牛永志 王國平 鄭昀曄 馬文廣
摘 要:二酰甘油?;D(zhuǎn)移酶(DGAT)是三酰甘油合成的關(guān)鍵酶和唯一限速酶。在煙草中鑒定DGAT 基因?qū)τ谘芯坑椭x途徑和創(chuàng)造具有附加值的新型油料作物具有重要意義。本研究從煙草基因組鑒定DGAT 家族基因,并對序列特性、基因結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位、進(jìn)化模式、表達(dá)模式等進(jìn)行分析。結(jié)果表明,共獲得25 個(gè)煙草DGAT 家族蛋白,其平均氨基酸長度為485,大部分為堿性蛋白和親水性蛋白,有13 個(gè)DGAT 蛋白定位到8 條連鎖群上;有16 個(gè)蛋白定位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),6 個(gè)定位葉綠體,3 個(gè)定位到胞外;煙草DGAT 蛋白包含典型的WS_DGAT 結(jié)構(gòu)域和LPLAT 結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)發(fā)育樹將DGAT 家族分為DGAT1、DGAT2、DGAT3 和WSD 等4 個(gè)類群,但煙草DGAT 僅劃分到DGAT2 和WSD 兩個(gè)類群;不同煙草DGAT基因的時(shí)空表達(dá)特性有所差異,并表現(xiàn)出一定的組織特異性,主要集中在衰老葉片和花器官中大量表達(dá)。
關(guān)鍵詞:基因家族;DGAT;煙草;生物信息
植物油脂不僅可作為細(xì)胞膜組成的脂肪酸供體,還可以以三酰甘油(Triacylglycerol,TAG)的形式存貯,作為真核生物主要的能量來源,對植物生長發(fā)育具有重要作用[1]。同時(shí),植物油含有豐富的不飽和脂肪酸,是人類健康飲食的重要物質(zhì)。植物油脂經(jīng)甲基化處理后也可作為一種可再生生物柴油,在替代石油燃料方面具有潛在價(jià)值[2]。因此,了解油脂的生物合成也將有助于創(chuàng)造具有附加值的新型油料作物。
三酰甘油是油脂貯藏的一種主要形式。雖然在不同的器官和組織中,三酰甘油的生物合成存在多種途徑[3],但最經(jīng)典的還是三磷酸甘油途徑(Kennedy途徑)[4]。在該途徑中,二酰甘油?;D(zhuǎn)移酶(Diacylglycerol acyltransferase, DGAT)催化最后一步反應(yīng),將二酰甘油轉(zhuǎn)化為三酰甘油,是影響三酰甘油含量的關(guān)鍵酶,也是唯一的限速酶[5]。目前,DGAT 基因家族共發(fā)現(xiàn)4 種亞型,分別為DGAT1、DGAT2、DGAT3 和WS/DGAT。其中DGAT1、DGAT2 是主要亞型,在大多數(shù)真核生物中廣泛存在。DGAT1 已經(jīng)在旱金蓮[6]、蓖麻[7]、玉米[8]、芝麻[9]、油菜[10]等作物中被鑒定,DGAT2 已經(jīng)在蓖麻[11]、油桐[12]、油菜[10]、橄欖[13]等作物中被鑒定。研究表明DGAT1 和DGAT2 在真核生物進(jìn)化過程中是獨(dú)立進(jìn)化的,并且其功能趨于同質(zhì)化[14]。DGAT3 和WS/DGAT 是近幾年發(fā)現(xiàn)的亞型,只在很少的作物中被報(bào)道。其中DGAT3 是一種可溶性酶,在花生[15]和擬南芥[16]等作物中被鑒定。WS/DGAT 是一種雙功能酶,其主要功能是催化蠟酯的合成,同時(shí)也參與少量TAG 的合成[17-18]。與DGAT1 和DGAT2 一樣,DGAT3 和WS/DGAT 似乎也是獨(dú)立進(jìn)化的[19]。
煙草是一種葉用經(jīng)濟(jì)作物,但其種子油含量高,總體上占到種子重量的33.6%~39.4%,有的甚至可以達(dá)到48%[20]。而且煙籽油營養(yǎng)價(jià)值高,不飽和脂肪酸含量高于橄欖油、茶籽油、大豆油、玉米油、芝麻油、亞麻油等,僅次于核桃油[21-22],可以作為一種潛在的食用油。此外,煙草種子油經(jīng)過酯交換反應(yīng)后也可用于可再生生物燃油[23]。目前,煙草中的一個(gè)DGAT 基因已經(jīng)被鑒定[24],但還有很多基因功能尚待解析。本研究利用生物信息學(xué)方法對煙草DGAT 基因家族進(jìn)行系統(tǒng)分析,為深入研究油脂代謝途徑以及培育高油含量煙草新品種奠定基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 DGAT 基因家族序列鑒定與特征分析
