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長(zhǎng)鏈非編碼RNA在子宮內(nèi)膜異位癥中表達(dá)模式的研究現(xiàn)狀

2020-03-02 21:57:08蔡雪何征秦張廣美
關(guān)鍵詞:異位遺傳調(diào)控

蔡雪,何征秦,張廣美

子宮內(nèi)膜異位癥(endometriosis,EMs)是指有活性的子宮內(nèi)膜細(xì)胞種植在子宮內(nèi)膜以外的位置而形成的一種激素依賴(lài)性疾病。該病多發(fā)生于生育年齡的女性,絕經(jīng)后異位病灶可逐漸萎縮退化。其主要癥狀包括痛經(jīng)、慢性盆腔痛、性交痛、月經(jīng)異常及不孕,嚴(yán)重影響著育齡期女性的身心健康。臨床上主要依據(jù)測(cè)定血清糖類(lèi)抗原125(CA125)和影像學(xué)檢查輔助診斷及評(píng)估病情。然而EMs的準(zhǔn)確診斷方式、臨床分期及治療方案的制定主要依靠有創(chuàng)的腹腔鏡檢查。目前還沒(méi)有用于診斷EMs的特異性生物標(biāo)志物。即使手術(shù)切除異位病灶配合激素類(lèi)藥物治療,仍有約50%的EMs患者在5年內(nèi)復(fù)發(fā)[1]。EMs的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,推測(cè)有免疫缺陷、炎癥因子、經(jīng)血逆流、遺傳因素、醫(yī)源性EMs、著床假說(shuō)及侵襲黏附和血管生成等,但目前尚無(wú)全面系統(tǒng)的闡釋[2-4]。其主要病理表現(xiàn)為功能不良的子宮內(nèi)膜細(xì)胞凋亡減少和持續(xù)異位子宮內(nèi)膜(ectopic endometrium,EC)存活共同存在。近年來(lái),人們發(fā)現(xiàn)了多種長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)在基因調(diào)控上的作用,為探究EMs的發(fā)病機(jī)制提供了新的研究思路,本文就lncRNAs在EMs中表達(dá)模式的研究現(xiàn)狀及EMs與自身免疫疾?。╝utoimmune diseases)共病作用機(jī)制的新思路進(jìn)行綜述。

1 lncRNAs的分類(lèi)及功能

LncRNAs是一類(lèi)長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸的具有異質(zhì)性的非蛋白編碼RNA。其種類(lèi)繁多,數(shù)量遠(yuǎn)超過(guò)編碼基因,根據(jù)功能可分為:支架lncRNAs、向?qū)ncRNAs、誘餌lncRNAs或核轉(zhuǎn)錄抑制子、核糖體激活劑、競(jìng)爭(zhēng)內(nèi)源 RNAs(ceRNAs,又稱(chēng) lncRNAs海綿)和前體lncRNAs[5]。LncRNAs能夠在染色質(zhì)修飾、選擇性剪接、蛋白定位和活性上調(diào)節(jié)基因表達(dá),并能保護(hù) 3′非翻譯區(qū)(UTR)的信使 RNA(mRNA)不與微小RNA(miRNA)結(jié)合,增加其穩(wěn)定性[6]。

LncRNAs在基因調(diào)控的各個(gè)水平上都發(fā)揮著作用,包括表觀遺傳機(jī)制和核組織,以及RNA的加工、穩(wěn)定和翻譯[7]。其中,細(xì)胞核中特異表達(dá)的lncRNAs主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控和表觀遺傳修飾,而細(xì)胞質(zhì)中的lncRNAs主要參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控和翻譯后調(diào)控[8]。由于lncRNAs不僅在順式或反式中作為轉(zhuǎn)錄本,還可以作為影響重疊基因表達(dá)的副產(chǎn)物,或者在其基因組位點(diǎn)調(diào)節(jié)DNA元件,因此分析它們?cè)诎l(fā)育和疾病過(guò)程中的確切作用方式和功能比蛋白編碼基因更為復(fù)雜和困難[7]。

