王繼國,謝有余,王華磊,魏東芝
華東理工大學(xué) 生物工程學(xué)院,上海 200237
據(jù)FDA數(shù)據(jù)庫分析,手性胺類化合物是小分子藥物合成中重要的分子模塊[1]。相比化學(xué)催化劑,合成手性胺的生物催化劑以光學(xué)純度高、環(huán)境污染小等優(yōu)勢[2-3]一直被作為研究熱點,如轉(zhuǎn)氨酶類[4-10]、單胺氧化酶類[11]、亞胺還原酶類[12-13]及胺脫氫酶類[14-15]等。其中ω-轉(zhuǎn)氨酶 (ω-TAs) 具有對映選擇性和區(qū)域選擇性高、底物譜較廣以及無需額外添加昂貴的輔酶的優(yōu)勢,成為工業(yè)上用于生產(chǎn)手性胺的重要工業(yè)酶之一[3,16-24]。
目前報道的野生ω-TAs中能直接用于制藥工業(yè)的為數(shù)不多,主要受限于酶的熱不穩(wěn)定及不利的反應(yīng)平衡[4-10]。異丙胺 (IPA) 被認為是ω-TAs工業(yè)應(yīng)用的理想氨基供體,其價格低廉利于供體過量,可以通過移除副產(chǎn)物丙酮來改變反應(yīng)平衡[3-4]。但能接受IPA供體的野生ω-TAs數(shù)量極少,極大限制了其作為理想氨基供體的工業(yè)應(yīng)用[25]。利用IPA供體有效地改變反應(yīng)平衡對ω-TAs提出了嚴格的要求[26]:(1) 能接受IPA為供體;(2) 最適反應(yīng)溫度在40–60 ℃之間,且保持較高的熱穩(wěn)定性;(3) 最適pH值在7.0以上;(4) 能轉(zhuǎn)化100–250 mmol/L以上的底物濃度[27]。
近年來基于新型氨基供體的高通量篩選方法被大量建立[5],但是這些氨基供體因成本高及產(chǎn)物純化難等問題難以適應(yīng)工業(yè)用途,而目前尚無基于IPA供體的高通量篩選方法。所以適當(dāng)選擇合適的高通量篩選方法,配合兼容IPA供體的轉(zhuǎn)化率篩選流程有利于新型ω-TAs工業(yè)適應(yīng)性選擇。為了從土壤宏基因組中發(fā)現(xiàn)一種新型ω-TA,我們從目標底物篩選、序列來源篩選做了適應(yīng)工業(yè)的選擇;接著以鄰亞二甲苯二胺顯色法快速初篩酶活,再使用IPA供體的HPLC分析法進行轉(zhuǎn)化率篩選,最后采用1-苯乙胺 (1-PEA) 動力學(xué)分析法進行酶學(xué)篩選,從而篩選出了一種來源于柄桿菌屬的新型ω-轉(zhuǎn)氨酶ATA-W12,并成功用于光學(xué)純(S)-(+)-1-Boc-3-氨基哌啶的50 mL規(guī)模制備。
1-Boc-3-哌啶酮 (98977-36-7)、1-Boc-3-吡咯烷酮 (101385-93-7) 作為目標底物,鄰亞二甲苯二胺二鹽酸鹽 (21294-14-4)、IPA (75-31-0) 和(S)-(-)-α-甲基芐胺 (2627-86-3,1-PEA)作為氨基供體。其中鄰亞二甲苯二胺二鹽酸鹽購自杰達維(上海) 醫(yī)藥科技發(fā)展有限公司,另外4種均購自上海百靈威化學(xué)技術(shù)有限公司。其余化學(xué)試劑均購自國藥集團化學(xué)試劑有限公司。
土壤樣品按Fast DNA Spin Kit for Soil試劑盒(MP Biomedicals,USA) 提取土壤基因組DNA,交于上海派森諾生物科技股份有限公司用Hiseq 2000 (Illumina Inc,USA) 進行高通量測序。得到3.3 Gb的棉花地土壤宏基因組數(shù)據(jù),由ORF finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)及blastx(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) 分析獲得21個ω-TAs基因全長序列 (具體數(shù)據(jù)作為附件,包括附表1和2,附圖1和2,可在網(wǎng)絡(luò)版中下載。見附表1)。