本研究從茄科數(shù)據(jù)庫(https://solgenomics.net/)下載普通煙草品種K326 的基因組數(shù)據(jù)(2017 年發(fā)布,包括GFF 文件、蛋白序列文件和核酸序列文件)。通過兩種方式獲得煙草DGAT 家族基因,一種是從Pfam 數(shù)據(jù)庫(http://pfam.xfam.org/)下載DGAT 基因家族的HMM模型文件(PF03982),利用HMMER3.0 軟件檢索煙草基因組數(shù)據(jù),E 值設(shè)為1e-5;另一種是以擬南芥的DGAT1(At2g19450)、DGAT2(At3g51520)、DGAT3(At1g48300)和WSD1(At5g37300)為參考序列,通過HMMER 3.0 軟件構(gòu)建HMM 模型,然后利用該模型檢索煙草基因組數(shù)據(jù),E 值設(shè)為1e-5。將兩種方式獲得的基因去除重復(fù)后,即為初始的煙草DGAT 家族基因。然后將初始基因上傳至Pfam 網(wǎng)站進(jìn)行結(jié)構(gòu)域預(yù)測,E 值設(shè)為1e-5,剔除不含DGAT 家族典型蛋白結(jié)構(gòu)域的序列,剩余的即為煙草DGAT 基因家族成員。
利用ExPaSy 網(wǎng)站(https://www.expasy.org/)的ProtParam 工具分析蛋白的氨基酸含量、分子量、等電點(diǎn)、脂肪族氨基酸指數(shù)和疏水性指數(shù)等理化性質(zhì)。從GFF 文件中提取基因的染色體位置。
1.2 亞細(xì)胞定位及跨膜區(qū)預(yù)測
利用在線網(wǎng)站Softberry(http://linux1.softberry.com/)的ProtComp 工具進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測。利用在線工具TMHMM 2.0(www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/)進(jìn)行跨膜區(qū)預(yù)測。
1.3 進(jìn)化樹構(gòu)建
從Uniprot 數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org)分別下載擬南芥、大豆、油菜、水稻的部分DGAT 基因(表1)。利用MEGA 軟件進(jìn)行多序列比對(采用ClustalW 比對方式,默認(rèn)參數(shù)),并構(gòu)建NJ 樹(檢驗(yàn)方法為Bootstrap 法,檢驗(yàn)次數(shù)設(shè)為1000 次,gap處理選擇Pairwise Deletion)。利用在線網(wǎng)站iTOL(https://itol.embl.de/)對進(jìn)化樹進(jìn)行可視化。
1.4 蛋白結(jié)構(gòu)域及基因結(jié)構(gòu)分析
利用在線網(wǎng)站MEME(http://meme-suite.org/)進(jìn)行保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測,Motif 長度范圍為6~100,檢索的最大Motif 數(shù)為10,其他選擇默認(rèn)參數(shù)。利用在線網(wǎng)站EvolView(https://www.evolgenius.info/evolview/#login)對蛋白結(jié)構(gòu)域進(jìn)行可視化。利用NCBI 的CDD 工具(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/?term=)鑒定結(jié)構(gòu)域的類型。利用TBtools 軟件對基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行可視化。
1.5 表達(dá)模式分析
