劉小柳 綜述,黃海麗,鄧玉容,肖昭君,張秀明 審校
(廣東省深圳市羅湖醫(yī)院集團醫(yī)學(xué)檢驗實驗室/深圳大學(xué)第三附屬醫(yī)院檢驗科,廣東深圳 518001)
病毒感染是引起急性呼吸道疾病的主要原因[1]。2003年暴發(fā)的嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)及2012年暴發(fā)的中東呼吸綜合征(MERS)均為冠狀病毒感染引起的急性呼吸道疾病。新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)感染導(dǎo)致的新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)是一種傳染性較強的急性呼吸道疾病,在世界范圍內(nèi)廣泛傳播,對全球的公共衛(wèi)生安全造成了巨大威脅[2-5]。全基因組測序和種系分析表明,SARS-CoV-2為冠狀病毒β屬,有包膜,顆粒呈圓形或橢圓形,基因組為線性單股正鏈RNA病毒,直徑60~140 mm,可引起人類呼吸道感染。SARS-CoV-2的基因組與蝙蝠SARS樣冠狀病毒(bat-SL-CoVZC45)的基因組同源性達85%以上,其基因組大小為29 891個核苷酸,包含兩端非翻譯區(qū)(UTR)基因和一個完整的開放閱讀框(ORF)基因,可編碼9 860個氨基酸[6]。SARS-CoV-2基因組排列順序為:5′-復(fù)制酶多聚糖蛋白(ORF1/ab)-結(jié)構(gòu)蛋白[刺突糖蛋白(S)-小包膜糖蛋白(E)-膜糖蛋白(M)-核衣殼蛋白(N)]-3′[6-7]。本文從流行病學(xué)、臨床特征、診斷技術(shù)、治療方法、感染控制與預(yù)防等方面對COVID-19的研究進展進行了綜述,現(xiàn)報道如下。
流行病學(xué)研究表明,COVID-19通過呼吸道飛沫或密切接觸傳播[4],潛伏期一般為5~7 d,最短可為1 d,最長可達10 d,患者在感染潛伏期內(nèi)癥狀不典型,甚至毫無癥狀,是 COVID-19的潛在傳染源[8],隔離觀察期一般設(shè)定為14 d。COVID-19可能源自市場或周邊地區(qū)攜帶SARS-CoV-2的蝙蝠或蝙蝠糞便[9]。除呼吸道飛沫傳播和接觸傳播外,消化道傳播可能也是COVID-19的另一條潛在傳播途徑。人群對COVID-19均普遍易感,主要的感染高危人群為老年人群和合并有基礎(chǔ)疾病的患者。
2.1臨床表現(xiàn) COVID-19與SARS具有許多相同的臨床表現(xiàn)[10]。COVID-19患者多以發(fā)熱、乏力、干咳為主要癥狀,部分可伴有鼻塞、流涕、咽痛和腹瀉等,輕型患者可僅表現(xiàn)為低熱、輕微乏力,重型患者可在感染1周后出現(xiàn)呼吸困難和低氧血癥,甚至迅速發(fā)展為急性呼吸窘迫綜合征、膿毒癥休克、代謝性酸中毒、凝血功能障礙,以及多器官功能障礙綜合征[11]。
2.2實驗室檢查 COVID-19實驗室檢查表現(xiàn)多樣,如外周血白細(xì)胞計數(shù)正?;驕p少,淋巴細(xì)胞絕對值減少,C反應(yīng)蛋白和紅細(xì)胞沉降率升高,D-二聚體和肌酸激酶水平升高[4];晚期患者可出現(xiàn)白細(xì)胞介素-6、腫瘤壞死因子-α、干擾素-γ等促炎細(xì)胞因子的明顯升高[12],具有“細(xì)胞因子風(fēng)暴”的特征。
2.3影像學(xué)檢查 所有疑似COVID-19的患者均建議接受肺部CT檢查[12]。確診患者早期肺部CT檢查特征表現(xiàn)為多發(fā)小斑片狀影和間質(zhì)改變,以肺外帶最為明顯;嚴(yán)重者可發(fā)展為雙肺多發(fā)磨玻璃影和間質(zhì)浸潤;胸腔積液少見[13]。