2 lncRNAs在EMs中的表達(dá)模式

2.1 尿路上皮癌相關(guān)蛋白1(UCA1) UCA1首次在膀胱移行細(xì)胞癌中被發(fā)現(xiàn),位于19p13.12正鏈上,序列評(píng)估表明其與人內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒H家族同源[9]。其有三個(gè)變異體,大小分別為1.4 kb、2.2 kb和2.7 kb,通過(guò)選擇性剪接產(chǎn)生[10]?;蛐酒芯勘砻?,UCA1在卵巢EMs患者中的表達(dá)受到抑制,提示UCA1可能參與了該病的發(fā)病過(guò)程[11]。此外,大多數(shù)卵巢子宮內(nèi)膜異位組織中UCA1的表達(dá)水平明顯降低,且UCA1的下調(diào)程度與卵巢EMs的嚴(yán)重程度呈正相關(guān)[12]。UCA1可能成為評(píng)估卵巢EMs分期和預(yù)后的生物標(biāo)志物。

2.2 印跡基因H19 H19是在癌癥、血管生成、糖尿病等領(lǐng)域研究最廣泛的lncRNAs之一。其在胚胎發(fā)育過(guò)程中高表達(dá),隨后漸漸被抑制。人H19是一個(gè)2.3 kb的RNA分子,由位于染色體11p15.5的H19基因編碼。H19基因與胰島素樣生長(zhǎng)因子2(Igf2)一起形成一對(duì)印跡基因,其表達(dá)主要局限于卵巢和子宮內(nèi)膜,在月經(jīng)周期和增殖期表達(dá)上調(diào)[13]。既往研究表明,H19的表達(dá)水平與EMs進(jìn)展相關(guān)。EMs患者的在位子宮內(nèi)膜組織中的H19表達(dá)顯著降低,H19表達(dá)的降低增加了miRNA let-7活性,從而在轉(zhuǎn)錄后水平抑制Igf1受體(Igf1r)表達(dá),進(jìn)而抑制了在位子宮內(nèi)膜間質(zhì)細(xì)胞(ESCs)的增殖,這可能是EMs患者不孕的機(jī)制之一[14]。H19在EMs患者異位子宮內(nèi)膜中的表達(dá)卻顯著升高,在敲除異位子宮內(nèi)膜細(xì)胞中的H19后,研究發(fā)現(xiàn)miR-124-3p表達(dá)上調(diào)而糖蛋白Ⅲa(ITGB3)表達(dá)下調(diào),異位子宮內(nèi)膜的增殖和侵襲力顯著降低[15],或?yàn)橹委熖峁┝诵碌陌悬c(diǎn)。有研究表明,雌激素/H19/miR-216a-5p/α平滑肌肌動(dòng)蛋白(ACTA2)途徑的改變調(diào)節(jié)了EMs在位子宮內(nèi)膜間質(zhì)細(xì)胞(EuESC)的轉(zhuǎn)移,其中H19或ACTA2的下調(diào)抑制了EMs患者EuESC的侵襲和遷移[16]。相反,另一項(xiàng)研究將H19過(guò)表達(dá)的慢病毒載體轉(zhuǎn)染CD4+T細(xì)胞后,觀察到過(guò)表達(dá)的H19通過(guò)調(diào)節(jié)miR-342-3p/人早期應(yīng)答基因3(IER3)抑制了Th17細(xì)胞分化誘導(dǎo)的子宮內(nèi)膜異位癥樣病變的生長(zhǎng)[17]。上述兩種相反的效應(yīng)可能是由于人口學(xué)差異造成,如種族差異,因此H19在EMs中的作用機(jī)制還需要深入研究。

