊,繼續(xù)求解,得到E1和,如此循環(huán)下去,直到En和En+1之間的差足夠小。這個(gè)差值是我們自己設(shè)置的。一般是要小于1kJ/mol。此時(shí)可以認(rèn)為,我們求出了合適的能量E和波函數(shù)。這個(gè)過程是不斷循環(huán)迭代的,所以稱為自洽場迭代方法。實(shí)際計(jì)算的時(shí)候是矩陣計(jì)算,需要對矩陣進(jìn)行對角化計(jì)算。
量子化學(xué)計(jì)算精度的關(guān)鍵在于理論方法和基組兩個(gè)部分。如圖所示:
圖1 量子化學(xué)計(jì)算精度與理論方法、基組的關(guān)系
考慮到計(jì)算的體系大小和計(jì)算的資源等,我們需要做的是理論方法能夠和基組大小達(dá)到匹配。高精度的理論方法配合高質(zhì)量的基組,否則就是一種浪費(fèi)。
除了Hartree-Fock計(jì)算方法外,還有一種常見的計(jì)算方法是密度泛函方法。密度泛函方法是目前實(shí)際計(jì)算中廣泛使用的方法,能夠在可以接受的時(shí)間范圍內(nèi),給出較為精確的計(jì)算結(jié)果。密度指電子數(shù)密度;泛函是說能量是電子密度的函數(shù),而電子密度又是空間坐標(biāo)的函數(shù);函數(shù)的函數(shù),是為泛函(Functional)。[2]密度泛函理論是一種通過電子密度研究多電子體系電子結(jié)構(gòu)的方法。具體到操作中,密度泛函理論通過各種各樣的近似,把難以解決的包含電子-電子相互作用的問題簡化成無相互作用的問題,再將所有誤差單獨(dú)放進(jìn)一項(xiàng)中(XC Potential),之后再對這個(gè)誤差進(jìn)行分析。下圖給出了計(jì)算精度和時(shí)間花費(fèi)的關(guān)系。
圖2 計(jì)算精度與計(jì)算時(shí)間的關(guān)系
Gaussian是最早的一批量子化學(xué)計(jì)算程序,由1998年諾貝爾獎(jiǎng)獲得者John A.Pople從1970年起在卡內(nèi)基梅隆大學(xué)主導(dǎo)開發(fā)。該軟件功能全面,配合GaussView圖形界面。輸入文件的編寫是所有主流量化程序中最簡單的,能夠?qū)崿F(xiàn)很多的功能。包括對于基態(tài)、激發(fā)態(tài)、反應(yīng)過渡態(tài)的幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化;基態(tài)、激發(fā)態(tài)能量計(jì)算,化學(xué)鍵能計(jì)算,電子解離能和親合能的計(jì)算;對于紅外光譜,拉曼光譜,核磁共振譜的光譜計(jì)算;偶極矩,電荷分布,電荷密度,熱力學(xué)參數(shù)等的計(jì)算。
具體計(jì)算的時(shí)候,波函數(shù)是用原子軌道線性展開的。原子軌道是由基組構(gòu)成的??紤]到不同的計(jì)算要求,需要對基組添加極化函數(shù)和彌散函數(shù)。極化函數(shù)是用來描述分子軌道發(fā)生很大形變時(shí),更準(zhǔn)確地描述。例如,我們知道s軌道是個(gè)球形的,但是如果收到周圍電荷的影響,球形可能形變成橢球形,此時(shí),用極化函數(shù)可以描述這種變形。另外,在電子遷移的過程中,電子會彌散到整個(gè)空間,這個(gè)時(shí)候用彌散函數(shù)描述這種大的范圍的軌道性質(zhì),才能更真實(shí)反應(yīng)體系的性質(zhì)。同時(shí)需要注意的是,基組的變大會使得計(jì)算花費(fèi)的時(shí)間增大很多。
通過計(jì)算振動(dòng)頻率判斷乙酸、乙醛、丙酮中的羰基強(qiáng)弱。