2.4組織病理學(xué) CHAN等[14]研究發(fā)現(xiàn),COVID-19患者肺部病理改變?yōu)榉翘禺愋匝仔苑磻?yīng),肺泡上皮細(xì)胞嚴(yán)重脫落,肺泡間隔增寬,以及肺間質(zhì)小動脈壁損傷,以上癥狀表明炎性反應(yīng)在整個疾病過程中發(fā)揮著重要作用。
COVID-19的臨床診斷基于中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會和國家中醫(yī)藥管理局推薦的一系列臨床標(biāo)準(zhǔn)[15],實驗室診斷主要包括病毒培養(yǎng)、核酸檢測、基因測序、血清學(xué)檢測等,具體原理與優(yōu)缺點如下。
3.1SARS-CoV-2分離培養(yǎng) 診斷病毒感染的基本條件是鑒定出病原體。病原體鑒定主要包括病毒分離和病毒核酸檢測2個方面,其中病毒分離是實驗室診斷病毒的“金標(biāo)準(zhǔn)”。病毒細(xì)胞培養(yǎng)能幫助實驗室順利進行下一步的細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和合成代謝研究,病毒經(jīng)過純化和鑒定后,既可為臨床診斷提供有效的序列,也能為病毒疫苗的研發(fā)和抗病毒藥物的研制,以及病毒致病機制的研究做出貢獻,但是多數(shù)病毒細(xì)胞培養(yǎng)出現(xiàn)病變需要5~10 d[16],培養(yǎng)周期長,靈敏度和特異度低,顯然不能滿足臨床快速準(zhǔn)確檢測病毒的需求,需要尋求其他的確診方法。
3.2核酸檢測 核酸檢測具有靈敏度、特異度高的特點,SARS-CoV-2核酸檢測陽性已被列為COVID-19的確診指標(biāo)。SARS-CoV-2的基因組為單鏈正向RNA[17-19],因此需通過反轉(zhuǎn)錄酶合成互補的cDNA鏈,再以cDNA鏈為基礎(chǔ)進行PCR擴增[20]。當(dāng)前SARS-CoV-2的核酸檢測方法包括反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)[21]、實時熒光定量PCR(RT-qPCR)、反轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)的等溫擴增(RT-LAMP)及實時RT-LAMP[22-23],但核酸檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性需要結(jié)合標(biāo)本類型、標(biāo)本采集、保存與運輸及患者感染進程等影響因素來綜合分析。了解不同標(biāo)本中SARS-CoV-2的水平變化是確診COVID-19及判斷患者治療效果和預(yù)后的關(guān)鍵。人員操作、核酸提取、試劑盒性能等均可能造成核酸檢測出現(xiàn)假陰性或假陽性結(jié)果,因此,實驗室在做好質(zhì)量控制的同時應(yīng)結(jié)合臨床評價及檢測數(shù)據(jù)進行分析,以確保結(jié)果的準(zhǔn)確性[24-25]。