2.3 轉(zhuǎn)移相關(guān)肺腺癌轉(zhuǎn)錄本1(MALAT1) MALAT1與多種疾病的發(fā)生、轉(zhuǎn)移和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化密切相關(guān)[18]。缺氧是導(dǎo)致EMs形成的重要微環(huán)境。EMs患者的異位子宮內(nèi)膜中MALAT1和自噬水平均上調(diào),其表達(dá)水平與缺氧誘導(dǎo)因子 1α(HIF-1α)呈正相關(guān)[19]。MALAT1的表達(dá)機(jī)制與P21上調(diào)激活細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)蛋白激酶/絲裂原活化蛋白激酶(ERK/MAPK)信號(hào)通路有關(guān)[20]。MALAT1可能通過(guò)P21/P53在ERK/MAPK途徑上控制細(xì)胞周期來(lái)調(diào)節(jié)卵泡顆粒細(xì)胞增殖,敲除MALAT1可導(dǎo)致細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)性激酶2(CDK2),細(xì)胞周期蛋白D1和磷酸化P38 MAPK蛋白水平降低[21]。另一項(xiàng)研究顯示,lncRNA BANCR的抑制劑可顯著降低EMs大鼠血清中ERK/MAPK信號(hào)通路的表達(dá),通過(guò)抑制EMs灶中血管生成因子的表達(dá),抑制異位子宮內(nèi)膜的增殖和發(fā)育[22]。因此,ERK在EMs的發(fā)生、發(fā)展和病理變化中起重要作用,抑制該信號(hào)通路的激活可作為治療EMs的新策略。MALAT1小干擾RNA(siRNA)的轉(zhuǎn)染抑制了MALAT1在子宮內(nèi)膜細(xì)胞中的表達(dá),增強(qiáng)了半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(caspase3)活性,降低了核因子 κB/誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(NF-κB/iNOS)或基質(zhì)金屬蛋白酶 9(MMP-9)的表達(dá)[23],抑制了細(xì)胞的增殖或侵襲。MALAT1可能通過(guò)NF-κB/iNOS途徑促進(jìn)子宮內(nèi)膜細(xì)胞凋亡并調(diào)節(jié)MMP-9表達(dá)[23],從而導(dǎo)致EMs的發(fā)生。

2.4 lncRNA LINC00261 已有研究證明LINC00261具有抑制EMs病灶增長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移的能力[24]。最新生物信息學(xué)分析、RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀(RIP)分析、RNA下拉實(shí)驗(yàn)和熒光素酶分析揭示了競(jìng)爭(zhēng)內(nèi)源RNA的作用機(jī)制,進(jìn)一步證實(shí)了LINC00261作為分子海綿直接與miR-132-3p結(jié)合調(diào)控BCL2L11基因的表達(dá)[25]。因此,LINC00261/miR-132-3p/BCL2L11調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可能成為治療EMs的新靶點(diǎn)。

2.5 其他 細(xì)胞黏附樣分子L1(CHL1)基因是神經(jīng)細(xì)胞黏附分子L1基因家族成員,其中CHL1-AS1和CHL1-AS2是CHL1 mRNA的兩個(gè)反義lncRNAs分子。與在位子宮內(nèi)膜組織相比,CHL1-AS1、CHL1-AS2及CHL1 mRNA表達(dá)水平在異位子宮內(nèi)膜組織中顯著上調(diào)。CHL1與CHL1-AS1和CHL1-AS2相互作用,參與EMs的發(fā)生發(fā)展[26]。MiR-6076可與CHL1-AS1或CHL1結(jié)合,調(diào)節(jié)CHL1的表達(dá),缺少miR-6076或CHL1過(guò)表達(dá)可部分挽救CHL1-AS1基因下調(diào)或miR-6076上調(diào)對(duì)細(xì)胞增殖和遷移的影響[27]。

AC002454.1是一種天然反義lncRNA[28],其與細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)性激酶6(CDK6)mRNA在EMs患者的異位子宮內(nèi)膜和在位內(nèi)膜組織中均高表達(dá)[29]。同時(shí),AC002454.1和CDK6均對(duì)在位內(nèi)膜細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲能力有正向調(diào)節(jié)作用,并能促進(jìn)細(xì)胞由G0/G1期向S期轉(zhuǎn)化[28]。因此,AC002454.1和CDK6可能協(xié)同作用于子宮內(nèi)膜細(xì)胞,促進(jìn)EMs的進(jìn)展。