煙草基因表達(dá)圖譜(TobEA)由EDWARDS 等于2010 年發(fā)布,該圖譜包含了早期衰老葉、中早期衰老葉、中后期衰老葉、后期衰老葉、成熟葉、莖生葉、幼葉、上部莖、下部莖、成熟根、幼根、種子、未開花蕾、開放花蕾、花朵、幼芽、莖頂端、子葉和花頂端19 個(gè)樣品組織,貫穿從種子萌發(fā)到植株衰老的整個(gè)生命周期。從EMBL-EBI 網(wǎng)站下載TobEA數(shù)據(jù),登錄號為E-MTAB-176(http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-176/),通過blastp 比對檢索DGAT 家族成員匹配的樣品編號,通過樣品編號獲取對應(yīng)的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)。將數(shù)據(jù)整理后利用Cluster 3.0 軟件和Java TreeView 工具繪制熱圖。
2 結(jié) 果
2.1 不同物種DGAT 家族基因統(tǒng)計(jì)
根據(jù)以往研究報(bào)道[25-26],DGAT 基因家族已在14 種被子植物中得到鑒定(表2)。除了向日葵中沒有鑒定到DGAT2 和DGAT3 基因,其他物種中的DGAT 家族均包含4 種類型,其中數(shù)量較多的是花生(46 個(gè))、油菜(35 個(gè))和大豆(28 個(gè))。整體上看,雙子葉植物比單子葉植物的DGAT數(shù)量更多,WSD 亞型的基因數(shù)量比其他亞型更多。本研究中共鑒定得到煙草DGAT 家族基因25 個(gè),數(shù)量僅次于大豆,其中包含17 個(gè)WSD 基因和8 個(gè)DGAT基因。
2.2 煙草DGAT 基因特征分析
分析DGAT 家族基因的序列特征發(fā)現(xiàn)(表3),平均氨基酸長度為485,范圍在213~724 之間;平均分子量為54521.81 kDa , 范圍在23855.26~81470.47 kDa 之間;平均等電點(diǎn)為8.34,范圍在6.05~9.42 之間,其中酸性蛋白(等電點(diǎn)小于7)有4 個(gè),堿性蛋白(等電點(diǎn)大于7)有21 個(gè),大部分的蛋白質(zhì)呈堿性;平均脂肪族氨基酸指數(shù)為95.52,范圍在85.54~105.96 之間;平均疏水性指數(shù)為-0.13,范圍在-0.39~0.26 之間,除了NtDGAT1 和NtDGAT2 表現(xiàn)為疏水性,其余全部表現(xiàn)為親水性,NtDGAT1 和NtDGAT2 可能參與了細(xì)胞膜的組成。
染色體定位分析顯示(表3),有13 個(gè)煙草DGAT 基因定位到8 條連鎖群上,其中19 號連鎖群含有最多的4 個(gè)基因,13 和17 號連鎖群分別含有2 個(gè)基因,2、3、6、21 和23 號連鎖群上分別含有1 個(gè)基因。其余12 個(gè)DGAT 基因分別定位到不同的Scaffold 上。
2.3 亞細(xì)胞定位分析與跨膜區(qū)預(yù)測
亞細(xì)胞定位分析顯示(表3),有16 個(gè)基因(NtDGAT1、NtDGAT2 以及NtWSD1~NtWSD14)定位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),有6 個(gè)(NtDGAT3~NtDGAT8)定位到葉綠體,有3 個(gè)(NtWSD15~NtWSD17)定位到胞外。以往研究表明DGAT1 和DGAT2 亞型蛋白是一種膜結(jié)合蛋白,而且主要在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,WSD亞型蛋白表現(xiàn)出多樣性,一些是可溶性蛋白,其余是膜結(jié)合蛋白[27]。水溶性蛋白可能定位于胞外,而膜結(jié)合蛋白可能定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或葉綠體,這與本研究結(jié)果一致。跨膜區(qū)預(yù)測結(jié)果顯示,NtDGAT1 和NtDGAT2 分別包含2 個(gè)跨膜區(qū),NtWSD5、NtWSD7、NtWSD11 和NtWSD12 分別包含1 個(gè)跨膜區(qū),其余蛋白沒有檢測到跨膜區(qū)。結(jié)合疏水性指數(shù)、亞細(xì)胞定位和跨膜區(qū)預(yù)測結(jié)果,說明NtDGAT1 和NtDGAT2是一種膜蛋白。