在GView軟件中搭建乙酸分子,點(diǎn)擊Calculate,Job Type設(shè)置為Opt+Freq,Method設(shè)置為DFT下的B3LYP法和3-21G基組,打開Gaussian03W進(jìn)行計(jì)算,再用GView打開輸出文件,在Result一欄點(diǎn)擊Vibrations,在彈出的對話框中設(shè)置Show Displacement Vectors,點(diǎn)擊各個(gè)振動(dòng)頻率,觀察選中哪一個(gè)頻率時(shí)箭頭顯示為羰基的振動(dòng)頻率,將其記錄下來。完成后對乙醛、丙酮進(jìn)行相同操作。以上全部完成后,將基組改為6-31G,方法不變,重復(fù)全部操作。
圖3 B3LYP/6-31G 優(yōu)化后的(a)乙酸;(b)乙醛;(c)丙酮
表1 B3LYP/6-21g//6-31g乙酸、乙醛、丙酮羰基的振動(dòng)伸縮頻率的計(jì)算結(jié)果
羰基由強(qiáng)到弱排列順序:乙酸、乙醛、丙酮。
由于化學(xué)鍵振動(dòng)伸縮頻率越高強(qiáng)度越大,我們從計(jì)算結(jié)果可以得知在使用B3LYP方法的前提下,使用3-21G基組計(jì)算時(shí)得出的結(jié)論是羰基強(qiáng)度從強(qiáng)到弱順序?yàn)橐宜?、丙酮、乙醛,使?-31G基組時(shí)從強(qiáng)到弱順序則為乙酸、乙醛、丙酮。要試圖解釋此結(jié)果可以考慮從羰基氧和羰基碳原子的電荷分布入手,而這正是從輸出文件中可以得到的,具體數(shù)據(jù)見表2和表3。
表2 B3lyp/3-21G計(jì)算后的乙酸、乙醛和丙酮中羰基碳和羰基氧的電荷分布
由表2可見,用3-21G基組算出的羰基碳氧電荷差值的大小順序與羰基的相對強(qiáng)弱順序是吻合的,從靜電作用角度理解,碳原子和氧原子間更大的電荷差距使得正負(fù)電荷之間的庫倫相互作用增強(qiáng),對于鍵能的增益更加明顯。
表3 B3LYP/6-31G 計(jì)算后的乙酸、乙醛和丙酮中羰基碳和羰基氧的電荷分布
由表3可知,從羰基碳氧電荷差值大小順序來看,6-31G基組算得的結(jié)果與3-21G基組相同,皆為乙酸>丙酮>乙醛,但是從振動(dòng)伸縮頻率上看,6-31G基組算得的羰基強(qiáng)弱順序?yàn)橐宜幔疽胰颈?,與3-21G的結(jié)果以及6-31G的電荷差值結(jié)果不符。因?yàn)楸M管3-21G與6-31G屬于不同的基組,但是它們都屬于劈裂價(jià)鍵基組,對這兩個(gè)基組而言,每個(gè)價(jià)層電子軌道都會被劈裂為兩個(gè)基函數(shù),3-21G基組中價(jià)層電子軌道由3個(gè)和1個(gè)高斯型函數(shù)線性組合而成,每個(gè)內(nèi)層電子軌道由3個(gè)高斯型函數(shù)線性組合而成,而6-31G基組中后者為6個(gè),價(jià)層電子軌道由3個(gè)和1個(gè)高斯型函數(shù)線性組合而成,每個(gè)內(nèi)層電子軌道由6個(gè)高斯型函數(shù)線性組合而成,二者的結(jié)果為何不同還需要進(jìn)一步探索。
計(jì)算化學(xué)的發(fā)展幫助我們更好地理解實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象并且給出定量的解釋。但是同時(shí),我們要意識到很多時(shí)候,計(jì)算的結(jié)果和實(shí)驗(yàn)結(jié)果有出入的時(shí)候,要明確我們計(jì)算的物理量是否就是實(shí)驗(yàn)上的。比如,我們研究是羰基的鍵的活潑性,而不是羰基的鍵和鍵共同的。我們計(jì)算的頻率是雙鍵的頻率。因此,要做出區(qū)分。Gaussian軟件結(jié)合Gaussview軟件的作圖能幫助快速計(jì)算,并給出定量的結(jié)果去討論,而計(jì)算結(jié)果需要結(jié)合有機(jī)化學(xué)的知識去進(jìn)一步分析。