HOXA11-AS1(同源盒A11反義lncRNAs)和部分同源盒A(HOXA)基因(主要包括HOXA9、HOXA10、HOXA11和 HOXA13)mRNA 在 EMs患者在位子宮內(nèi)膜的表達(dá)水平明顯低于異位子宮內(nèi)膜,提示HOXA11-AS1可能在腹膜EMs的發(fā)生發(fā)展中起一定作用[30]。

LncRNA-TC0101441位于1號(hào)染色體上,包含兩個(gè)外顯子,可以促進(jìn)卵巢上皮癌(EOC)增殖,介導(dǎo)雌二醇(E2)誘導(dǎo)的 EOC 細(xì)胞遷移[31-32]。TC0101441 在卵巢癌組織中高表達(dá),并且這種過(guò)表達(dá)與侵襲性臨床表型和不良預(yù)后密切相關(guān)[33]。臨床上發(fā)現(xiàn)TC0101441在異位子宮內(nèi)膜中的表達(dá)高于在位和正常子宮內(nèi)膜,TC0101441高表達(dá)的子宮內(nèi)膜異位囊腫基質(zhì)細(xì)胞(ECSCs)生成細(xì)胞外囊泡(EVs)后,EVs被低表達(dá)ECSCs內(nèi)化吸收,從而實(shí)現(xiàn)了TC0101441在ECSCs中的轉(zhuǎn)移,最終促進(jìn)子宮內(nèi)膜異位癥的遷移和侵襲[34]。該實(shí)驗(yàn)首次從“l(fā)ncRNAs的細(xì)胞外囊泡轉(zhuǎn)移”的角度提出了一種EMs遷移/侵襲的新機(jī)制[34],可以看出細(xì)胞外囊泡TC0101441作為EMs特異性標(biāo)志物的潛力。

3 lncRNAs可能在自身免疫性疾病與EMs中發(fā)揮橋梁作用

LncRNAs表達(dá)譜的改變?cè)诟鞣N疾病的發(fā)病機(jī)制中都被認(rèn)為是一個(gè)重要的影響因素?,F(xiàn)已證實(shí)其與人類(lèi)多種疾病尤其是免疫相關(guān)性疾病的發(fā)生密切相關(guān)。一項(xiàng)關(guān)于多發(fā)性硬化癥患者的研究顯示,與炎癥相關(guān)的包括MALAT1在內(nèi)的多種lncRNAs普遍表達(dá)失調(diào)[35]。遺傳、免疫和炎癥因素與在位子宮內(nèi)膜的黏附性和強(qiáng)侵襲性可能導(dǎo)致了EMs的發(fā)生。其中免疫學(xué)因素在EMs的發(fā)病機(jī)制和病理生理機(jī)制中起重要作用,EMs的慢性局部炎癥和自身抗體與自身免疫疾病有許多相似之處。

3.1 lncRNAs在免疫炎癥因子中的表達(dá)調(diào)控LncRNAs能夠調(diào)節(jié)免疫系統(tǒng)的反應(yīng)和基因的表達(dá),并顯示出生物功能的組織特異性和復(fù)雜性。這些分子可以在免疫細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化,天然免疫和獲得性免疫激活中起作用。LncRNAs在各種生物學(xué)和免疫學(xué)過(guò)程中起著關(guān)鍵作用,參與了機(jī)體固有免疫和適應(yīng)性免疫,有證據(jù)支持lncRNAs參與自身免疫性疾病和炎癥性疾病的發(fā)病機(jī)制[36],如lincRNA-Cox2、lnc-DC(一種在樹(shù)突狀細(xì)胞中作用的lncRNAs)等。生物信息學(xué)分析表明,lncRNAs在與EMs相關(guān)的多種重要途徑中富集,如甲狀腺激素合成途徑[37]。此外,在瞬時(shí)受體電位(Trp)離子通道和甲狀腺激素合成中發(fā)現(xiàn)豐富的炎癥介質(zhì),表明lncRNAs可能介導(dǎo)與EMs相關(guān)的炎癥和免疫因子的表達(dá)[37]。LncRNAs在炎癥反應(yīng)的進(jìn)展和管理中也可能發(fā)揮作用,一些非編碼RNA被證明是炎癥相關(guān)介質(zhì)的重要轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,如 miR-126、miR-132 和 miR-146,其作為具有診斷價(jià)值的生物標(biāo)志物,在評(píng)估預(yù)后、個(gè)體化治療中發(fā)揮指導(dǎo)作用[38]。免疫學(xué)證據(jù)表明,B細(xì)胞的表觀遺傳失調(diào),包括lncRNAs的異常表達(dá)、組蛋白修飾和DNA甲基化的改變,可導(dǎo)致機(jī)體產(chǎn)生致病性自身抗體[39]。