設(shè)計含雙酶切位點的21個候選ω-TAs基因的引物序列 (見附件附表2),由上海捷瑞生物工程有限公司合成。使用南京諾唯贊生物科技有限公司的2×TaqMaster Mix進行PCR擴增,循環(huán)條件為:95 ℃預(yù)變性3 min;35個循環(huán) (95 ℃變性15 s;60 ℃退火15 s;72 ℃延伸1.5 min);最終72 ℃延伸5 min,4 ℃孵育。將擴增成功的產(chǎn)物使用FavorPrep? GEL/PCR purification kit(Favorgen,Taiwan) 進行DNA凝膠回收。
用FastDigest系列BamHⅠ、HindⅢ、EcoRⅠ和XhoⅠ(Thermo,USA) 將PCR產(chǎn)物和pET-28a (+) 質(zhì)粒載體 (Merck,Germany) 酶切后使用Ligation high(TOYOBO,Janpan) 進行連接。重組質(zhì)粒被轉(zhuǎn)化到大腸桿菌Escherichia coliDH5α后通過菌落PCR及測序進行鑒定,鑒定成功后轉(zhuǎn)入E.coliBL21(DE3)表達宿主中。E.coliDH5α和E.coliBL21 (DE3) 購自天根生化科技 (北京) 有限公司。
鑒定成功的單克隆接種到含50 μg/mL卡那霉素的LB培養(yǎng)基試管,在37 ℃、200 r/min搖床中過夜培養(yǎng)。按1%接種到含卡那霉素的LB培養(yǎng)基中,在37 ℃、200 r/min搖床中培養(yǎng)。當(dāng)OD600達到0.6–0.8時,加入0.1 mmol/L IPTG,在20 ℃、200 r/min條件下誘導(dǎo)表達。收集菌體經(jīng)2次洗滌后在100 mmol/L Tris-HCl緩沖液 (pH 8.0) 中超聲破碎,在4 ℃、8 000×g條件下離心15 min收集得到上清。上清及沉淀重懸液用SDS-PAGE分析蛋白表達狀況。
按照Green AP的顯色方法[28]在白色96孔微孔板 (Nucn,Denmark) 建立了200 μL反應(yīng)體系,每個反應(yīng)混合液中包含30 mmol/L鄰亞二甲苯二胺二鹽酸鹽、20 mmol/L目標底物、0.1 mmol/L輔酶PLP及80 μL粗酶液,用100 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0) 補足到200 μL。設(shè)置無酶和無底物對照,兩個復(fù)孔。在微孔板振蕩器 (杭州奧盛) 中37 ℃、500 r/min進行反應(yīng)。反應(yīng)持續(xù)到15 min和16 h后分別觀察顏色變化及拍照。
為了篩選能兼容IPA供體并對兩種目標底物高轉(zhuǎn)化率的ω-TAs,建立了1 mL反應(yīng)體系。反應(yīng)液包括30 mmol/L IPA、20 mmol/L目標底物、0.1 mmol/L輔酶PLP及 400 μL粗酶液,用100 mmol/L Tris-HCl (pH 8.0) 補足到1 mL。反應(yīng)在37 ℃、200 r/min搖床中進行。反應(yīng)持續(xù)16 h的產(chǎn)物用乙酸乙酯萃取后進行HPLC分析。HPLC分析條件為:Zorbax XDB-C18色譜柱 (Agilent,USA);流動相PBS︰MeOH=70︰30;流速0.8 mL/min;柱溫37 ℃;檢測波長210 nm。用不含酶對照的目標底物吸收峰面積為100%,用目標底物的峰面積除以對照體系的峰面積計算底物的轉(zhuǎn)化率。