2.4 進(jìn)化分析
選取水稻(7 個(gè))、擬南芥(4 個(gè))、油菜(11個(gè))和大豆(13 個(gè))的DGAT 家族基因(表1),與本研究鑒定的25 個(gè)煙草DGAT 家族基因一同構(gòu)建進(jìn)化樹。結(jié)果顯示(圖1),整個(gè)進(jìn)化樹分為DGAT1、DGAT2、DGAT3 和WSD 4 個(gè)類群,但是煙草DGAT基因僅劃分到DGAT2 和WSD 兩個(gè)類群,其中NtDGAT1~NtDGAT8 劃分到DGAT2 類群中,NtWSD1~NtWSD17 劃分到WSD 類群中,煙草中未發(fā)現(xiàn)DGAT1 和DGAT3 亞型基因。大部分的煙草基因是聚在一起的,其中NtDGAT3~NtDGAT8 基因聚在一簇,NtWSD1~NtWSD13 基因聚在一簇,共形成了10 個(gè)姊妹系,這說明煙草中存在大量冗余基因,可能是在進(jìn)化過程中發(fā)生了基因復(fù)制。不同的是,煙草NtDGAT1 和NtDGAT2 基因與大豆的GmDGAT2a 、GmDGAT2b 、GmDGAT2d 和GmDGAT2e 單獨(dú)聚在一起, 煙草NtWSD15~NtWSD17 與大豆GmWSD1~GmWSD3 單獨(dú)聚在一起,它們的功能可能更相似。而且亞細(xì)胞定位結(jié)果也顯示,這些基因與其他基因的定位結(jié)果不同,這也進(jìn)一步說明了這些基因的特殊性。從進(jìn)化時(shí)間上看,各類群中均分布有水稻、擬南芥、油菜和大豆基因,這說明DGAT 家族基因的分化時(shí)間可能早于物種的分化時(shí)間。從親緣性上看,油菜、擬南芥、大豆和煙草之間的親緣關(guān)系更近,水稻與他們的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),因?yàn)樗緦儆趩巫尤~植物,而其他屬于雙子葉植物。此外,DGAT1 和DGAT2亞型聚在一簇,其親緣關(guān)系較近,而DGAT3 和WSD亞型分別聚成一簇,與DGAT1 和DGAT2 亞型親緣關(guān)系較遠(yuǎn),這與以往研究結(jié)果一致。
2.5 蛋白結(jié)構(gòu)域與基因結(jié)構(gòu)分析
由于WSD 亞型的主要功能是參與蠟酯的合成,其次參與少量TAG 的合成,與DGAT1、DGAT2 和DGAT3 亞型在功能和結(jié)構(gòu)上差異較大,所以,本研究單獨(dú)分析了WSD 亞型的蛋白結(jié)構(gòu)域。結(jié)果顯示(圖2a),WSD 亞型蛋白檢測到2 個(gè)WS_DGAT 結(jié)構(gòu)域(motif1 和motif2),除了NtWSD13 缺失了motif2 和NtWSD14 缺失了motif1 外,其余的WSD基因都包含了2 個(gè)WS_DGAT 結(jié)構(gòu)域(motif1 和motif2)。另外,也檢測到4 個(gè)功能未知的結(jié)構(gòu)域DUF1298(motif4、motif5、motif9 和motif10)。DGAT亞型蛋白檢測到3 個(gè)LPLAT(LysophospholipidAcyltransferases)結(jié)構(gòu)域(motif11、motif16、motif20)和一個(gè)Hydrolase_4 結(jié)構(gòu)域(motif14)。其中,LPLAT是一個(gè)溶血磷脂?;D(zhuǎn)移酶超基因家族,催化甘油磷脂的合成。LPLAT 包含了GPAT、AGPAT、MGAT、LPEAT、LPCAT、DHAPAT、TAZ 等眾多成員。Hydrolase_4 是一個(gè)水解酶家族。NtDGAT1 和NtDGAT2 檢測到所有的3 個(gè)LPLAT 結(jié)構(gòu)域,其余的僅檢測到2 個(gè)LPLAT 結(jié)構(gòu)域(motif11 和motif16)。除了NtDGAT1、NtDGAT2 和NtDGAT4 外,其余均檢測到Hydrolase_4 結(jié)構(gòu)域。