3.2 lncRNAs在遺傳機(jī)制中的表達(dá)調(diào)控 大多數(shù)致EMs的常見(jiàn)遺傳危險(xiǎn)因素位于調(diào)控DNA序列中,并改變了基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控[40]。自然調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Treg細(xì)胞)特異性表觀遺傳變化,如DNA低甲基化和增強(qiáng)子激活,可能與常見(jiàn)自身免疫性疾病的易感性有關(guān)[41]。具有增加EMs風(fēng)險(xiǎn)的變異基因組區(qū)域包括1號(hào)染色體上的lncRNA LINC00339和細(xì)胞分裂周期42(CDC42)基因,9號(hào)染色體上的 lncRNA CDKN2A-AS1和12號(hào)染色體上的VEZT基因(一種抑癌基因),但目前仍然缺少進(jìn)一步研究確認(rèn)這些區(qū)域及其他區(qū)域的致病基因通過(guò)遺傳機(jī)制導(dǎo)致EMs發(fā)生的具體途徑[40]。

4 展望

綜上所述,多種lncRNAs在細(xì)胞增殖、分化、侵襲、轉(zhuǎn)移和凋亡中發(fā)揮重要作用,其異常表達(dá)與EMs的發(fā)生發(fā)展及預(yù)后密切相關(guān)。異常表達(dá)的lncRNAs通過(guò)改變?cè)谖缓彤愇蛔訉m內(nèi)膜,內(nèi)分泌/旁分泌的影響以及生長(zhǎng)因子、細(xì)胞因子、免疫細(xì)胞和激素等免疫學(xué)方面的影響直接或間接參與了EMs的病理生理過(guò)程。隨著對(duì)lncRNAs研究的不斷深入,將會(huì)有更多種類(lèi)的lncRNAs被發(fā)現(xiàn),其表達(dá)、調(diào)控基因的方式也將會(huì)被更透徹地理解。結(jié)合lncRNAs在表觀遺傳學(xué)上的作用方式,或許將會(huì)為人類(lèi)打開(kāi)調(diào)控基因變異方向的大門(mén),為EMs的基因水平治療模式指明方向。

另外,EMs與自身免疫疾病在產(chǎn)生自身抗體、激素依賴(lài)、遺傳易感性等方面關(guān)系密切,對(duì)lncRNAs的進(jìn)一步研究可能揭示在EMs與自身免疫疾病之間存在共同的生物學(xué)途徑。若將自身免疫性疾病的免疫調(diào)節(jié)治療思路應(yīng)用于EMs的治療中,可能改善目前EMs激素和手術(shù)治療的缺點(diǎn)。但目前相關(guān)方面研究較少,需要進(jìn)行更大規(guī)模的研究來(lái)探討EMs是作為自身免疫病發(fā)病的危險(xiǎn)因素,抑或EMs是自身免疫病進(jìn)一步發(fā)展的結(jié)果,或者這兩種疾病具有共同的病理機(jī)制和途徑,從而導(dǎo)致它們共同發(fā)生。隨著該領(lǐng)域研究的不斷深入,lncRNAs在EMs中的表達(dá)模式及作用機(jī)制將日趨明朗,將會(huì)為進(jìn)一步的診斷與治療提供特異性的診斷標(biāo)志物和更加精確的治療靶點(diǎn)。

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