3.3基因測序 病毒的全基因組測序是研究病毒進化、毒力因子變異的基礎(chǔ),對于完全未知的病毒,測序是必須的,其可以直接檢測病毒核酸堿基的排列順序。SARS-CoV-2與SARS冠狀病毒具有79.5%的同源性[26],與NC-004718、bat-SL-CoVZC45和蝙蝠中檢測到的冠狀病毒bat/Yunnan/RaTG13/2013具有極高的基因組序列相似度(分別為80%、88%、96%)[27]。國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心建立了SARS-CoV-2信息庫(https://bigd.big.ac.cn/ncov),為SARS-CoV-2的檢測試劑盒研發(fā)、抗病毒藥物靶點設(shè)計等相關(guān)研究提供了支持。目前,SARS-CoV-2的全部序列測序面臨著所需儀器昂貴,檢測時間較長,需專業(yè)生物信息學(xué)人員對檢測結(jié)果進行解讀,測序技術(shù)不適合大規(guī)模檢測等問題,因此,仍然需要開發(fā)更為簡便、經(jīng)濟、高效的檢測方法。
3.4血清學(xué)檢測 由于SARS-CoV-2表面帶有多種結(jié)構(gòu)蛋白,利用抗原與抗體特異性結(jié)合的原理,可通過檢測抗體或抗原來反映病毒的存在。SARS-CoV-2特異性IgM抗體多在患者發(fā)病3~5 d后被檢測出陽性,IgG抗體滴度在恢復(fù)期較急性期有4倍及以上增高[28]。目前,抗體血清學(xué)檢測主要采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)、間接免疫熒光試驗和膠體金免疫層析法[29]。北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心的團隊提出,對康復(fù)期COVID-19患者血液中的B細(xì)胞進行高通量單細(xì)胞測序,可找到多種SARS-CoV-2全人源抗體,通過對重組病毒蛋白進行ELISA檢測可篩選出與病毒表面S蛋白的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域(RBD)特異性結(jié)合的抗體。目前,體外細(xì)胞-活病毒結(jié)合試驗及中和試驗正在進行中。
4.1藥物治療 目前還未研發(fā)出治療COVID-19的特效藥物,只能采用非特異性治療措施來預(yù)防嚴(yán)重的并發(fā)癥,從而降低重型病例的發(fā)生率和病死率,常用方法包括:提供支持性護理和常規(guī)對癥治療,以及聯(lián)合中藥、激素類藥物進行治療。此外,研究發(fā)現(xiàn),廣譜抗菌藥物、抗病毒藥物、抗真菌藥物和干擾素能最大限度地降低SARS-CoV-2的感染風(fēng)險[29-30]。
目前,關(guān)于COVID-19藥物治療的研究中,第一類是基于病毒的藥物研究,主要包括核苷酸類似物和人類免疫缺陷病毒蛋白酶抑制劑,上述兩類藥物可以減弱病毒感染機體導(dǎo)致的臨床癥狀[31]。在CHEN等[32]的研究中,有75例患者接受了如下治療:每天口服75 mg奧司他韋、500 mg洛匹那韋、500 mg利托那韋2次,以及靜脈注射0.25 g更昔洛韋,療程為3~14 d(根據(jù)病情變化調(diào)整);在HUANG等[33]的研究中,所納入的41例患者中有38例接受了抗病毒治療;在WANG等[34]的研究中,接受奧司他韋治療的患者占89.9%(124/138);在GUAN等[35]的研究中,有35.8%(393/1 099)的患者接受了奧司他韋治療;LU[36]的研究表明,瑞德西韋在治療COVID-19中具有較大潛力。瑞德西韋是一種治療埃博拉病毒的核苷酸類似物[37],美國首例確診的COVID-19患者在靜脈注射瑞德西韋后血氧飽和度上升,雙下肺啰音消失[38]。瑞德西韋被世界衛(wèi)生組織認(rèn)為可能是目前唯一有效的COVID-19治療藥物,現(xiàn)已在多個國家啟動瑞德西韋的隨機、雙盲及安慰劑對照的Ⅲ期臨床試驗。其次,還有許多其他藥物正在研發(fā)中,包括臨床治療候選的EIDD-2801化合物,其已被證實具有治療季節(jié)性和大流行性流感病毒感染的潛力[39]。