基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示(圖2b),聚成一簇的基因結(jié)構(gòu)相似,WSD 亞型基因序列平均外顯子數(shù)目為6.24 個(gè),范圍為2~8 個(gè),DGAT 亞型基因序列平均外顯子數(shù)目為11.25 個(gè),范圍為5~14 個(gè)。WSD亞型基因外顯子數(shù)目相對較少,基因序列相對較短。這在一定程度上也反映了基因的進(jìn)化關(guān)系。
2.6 基因表達(dá)分析
基因表達(dá)分析結(jié)果顯示(圖3),不同基因的表達(dá)模式有所差異,并表現(xiàn)出一定的組織特異性?;騈tDGAT1~NtDGAT8 的表達(dá)模式類似,在未開放花蕾、已開放花蕾、花頂端和花等花器官以及莖生葉中的表達(dá)量均較低,在早期、早中期、中后期、后期衰老葉、成熟葉等葉片以及幼芽中的表達(dá)量均較高,在種子、幼葉、子葉、莖尖等幼嫩組織以及上部莖中的表達(dá)量中等。但其中基因NtDGAT1、NtDGAT2、NtDGAT3 和NtDGAT5 在下部莖、成熟根、幼根中的表達(dá)量較高,而基因NtDGAT4、NtDGAT6、NtDGAT7 和NtDGAT8 在這些組織中的表達(dá)量中等?;騈tWSD13、NtWSD14 和NtWSD15除了在種子、幼葉和莖尖的表達(dá)量較低外,在其余組織中的表達(dá)情況與NtDGAT1 、NtDGAT2 、NtDGAT3 和NtDGAT5 的表達(dá)模式基本一致?;騈tWSD16 和NtWSD17 在幼芽、子葉、幼葉和莖端的表達(dá)量較高,在花和幼根中的表達(dá)量較低,在其余組織中的表達(dá)量趨于中等?;騈tWSD1~NtWSD12 的表達(dá)模式相似,并且與基因NtDGAT1~NtDGAT8 的表達(dá)模式相反,在未開放花蕾、已開放花蕾、花頂端和花等花器官以及莖生葉中的表達(dá)量均較高,在早期、早中期、中后期、后期衰老葉、成熟葉以及幼芽中的表達(dá)量均較低,在種子、幼葉、子葉、莖尖等幼嫩組織以及上部莖中的表達(dá)量中等??傮w來看,DGAT 家族基因主要集中在衰老葉片和花器官中大量表達(dá)。
3 討 論
植物DGAT基因?qū)刂朴椭暮铣删哂兄匾饔谩D壳?,雖然在一些植物中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了不同的DGAT 基因,但尚未得到全面的解釋,因此,關(guān)于植物中TAG 合成的基因還需要更深入的研究。利用生物信息學(xué)方法鑒定DGAT 基因家族,并對其序列特性、基因結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位、進(jìn)化模式和表達(dá)模式等進(jìn)行系統(tǒng)分析,對于更好地理解它們在TAG生物合成中的作用至關(guān)重要。
在物種進(jìn)化過程中,發(fā)生過多次的基因復(fù)制和全基因組復(fù)制事件,這也助推了基因和物種的進(jìn)化和多樣化[28-29]。本研究共鑒定到煙草DGAT 家族基因25 個(gè),數(shù)量僅次于花生(46 個(gè))、油菜(35 個(gè))和大豆(28 個(gè))。油菜、花生和煙草都是異源四倍體,大豆是由古四倍體演變而來的二倍體,這些作物含有較多的基因數(shù),很可能是由于在進(jìn)化過程中發(fā)生全基因組復(fù)制所致。
DGAT 家族的亞細(xì)胞定位存在差異,亞型DGAT1 和亞型DGAT2 大多定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,但是其位置并不重疊,桐樹的DGAT1 和DGAT2 定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的不同點(diǎn)狀區(qū)域,功能也沒有發(fā)生冗佘[12]。大豆DGAT2a 主要定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜和油體膜上,菠菜葉中DGAT1 主要定位在葉綠體中[30],而亞型DGAT3 是一種可溶性蛋白,存在于細(xì)胞質(zhì)中[15]。