采用常州天地人和生物科技有限公司的鎳柱試劑盒對ATA-W12轉(zhuǎn)氨酶進行純化,用SDS-PAGE進行蛋白鑒定及Bradford法進行蛋白定量。
按照Sch?tzle等報道的酶動力學(xué)分析法[29],在紫外96孔酶標板中建立了200 μL反應(yīng)體系,用SPECTRAMAX190酶標儀 (Molecular Devices,USA) 在波長245 nm下進行測定。反應(yīng)液中包含2.5 mmol/L 1-PEA、2.5 mmol/L丙酮酸、0.25%二甲基亞砜及0.392 μg ATA-W12蛋白,用對應(yīng)的反應(yīng)緩沖液補足200 μL。
為了測定最適pH值我們配制了不同pH的緩沖液,包括100 mmol/L PBS的pH值調(diào)為6.0、7.0;100 mmol/L Tris-HCl的pH值調(diào)為8.0、8.5、9.0;100 mmol/L甘氨酸-氫氧化鈉溶液pH值調(diào)為9.2、10.0、10.5。最適pH測定在37 ℃,5 min反應(yīng)測定吸收值,以最高吸收值為100%計算相對酶活力。
為了測定ATA-W12的最適溫度,我們使用最適pH的緩沖液,加入如上反應(yīng)體系。在4 ℃、20 ℃、30 ℃、40 ℃、50 ℃、60 ℃、65 ℃及70 ℃下反應(yīng)5 min后測定,以最高吸收值為100%計算相對酶活力。
為了測試ATA-W12熱穩(wěn)定性,將8臺加熱制冷金屬浴(杭州博日)設(shè)置溫度為4 ℃、10 ℃、20 ℃、30 ℃、40 ℃、50 ℃、60 ℃和70 ℃預(yù)熱,然后將ATA-W12稀釋后保溫,分別在0.5、1、3、12、24、43、68、168 h時間點采樣檢測,反應(yīng)緩沖液采用最適pH的緩沖液,40 ℃、5 min反應(yīng)后測定吸收值,以?20 ℃保存的ATA-W12作為對照為100%酶活計算相對酶活。以上所有實驗均以不加酶的反應(yīng)體系作為空白扣除吸收值,設(shè)置3個重復(fù)。
采用50 mL放大規(guī)模制備(S)-(+)-1-Boc-3-氨基哌啶,反應(yīng)體系包括5 g ATA-W12濕菌體、500 mmol/L 1-Boc-3-哌啶酮、1.5 mol/L酸化IPA、2 mL二甲基亞砜、0.2 mmol/L PLP和100 mmol/L Tris-HCl (pH 8.5)。
反應(yīng)在100 mL反應(yīng)瓶中進行,利用2 mol/L IPA水溶液流加控制pH值為8.5,溫度控制在40 ℃,攪拌速度為300 r/min。每小時取3個重復(fù)樣檢測反應(yīng)進程,通過HPLC分析檢測。轉(zhuǎn)化率測定采用ZORBAX Extend C18 (4.6 mm×250 mm×5 μm),流動相為28%乙腈︰72% TFA溶液 (0.1%),流速為0.8 mL/min,柱溫37 ℃,進樣量5 μL,210 nm紫外檢測。轉(zhuǎn)化率通過產(chǎn)物摩爾量除以添加底物摩爾量的比率來計算。取反應(yīng)后溶液100 μL加入500 μL的乙酸乙酯萃取2次,加入無水硫酸鈉干燥過夜,溶于異丙醇后用HPLC測ee值。ee值測定采用Chiralcel AD-H,流動相為90%的正己烷︰10%的乙醇,流速為1 mL/min,柱溫30 ℃,進樣量5 μL,210 nm紫外檢測。反應(yīng)結(jié)束后用等體積的乙酸乙酯萃取3次,合并萃取相,12 000 r/min離心10 min后取有機相,旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)得到(S)-(+)-1-Boc-3-氨基哌啶。