最后,鑒于中醫(yī)藥曾在SARS暴發(fā)、流行期間發(fā)揮了重要作用,因此,針對COVID-19,我國中醫(yī)藥專家推薦使用連花清瘟膠囊進行治療[40]。此外,針對臨床治療的不同階段,中醫(yī)藥專家也給出了不同中藥處方和中成藥治療方案供臨床選擇,但從藥物研發(fā)角度考慮,將一種天然藥物或中藥的化學(xué)成分開發(fā)成為新藥,其理論基礎(chǔ)、成藥性評價和基于循證醫(yī)學(xué)的研發(fā)過程必然會面臨嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。
4.2疫苗 目前,全球已有15種疫苗候選產(chǎn)品正在試驗驗證階段[41],運用的技術(shù)有信使RNA、基于DNA的納米顆粒、合成和修飾的病毒樣顆粒等。目前,已知的SARS-CoV-2候選疫苗都具有安全性高、耐受性良好的特征,并能夠在研究者中引發(fā)相應(yīng)且適當(dāng)?shù)拿庖叻磻?yīng)[42]。位于SARS-CoV-2外膜S蛋白中的RBD介導(dǎo)受體在病毒進入宿主細(xì)胞時發(fā)揮主要作用[43],由于其是中和抗體的主要靶標(biāo)[44],因此可以作為潛在的疫苗候選物,以其為研究方向進行研究或許可有助于在短時間內(nèi)大規(guī)模生產(chǎn)出針對SARS-CoV-2感染的潛在有效疫苗或治療劑。
COVID-19的控制與預(yù)防仍是當(dāng)前疾病研究的重點。為了減少COVID-19的感染率和病死率,避免更大規(guī)模的暴發(fā)和流行,迫切需要采取公共衛(wèi)生和感染控制措施以限制SARS-CoV-2的全球性傳播[43]。根據(jù)應(yīng)對MERS和SARS的相關(guān)經(jīng)驗[45],當(dāng)前的首要任務(wù)是通過早期隔離感染人群、控制傳染源等疫情預(yù)防控制手段切斷病毒傳播,同時早期診斷和隔離可在一定程度上減少聚集性發(fā)病,也可為重癥患者爭取更多的治療時間。充分利用目前有限的藥物治療證據(jù),制訂預(yù)防、控制和防止病毒傳播的藥物應(yīng)用戰(zhàn)略也是預(yù)防控制工作的關(guān)鍵。
目前,全國各地都應(yīng)建設(shè)防疫基礎(chǔ)設(shè)施,例如“小湯山”模式醫(yī)院和隔離病房;應(yīng)當(dāng)采取檢疫措施,及時公布疫情信息,以避免不必要的恐慌;個人避免病毒感染的最佳方法是遠(yuǎn)離感染者,并保證個人衛(wèi)生防護,例如勤洗手、戴口罩、通風(fēng),避免與感染者密切接觸,避免食用生或半熟的肉類、蛋類,遵循良好的食品安全規(guī)范,倡導(dǎo)文明的生活方式,嚴(yán)厲打擊非法買賣、食用野生動物。
COVID-19的暴發(fā)與流行無疑是對全球公共衛(wèi)生應(yīng)急反應(yīng)能力的一次巨大挑戰(zhàn),但由于SARS-CoV-2的錯配修復(fù)機制不完善,易引起變異,其是否會在頻繁的變異中獲得新的特性,表現(xiàn)出更強的傳染性和致病性?COVID-19無癥狀感染者、潛伏期和恢復(fù)期患者是否會成為新的傳染源?SARS-CoV-2是否會成為人類循環(huán)病毒?能否用病理解剖揭示COVID-19患者多器官的病理學(xué)、病理生理學(xué),乃至免疫組織化學(xué)等方面的改變?以上問題目前仍不明確。因此,有待深入研究SARS-CoV-2的進化起源、致病機制、病毒檢測、特效藥物的研究、疫苗效果及安全性等問題,施行以科學(xué)證據(jù)為基礎(chǔ)的疫情預(yù)防控制措施,同時完善公共衛(wèi)生及重大疫情管理體制。