亞型WSD 蛋白表現(xiàn)出多樣性,一些是可溶性蛋白,其余是膜結(jié)合蛋白[27]。本研究中,NtDGAT1 和NtDGAT2 定位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,NtDGAT3~NtDGAT8 定位到葉綠體上,它們可能屬于膜蛋白,只是大部分定位到葉綠體而非內(nèi)質(zhì)網(wǎng),這與以往結(jié)果有所差異。此外,大部分WSD 蛋白(NtWSD1~NtWSD14)定位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,可能屬于膜結(jié)合蛋白,少量WSD蛋白(NtWSD15~NtWSD17)定位到胞外,可能屬于可溶性蛋白,這與以往報(bào)道一致。結(jié)合疏水性指數(shù)、亞細(xì)胞定位和跨膜區(qū)預(yù)測3 個(gè)結(jié)果,可以確定NtDGAT1 和NtDGAT2 是一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜結(jié)合蛋白。
進(jìn)化分析結(jié)果顯示,DGAT1、DGAT2、DGAT3和WSD 亞型分別單獨(dú)聚成一簇,這說明DGAT 家族基因的分化早于物種分化時(shí)間,或者類似于DGAT1 和DGAT2,有獨(dú)立的起源[14],這與以往研究結(jié)果一致[19]。研究報(bào)道,DGAT1 和DGAT2 與DGAT3 和WS/DGAT 相似性較低[14,19]。而本研究中也表現(xiàn)出相似的結(jié)果,DGAT1 和DGAT2 亞型聚在一簇,其親緣關(guān)系較近,而DGAT3 和WSD 亞型分別聚成一簇,與DGAT1 和DGAT2 亞型親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
DGAT 基因主要參與了油脂的積累,還參與植物種子萌發(fā)、幼苗發(fā)育和葉片衰老等生物過程中的脂類的代謝,因此,DGAT 基因應(yīng)該在種子、花朵、葉片等眾多組織中都有表達(dá),但表達(dá)水平具有組織特異性。研究表明,旱金蓮DGAT1 只在發(fā)育的種子中表達(dá)[6]。蓮座DGAT1 基因的表達(dá)量隨著葉片的衰老不斷提高[31]。桐樹的DGAT1 在各器官中的表達(dá)水平幾乎沒有差異,但DGAT2 在發(fā)育的種子中表達(dá)量極高[12]。擬南芥DGAT3 在胚根、花粉、衰老葉、葉原基、木質(zhì)部的表達(dá)量較高,WSD 在花序、花、雌蕊、柱頭、子房和花梗的表達(dá)量較高。煙草DGAT 家族基因表現(xiàn)出時(shí)空特異性表達(dá)。NtDGAT1~NtDGAT8 以及NtWSD13~NtWSD15 在不同時(shí)期的衰老葉片中表達(dá)量較高,在不同的花器官中表達(dá)量較低,這些基因可能主要參與了葉片脂類的合成。而NtWSD1~NtWSD12 的表達(dá)情況與此相反,他們可能主要參與了種子油脂的合成。
4 結(jié) 論
本研究從煙草基因組鑒定得到25 個(gè)DGAT 家族基因;其平均氨基酸長度為485,大部分為堿性蛋白和親水性蛋白,有13 個(gè)DGAT 蛋白定位到8條連鎖群上;有16 個(gè)蛋白定位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),6 個(gè)定位到葉綠體,3 個(gè)定位到胞外;煙草DGAT 蛋白包含典型的WS_DGAT 結(jié)構(gòu)域和LPLAT 結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)發(fā)育樹將DGAT 家族分為DGAT1、DGAT2、DGAT3和WSD 4 個(gè)類群,但煙草DGAT 僅劃分到DGAT2和WSD 兩個(gè)類群;不同煙草DGAT 基因的時(shí)空表達(dá)特性有所差異,并表現(xiàn)出一定的組織特異性,主要集中在衰老葉片和花器官中大量表達(dá)。
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