手性3-氨基哌啶及3-氨基吡咯烷是一種重要手性胺醫(yī)藥中間體,廣泛用于原料藥的合成,如妥舒沙星、克林沙星、頭孢霉菌素衍生物等,還作為治療肥胖、Ⅰ型和Ⅱ型糖尿病、抗抑郁和精神分裂的原料藥的重要分子砌塊。但化學(xué)法合成路線復(fù)雜,拆分及氨基保護試劑成本太高,手性胺產(chǎn)物的光學(xué)活性差[30]。近10年來科學(xué)家一直在嘗試使用ω-TAs進行動力學(xué)拆分及不對稱合成來生產(chǎn)這兩種醫(yī)藥中間體,但限于ω-TAs性能都面臨著底物水平低、轉(zhuǎn)化率低及反應(yīng)時間過長等問題難以適應(yīng)工業(yè)用途[27,30-33]。所以針對這兩種手性胺醫(yī)藥中間體的生產(chǎn)篩選一種適應(yīng)于工業(yè)用途的ω-轉(zhuǎn)氨酶非常具有研究價值和應(yīng)用前景。
另外H?hne等[30]發(fā)現(xiàn)使用ω-TAs合成這兩種醫(yī)藥中間體時,采用Boc或Cbz保護雜環(huán)氮能有效地提高ω-TAs的反應(yīng)轉(zhuǎn)化率和ee值,所以本研究選擇1-Boc-3-哌啶酮和1-Boc-3-吡咯烷酮作為這兩種手性胺合成的目標底物。
目前報道的野生轉(zhuǎn)氨酶很少能適應(yīng)工業(yè)應(yīng)用,這可能由于序列來源的工業(yè)導(dǎo)向性差。我們進行此研究時采集了深海污泥、棉花地土壤、酒廠窖泥及貴州紅壤4種環(huán)境樣品。對比這4種土壤來源,棉花地土壤長期以尿素及動物糞便肥料為主,其中含有豐富的氨類化合物及耐受高氨濃度的細菌菌群,選擇其宏基因組作為挖掘耐高氨濃度、適應(yīng)工業(yè)應(yīng)用的ω-TAs的最佳來源。我們對棉花地土壤基因組DNA進行了提取并進行了高通量測序,并獲得了21個ω-TAs基因全長序列(見附表1)。
從土壤宏基因組高通量測序所得到的ω-TAs基因的豐度和在工程菌中克隆表達情況有很大差異,所以我們設(shè)計了21個ω-TAs候選基因的引物(見附表2),對這些基因進行克隆篩選。
最終我們從21個候選ω-TAs基因中成功擴增了11個ω-TAs基因。接著將這11個基因克隆到pET-28a(+)載體上進行菌落PCR并將構(gòu)建的質(zhì)粒測序進行確認 (圖1),圖1酶的標號省略ATA-。結(jié)果顯示,6種ω-TAs 包括ATA-W5、7、8、11、12及19被成功克隆。對這6種ω-TAs進行了表達,制備了6種粗酶液 (菌體裂解液上清),并用粗酶液 (圖2中a系列) 和沉淀 (圖2中b系列)分析了表達狀況,圖2酶編號省略ATA-W。
圖1 菌落PCR和測序確認6種ω-TAs成功克隆Fig.1 Six of ω-TAs were successfully cloned and confirmed by colony PCR and sequencing.
圖2 SDS-PAGE鑒定ω-轉(zhuǎn)氨酶表達Fig.2 Identification of ω-TAs by SDS-PAGE.a:clarified cell lysates b:insoluble fraction.
ATA-W11、19兩種蛋白以包涵體形式表達較多,而ATA-W5、7、8、12這4種ω-TAs主要為可溶性表達。雖然有兩種在上清中表達較少,為了對其上清酶活進行確認,也對其進行了酶活篩選實驗,進一步驗證6種粗酶液酶活性情況。
為了篩選對兩種目標底物有活性的酶,我們采用Green等報道的顯色方法[28]針對6種新酶粗酶液和13種ω-TAs原酶庫粗酶液進行了酶活篩選,結(jié)果如圖3所示。
圖3 19種ω-TAs粗酶液的酶活篩選Fig.3 Activity screening of 19 ω-TAs’ clarified cell lysates.
圖3中1–3列含20 mmol/L 1-Boc-3-吡咯烷酮,4–6列含20 mmol/L 1-Boc-3-哌啶酮,每列含兩個復(fù)孔。A行為無酶的對照組;含ATA-W5的B1/B2和含PSGA的B4/B5 作為無底物空白對照。C-H1/4分別包含ATA-W5、7、8、11、12、19共6種來自于宏基因組挖掘的新型ω-TAs。C-H2/5和C-H3/6分別為ATA-2、6、8、9、PSGA、BPSTM和ATA-12、13、14、15、16、17、18,共計13種為本研究組ω-TAs原酶庫。
反應(yīng)進行15 min后,含7種原酶庫ω-TAs孔出現(xiàn)了不同程度顏色加深,包括PSGA、ATA-2、8、9、13、15、18,說明反應(yīng)速度快。但由于B4/B5含PSGA的無底物對照顏色也變深,故無法說明顏色加深是否由于底物轉(zhuǎn)化造成。反應(yīng)經(jīng)過16 h之后,除以上含7種酶的孔形成明顯黑色沉淀外,含另外4種酶的孔,包括ATA-W12和ATA-12、14、17也形成了黑色沉淀,說明這4種酶反應(yīng)速率慢,但也具有較高的活性。
因含PSGA酶的無底物對照組有不依賴目標底物反應(yīng)的假陽性,因96孔板通量問題,原反應(yīng)只對ATA-W5和PSGA做了對照。為了進一步確認,我們對經(jīng)過16 h反應(yīng)能形成黑色沉淀的11種酶重新進行測定,如圖4所示,2/5列為含1-Boc-3-吡咯烷酮的反應(yīng),3/6列為含1-Boc-3-哌啶酮的反應(yīng),f5/6均為不含酶的對照。1/4為含酶不含底物的空白組。
經(jīng)16 h反應(yīng)后,含11種酶實驗組及對照組出現(xiàn)了黑色沉淀 (圖4)。圖4中不含酶空白組均未出現(xiàn)黑色沉淀,說明了這種假陽性的產(chǎn)生不是Green等所推測的由PLP造成的,可能是由于其推測的粗酶液本身含有天然酮類底物如丙酮酸產(chǎn)生的非特異反應(yīng)。
圖4 確認粗酶液中酮類及PLP雜質(zhì)的影響Fig.4 Confirming the influence of impurity ketone or PLP in the clarified cell lysates.
Green等報道的顯色篩選法[28]一直被作為一種正向篩選法來高通量篩選ω-TAs,但是實驗結(jié)果說明,可能由于粗酶液中太多丙酮酸等酮類雜質(zhì)造成該方法并不適合粗酶液的正向篩選。無論如何,黑色沉淀的形成說明ω-TAs一定具有很高的酶活力。所以該方法可作為一種“負向篩選法”來排除低活性的酶進行酶活力初篩。通過這種“負向”酶活初篩,我們篩選出共11種具有較高活性的ω-TAs,包括原酶ATA-2、8、9、12、13、14、15、17、18、PSGA和宏基因組挖掘的新酶ATA-W12。
為了進一步確認這11種ω-TAs對IPA的兼容性及底物轉(zhuǎn)化能力,以30 mmol/L IPA和20 mmol/L目標底物 (1-Boc-3-哌啶酮及吡咯烷酮) 建立了1 mL密閉反應(yīng),經(jīng)過37 ℃、16 h反應(yīng)后用HPLC法檢測底物轉(zhuǎn)化率。
圖5顯示了這種篩選的結(jié)果,除了ATA-12對1-Boc-3哌啶酮的反應(yīng)非常低之外,其他所有酶對兩種底物都在IPA供體下具有不同的轉(zhuǎn)化率。轉(zhuǎn)化率超過50%的是ATA-2、9和ATA-W12。轉(zhuǎn)化率篩選結(jié)果和顯色對比讓我們感到意外的是,ATA-2、9在顯色篩選法中僅15 min就發(fā)生了顏色變化,說明酶的反應(yīng)速度很快;而ATA-W12反應(yīng)很慢,16 h反應(yīng)后卻比ATA-2、9轉(zhuǎn)化率高。這可能是由于ATA-W12比ATA-2、9在37 ℃下的熱穩(wěn)定性更高,一直在反應(yīng)中維持更高的活性。也說明了顯色篩選法只能作為一種不依賴于底物的初篩方法,為IPA供體下轉(zhuǎn)化率篩選法降低工作量。
圖5 兼容IPA的ω-TAs轉(zhuǎn)化率篩選Fig.5 Conversion screening of ω-TAs with IPA.
分析以ATA-2、9和ATA-W12三種ω-TAs的反應(yīng)產(chǎn)物測定的HPLC圖譜 (見附圖1),ATA-W 12處于25.663 min產(chǎn)物峰的信號是最強的。再者為了真實體現(xiàn)11種ω-TAs在不采取副產(chǎn)物移除的情況下對兼容IPA下底物轉(zhuǎn)化效率,我們進行此1 mL反應(yīng)時采取了密閉管反應(yīng)體系。即使在這種密閉反應(yīng)體系下,ATA-W12 可以轉(zhuǎn)化67.42%的1-Boc-3-哌啶酮和85.84%的1-Boc-3-吡咯烷酮,這有利于減壓或微加熱去除副產(chǎn)物丙酮改變轉(zhuǎn)氨反應(yīng)平衡的策略實施。
根據(jù)宏基因組測序數(shù)據(jù)可知ATA-W12是一種來源于Caulobactersp.UNC358 MF Tsu5.1的轉(zhuǎn)氨酶,用Pfam蛋白家族數(shù)據(jù)庫分析可知屬于Ⅲ類TAs。目前為止,在野生轉(zhuǎn)氨酶[5]中,來源于Caulobactersp.的ω-TAs尚未見研究報道,所以我們對ATA-W12進行了酶學(xué)性質(zhì)研究。
如圖6所示,泳道1為純化的ATA-W12,分子量大約55 kDa左右,110 kDa左右較淡條帶為酶的二聚體形式;泳道2和3分別為菌體破碎液的沉淀部分及上清部分,說明了ATA-W12為可溶性表達。
圖6 ATA-W12的表達及純化Fig.6 Overexpression and purification of ATA-W12.Lane 1:purified ATA-W12 and its dimer;lane 2:precipitation fraction;lane 3:supernatant fraction.
為了得到ATA-W12的適宜反應(yīng)條件,我們測定了ATA-W12ω-轉(zhuǎn)氨酶的最適pH值、最適溫度和溫度依賴的熱穩(wěn)定性,結(jié)果見圖7。
圖7A顯示了ATA-W12最適pH值為8.5,符合了用IPA為供體時理想指標 (pH值大于7.0)。在pH 8.5的堿性環(huán)境下,氨基供體和手性胺產(chǎn)物的氨基被質(zhì)子化,從而減少減壓或加熱原位蒸餾時氨基供體和手性胺產(chǎn)物的損失。同時可以看出即使pH達到9.0,該酶依然保持90%左右的活性,pH 8.5–9.0的高活性范圍使得工業(yè)生產(chǎn)控制過程更為簡便。
圖7B顯示了ATA-W12最適溫度為50 ℃,且在40 ℃時仍有96%以上的酶活力,這種40–50 ℃的范圍也符合IPA供體原位蒸餾最佳范圍40–60 ℃之間。這種范圍既能實現(xiàn)有效產(chǎn)物移除,又能避免底物和目標產(chǎn)物的蒸餾損失。
圖7C顯示了ATA-W12溫度依賴的穩(wěn)定性,我們發(fā)現(xiàn)ATA-W12在40 ℃和50 ℃孵育12 h之內(nèi)酶活力依然保持在96%以上。所以當(dāng)反應(yīng)能控制在12 h內(nèi)完成時,該酶有40–50 ℃的溫控范圍,降低了工業(yè)生產(chǎn)對溫度控制設(shè)備的要求。但是在12 h以上時,50 ℃孵育的酶活力逐漸下降,而40 ℃孵育168 h后依然保持,所以結(jié)合最適溫度和熱穩(wěn)定性,ATA-W12的最適溫度控制在40 ℃較為合適。出乎意料的是,40 ℃孵育的酶活力與4–30 ℃之間孵育相比,隨著孵育時間的延長酶的活力反而緩緩上升,推測可能40 ℃情況下能讓該酶保持高活性構(gòu)象狀態(tài)。
圖7 1-PEA快速分析法鑒定ATA-W12酶學(xué)性質(zhì)Fig.7 Characterization of the ATA-W12 by a rapid assay using 1-PEA.
綜合以上三者的ATA-W12的酶學(xué)篩選結(jié)果,可得出ATA-W12在pH 8.5和溫度40 ℃條件下進行手性胺中間體放大合成的優(yōu)選適宜反應(yīng)條件。pH值范圍在8.5–9之間,若反應(yīng)在12 h之內(nèi)完成,溫度可在40–50 ℃之間進行調(diào)整。
為了驗證新型轉(zhuǎn)氨酶-ATA-W12工業(yè)適應(yīng)的潛力,我們采用酶學(xué)篩選確立的ATA-W12的初步反應(yīng)條件實現(xiàn)(S)-(+)-1-Boc-3-氨基哌啶的50 mL實驗室規(guī)模放大測試。為了方便制備,采用5 g未破碎ATA-W12濕菌體,因在pH 8.5、40 ℃及攪拌速度300 r/min的反應(yīng)條件下,ATA-W12很容易從濕菌體中裂解釋放實現(xiàn)催化。添加4%的二甲基亞砜,使得500 mmol/L 1-Boc-3-哌啶酮容易溶解且對ATA-W12酶活抑制影響不大。采用3倍底物濃度的IPA供體,過量底物濃度使得反應(yīng)利于向產(chǎn)物生成方向進行。因起始反應(yīng)速度快造成pH下降,采用2 mol/L異丙胺水溶液供體流加調(diào)節(jié)pH為8.5。經(jīng)過8 h反應(yīng)后,用HPLC法不能檢測到反應(yīng)底物,500 mmol/L 1-Boc-3氨基哌啶酮幾乎100%轉(zhuǎn)化為 (S)-(+)-1-Boc-3-氨基哌啶,產(chǎn)物純化后測試ee值>99.95% (見附圖2),該項成果2016年申請了中國發(fā)明專利,并于2019年獲得發(fā)明授權(quán)[34]。
Green等[28]建立的ω-TAs高通量篩選法是基于易脫氨供體鄰亞二甲苯二胺,可廣泛接受各類ω-TAs和酮類底物,因其方法的簡便性及通用性得到廣泛應(yīng)用。本研究發(fā)現(xiàn)該方法在粗酶液篩選中易產(chǎn)生不依賴于目標底物的假陽性,但可以作為一種酶活初篩方法。Schatzle等[29]建立的ω-TAs快速動力分析法是基于另一種易脫氨供體1-PEA的方法,可以快速地對ω-TAs的熱穩(wěn)定性及反應(yīng)條件進行初步篩選。雖然理想工業(yè)用氨基供體IPA可以采用傳統(tǒng)的HPLC及轉(zhuǎn)化率的篩選,但是因費時費力不太適合高通量篩選。本研究組合了基于3種供體的篩選方法建立了一套有效的“ω-轉(zhuǎn)氨酶的工業(yè)適應(yīng)性選擇”流程。發(fā)展以生物傳感器或顯色法檢測丙酮副產(chǎn)物,來建立“基于IPA供體的ω-轉(zhuǎn)氨酶高通量篩選方法“是一個值得繼續(xù)研究的課題。
Gundersen等[32]以25 mL實驗規(guī)模,采用Ars-ωTA轉(zhuǎn)氨酶和IPA氨基供體經(jīng)過96 h反應(yīng)得到50 g/L的(S)-(+)-1-Boc-3-氨基哌啶,轉(zhuǎn)化率為91%。而本研究發(fā)現(xiàn)的ATA-W12采用酶學(xué)篩選的初步反應(yīng)條件和1.5 mol/L的IPA供體,8 h后幾乎完全轉(zhuǎn)化500 mmol/L 1-Boc-3-哌啶酮生成100 g/L的(S)-(+)-1-Boc-3-氨基哌啶,生產(chǎn)效率大大提高。這可能主要源于ATA-W12具有耐高濃度IPA和高熱穩(wěn)定性的優(yōu)良特性。對ATA-W12的轉(zhuǎn)氨過程進行優(yōu)化,提高生產(chǎn)效率值得進一步研究。
總之,本研究發(fā)現(xiàn)的ATA-W12是為數(shù)不多的具有工業(yè)應(yīng)用“天賦”的野生新型ω-轉(zhuǎn)氨酶,通過該酶的底物譜研究,可以實現(xiàn)其他S-型醫(yī)藥中間體的生產(chǎn)。另外也可作為“人工進化”改造的優(yōu)良起始酶種,通過拓展底物譜改造可實現(xiàn)更多醫(yī)藥中間體生產(chǎn),在制藥工業(yè)中具有廣闊應(yīng)用前景。